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BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Trypanosoma_20cruzi_20[genbank_20GCA_5F000209065.1_202005-08-02] 29,495 sequences; 89,937,456 total letters Query= NC_001416.1 Length=48502 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq13611 1573 0.0 seq8220 1503 0.0 seq10087 1483 0.0 seq5240 1357 0.0 >seq13611 Length=919 Score = 1573 bits (1744), Expect = 0.0 Identities = 896/919 (97%), Gaps = 0/919 (0%) Strand=Plus/Plus Query 45470 TGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCG 45529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1 TGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTTCTCG 60 Query 45530 ATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTT 45589 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTT 120 Query 45590 ATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTG 45649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTG 180 Query 45650 TCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTT 45709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTT 240 Query 45710 GGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACG 45769 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACG 300 Query 45770 CTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATA 45829 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATA 360 Query 45830 TCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGGTTATG 45889 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGGTTATG 420 Query 45890 GTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGG 45949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGG 480 Query 45950 TCAGAGAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCAT 46009 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TCAGAGAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCAT 540 Query 46010 CATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGC 46069 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGC 600 Query 46070 CCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCA 46129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCA 660 Query 46130 GATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGC 46189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGC 720 Query 46190 TAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTGCACAT 46249 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 721 TAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCGTCGGTTGCACAT 780 Query 46250 CAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGC 46309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGC 840 Query 46310 CTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGAT 46369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGAT 900 Query 46370 CACTATGCAAAAACAACTG 46388 ||||||||||||||||||| Sbjct 901 CACTATGCAAAAACAACTG 919 >seq8220 Length=837 Score = 1503 bits (1666), Expect = 0.0 Identities = 837/838 (99%), Gaps = 1/838 (0%) Strand=Plus/Minus Query 17693 CCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGACCCGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGG 17752 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 837 CCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGACCCGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGG 778 Query 17753 AAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGC 17812 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 777 AAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGC 718 Query 17813 TGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCC 17872 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 717 TGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCC 658 Query 17873 GCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATG 17932 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 657 GCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATG 598 Query 17933 ATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGG 17992 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 597 ATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGG 538 Query 17993 AGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGA 18052 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 537 AGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGA 478 Query 18053 AAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGA 18112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 477 AAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGA 418 Query 18113 CCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAG 18172 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 417 CCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAG 358 Query 18173 GCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACG 18232 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 357 GCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACG 298 Query 18233 GGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCC 18292 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 297 GGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCC 238 Query 18293 TGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGA 18352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 237 TGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGA 178 Query 18353 CACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACT 18412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 177 CACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACT 118 Query 18413 CCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGG 18472 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 117 CCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGG 58 Query 18473 CGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCG 18530 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 57 CGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGC-TTTCCGCGCCAGCG 1 >seq10087 Length=869 Score = 1483 bits (1644), Expect = 0.0 Identities = 847/869 (97%), Gaps = 1/869 (0%) Strand=Plus/Minus Query 38294 ACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATAC 38353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 869 ACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATAC 810 Query 38354 TTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTT 38413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 809 TTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTT 750 Query 38414 AACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCG 38473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 749 AACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCG 690 Query 38474 CAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTT 38533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 689 CAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTT 630 Query 38534 GAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTC 38593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 629 GAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTC 570 Query 38594 ACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGA 38653 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 569 ACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGA 510 Query 38654 GGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACT 38713 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 509 GGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACT 450 Query 38714 TCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACG 38773 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 449 TCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACG 390 Query 38774 CCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGT 38833 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 389 CCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGT 330 Query 38834 TTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAA 38893 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 329 TTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAA 270 Query 38894 TCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCA 38953 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 269 TCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCA 210 Query 38954 AGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATA 39013 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 209 AGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATA 150 Query 39014 AAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 39073 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 149 AAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATA 90 Query 39074 NAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTA 39133 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 89 AAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTA 30 Query 39134 TTACaaaag-aaaaaagaaaaGATTATTC 39161 ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 29 TTACAAAAGAAAAAAAGAAAAGATTATTC 1 >seq5240 Length=752 Score = 1357 bits (1504), Expect = 0.0 Identities = 752/752 (100%), Gaps = 0/752 (0%) Strand=Plus/Minus Query 30199 CCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTT 30258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 752 CCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTT 693 Query 30259 CTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGG 30318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 692 CTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGG 633 Query 30319 TCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGA 30378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 632 TCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGA 573 Query 30379 GAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGC 30438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 572 GAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGC 513 Query 30439 AACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGC 30498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 512 AACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGC 453 Query 30499 CACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTG 30558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 452 CACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTG 393 Query 30559 CTGTGTTGCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTC 30618 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 392 CTGTGTTGCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTC 333 Query 30619 ATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAG 30678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 332 ATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAG 273 Query 30679 CCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAA 30738 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 272 CCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAA 213 Query 30739 CATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCG 30798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 212 CATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCG 153 Query 30799 GTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCGGAAACTGCTGTCT 30858 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 152 GTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCGGAAACTGCTGTCT 93 Query 30859 GGCtttttttGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCT 30918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 92 GGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCT 33 Query 30919 GAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAA 30950 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 32 GAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAA 1 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 155030481064160