Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Drosophila_20biarmipes_20[refseq_20GCF_5F000233415.1_202013-03-04] 5,523 sequences; 169,378,599 total letters Query= NC_019489.1 Length=41726 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq1500 3530 0.0 seq1936 1519 0.0 seq1921 690 0.0 seq1912 297 5e-76 seq1837 109 1e-19 >seq1500 Length=2941 Score = 3530 bits (3914), Expect = 0.0 Identities = 2124/2235 (95%), Gaps = 0/2235 (0%) Strand=Plus/Minus Query 11968 GCTATGGACAAGAAGGTGGGCAAGTGACGCCGGTAGCTTTTATTAAAAGCATAATTGTTT 12027 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2941 GCTATGGACAAGAAGGTGGGCAAATGACGCCGGTAGCTTTTATTAAAAGCATAATTGTTG 2882 Query 12028 CAAATATTAATGAAATACCAGAACTAGCTGTGGAACATATCCATAGCTTTTTTATTCCAA 12087 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2881 CAAATATTAATGAAATACCAGAACTAGCTGTGGAACATATCCATAGCTTTTTTATTCCAA 2822 Query 12088 TTAACGATACTTCAACTGACGAGCCTATTGTAGTAATAAGCGGGTTACCTGAACGTAGTC 12147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| Sbjct 2821 CTAACGATACTTCAACTGACGAGCCTATTGTAGTAATCAGTGGGTTACCTGAGCGTAGTC 2762 Query 12148 AAGATTATGGCAATGGGATTCCATTCCAATCAACGAAGCAAGTCCAGATACAGCTCTATT 12207 ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2761 AAGATTATGGCAACGGGATTCCATTCCAATCGACGAAGCAAGCTCAGATACAGCTCTATT 2702 Query 12208 ATCCTAAAGATTACTTGGGCGATATGGATGCCATCGAATCCGGGTTAAAACAAGTGCTGT 12267 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct 2701 ATCCTAAAGATTACTTGGGCGATATGGATGCCATCGAAGCCGGGTTAAAACAAGTGCTAT 2642 Query 12268 TGACCAATGATATTCGTTGTTATAGCGATGCTGGCCAGACATTAACACCAGATTCAGAAA 12327 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2641 TGACCAATGATATTCGTTGTTATAGCGATGCCGGCCAGACATTAACACCAGATTCAGAAA 2582 Query 12328 GTATCACAAACACTTTGAAATTTAATTATATAAAGGAGGCCATTTAAATGGCAACATTAG 12387 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2581 GTATCACGAACACTTTGAAATTTAATTATATAAAGGAGGCCATTTAAATGGCAACGTTAG 2522 Query 12388 GTTTAAACATGTTATACACCGGTATTAAAGCCGATGACGGGTCAACGGTTATTGATGCAG 12447 ||||||| |||||||||||| | || || ||| || ||||| ||||||||||| | Sbjct 2521 GTTTAAATATGTTATACACCAGCATCAAGAATACTGATGGTTCAACAGTTATTGATGCGG 2462 Query 12448 ATAAGGGGTTGTCGGCCGCTGGGGTATACCCCATTGATACTAGCAAAGCAAACGGTAACT 12507 |||| || || || || | || || || | |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2461 ATAAAGGATTATCAGCGACGGGTGTTTATCAAATTGATACTAGCAAGGCAAACGGTAACT 2402 Query 12508 TGGGTACTAAGACTGCTAACATTACCGGGCTATCTGGAACGGTATCTAAAATTACTGGCA 12567 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 2401 TGGGTACTAAGACTGCTAACATTACCGGGCTATCTGGGACGGTATCTAAGATTACTGGCA 2342 Query 12568 ACAATGAAGTTGTGGATGTTTCTAATCCACCTTCGGCACCATCAGTCGCGATTGATTCGA 12627 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || | | Sbjct 2341 ACAATGAAGTTGTGGACGTTTCTAATCCACCTTCGGCACCGTCAGTGGCAATCGACGCAA 2282 Query 12628 ACGAAATCAACTTTATTGTTAAACAAAAGCTATTGGGACGGGTATCAGATGGCAAGGGCG 12687 | ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || || | Sbjct 2281 ATGAAATTAATTTCATCGTCAAGCAAAAACTATTAGGCCGGGTATCAGATGGTAAAGGTG 2222 Query 12688 GTTACTCTGATACTGACAAGCCGGTTGAAGCTGGTCTGATTATTGAATCTCGTTCTCCTA 12747 ||||| |||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || Sbjct 2221 GTTACATTGATTCTGACACACCCGTTGAAGCTGGCCTTATTATTGAGTCACGTTCACCAG 2162 Query 12748 TCTTTCGAACCGCGATTTATTATTGCTTTGGTCGTGGAATCTTTAATGAAGCTGGTCAGA 12807 | || || || |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| Sbjct 2161 TGACACGTACTGCTGTTTATTTCTGCTTTGGTCGTGGGATTTTTAACGAAGCTGGCCAGA 2102 Query 12808 ACATTCAAACAAACACTGATACGGCTGAAACTCGCGACGATGATAATTTGACATTTACCG 12867 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2101 ACATTCAAACAAACACGGATACAGCTGAAACTCGTGACGATGATAATTTGACATTTACCG 2042 Query 12868 CCTTGAACTATGATGGCTTCGGTGGCCAACCGTACAAGGTATATGCTGAGTCAGATCCTA 12927 |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 CCTTGAACTATGATAAATTCAGCGGCCAACCATACAAGGTATATGCTGAGTCAGATCCTA 1982 Query 12928 AATTTGATAAGCAAGCGATGTTTGACGCTGTATTTCCTGGACAAACGTTTTATAAAAACG 12987 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 AATTTGATAAGCAAGCGATGTTTGACGCTGTATTCCCTGGACAAACGTTTTATAAAAACG 1922 Query 12988 CGAGTAACGGCACCAGTGGTCAATAAAGCTACAACTGACACAGGCTCACAGACTAGTAAA 13047 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 CGAGTAACGGCACCAGTGGTCAATAAAGCTACAACTGACACAGGCTCACAGACTAGTAAA 1862 Query 13048 ACTGATAGTGACTCATCTGCGCCAACCAGTAATAAATGATAATTATGGTCGCCTAAAATA 13107 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1861 ACTGATAGTGACTCATCTGCGCCAACCAGTAATAAATGATAATTATGGTCGCCTAAAATA 1802 Query 13108 AATCCACAATACCGCTAGGGGCGGCTTTTAAACATGCTGAGAAGCGCATTCTAAGCACGG 13167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 AATCCACAATACCGCTAGGGGCGGCTTTTAAACATGCTGAGAAGCGCATTCTAAGCACGG 1742 Query 13168 GTTCACAATAAATGATAATAAACAATACACAAAGGGGCATATAAATAATGGCAAAATCAG 13227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 GTTCACAATAAATGATAATAAACAATACACAAAGGGGCATATAAATAATGGCAAAATCAG 1682 Query 13228 TTAAATTTGATGGCAAGAAAATTGGGACGGGCACGCAGTATACGTTGATTGATAGTGGTC 13287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 TTAAATTTGATGGCAAGAAAATTGGGACGGGCACGCAGTATACGTTGATTGATAGTGGTC 1622 Query 13288 AAAATGTTGAAAAAATGGCCGAAGCATATAAGAAGTTCATCAAGACTACTGAAGAAACTG 13347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 AAAATGTTGAAAAAATGGCCGAAGCATATAAGAAGTTCATCAAGACTACTGAAGAAACTG 1562 Query 13348 AGGATAGTATTACAGGTGTAGTCGAATTAACACCTAAGCTTGCAAAGGTTGTGGCTGAAA 13407 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 AGGACAGCATTACAGGTGTAGTCGAATTAACACCTAAGCTTGCAAAGGTTGTGGCTGAAA 1502 Query 13408 CGACCTGTGATTTATTGGAACTAAATGCTTCGCAAAAGAAACGTGTCATGTCCATGGAAT 13467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 CGACCTGTGATTTATTGGAACTAAATGCTTCGCAAAAGAAACGTGTCATGTCCATGGAAT 1442 Query 13468 TTTCGGTTAGCGACGAATACGACTTCTTTAATGACTGTTTAAAACAATTCTTGGGAGTAG 13527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 TTTCGGTTAGCGACGAATACGACTTCTTTAATGACTGTTTAAAACAATTCTTGGGAGTAG 1382 Query 13528 AATTACCATCTGTAGGCAACAGCAGCGATCAGGAAGAGGAAGAAGACCCAAAATTGCCAA 13587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 AATTACCATCTGTAGGCAACAGCAGCGATCAGGAAGAGGAAGAAGACCCAAAATTGCCAA 1322 Query 13588 AGCCAGAATGATTTGGCAACTTGATAATTTTATTCAGGATATTGATTACATCGCTAATCA 13647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1321 AGCCAGAATGATTTGGCAACTTGATAATTTTATTCAGGATATCGATTACATCGCTAATCA 1262 Query 13648 ATTGATTTCACAAGGCATATTGCCTAGTGACTTTTATCAAAGCTCATTTAGTGAAATGCA 13707 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 ATTGATTTCACAAGGCATATTGCCTAGTGACTTTTATCAAAGCTCATTTAGTGAAATGCA 1202 Query 13708 AACAGCATTGAATGCCAAGTCACGTAAAGACCGTGTTCAAGATCCGCTCGAATTAGCACG 13767 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 AACAGCATTGAATGCCAAGTCACGTAAAGACCGTGTTCAAGATCCGCTCGAATTAGCACG 1142 Query 13768 TCAAATCGGTGCGTTGTAAAGGAGGCAAAGTATGGCAACAGAGAAAATTCAAGGCTACGA 13827 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 TCAAATCGGTGCGTTGTAAAGGAGGCAAAGTATGGCAACAGAGAAAATTCAAGGCTACGA 1082 Query 13828 ATTCGCAATTAACATGGACGATGGTGGCATGACTCGCACGTTGCGAGAAATAAAGAATGA 13887 |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 ATTCGCCATTAACATGGACGATGGTGGCATGACTCACACGTTGCGAGAAATAAAGAATGA 1022 Query 13888 AGCAAAATTACTAAAATCTGGTATGCAAGCTAACTTTGCTGAAATCCGTTCGGGTGAAGG 13947 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 AGCAAAATTACTAAAATCTGGTATGCAAGCTAACTTTGCTGAAATCCGTTCGGGTGAAGG 962 Query 13948 TATTATGGCGGCTTATGCGGGTAAAGTCAAAGATGCTGGCCGAGCTATTGAAGCACAACG 14007 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TATTATGGCGGCTTATGCGGGTAAAGTCAAAGATGCTGGCCGAGCTATTGAAGCACAACG 902 Query 14008 ATTAGTAATTGAGCGTCTCAAAAGCGAGCAAAACGGATTAGACCAAACCACTCAAAAAGG 14067 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 ATTAGTAATTGAGCGTCTCAAAAGCGAGCAAAACGGATTAGACCAAACCACTCAAAAAGG 842 Query 14068 CCGAGAAGCTTATGTTAAATATGAAAATCAGATTAACGCTACCAAGCGCTCAATCGCCAG 14127 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 841 CCGAGAAGCTTATGTTAAATATGAAAATCAGATTAACACTGCCAAGCGCTCAATCGCCAG 782 Query 14128 TTTAGAGGGGCAACAAGAACGAGCACAGAAGTCACTTGATCTGCAAAAAAGTGGTGTCTT 14187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TTTAGAGGGGCAACAAGAACGAGCACAGAAGTCACTTGATCTGCAAAAAAGTGGTGTCTT 722 Query 14188 ACAATTAAAGGACGC 14202 ||||||||| || || Sbjct 721 ACAATTAAAAGAGGC 707 Score = 810 bits (898), Expect = 0.0 Identities = 583/665 (88%), Gaps = 8/665 (1%) Strand=Plus/Minus Query 14564 AAGGCCGAAGGAAATGAGTTGGAAGCAAATAAGGCTAAATCTAATGGCTTGCGAGAGGCC 14623 || ||||| || | ||||| ||||| || ||| ||| ||| || || | || | Sbjct 660 AAAGCCGAGGGCCACGAGTTTGAAGCCAACAAGT-TAAGGCTANCGGGTTACATCAGTCT 602 Query 14624 TATGATAACCTTAATAAACAATTAAAAGCAGAAAGCGAAG-AG-CTCAATAGAATTAAAT 14681 ||| || | ||||| || ||| || | || || || ||| || || |||| ||| Sbjct 601 TATAATGAGCTTAACAAGCAACTAGAGGCTGA--GCAAAGCAGACTGAATAAGATTGCGA 544 Query 14682 CGGTCAGTGGCGAAAGCTCAAATGCATATAAGCAACAATCTATTCGAGTGAACGAATTAG 14741 | ||||| | || || || | | || ||||| ||| | ||||||||||||| Sbjct 543 GTGCTAGTGGTAACAGTTCTAAAGAGTTCAAAGAACAACAGATTAGGGTGAACGAATTAG 484 Query 14742 GCACTAAAATTGCCCAAACTCGGACTAAGATGAAAGAGCTTGATGAGCAATTAAGCAAAA 14801 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 483 GCACTAAAATTGCCCAAACTCGGGTTAAGATGAAAGAGCTTGATGAGCAATTAAGCAAAA 424 Query 14802 AGCCACAGTCAGGATTAACGTCAGTCATTAGCCAGCTAAATAGAGTAAACGAGCACGCAG 14861 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 423 AGCCACAGTCAGGATTAACGTCAGTCATTAGCCAGCTAAATAGAGTAAACGAGCACGCAG 364 Query 14862 ATAAGGCCAATCATTTATTTGGCAAAATTCTGGGTGCTCATTTAGTTGCCAATGGTATTA 14921 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 363 ATAAGGCCAATCATTTATTTGGCAAAATTCTGGGTGCTCATTTAGTTGCCAATGGTATTA 304 Query 14922 CGAGCGCTTTTCAATCAATTACTTCACATATTCACGAAGCTATTAGCGCTGGTATGGAAT 14981 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 CGAGCGCTTTTCAATCAATTACTTCACATATTCACGAAGCTATTAGCGCTGGTATGGAAT 244 Query 14982 ATGAAAAAGAGCAGCAGAAGATGGTGGCCACTTGGTTGACTTTAACTGGCACTGTTGGCA 15041 |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 243 ATGAAAAAGAGCAGCAAAAGATGACGGCCACCTGGTTGACTTTAACTGGTACGGTTGGCA 184 Query 15042 AATCTAACGCAATGGTTAAAACAATCAACGACTTATCTGTTAAGACCGGTCAAGCCGTAG 15101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| Sbjct 183 AATCTAACGCAATGGTTAAAACAATCAACGACTTGTCTGTTCAGACTGGTCAAGCTGTAG 124 Query 15102 ATGTTGTAAATGAATTAGAGCAAGGTTTTTATCACT-TACATTCCAATAAAAAAGAATCA 15160 ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct 123 ATGTTGTTAATGAACTAGAGCAAGGTTTTTATCACTCTACATTCCA--TAAAAAGAATCA 66 Query 15161 GATGAACTAACCAAATCCATGCTGAACATGGCTGACGCTGTTGGTTTAGATAGCCAACAA 15220 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 65 GATGAACTAACCAAATCCATGCTGAACATGTCTGACGCTGTTGGTTTAGATAGCCAACAA 6 Query 15221 ATTCA 15225 ||||| Sbjct 5 ATTCA 1 >seq1936 Length=1051 Score = 1519 bits (1684), Expect = 0.0 Identities = 969/1052 (92%), Gaps = 1/1052 (0%) Strand=Plus/Plus Query 6500 TCGCAGGATAATCTGGACGAAACTTATAAGCCTGATATGTGGGTTAAAAGTAATCCCTTG 6559 |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TCGCAGGACAATCTGGATGAAACTTATAAGCCCGATATGTGGGTTAAAAGTAATCCCTTA 60 Query 6560 CTAGATTTACCGAGCCAACGAGAAGTGTTGCTGAACGGCTTGACAGATAAGCGCGATTCT 6619 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTAGATTTACCGAGCCAACGAGAAGTGTTACTGAACGGCTTGACAGATAAGCGCGATTCT 120 Query 6620 GACGCTTTGTCGGGTACACTCAACGATTTCCAAAATAAGAACCTTAACTTGTGGCTAGAA 6679 ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GACGCCTTGTCGGGCACACTCAACGATTTTCAAAACAAAAACCTTAACTTGTGGCTAGAA 180 Query 6680 CAATCGGTCGACAGCTTCTTAAAACTGCCTGACGTTGAAAAAGCCATCGTGCCATCATTT 6739 |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| Sbjct 181 CAATCGACCGACAGCTTCTTGAAACTGCCTGACGTTGAGCGAGCTATTATATCATCATTT 240 Query 6740 AGTTTTGACGATCGGCAAGTTTATATTGGTTTTGACTACTCAATGTTTAGTGATAACACG 6799 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 241 AGTTTTGATGATCGGCAAGTTTATATTGGCTTTGATTACTCGATGTTTAGTGATAACACA 300 Query 6800 GCGCTAGCGTTTGTATTCCCTTATCGCGATAATAATGACAAACCACGATGGTTTATTTAT 6859 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GCGCTAGCGTTTGTATTTCCTTATCGTGATAATAATGATAAACCACGATGGTTTATTTAT 360 Query 6860 CAGCATAGCTTTATTCCCTGGCAGAAAGCTGGTTCGATTGAAGCTAAAGAAAAACAAGAC 6919 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 361 CAGCATAGCTTTATTCCCTGGCAGAAAGCCGGTTCAATTGAGGCTAAAGAAAAGCAAGAC 420 Query 6920 GGTATTAATTATCGGGACTTAGCTAAAAAGGGATTTTGTACAATTAGTAGCCATCCGCAA 6979 |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 421 GGTATTAACTATCGGGACTTAGCTCAAAAGGGATTTTGTACAATTAGTAGCCATCCTCAA 480 Query 6980 GGACTGATTAATGACGAGCAGGTTTATCAGTGGTTACTTAACTTTGTTGAACGGCATCGA 7039 ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 481 GGACTAATCAATGACGAGCAAGTTTATCAGTGGTTACTTAACTTTGTTGAGCGGCATCGA 540 Query 7040 CTGGAAGTTGTTTTCTTTGGCTATGACGCGTGGGGGCTAACACCTACAATCAAACAATTG 7099 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct 541 CTGGAAGTTGTTTTCTTTGGTTATGACGCGTGGGGGCTAACGCCTACAATCAAGCAGCTA 600 Query 7100 GATTTGAATTCAGGCTGGCCATTGCAAGCCATTCGGCAACGGACTAGTGAATTGAAGGAT 7159 ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 601 GATTTAAATTCCGGTTGGCCATTGCAAGCCATTCGGCAGCGAACTAGTGAATTGAAGGAT 660 Query 7160 CCAACTAAGTTTTTGCAGACGATTTTTGTTGAAGGGTCAGTTGACCGATTCGATGATCGA 7219 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||| Sbjct 661 CCAACTAAGTTTTTGCAGACGATGTTTGTTGAAGGCTCGGTAGACCGCTTGGATGATCGA 720 Query 7220 ATTATGGAAAAGGCATTACTAAATGCTGAAATTTATGAAGACAAAATTGGTATTCAAGTC 7279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATTATGGAAAAGGCATTACTAAATGCTGAAATTTATGAAGACAAAATTGGTATTCAAGTC 780 Query 7280 GATAAGGCTAAGGCCACGCTGAAAATTGATGTAGTTGATGCGCTAATTGACGCCTTATTC 7339 ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||| Sbjct 781 GATAAAGCTAAGGCCACATTGAAGATTGATGTGGTAGATGCGTTAATTGATGCCTTATTT 840 Query 7340 CAAGCCATGTATCACTTTGAAGACTTTTCAGATGTAAACAATCCTGATAAACAGGTTGAA 7399 || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || Sbjct 841 CAGGCTATGTATCACTTTGAAGACTTTTCAGACGTGAACAATCCTGATAAACAGGTCGAG 900 Query 7400 CGTATGAACGAAAAACAAGTTCTAGAATGGTTTAATAACCCGGAGTCGGGATTGCTAGGA 7459 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 901 CGTATGAACGAAAAACAAGTTCTTGAATGGTTTAATAACCCGGAGTCAGGATTGCTAGGA 960 Query 7460 GATGATGTTAATGATTTTTAAACAATTTTTTGCAACTATCTGGCATTACTTTGATGTGCT 7519 |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 961 GATGATATTGATGATTTTTAAACAA-TTTTTGCAACTATCTGGCATTATTTTGATGTACT 1019 Query 7520 GTGCTTTATTCTAAGTATGATTGCTGGGGTAT 7551 ||| || |||||| |||||||||| ||||||| Sbjct 1020 GTGTTTCATTCTAGGTATGATTGCCGGGGTAT 1051 >seq1921 Length=1143 Score = 690 bits (764), Expect = 0.0 Identities = 495/566 (87%), Gaps = 9/566 (2%) Strand=Plus/Plus Query 26208 GTTAAGTTAAAAGTATTAAATACTCTGATTGATAGCCTGACTGCTTTAAAGCCAGTTACC 26267 ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GTTAAATTAAAGGTGTTAAACACGCTGATTGATAGTCTGACTGCTTTAAAGCCAGTTACC 60 Query 26268 ACGACTNNNNNNNNNNNNNNNNCACAGGAGGCTTAAATTATGAATATCGATGCACAGGCC 26327 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 61 ACGACTACGACAACCACCA---CACAGGAGGATTAAATTATGAATATCGATACACAGGCC 117 Query 26328 TTAATTAACAAGATGACGAGTAACTATGCCCAAGCAATTGCCGTTAAAGATCAGCAATTA 26387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 118 TTAATTAACAAGATGACGAGTAACTATGCCCAAGCAATTGCCGTTAAAGATCAGCAATTA 177 Query 26388 GCGATGGCACAAGTTCAAATTGACCAGCTCAATGCCAAGTTGGCCGAGAAGGAGGCACCT 26447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 178 GCGATGGCACAAGTTCAAATTGACCAGCTCAATGCCAAGTTGGCTGAGAAGGAGGCACCT 237 Query 26448 AAAGATGG-CGAAGACGCTTAGTTTTACCGATACTTCACCACAAACGGTTAAAATTGGTG 26506 ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct 238 -AAGATGGACGAA-ACGCTTAGTTTTACCGATACTTCACCACAAACGGTT-AAATTGGCG 294 Query 26507 ATACCACCACTAGCTTTACGTTAATTTGTGGCAATGATAATGTGGCAACGAACTTAACTA 26566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct 295 ATACCACCACTAGCTTTACGTTAATTTGTGGCAATGATAATGTGGCCACTGACTTAACTA 354 Query 26567 ATGCCACGTCAATTACCGTTAAATTAGGCAATACTAGTGGCTATCTTAAATCGGCCAAAG 26626 ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 355 ATGCCACTTCAATTACCGTTAAACTGGGCAATACTAGTGGCTATCTTAAATCGGCCACAG 414 Query 26627 TTGACCCAGCTAGTTTAACCGACCCCACGACTGGTCAAGTTACCGTTAACTTTAA-TGCT 26685 |||||||| |||||||||| || || || ||||| | || | | || |||||| || Sbjct 415 TTGACCCAACTAGTTTAACGGATCCAACAACTGG-CCAGATTGTGCTAGCTTTAACAGCG 473 Query 26686 GACTTGATGACTAGTTTAACCGCTGGTAGCTATGCCATTGAAGTATGGGTGGTTGATAGT 26745 || || ||||| | ||||| || || ||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 474 GATTTAATGACCGGCTTAACAGCGGGAGATTATCAGCTAGAAGTATGGGTGGTTGATAGT 533 Query 26746 ACCGGAACGTCAATCTACCCTAGTGA 26771 |||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 534 ACCGGAACGTCAATTTACCCGAGTGA 559 Score = 655 bits (726), Expect = 0.0 Identities = 465/533 (87%), Gaps = 0/533 (0%) Strand=Plus/Plus Query 27334 TGAATAGGAGGTAGACAATTGAATAAGCACAAGTTAAAGGCACTCATCTTAACGGTGGGC 27393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 593 TGAATAGGAGGTAGACAATTGAATAAGCACAAGTTAAAGGCACTCATCTTAACGGTGGGC 652 Query 27394 GCCATTTTTATGGCCTTTTTAATGGTCAATGTTACCAGTCAGGCGTCAACTAGTCGTGAT 27453 |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| Sbjct 653 GCCATTTTTATGGCCTTTTTAATGGTCAATTTAAACAGTCAGGCTTCAACTAGTCGTGAC 712 Query 27454 CAAGGGCCGGATTGGTCTAAGTATAACGGTAATAGTGGGACATTCGGCTATAGTTCCGAT 27513 |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 713 CAAGGGGTCGACTGGTCTAAGTATAACAGTAATAGTGGGACATTCGGCTATAGCACCGAT 772 Query 27514 AAGTTTGTATTCTCACAGGCCGGTGGTTTCTATGGTGGGACTAATATCCCTCAGACCACG 27573 ||||| || |||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| Sbjct 773 AAGTTCGTGCTCTCACAGGCGGGCGGCTTTTATGGCGGTACTAATATCCCGCAGACCACT 832 Query 27574 TATAACAGCCAAGTCAAATCAGCTCAACAGGCTGGTAAACGGGTGCACACCTATTTATGG 27633 ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 833 TATGCTAGCCAAGTTAAATCGGCTCAACAGGCTGGTAAACGGGTGCACACCTATTTATGG 892 Query 27634 GACGGTGTTGGTGGCAATATGACCAATGCCAAGGCTATGATGGCCTATTACTTGCCACGT 27693 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 893 GACGGGGTTGGTGGCAATATGACCAATGCCAAGGCGATGATGGCCTATTACTTGCCACGT 952 Query 27694 GTTAGGACGCCCAAGGGCAGCATTGTGGCGTTGGACTATGAGGACGGTGCTTCTAATAGC 27753 |||| ||| |||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 953 GTTAAGACACCCAAGGGTAGTATTGTCGCACTAGACTATGAGGACGGTGCTTCTAATAGT 1012 Query 27754 GTGACAGCCAATACTAATGTCATTCTAGCTCAGATGAAGCTGATTAAAGACGCTGGCTAT 27813 |||||||| || |||||||||||| |||||| | ||| | ||||| | |||||| Sbjct 1013 GTGACAGCTAACACTAATGTCATTAAAGCTCAATTTAAGTTAATTAAGGCGTACGGCTAT 1072 Query 27814 ACGCCGATGCTGTATTCCGGTAAAGCTTACCTCAATTATCATGTTAATGTGAG 27866 || || ||||| ||| ||||| || || || | | |||||||||||||| Sbjct 1073 ACCCCAATGCTTTATGGTGGTAAGGCCTATCTAAGTGCACATGTTAATGTGAG 1125 >seq1912 Length=1433 Score = 297 bits (328), Expect = 5e-76 Identities = 170/174 (98%), Gaps = 0/174 (0%) Strand=Plus/Minus Query 3755 GTGCTAAATTGGTAGTATGCCAAATGTGATTGACGTGCATGAAGTAATCCTCCAAATTAC 3814 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1298 GTGCTAAATTGGTAGTATGCCAAATGTGATTGACGTGCATGAAGTAATCCTCCAAATTAC 1239 Query 3815 AGACTGGTAATCGCTGTGGGCTAATTGGCAAGCCACAATGGGATGTAGGTTCGAGGCCTA 3874 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1238 AGACTGGTAATCGCCGTGGGCTAATTGGTAAGCCACAATGGGATGTAGGTTCGAGTCCTA 1179 Query 3875 CCGGCGATATAGTTATGTGATACAGCACCCAATGGGAGTTGACCGCATAACGTG 3928 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1178 CCGGCGATATTGTTATGTGATACAGCACCCAATGGGAGTTGACCGCATAACGTG 1125 Score = 145 bits (160), Expect = 2e-30 Identities = 91/97 (94%), Gaps = 1/97 (1%) Strand=Plus/Minus Query 4102 ATGTAGGGTGCAAATCCCTACCAAGCACATTAAACGCGTCCACGGCTCCAAAACGGACAA 4161 ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| Sbjct 1023 ATGTAGGGTGCAAATCCCTACCAAGCACATTGAAAGCA-CCGCGGCTCCAAAACGGACAA 965 Query 4162 TCTCCAAACTAACTCTCGCTTATTGGCGGGAGTTTTT 4198 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 964 TCTCCAAACTAGCTCTCGCTTATTGGCGGGAGTTTTT 928 >seq1837 Length=1243 Score = 109 bits (120), Expect = 1e-19 Identities = 65/68 (96%), Gaps = 0/68 (0%) Strand=Plus/Minus Query 34627 CTGGTCTTATGTAAGTATAATACCGCTAAATATGTAGAACGTGTGTTCTTTTTAACGCAT 34686 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1016 CTTGTCTTATGTAAGTATAATACCGCTAAATATGTAGAACGTGTGTTCTTTTTAACACAT 957 Query 34687 AAGCAAAG 34694 ||||| || Sbjct 956 AAGCATAG 949 Score = 93.3 bits (102), Expect = 1e-14 Identities = 53/54 (98%), Gaps = 0/54 (0%) Strand=Plus/Minus Query 35085 ATTTTGTTCTCTCAGTTGATTGTCAGCGTAGTTGTAAACATTTTGCTGACGATC 35138 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 563 ATTTTGTTCTTTCAGTTGATTGTCAGCGTAGTTGTAAACATTTTGCTGACGATC 510 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 133392850772688