Homology viewer

Options
Top level taxon:
Lowest rank to show:
Only show nodes with at least sequences
Show unranked nodes
Show taxonomic rank for each node
Compress non-branching lineages
Show sister nodes
Queries (space-separated sequence names, genome names, or genome accessions):
59 query sequences selected (show)
root └─ Eukaryota ├─ Viridiplantae │ └─ Streptophyta │ └─ Streptophytina │ ├─ Pinidae │ │ └─ Pinales │ │ └─ Pinaceae │ │ └─ Picea │ │ └─ Picea abies - 8,8703546595083743093111,2024283421673454265546992898612,3271673094775086593548,8701,202289517461407551419226441107221646740313639509307785475419724614356520286179174185 . 547778450773477 │ └─ rosids │ ├─ Fabales │ │ └─ Fabaceae │ │ └─ Papilionoideae │ │ └─ Phaseoleae │ │ └─ Phaseolus │ │ └─ Phaseolus vulgaris - . . . . . 172168 . . . . 168 . . . . . . . 172100 . . . . . . 81 . 81 . . . . . 107 . . . . . 104 . . . . . 99 . 116929288 . . . . . 90 │ └─ Brassicales │ └─ Brassicaceae │ └─ Camelineae │ ├─ Capsella <angiosperm> │ │ └─ Capsella rubella - . . . . 90140140 . 9290 . 14082 . . . . . . 140 . . . . . . 86 . . . . 82 . 86 . 81 . . 90 . . . . . . . . 9786 . . . . . . . . . 90 │ └─ Camelina │ └─ Camelina sativa - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86 . . . . . . . . . . . . . . . . ├─ Metazoa │ ├─ Platyhelminthes │ │ └─ Trematoda │ │ └─ Digenea <flatworm> │ │ └─ Strigeidida │ │ └─ Schistosomatoidea │ │ └─ Schistosomatidae │ │ └─ Schistosoma │ │ └─ Schistosoma japonicum - 4445565946661,1129429485982,4191,6633529495,5711,8296195175225763529428666665945564445981,6697429311,1461,8262,9174261,1194848106435871,703578792893360628459488702935875805614610616 . 571273356554751 │ ├─ Arthropoda │ │ ├─ Hexapoda │ │ │ └─ Insecta │ │ │ └─ Pterygota <winged insects> │ │ │ └─ Neoptera │ │ │ └─ Holometabola │ │ │ └─ Lepidoptera │ │ │ └─ Glossata │ │ │ └─ Neolepidoptera │ │ │ └─ Heteroneura │ │ │ └─ Papilionoidea │ │ │ └─ Nymphalidae │ │ │ └─ Heliconiinae │ │ │ └─ Heliconiini │ │ │ └─ Heliconius │ │ │ └─ Heliconius melpomene │ │ │ └─ Heliconius melpomene melpomene - 1791791502894081,6531,622208262358 . 1,609279241165201118147 . 1,653392289150179179208354349367412244288 . 417132378161194367255352444 . 29515892345389334365219214210 . 192 . . 150385 │ │ └─ Chelicerata │ │ └─ Merostomata │ │ └─ Xiphosura │ │ └─ Limulidae │ │ └─ Limulus │ │ └─ Limulus polyphemus - 88102 . 9220634234784154201 . 342165134 . 1239582 . 34215992 . 1028884201176215201134168 . 20199230 . 147201129179230 . 102 . 88105183176203127127127 . 154 . . 113167 │ ├─ Hemichordata │ │ └─ Enteropneusta │ │ └─ Harrimaniidae │ │ └─ Saccoglossus │ │ └─ Saccoglossus kowalevskii - 1521611273945491,2071,175214349477 . 1,180367315154167149143 . 1,207517394127161152214466522488563320376 . 567136545140215495302455587 . 34316792417545434509280277271 . 201 . . 136504 │ ├─ Chordata │ │ └─ Craniata <chordata> │ │ ├─ Mammalia │ │ │ ├─ Diprotodontia │ │ │ │ └─ Macropodidae │ │ │ │ └─ Notamacropus │ │ │ │ └─ Notamacropus eugenii - . 86 . 2664121,0291,002 . 230345 . 1,00226423082100 . . . 1,029365266 . 86 . . 342394354426233264 . 43010043088131367196331441 . 23593 . 311410313390172172167 . 120 . . 90374 │ │ │ ├─ Euarchontoglires │ │ │ │ ├─ Rodentia │ │ │ │ │ └─ Castorimorpha │ │ │ │ │ └─ Heteromyidae │ │ │ │ │ └─ Dipodomyinae │ │ │ │ │ └─ Dipodomys │ │ │ │ │ └─ Dipodomys ordii - 581482663486367407455708435233423405432489558187572641423407419486663482581708311390365333486453417441 . 457495659154544489136594533480735486462457304468500506131522773753614399 │ │ │ │ └─ Primates │ │ │ │ └─ Haplorrhini │ │ │ │ └─ Simiiformes │ │ │ │ └─ Catarrhini │ │ │ │ └─ Hominoidea │ │ │ │ └─ Hominidae │ │ │ │ └─ Ponginae │ │ │ │ └─ Pongo │ │ │ │ └─ Pongo abelii - . . . . . 127127 . . . . 127 . . . . . . . 127 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ └─ Laurasiatheria │ │ │ └─ Tylopoda │ │ │ └─ Camelidae │ │ │ └─ Vicugna <genus> │ │ │ └─ Vicugna pacos - . . . . 92336345 . 81104 . 318 . . . 93 . . . 336 . . . . . . 99 . . . . . . . . 113 . . 104 . 97111 . . . . . 120111129 . . . . . . . . 88 │ │ ├─ Actinopterygii │ │ │ └─ Actinopteri │ │ │ └─ Neopterygii │ │ │ └─ Teleostei │ │ │ └─ Gadiformes │ │ │ └─ Gadoidei │ │ │ └─ Gadidae │ │ │ └─ Gadus │ │ │ └─ Gadus morhua - 10713293203334872881145262361 . 830242201102235118 . . 87229820393132107145378345374347201233 . 318140419158221374208304399 . 18890100226376300360214217205 . 273 . . 145271 │ │ └─ Aves │ │ ├─ Neognathae │ │ │ └─ Passeriformes │ │ │ └─ Passeroidea │ │ │ └─ Fringillidae │ │ │ └─ Carduelinae │ │ │ └─ Serinus │ │ │ └─ Serinus canaria - 11112093131232641646163174251 . 619161118120161140 . . 64116313193120111163273242178246131161 . 201 . 293136168266127168257 . 152102109187277158232150150154 . 224 . . 111190 │ │ └─ Palaeognathae │ │ └─ Apterygiformes │ │ └─ Apterygidae │ │ └─ Apteryx │ │ └─ Apteryx australis │ │ └─ Apteryx australis mantelli - . . . . . 9292 . . . . 92 . . . . . . . 92 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ ├─ Echinodermata │ │ ├─ Echinozoa │ │ │ └─ Echinoidea │ │ │ ├─ Perischoechinoidea │ │ │ │ └─ Cidaroida │ │ │ │ └─ Cidaridae │ │ │ │ └─ Eucidaris │ │ │ │ └─ Eucidaris tribuloides - . . . 95158416416 . 129179 . 385125 . . . . . . 4169095 . . . . 17015012217697129 . 152 . 187 . . 183122107176 . 99 . . 12215890150979797 . 107 . . . 97 │ │ │ └─ Euechinoidea │ │ │ └─ Echinacea <Echinodermata> │ │ │ └─ Temnopleuroida │ │ │ └─ Toxopneustidae │ │ │ └─ Lytechinus │ │ │ └─ Lytechinus variegatus - . . . . 19933333681134194 . 333147118 . 113 . . . 333154 . . . . 81190168197194118152 . 19084228 . 134190107183219 . . . . 81188179199104104104 . 127 . . 90158 │ │ └─ Asterozoa │ │ └─ Asteroidea │ │ └─ Valvatacea <echinoderm> │ │ └─ Valvatida │ │ └─ Asterinidae │ │ └─ Patiria │ │ └─ Patiria miniata - . . . 136168369369 . 132185 . 351141 . . 86 . . . 369109136 . . . . 183149129183114141 . 15682196 . . 194134125187 . 116 . . 138165113168979792 . 147 . . . 127 │ ├─ Cnidaria │ │ └─ Cubozoa │ │ └─ Carybdeida │ │ └─ Alatinidae │ │ └─ Alatina │ │ └─ Alatina alata - . . . . . 271271 . . . . 253 . . . . . . . 271 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ └─ Nematoda │ ├─ Chromadorea │ │ ├─ Ascaridida │ │ │ └─ Ascaridoidea │ │ │ └─ Ascarididae │ │ │ └─ Ascaris │ │ │ └─ Ascaris suum - . . . . . 147147 . . . . 147 . . . . . . . 147 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ └─ Tylenchida │ │ └─ Tylenchina │ │ └─ Tylenchoidea │ │ ├─ Hoplolaimidae │ │ │ └─ Rotylenchulinae │ │ │ └─ Rotylenchulus │ │ │ └─ Rotylenchulus reniformis - . . . . . . . 92 . . . . . . . . . . . . . . . . . 92 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ └─ Heteroderidae │ │ └─ Heteroderinae │ │ └─ Globodera │ │ └─ Globodera ellingtonae - . . . . . . . . . . . . . . . . . 86 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ └─ Enoplea │ └─ Dorylaimia │ └─ Trichocephalida │ └─ Trichinellidae │ └─ Trichinella │ ├─ Trichinella spiralis - . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ ├─ Trichinella nativa - . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ ├─ Trichinella britovi - . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ ├─ Trichinella sp. T6 - . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ ├─ Trichinella sp. T8 - . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ ├─ Trichinella murrelli - . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ ├─ Trichinella sp. T9 - . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ └─ Trichinella patagoniensis - . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ├─ Fungi │ └─ Dikarya │ ├─ Ascomycota │ │ ├─ Pezizomycotina │ │ │ ├─ Eurotiomycetes │ │ │ │ └─ Eurotiomycetidae │ │ │ │ ├─ Onygenales │ │ │ │ │ └─ Ascosphaeraceae │ │ │ │ │ └─ Ascosphaera │ │ │ │ │ └─ Ascosphaera apis │ │ │ │ └─ Eurotiales │ │ │ │ └─ Aspergillaceae │ │ │ │ └─ Penicillium │ │ │ │ ├─ Penicillium flavigenum - . . . . . . . 93 . . . . . . . . . . . . . . . . . 93 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium coprophilum - . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium italicum │ │ │ │ │ ├─ GCA_000769765.1 - . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ │ ├─ GCA_001008395.1 - . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ │ └─ GCA_002116305.1 - . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium freii - . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium polonicum - . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium solitum │ │ │ │ │ ├─ GCA_001750005.1 - . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ │ ├─ GCA_000952775.2 - . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ │ └─ GCA_002072235.1 - . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium nalgiovense - . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium griseofulvum │ │ │ │ │ ├─ GCA_001735785.1 - . . . . . . . 88 . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ │ └─ GCA_001561935.1 - . . . . . . . 88 . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium verrucosum - . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium paneum │ │ │ │ ├─ Penicillium nordicum │ │ │ │ │ ├─ GCA_001278595.1 - . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ │ └─ GCA_000733025.2 - . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium sp. HKF2 - . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium chrysogenum │ │ │ │ │ ├─ GCA_002080375.1 - . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ │ ├─ GCA_000801355.1 - . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ │ └─ GCA_000710275.1 - . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ │ ├─ Penicillium rubens │ │ │ │ └─ Penicillium digitatum │ │ │ ├─ Dothideomycetes │ │ │ │ └─ Dothideomycetidae │ │ │ │ └─ Capnodiales │ │ │ │ └─ Cladosporiaceae │ │ │ │ └─ Rachicladosporium │ │ │ │ └─ Rachicladosporium antarcticum - . . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ └─ Sordariomycetes │ │ │ └─ Hypocreomycetidae │ │ │ └─ Microascales │ │ │ └─ Ceratocystidaceae │ │ │ └─ Endoconidiophora │ │ │ ├─ Endoconidiophora laricicola - . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ │ └─ Endoconidiophora polonica - . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . │ │ └─ Saccharomycotina │ │ └─ Saccharomycetes │ │ └─ Saccharomycetales │ │ └─ Saccharomycetaceae │ │ └─ Saccharomyces │ │ └─ Saccharomyces paradoxus │ └─ Basidiomycota │ └─ Agaricomycotina │ └─ Agaricomycetes │ └─ Polyporales │ └─ Coriolaceae │ └─ Postia │ └─ Postia placenta ├─ Apicomplexa │ └─ Coccidia │ └─ Eucoccidiorida │ └─ Eimeriorina │ └─ Sarcocystidae │ └─ Toxoplasma <Apicomplexa> │ └─ Toxoplasma gondii ├─ Entamoebidae │ └─ Entamoeba │ └─ Entamoeba dispar ├─ Oomycetes │ └─ Peronosporales │ └─ Peronosporaceae │ └─ Plasmopara │ └─ Plasmopara halstedii - . . . . . 372345 . . . . 365 . . . . . . . 372 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . └─ Myxogastromycetidae └─ Physariida └─ Physaraceae └─ Physarum └─ Physarum polycephalum - . 104 . 114237369369104163215 . 369172141 . 13295 . . 369172114 . 104 . 104212210248228141178 . 22310527384158212132208271 . 107 . 92104228205232129129129 . 158 . . 122201