Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Komagataella_20pastoris_20[genbank_20GCA_5F900016595.1_202016-02-08] 207 sequences; 9,358,152 total letters Query= NC_009334.1 Length=172764 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq76 1191 0.0 seq77 1063 0.0 seq98 872 0.0 seq94 544 9e-150 seq68 497 1e-135 >seq76 Length=698 Score = 1191 bits (1320), Expect = 0.0 Identities = 669/675 (99%), Gaps = 0/675 (0%) Strand=Plus/Plus Query 8014 ATCGCAACATTAGCCCACCGTGCTCTCAACGACCTCGTGAATATGAGGACCAACAACCCT 8073 || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 24 ATGGCAACATTAGCCCACCGTGCTCTCAGCGACCTCGTGAATATGAGGACCAACAACCCT 83 Query 8074 GTGCTTGGCGCTCAGGCGCAAGTGTGTGTAACTTGTCTTCCAGATCGCAGCAATCGCGCC 8133 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 84 GTGCTTGGCGCTCAGGCGCAAGTGTGTGTAATTTGTCCTCCAGATCGCAGCAATCGCGCC 143 Query 8134 CCTATCTTGGCCCGCCCACCTACTTATGCAGGTATTCCCCGGGGTGCCATTAGTGGTTTT 8193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 144 CCTATCTTGGCCCGCCCACCTACTTATGCAGGTATTCCCCGGGGTGCCATTAGTGGTTTT 203 Query 8194 GTGGGCAAGTGGTTTGACCGCAGTGGTTAGCGGGGTTACAATCAGCCAAGTTATTACACC 8253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 204 GTGGGCAAGTGGTTTGACCGCAGTGGTTAGCGGGGTTACAATCAGCCAAGTTATTACACC 263 Query 8254 CTTAGTTTACAGTCCAAAACCGCAGGGCGGCGTGTGGGGGCTGACGCGTGCCCCCACTCC 8313 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 264 CTTATTTTACAGTCCAAAACCGCAGGGCGGCGTGTGGGGGCTGACGCGTGCCCCCACTCC 323 Query 8314 ACAATTTCaaaaaaaaGAGTGGCCACTTGTCTTTGTTTATGGGCCCCATTGGCGTGGAGC 8373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 324 ACAATTTCAAAAAAAAGAGTGGCCACTTGTCTTTGTTTATGGGCCCCATTGGCGTGGAGC 383 Query 8374 CCCGTTTAATTTTCGGGGGTGTTAGAGACAACCAGTGGAGTCCGCTGCTGTCGGCGTCCA 8433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 384 CCCGTTTAATTTTCGGGGGTGTTAGAGACAACCAGTGGAGTCCGCTGCTGTCGGCGTCCA 443 Query 8434 CTCTCTTTCCCCTTGTTACAAATAGAGTGTAACAACATGGTTCACCTGTCTTGGTCCCTG 8493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 444 CTCTCTTTCCCCTTGTTACAAATAGAGTGTAACAACATGGTTCACCTGTCTTGGTCCCTG 503 Query 8494 CCTGGGACACATCTTAATAACCCCAGTATCATATTGCACTAGGATTATGTGTTGCCCATA 8553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 504 CCTGGGACACATCTTAATAACCCCAGTATCATATTGCACTAGGATTATGTGTTGCCCATA 563 Query 8554 GCCATAAATTCGTGTGAGATGGACATCCAGTCTTTACGGCTTGTCCCCACCCCATGGATT 8613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 564 GCCATAAATTCGTGTGAGATGGACATCCAGTCTTTACGGCTTGTCCCCACCCCATGGATT 623 Query 8614 TCTATTGTTAAAGATATTCAGAATGTTTCATTCCTACACTAGTATTTATTGCCCAAGGAG 8673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 624 TCTATTGTTAAAGATATTCAGAATGTTTCATTCCTACACTAGTATTTATTGCCCAAGGGG 683 Query 8674 TTTGTGAGGGTTATA 8688 ||||||||||||||| Sbjct 684 TTTGTGAGGGTTATA 698 >seq77 Length=746 Score = 1063 bits (1178), Expect = 0.0 Identities = 654/712 (92%), Gaps = 1/712 (0%) Strand=Plus/Plus Query 8793 TCACAACTCAGCAGTTATTCTATTAGCTAAACGAAGGAGAATGAAGAAGCAGGCGAAGAT 8852 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TCACAACTCAGCAGTTATTCTATTAGCTAAACGAAGGAGAATGAAGAAGCAGGCGAAGAT 60 Query 8853 TCAGGAGAGTTCACTGCCCGCTCCTTGATCTTCAGCCACTGCCCTTGTGACTAAAATGGT 8912 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCAGGAGAGTTCACTGCCCGCTCCTTGATCTTCAGCCACTGCCCTTGTGACTAAAATGGT 120 Query 8913 TCACTACCCTCGTGGAATCCTGATCCCATGTAAATAAAACCGTGACAGCTCATGGGGTGG 8972 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCACTACCCTCGTGGAATCCTGACCCCATGTAAATAAAACCGTGACAGCTCATGGGGTGG 180 Query 8973 GAGATATCGCTGTTCCTTAGGACCCTTTTACTAACCCTAATTCGATAGCATATGCTTCCC 9032 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GAGATATCGCTGTTCCTTAGGACCCTTTTACTAACCCTAATTCGATAGCATATGCTTCCC 240 Query 9033 GTTGGGTAACATGTGCTATTGAATTAGGGTTAGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 9092 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GTTGGGTAACATATGCTATTGAATTAGGGTTAGTCTGGATAGTATATACTACTACCCGGG 300 Query 9093 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAGGGGGCCTTATAAACACTCTTGCTAACGCC 9152 | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 301 AAGCATATGCTACCCGTTTAGGGTTAACAAGGGGGCCTTATAAACACTATTGCTAATGCC 360 Query 9153 CTCTTGAGGGTCCGCTTATCGGTAGCTACACAGGCCCCTCTGATTGACGTTGGTGTAGCC 9212 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CTCTTGAGGGTCCGCTTATCGGTAGCTACACAGGCCCCTCTGATTGACGTTGGTGTAGCC 420 Query 9213 TCCCATAGTCTTCCTGGGCCCCTGGGAGGTACATGTCCCCCAGCATTGGTGTAAGAGCTT 9272 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TCCCGTAGTCTTCCTGGGCCCCTGGGAGGTACATGTCCCCCAGCATTGGTGTAAGAGCTT 480 Query 9273 CAACCAAGAGTTACACATAAAGGCAATGTTGTGTTGCAGTCCACAGACTGCAAAGTCTGC 9332 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CAGCCAAGAGTTACACATAAAGGCAATGTTGTGTTGCAGTCCACAGACTGCAAAGTCTGC 540 Query 9333 TTCAGGATGAAAGCCACTCAGTGTTGGCAAATGTGCACATCCATTTATAAGGATGTCAAC 9392 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TCCAGGATGAAAGCCACTCAGTGTTGGCAAATGTGCACATCCATTTATAAGGATGTCAAC 600 Query 9393 TACAGTCAGAGAACCCCTTTGTGTTTGGTcccccccccGTGTCACATGTGGAACAGGGCC 9452 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TACAGTCAGAGAACCCCTTTGTGTTTGGT-CCCCCCCCGTGTCACATGTGGAACAGGGCC 659 Query 9453 CAGTTGGCAAGTTGTACCAACCAACTGAAGGGATTACATGCACTGCCCCGCG 9504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 CAGTTGGCAAGTTGTACCAACCAACTGAAGGGATTACATGCACTGCCCCGCG 711 >seq98 Length=535 Score = 872 bits (966), Expect = 0.0 Identities = 509/526 (97%), Gaps = 0/526 (0%) Strand=Plus/Minus Query 97617 CGTGGTGAAAAGAGGCCCAGGAGTCCCAGTAGTCAGTCATCATCATCCGGGTCTCCACCG 97676 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 526 CGTGGAGAAAAGAGGCCCAGGAGTCCCAGTAGTCAGTCATCATCATCCGGGTCTCCACCG 467 Query 97677 CGCAGGCCCCCTCCAGGTAGAAGGCCATTTTTCCACCCTGTAGCGGAAGCCGATTATTTT 97736 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 466 CGCAGGCCCCCTCCAGGTAGAAGGCCATTTTTCCACCCTGTAGGGGAAGCCGATTATTTT 407 Query 97737 GAATACCACCAAGAAGGTGGCCCAGATGGTGAGCCTGACATGCCCCCGGGAGCGATAGAG 97796 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 406 GAATACCACCAAGAAGGTGGCCCAGATGGTGAGCCTGACGTGCCCCCGGGAGCGATAGAG 347 Query 97797 CAGGGCCCCGCAGATGACCCAGGAGAAGGCCCAAGCACTGGACCCCGGGGTCAGGGTGAT 97856 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 346 CAGGGCCCCGCAGATGACCCAGGAGAAGGCCCAAGCACTGGACCCCGGGGTCAGGGTGAT 287 Query 97857 GGAGGCAGGCGCAAAAAAGGAGGGTGGTATGGAAAGCATCGTGGTGAAGGAGGTTCCAGC 97916 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 286 GGAGGCAGGCGCAAAAAAGGAGGGTGGTTTGGAAAGCATCGTGGTCAAGGAGGTTCCAAC 227 Query 97917 CAGAAATTTGAGAACATTGCAGAAGGTTTAAGACTTCTCCTGGCTAGGTGTCACGTAGAA 97976 | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 226 CCGAAATTTGAGAACATTGCAGAAGGTTTAAGAGCTCTCCTGGCTAGGAGTCACGTAGAA 167 Query 97977 AGGACTACCGAGGATGGAAATTGGGTCGCCGGTGTGTTCGTATATGGAGGTAGTAAGACC 98036 ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 166 AGGACTACCGACGAAGGAACTTGGGTCGCCGGTGTGTTCGTATATGGAGGTAGTAAGACC 107 Query 98037 TCCCTTTACAACCTCAGGCGAGGAATTGGCCTTGCTATTCCACAATGTCGTCTTACACCA 98096 |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 106 TCCCTTTACAACCTAAGGCGAGGAACTGCCCTTGCTATTCCACAATGTCGTCTTACACCA 47 Query 98097 TTGAGTCGTCTCCCCTTTGGAATGGCCCCTGGACCCGGCCCACAAC 98142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 46 TTGAGTCGTCTCCCCTTTGGAATGGCCCCTGGACCAGGCCCACAAC 1 >seq94 Length=662 Score = 544 bits (602), Expect = 9e-150 Identities = 306/309 (99%), Gaps = 0/309 (0%) Strand=Plus/Plus Query 98414 GTGATGTAACTTGTTAGGAGACGCCCTCAATCGTATTAAAAGCCGTGTATTCCCCCGCAC 98473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 221 GTGATGTAACTTGTTAGGAGACGCCCTCAATCGTATTAAAAGCCGTGTATTCCCCCGCAC 280 Query 98474 TAAAGAATAAATCCCCAGTAGACATCATGCGTACTGTTGGTGTATTTCTGGCCACCTGTC 98533 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 281 TAAAGAATAAATCCCCAGTAGACATCATGCGTGCTGTTGGTGTATTTCTGGCCATCTGTC 340 Query 98534 TTGTCACCATTTTCGTCCTCCCAACATGGGGCAATTGGGCATACCCATGTTGTCACGTCA 98593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 341 TTGTCACCATTTTCGTCCTCCCAACATGGGGCAATTGGGCATACCCATGTTGTCACGTCA 400 Query 98594 CTCAGCTCCGCGCTCAACACCTTCTCGCGTTGGAAAACATTAGCGACATTTACCTGGTGA 98653 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 401 CTCAGCTCCGCGCTCAACACCTTCTCGCGTTGGAAAACATTAGCGACATTTACCTGGTGA 460 Query 98654 GCAATCAGACATGCGACGGCTTTAGCCTGGCCTCCTTAAATTCACCTAAGAATGGGAGCA 98713 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 461 GCAATCAGACATGCGACGGCTTTAGCCTGGCCTCCTTAAATTCACCTAAGAATGGGAGCA 520 Query 98714 ACCAGCTGG 98722 |||||| || Sbjct 521 ACCAGCAGG 529 Score = 279 bits (308), Expect = 6e-70 Identities = 160/164 (98%), Gaps = 0/164 (0%) Strand=Plus/Plus Query 98194 CTCATATATTTGCTGAGGGTTTGAAGGATGCGATTAAGGACCTTGTTTTGCCAAAGCCCG 98253 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct 1 CTCATATATTTGCTGAGGTTTTGAAGGATGCGATTAAGGACCTTGTTATGACAAAGCCCG 60 Query 98254 CTCCTACCTGCAATATCAAGGTGACTGTGTGCAGCTTTGACGATGGAGTAGATTTGCCTC 98313 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTCCTACCTGCAATATCAGGGTGACTGTGTGCAGCTTTGACGATGGAGTAGATTTGCCTC 120 Query 98314 CCTGGTTTCCACCTATGGTGGAAGGGGCTGCCGCGGAGGGTGAT 98357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CCTGGTTTCCACCTATGGTGGAAGGGGCTGCCGCGGAGGGTGAT 164 Score = 199 bits (220), Expect = 4e-46 Identities = 113/115 (98%), Gaps = 0/115 (0%) Strand=Plus/Plus Query 7342 GCAGGAAAAGGACAAGCAGCGAAAATTCACGCCCCCTTGGGAGGTGGCGGCATATGCAAA 7401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 525 GCAGGAAAAGGACAAGCAGCGAAAATTCACGCCCCCTTGGGAGGTGGCGGCATATGCAAA 584 Query 7402 GGATAGCACTCCCACTCTACTACTGGGTATTATATGCTGACTGTATATGCATTAG 7456 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 585 GGATAGCACTCCCACTCTACTACTGGGTATCATATGCTGACTGTATATGCATGAG 639 >seq68 Length=2200 Score = 497 bits (550), Expect = 1e-135 Identities = 284/290 (98%), Gaps = 0/290 (0%) Strand=Plus/Plus Query 96108 GATCCTCACAGGCCGCACCCAGCTCTTCTTCCGTTGCCCCAGTAGCATCTCTGTCTGGTG 96167 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1911 GATCCTCACAGGCCGCACCCAGCTTTTCTTCCGTTGCCCCAGTAGCATCTCTGTCTGGTG 1970 Query 96168 ACCTTGAAGAGGAAGAGGAGGGGTCCCGAGAATCCCCATCCCTACCGTCCAGCAAAAAGG 96227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1971 ACCTTGAAGAGGAAGAGGAGGGGTCCCGAGAATCCCCATCCCTACCGTCCAGCAAAAAGG 2030 Query 96228 GGGCCGATGAATTTGAGGCCTGGCTTGAGGCTCAGGATGCAAATTTTGAGGATGTTCAGC 96287 ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct 2031 GGGACGAGGAATTTGAGGCCTGGCTTGAGGCTCAGGACGCAAATCTTGAGGATGTTCAGC 2090 Query 96288 GAGAGTTTTCCGGGCTGCGAGTAATTGGTGATGAGGACGAGGATGGTTCGGAGGATGGGG 96347 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2091 GGGAGTTTTCCGGGCTGCGAGTAATTGGTGATGAGGACGAGGATGGTTCGGAGGATGGGG 2150 Query 96348 AATTTTCAGACCTGGATCTGTCTGACAGCGACCATGAAGGGGATGAGGGT 96397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2151 AATTTTCAGACCTGGATCTGTCTGACAGCGACCATGAAGGGGATGAGGGT 2200 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 552715369845280