Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Komagataella_20pastoris_20[genbank_20GCA_5F900016595.1_202016-02-08]
207 sequences; 9,358,152 total letters
Query= NC_009334.1
Length=172764
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq76 1191 0.0
seq77 1063 0.0
seq98 872 0.0
seq94 544 9e-150
seq68 497 1e-135
>seq76
Length=698
Score = 1191 bits (1320), Expect = 0.0
Identities = 669/675 (99%), Gaps = 0/675 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8014 ATCGCAACATTAGCCCACCGTGCTCTCAACGACCTCGTGAATATGAGGACCAACAACCCT 8073
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 ATGGCAACATTAGCCCACCGTGCTCTCAGCGACCTCGTGAATATGAGGACCAACAACCCT 83
Query 8074 GTGCTTGGCGCTCAGGCGCAAGTGTGTGTAACTTGTCTTCCAGATCGCAGCAATCGCGCC 8133
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GTGCTTGGCGCTCAGGCGCAAGTGTGTGTAATTTGTCCTCCAGATCGCAGCAATCGCGCC 143
Query 8134 CCTATCTTGGCCCGCCCACCTACTTATGCAGGTATTCCCCGGGGTGCCATTAGTGGTTTT 8193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 CCTATCTTGGCCCGCCCACCTACTTATGCAGGTATTCCCCGGGGTGCCATTAGTGGTTTT 203
Query 8194 GTGGGCAAGTGGTTTGACCGCAGTGGTTAGCGGGGTTACAATCAGCCAAGTTATTACACC 8253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 GTGGGCAAGTGGTTTGACCGCAGTGGTTAGCGGGGTTACAATCAGCCAAGTTATTACACC 263
Query 8254 CTTAGTTTACAGTCCAAAACCGCAGGGCGGCGTGTGGGGGCTGACGCGTGCCCCCACTCC 8313
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 CTTATTTTACAGTCCAAAACCGCAGGGCGGCGTGTGGGGGCTGACGCGTGCCCCCACTCC 323
Query 8314 ACAATTTCaaaaaaaaGAGTGGCCACTTGTCTTTGTTTATGGGCCCCATTGGCGTGGAGC 8373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 ACAATTTCAAAAAAAAGAGTGGCCACTTGTCTTTGTTTATGGGCCCCATTGGCGTGGAGC 383
Query 8374 CCCGTTTAATTTTCGGGGGTGTTAGAGACAACCAGTGGAGTCCGCTGCTGTCGGCGTCCA 8433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 CCCGTTTAATTTTCGGGGGTGTTAGAGACAACCAGTGGAGTCCGCTGCTGTCGGCGTCCA 443
Query 8434 CTCTCTTTCCCCTTGTTACAAATAGAGTGTAACAACATGGTTCACCTGTCTTGGTCCCTG 8493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 CTCTCTTTCCCCTTGTTACAAATAGAGTGTAACAACATGGTTCACCTGTCTTGGTCCCTG 503
Query 8494 CCTGGGACACATCTTAATAACCCCAGTATCATATTGCACTAGGATTATGTGTTGCCCATA 8553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 CCTGGGACACATCTTAATAACCCCAGTATCATATTGCACTAGGATTATGTGTTGCCCATA 563
Query 8554 GCCATAAATTCGTGTGAGATGGACATCCAGTCTTTACGGCTTGTCCCCACCCCATGGATT 8613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 GCCATAAATTCGTGTGAGATGGACATCCAGTCTTTACGGCTTGTCCCCACCCCATGGATT 623
Query 8614 TCTATTGTTAAAGATATTCAGAATGTTTCATTCCTACACTAGTATTTATTGCCCAAGGAG 8673
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 624 TCTATTGTTAAAGATATTCAGAATGTTTCATTCCTACACTAGTATTTATTGCCCAAGGGG 683
Query 8674 TTTGTGAGGGTTATA 8688
|||||||||||||||
Sbjct 684 TTTGTGAGGGTTATA 698
>seq77
Length=746
Score = 1063 bits (1178), Expect = 0.0
Identities = 654/712 (92%), Gaps = 1/712 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8793 TCACAACTCAGCAGTTATTCTATTAGCTAAACGAAGGAGAATGAAGAAGCAGGCGAAGAT 8852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCACAACTCAGCAGTTATTCTATTAGCTAAACGAAGGAGAATGAAGAAGCAGGCGAAGAT 60
Query 8853 TCAGGAGAGTTCACTGCCCGCTCCTTGATCTTCAGCCACTGCCCTTGTGACTAAAATGGT 8912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCAGGAGAGTTCACTGCCCGCTCCTTGATCTTCAGCCACTGCCCTTGTGACTAAAATGGT 120
Query 8913 TCACTACCCTCGTGGAATCCTGATCCCATGTAAATAAAACCGTGACAGCTCATGGGGTGG 8972
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCACTACCCTCGTGGAATCCTGACCCCATGTAAATAAAACCGTGACAGCTCATGGGGTGG 180
Query 8973 GAGATATCGCTGTTCCTTAGGACCCTTTTACTAACCCTAATTCGATAGCATATGCTTCCC 9032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GAGATATCGCTGTTCCTTAGGACCCTTTTACTAACCCTAATTCGATAGCATATGCTTCCC 240
Query 9033 GTTGGGTAACATGTGCTATTGAATTAGGGTTAGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 9092
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTTGGGTAACATATGCTATTGAATTAGGGTTAGTCTGGATAGTATATACTACTACCCGGG 300
Query 9093 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAGGGGGCCTTATAAACACTCTTGCTAACGCC 9152
| |||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 301 AAGCATATGCTACCCGTTTAGGGTTAACAAGGGGGCCTTATAAACACTATTGCTAATGCC 360
Query 9153 CTCTTGAGGGTCCGCTTATCGGTAGCTACACAGGCCCCTCTGATTGACGTTGGTGTAGCC 9212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTCTTGAGGGTCCGCTTATCGGTAGCTACACAGGCCCCTCTGATTGACGTTGGTGTAGCC 420
Query 9213 TCCCATAGTCTTCCTGGGCCCCTGGGAGGTACATGTCCCCCAGCATTGGTGTAAGAGCTT 9272
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCCCGTAGTCTTCCTGGGCCCCTGGGAGGTACATGTCCCCCAGCATTGGTGTAAGAGCTT 480
Query 9273 CAACCAAGAGTTACACATAAAGGCAATGTTGTGTTGCAGTCCACAGACTGCAAAGTCTGC 9332
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CAGCCAAGAGTTACACATAAAGGCAATGTTGTGTTGCAGTCCACAGACTGCAAAGTCTGC 540
Query 9333 TTCAGGATGAAAGCCACTCAGTGTTGGCAAATGTGCACATCCATTTATAAGGATGTCAAC 9392
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TCCAGGATGAAAGCCACTCAGTGTTGGCAAATGTGCACATCCATTTATAAGGATGTCAAC 600
Query 9393 TACAGTCAGAGAACCCCTTTGTGTTTGGTcccccccccGTGTCACATGTGGAACAGGGCC 9452
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TACAGTCAGAGAACCCCTTTGTGTTTGGT-CCCCCCCCGTGTCACATGTGGAACAGGGCC 659
Query 9453 CAGTTGGCAAGTTGTACCAACCAACTGAAGGGATTACATGCACTGCCCCGCG 9504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CAGTTGGCAAGTTGTACCAACCAACTGAAGGGATTACATGCACTGCCCCGCG 711
>seq98
Length=535
Score = 872 bits (966), Expect = 0.0
Identities = 509/526 (97%), Gaps = 0/526 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 97617 CGTGGTGAAAAGAGGCCCAGGAGTCCCAGTAGTCAGTCATCATCATCCGGGTCTCCACCG 97676
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526 CGTGGAGAAAAGAGGCCCAGGAGTCCCAGTAGTCAGTCATCATCATCCGGGTCTCCACCG 467
Query 97677 CGCAGGCCCCCTCCAGGTAGAAGGCCATTTTTCCACCCTGTAGCGGAAGCCGATTATTTT 97736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 466 CGCAGGCCCCCTCCAGGTAGAAGGCCATTTTTCCACCCTGTAGGGGAAGCCGATTATTTT 407
Query 97737 GAATACCACCAAGAAGGTGGCCCAGATGGTGAGCCTGACATGCCCCCGGGAGCGATAGAG 97796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 406 GAATACCACCAAGAAGGTGGCCCAGATGGTGAGCCTGACGTGCCCCCGGGAGCGATAGAG 347
Query 97797 CAGGGCCCCGCAGATGACCCAGGAGAAGGCCCAAGCACTGGACCCCGGGGTCAGGGTGAT 97856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 CAGGGCCCCGCAGATGACCCAGGAGAAGGCCCAAGCACTGGACCCCGGGGTCAGGGTGAT 287
Query 97857 GGAGGCAGGCGCAAAAAAGGAGGGTGGTATGGAAAGCATCGTGGTGAAGGAGGTTCCAGC 97916
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 286 GGAGGCAGGCGCAAAAAAGGAGGGTGGTTTGGAAAGCATCGTGGTCAAGGAGGTTCCAAC 227
Query 97917 CAGAAATTTGAGAACATTGCAGAAGGTTTAAGACTTCTCCTGGCTAGGTGTCACGTAGAA 97976
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 226 CCGAAATTTGAGAACATTGCAGAAGGTTTAAGAGCTCTCCTGGCTAGGAGTCACGTAGAA 167
Query 97977 AGGACTACCGAGGATGGAAATTGGGTCGCCGGTGTGTTCGTATATGGAGGTAGTAAGACC 98036
||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 AGGACTACCGACGAAGGAACTTGGGTCGCCGGTGTGTTCGTATATGGAGGTAGTAAGACC 107
Query 98037 TCCCTTTACAACCTCAGGCGAGGAATTGGCCTTGCTATTCCACAATGTCGTCTTACACCA 98096
|||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 TCCCTTTACAACCTAAGGCGAGGAACTGCCCTTGCTATTCCACAATGTCGTCTTACACCA 47
Query 98097 TTGAGTCGTCTCCCCTTTGGAATGGCCCCTGGACCCGGCCCACAAC 98142
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 46 TTGAGTCGTCTCCCCTTTGGAATGGCCCCTGGACCAGGCCCACAAC 1
>seq94
Length=662
Score = 544 bits (602), Expect = 9e-150
Identities = 306/309 (99%), Gaps = 0/309 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 98414 GTGATGTAACTTGTTAGGAGACGCCCTCAATCGTATTAAAAGCCGTGTATTCCCCCGCAC 98473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 GTGATGTAACTTGTTAGGAGACGCCCTCAATCGTATTAAAAGCCGTGTATTCCCCCGCAC 280
Query 98474 TAAAGAATAAATCCCCAGTAGACATCATGCGTACTGTTGGTGTATTTCTGGCCACCTGTC 98533
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 281 TAAAGAATAAATCCCCAGTAGACATCATGCGTGCTGTTGGTGTATTTCTGGCCATCTGTC 340
Query 98534 TTGTCACCATTTTCGTCCTCCCAACATGGGGCAATTGGGCATACCCATGTTGTCACGTCA 98593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341 TTGTCACCATTTTCGTCCTCCCAACATGGGGCAATTGGGCATACCCATGTTGTCACGTCA 400
Query 98594 CTCAGCTCCGCGCTCAACACCTTCTCGCGTTGGAAAACATTAGCGACATTTACCTGGTGA 98653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401 CTCAGCTCCGCGCTCAACACCTTCTCGCGTTGGAAAACATTAGCGACATTTACCTGGTGA 460
Query 98654 GCAATCAGACATGCGACGGCTTTAGCCTGGCCTCCTTAAATTCACCTAAGAATGGGAGCA 98713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 461 GCAATCAGACATGCGACGGCTTTAGCCTGGCCTCCTTAAATTCACCTAAGAATGGGAGCA 520
Query 98714 ACCAGCTGG 98722
|||||| ||
Sbjct 521 ACCAGCAGG 529
Score = 279 bits (308), Expect = 6e-70
Identities = 160/164 (98%), Gaps = 0/164 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 98194 CTCATATATTTGCTGAGGGTTTGAAGGATGCGATTAAGGACCTTGTTTTGCCAAAGCCCG 98253
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1 CTCATATATTTGCTGAGGTTTTGAAGGATGCGATTAAGGACCTTGTTATGACAAAGCCCG 60
Query 98254 CTCCTACCTGCAATATCAAGGTGACTGTGTGCAGCTTTGACGATGGAGTAGATTTGCCTC 98313
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTCCTACCTGCAATATCAGGGTGACTGTGTGCAGCTTTGACGATGGAGTAGATTTGCCTC 120
Query 98314 CCTGGTTTCCACCTATGGTGGAAGGGGCTGCCGCGGAGGGTGAT 98357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCTGGTTTCCACCTATGGTGGAAGGGGCTGCCGCGGAGGGTGAT 164
Score = 199 bits (220), Expect = 4e-46
Identities = 113/115 (98%), Gaps = 0/115 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7342 GCAGGAAAAGGACAAGCAGCGAAAATTCACGCCCCCTTGGGAGGTGGCGGCATATGCAAA 7401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 GCAGGAAAAGGACAAGCAGCGAAAATTCACGCCCCCTTGGGAGGTGGCGGCATATGCAAA 584
Query 7402 GGATAGCACTCCCACTCTACTACTGGGTATTATATGCTGACTGTATATGCATTAG 7456
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 585 GGATAGCACTCCCACTCTACTACTGGGTATCATATGCTGACTGTATATGCATGAG 639
>seq68
Length=2200
Score = 497 bits (550), Expect = 1e-135
Identities = 284/290 (98%), Gaps = 0/290 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 96108 GATCCTCACAGGCCGCACCCAGCTCTTCTTCCGTTGCCCCAGTAGCATCTCTGTCTGGTG 96167
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1911 GATCCTCACAGGCCGCACCCAGCTTTTCTTCCGTTGCCCCAGTAGCATCTCTGTCTGGTG 1970
Query 96168 ACCTTGAAGAGGAAGAGGAGGGGTCCCGAGAATCCCCATCCCTACCGTCCAGCAAAAAGG 96227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 ACCTTGAAGAGGAAGAGGAGGGGTCCCGAGAATCCCCATCCCTACCGTCCAGCAAAAAGG 2030
Query 96228 GGGCCGATGAATTTGAGGCCTGGCTTGAGGCTCAGGATGCAAATTTTGAGGATGTTCAGC 96287
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 2031 GGGACGAGGAATTTGAGGCCTGGCTTGAGGCTCAGGACGCAAATCTTGAGGATGTTCAGC 2090
Query 96288 GAGAGTTTTCCGGGCTGCGAGTAATTGGTGATGAGGACGAGGATGGTTCGGAGGATGGGG 96347
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2091 GGGAGTTTTCCGGGCTGCGAGTAATTGGTGATGAGGACGAGGATGGTTCGGAGGATGGGG 2150
Query 96348 AATTTTCAGACCTGGATCTGTCTGACAGCGACCATGAAGGGGATGAGGGT 96397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151 AATTTTCAGACCTGGATCTGTCTGACAGCGACCATGAAGGGGATGAGGGT 2200
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 552715369845280
Made in 2017 by Kirill Kryukov This page is placed in public domain using CC0 |