Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Talaromyces_20cellulolyticus_20[genbank_20GCA_5F000829775.1_202015- 01-16] 60 sequences; 36,402,801 total letters Query= NC_001416.1 Length=48502 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq34 2075 0.0 seq42 1101 0.0 >seq34 Length=3934 Score = 2075 bits (2300), Expect = 0.0 Identities = 1155/1157 (99%), Gaps = 1/1157 (0%) Strand=Plus/Plus Query 34811 TATGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATT 34870 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2778 TATGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATT 2837 Query 34871 CCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTTCCCGATGGAA 34930 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2838 CCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTTCCCGATGGAA 2897 Query 34931 TGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTA 34990 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2898 TGGGAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTA 2957 Query 34991 TGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAGAGGAA 35050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2958 TGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAGAGGAA 3017 Query 35051 TCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGC 35110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3018 TCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGC 3077 Query 35111 TGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGCAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGT 35170 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3078 TGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGCAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGT 3137 Query 35171 GGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCG 35230 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3138 GGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCG 3197 Query 35231 GTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACA 35290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3198 GTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACA 3257 Query 35291 GGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTT 35350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3258 GGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTT 3317 Query 35351 GTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCT 35410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3318 GTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCT 3377 Query 35411 GAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCA 35470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3378 GAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCA 3437 Query 35471 ATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAG 35530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3438 ATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAG 3497 Query 35531 GGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAG 35590 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3498 GGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAG 3557 Query 35591 TATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGT 35650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3558 TATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGT 3617 Query 35651 TATCTGTATGttttttatatgaatttattttttGCA-GGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGA 35709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3618 TATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGA 3677 Query 35710 GAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTG 35769 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3678 GAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTG 3737 Query 35770 GTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATT 35829 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3738 GTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATT 3797 Query 35830 CTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATG 35889 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3798 CTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATG 3857 Query 35890 CAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAAGCA 35949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3858 CAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAAGCA 3917 Query 35950 ATAACCCGCAGAAAAAC 35966 ||||||||||||||||| Sbjct 3918 ATAACCCGCAGAAAAAC 3934 >seq42 Length=3210 Score = 1101 bits (1220), Expect = 0.0 Identities = 613/615 (99%), Gaps = 0/615 (0%) Strand=Plus/Plus Query 37494 ATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCA 37553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCA 60 Query 37554 TCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAAC 37613 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTTAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAAC 120 Query 37614 ATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTC 37673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTC 180 Query 37674 ATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAG 37733 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAG 240 Query 37734 AATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGC 37793 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AATTTTTGTAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGC 300 Query 37794 ACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAG 37853 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAG 360 Query 37854 TTCAtttttctttttttCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTG 37913 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTG 420 Query 37914 TGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATC 37973 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATC 480 Query 37974 TAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGG 38033 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGG 540 Query 38034 AGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAA 38093 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAA 600 Query 38094 GACAGCTAAAGATCT 38108 ||||||||||||||| Sbjct 601 GACAGCTAAAGATCT 615 Score = 567 bits (628), Expect = 2e-157 Identities = 339/361 (94%), Gaps = 1/361 (0%) Strand=Plus/Plus Query 38814 AGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTG 38873 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 610 AGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTG 669 Query 38874 GAATAAACCAATGGACAGAATCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGT 38933 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 670 GAATAAACCAATGGACAGAATCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGT 729 Query 38934 CAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGG 38993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 730 CAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGG 789 Query 38994 CGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAA 39053 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 790 CGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAA 849 Query 39054 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACA 39113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 850 ATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACA 909 Query 39114 GGGGGACACAAAAGACACTATTACaaaagaaaaaagaaaaGATTATTCGTCAGAGAATTC 39173 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 910 GGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAG-AAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTC 968 Query 39174 T 39174 | Sbjct 969 T 969 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 155084689502080