Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Drosophila_20serrata_20[refseq_20GCF_5F002093755.1_202017-04-14]
1,356 sequences; 198,035,861 total letters
Query= NC_023426.1
Length=245717
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq1137 87.8 3e-12
>seq1137
Length=1059850
Score = 87.8 bits (96), Expect = 3e-12
Identities = 220/315 (70%), Gaps = 27/315 (9%)
Strand=Plus/Minus
Query 181218 ATTATATTTAAATATTTTATTAA-----AATTATCAATAAATCCTT-GTGATAATGAA-- 181269
||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| | | || | || || ||
Sbjct 839491 ATTATTATTAATTATTTTATTAATTATTAATTATTAATTATTAATTATTAATTATTAATT 839432
Query 181270 GTGAATGattgataatctaattgtatattgtt-attattaatatttaataatt-ctaatt 181327
| ||| ||| || || ||||| | |||| || ||||||||| ||||| ||| | |||
Sbjct 839431 ATTAATTATTAATTAT-TAATTAT-TATTATTAATTATTAATTATTAATTATTAATTATT 839374
Query 181328 tattttccattattaatttttcattcagcatctagaaattatgcatca-tatttattatt 181386
||| | |||||||||| || ||| | | || |||||| || | || ||||||||
Sbjct 839373 AATTATTAATTATTAATTATTAATT-ATTAATTATTAATTATTAATTATTAATTATTATT 839315
Query 181387 atccaatat--attataactgtctaattattaagttgttatccattaattaCTAATAATA 181444
|| | ||| ||||| | | |||||||||| || ||| |||||||| |||| ||
Sbjct 839314 ATTAATTATTAATTATTAATTATTAATTATTAA-TTATTAATTATTAATTATTAAT--TA 839258
Query 181445 TTCTTTTTTGaatatttatatgattactatagattatcatgtatattaatgtgttaataa 181504
|| || || | |||| || | | | ||| ||||| || ||||||| | ||||| |
Sbjct 839257 TTAATTATTAATTATTAAT-TATTAATTATTAATTATTAT---TATTAAT-TATTAATTA 839203
Query 181505 t--atta-taattat 181516
| |||| |||||||
Sbjct 839202 TTAATTATTAATTAT 839188
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 786153074479520
Made in 2017 by Kirill Kryukov This page is placed in public domain using CC0 |