Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Schistosoma_20haematobium_20[refseq_20GCF_5F000699445.1_202014-06-
09] 29,834 sequences; 375,894,156 total letters
Query= NC_005880.2
Length=148317
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq3308 940 0.0
seq8440 809 0.0
seq2836 596 1e-165
>seq3308
Length=2910
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Identities = 569/610 (93%), Gaps = 12/610 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 146859 CCTAACATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTTGAT 146918
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Sbjct 1766 CCTAGCATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGAAAAAATAAAAAAAGAAAAGGATTTGAT 1707
Query 146919 TATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGGA 146978
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Sbjct 1706 TATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGGA 1647
Query 146979 CGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACGT 147038
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Sbjct 1646 CGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACAT 1587
Query 147039 AGTAAACTTCTTTGATAGTTACGAGCAGGACATTGAAGCGGTCATCACTGAATACATTGA 147098
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Sbjct 1586 AGTAAACTTCTTTGATAGATACGAGCAGGACATTGAAGCCGTCATCACTGAATACATTGA 1527
Query 147099 AGAGGTTACAGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCGA 147158
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 AGAGGTTACGGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCGA 1467
Query 147159 GAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACCT 147218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 GAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACCT 1407
Query 147219 AGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACCG 147278
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 AGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACCA 1347
Query 147279 GGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACTGACAA 147338
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1346 GGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACGGACAA 1287
Query 147339 GGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCTCAAAGAATGGCACTATAGAAAGC 147398
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1286 GGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCGCAAAGAATGGCACTATAGGAAGC 1227
Query 147399 ACA------------CAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAGGAGATGT 147446
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 ACACAGACACACACACAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAGGAGATGT 1167
Query 147447 TGAAGATGAA 147456
||||||||||
Sbjct 1166 TGAAGATGAA 1157
Score = 940 bits (1042), Expect = 0.0
Identities = 569/610 (93%), Gaps = 12/610 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 7028 CCTAACATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTTGAT 7087
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1766 CCTAGCATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGAAAAAATAAAAAAAGAAAAGGATTTGAT 1707
Query 7088 TATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGGA 7147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706 TATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGGA 1647
Query 7148 CGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACGT 7207
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1646 CGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACAT 1587
Query 7208 AGTAAACTTCTTTGATAGTTACGAGCAGGACATTGAAGCGGTCATCACTGAATACATTGA 7267
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1586 AGTAAACTTCTTTGATAGATACGAGCAGGACATTGAAGCCGTCATCACTGAATACATTGA 1527
Query 7268 AGAGGTTACAGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCGA 7327
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 AGAGGTTACGGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCGA 1467
Query 7328 GAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACCT 7387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 GAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACCT 1407
Query 7388 AGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACCG 7447
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 AGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACCA 1347
Query 7448 GGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACTGACAA 7507
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Sbjct 1346 GGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACGGACAA 1287
Query 7508 GGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCTCAAAGAATGGCACTATAGAAAGC 7567
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Sbjct 1286 GGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCGCAAAGAATGGCACTATAGGAAGC 1227
Query 7568 ACA------------CAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAGGAGATGT 7615
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 ACACAGACACACACACAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAGGAGATGT 1167
Query 7616 TGAAGATGAA 7625
||||||||||
Sbjct 1166 TGAAGATGAA 1157
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Identities = 470/529 (89%), Gaps = 0/529 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 147438 AGGAGATGTTGAAGATGAATACAAGACGGGTAAACAGAGCGTTAAACGAAGCAGTTAGAT 147497
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Sbjct 585 AGGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTCGAT 526
Query 147498 TATTAGATGAACAAATAGCAGATACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTAG 147557
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 525 TATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTCG 466
Query 147558 AGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGGTATTAGTTGATGTTATGAATGGTGATG 147617
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Sbjct 465 AGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTGATG 406
Query 147618 ATGAGTAATGAACATTAGAGAGGTTCACAATGTCGTTAAGAGTGCTAAGAGCAAACTCCT 147677
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 405 ATGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACTCCT 346
Query 147678 GCAGGAGCAGGCTCACCCAACGGATAACCTCATAGAGCAGTACATCAATGATGAGCTACA 147737
|||||| || | | | || ||||||| | ||||||| || ||||||||
Sbjct 345 GCAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCTACA 286
Query 147738 CAGACGCACACAGAGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAATACTACTTCATATAGTAA 147797
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 285 CAGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAA 226
Query 147798 TAGCCCATATGGTAGCTTAGAAGAGNNNNNNNNNNNTTATGACCTATCGTCATTATCTAC 147857
| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 225 TGGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATCTAC 166
Query 147858 TGGTGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTAC 147917
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 TGAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTAC 106
Query 147918 AATCTTTTAGTTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAG 147966
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 AATATTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAG 57
Score = 699 bits (774), Expect = 0.0
Identities = 470/529 (89%), Gaps = 0/529 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7607 AGGAGATGTTGAAGATGAATACAAGACGGGTAAACAGAGCGTTAAACGAAGCAGTTAGAT 7666
||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 585 AGGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTCGAT 526
Query 7667 TATTAGATGAACAAATAGCAGATACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTAG 7726
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 525 TATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTCG 466
Query 7727 AGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGGTATTAGTTGATGTTATGAATGGTGATG 7786
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 465 AGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTGATG 406
Query 7787 ATGAGTAATGAACATTAGAGAGGTTCACAATGTCGTTAAGAGTGCTAAGAGCAAACTCCT 7846
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 405 ATGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACTCCT 346
Query 7847 GCAGGAGCAGGCTCACCCAACGGATAACCTCATAGAGCAGTACATCAATGATGAGCTACA 7906
|||||| || | | | || ||||||| | ||||||| || ||||||||
Sbjct 345 GCAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCTACA 286
Query 7907 CAGACGCACACAGAGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAATACTACTTCATATAGTAA 7966
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 285 CAGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAA 226
Query 7967 TAGCCCATATGGTAGCTTAGAAGAGNNNNNNNNNNNTTATGACCTATCGTCATTATCTAC 8026
| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 225 TGGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATCTAC 166
Query 8027 TGGTGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTAC 8086
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 TGAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTAC 106
Query 8087 AATCTTTTAGTTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAG 8135
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 AATATTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAG 57
Score = 333 bits (368), Expect = 3e-86
Identities = 257/304 (85%), Gaps = 15/304 (5%)
Strand=Plus/Minus
Query 146509 TAAATAAAGGGCTTGACTTTCAAGCCCTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAA 146568
||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| |||||| | || | ||
Sbjct 2424 TAAATAAGGGG-TTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAA-------GATATTTAA 2373
Query 146569 GCACAACGACAAAATAAACTGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATA 146628
| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 AAAATAC----AAATAA---GAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATA 2320
Query 146629 ATGAAATCGTAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGTGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGT 146688
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2319 ATGAAATCGTAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGT 2260
Query 146689 ACATCGACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAAAGAAATACATGACCAGGAAGCGGTTG 146748
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||
Sbjct 2259 ACATCGACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTG 2200
Query 146749 TTATTACTTCAGACACTTTGCAATCACTCAAATTTGCGGACACTATGGAAGAACTAGAAG 146808
| | ||||| |||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2199 TGGTGACTTCTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAG 2140
Query 146809 AATA 146812
||||
Sbjct 2139 AATA 2136
Score = 333 bits (368), Expect = 3e-86
Identities = 257/304 (85%), Gaps = 15/304 (5%)
Strand=Plus/Minus
Query 6678 TAAATAAAGGGCTTGACTTTCAAGCCCTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAA 6737
||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| |||||| | || | ||
Sbjct 2424 TAAATAAGGGG-TTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAA-------GATATTTAA 2373
Query 6738 GCACAACGACAAAATAAACTGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATA 6797
| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 AAAATAC----AAATAA---GAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATA 2320
Query 6798 ATGAAATCGTAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGTGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGT 6857
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2319 ATGAAATCGTAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGT 2260
Query 6858 ACATCGACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAAAGAAATACATGACCAGGAAGCGGTTG 6917
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||
Sbjct 2259 ACATCGACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTG 2200
Query 6918 TTATTACTTCAGACACTTTGCAATCACTCAAATTTGCGGACACTATGGAAGAACTAGAAG 6977
| | ||||| |||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2199 TGGTGACTTCTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAG 2140
Query 6978 AATA 6981
||||
Sbjct 2139 AATA 2136
>seq8440
Length=882
Score = 809 bits (896), Expect = 0.0
Identities = 482/504 (96%), Gaps = 3/504 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 146115 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 146174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 823
Query 146175 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAACTAAAGCAGAAAACAAA 146234
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 822 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 763
Query 146235 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTATTATGACGGATATAGAAACGGTGAGCTTGAGGAA 146294
|||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||||
Sbjct 762 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 703
Query 146295 AAATATGCAATCGAAATTGATGGCAACAAATTAATTATGCGTCATTGGGGTACACAAACA 146354
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 702 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 643
Query 146355 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAAATTGTTTCATACTATGGTGAAAGCAATTCAGAC 146414
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 642 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 583
Query 146415 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 146474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 523
Query 146475 CCAAGCAAAGACTTGTTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTTCAAGCC 146534
||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 522 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 463
Query 146535 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 146594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 403
Query 146595 GAATTGATACAAATG---AAATTA 146615
|||||||| ||||| ||||||
Sbjct 402 GAATTGATGAAAATGTTCAAATTA 379
Score = 809 bits (896), Expect = 0.0
Identities = 482/504 (96%), Gaps = 3/504 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 6284 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 6343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 823
Query 6344 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAACTAAAGCAGAAAACAAA 6403
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 822 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 763
Query 6404 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTATTATGACGGATATAGAAACGGTGAGCTTGAGGAA 6463
|||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||||
Sbjct 762 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 703
Query 6464 AAATATGCAATCGAAATTGATGGCAACAAATTAATTATGCGTCATTGGGGTACACAAACA 6523
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 702 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 643
Query 6524 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAAATTGTTTCATACTATGGTGAAAGCAATTCAGAC 6583
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 642 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 583
Query 6584 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 6643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 523
Query 6644 CCAAGCAAAGACTTGTTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTTCAAGCC 6703
||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 522 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 463
Query 6704 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 6763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 403
Query 6764 GAATTGATACAAATG---AAATTA 6784
|||||||| ||||| ||||||
Sbjct 402 GAATTGATGAAAATGTTCAAATTA 379
>seq2836
Length=4769
Score = 596 bits (660), Expect = 1e-165
Identities = 406/471 (86%), Gaps = 2/471 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 142944 CAAAAATAAATACACTAGGA-TATTATTCCCAGTGTATTATATAAtttttttATAGAATA 143002
|||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1756 CAAAAAAAAATACACCAGGAATATTATTCCCAGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATA 1697
Query 143003 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 143062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 1637
Query 143063 AATCCGTTTTGTGTTTTATACTCTTTTATTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 143122
|||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 1636 AATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTAGTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTA 1577
Query 143123 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 143182
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1576 AATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 1517
Query 143183 TTTTTATCTGTTCCGCCATCTAAATCATCTGATatttgataatttttgaatataatttct 143242
||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1516 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 1457
Query 143243 tttgtttctaattcatttactaataattgtgattttgCATATTGTAATACATCTTCATTG 143302
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1456 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTGATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTG 1397
Query 143303 TCCCACATTGGaatatagtttattttcatttaaatcaaatccttttcttataatttttnn 143362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1396 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTC-TATAATTTTTTT 1338
Query 143363 anntaatatttGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACACTT 143413
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1337 ATATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACCCTT 1287
Score = 596 bits (660), Expect = 1e-165
Identities = 406/471 (86%), Gaps = 2/471 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3113 CAAAAATAAATACACTAGGA-TATTATTCCCAGTGTATTATATAAtttttttATAGAATA 3171
|||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1756 CAAAAAAAAATACACCAGGAATATTATTCCCAGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATA 1697
Query 3172 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 3231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 1637
Query 3232 AATCCGTTTTGTGTTTTATACTCTTTTATTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 3291
|||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 1636 AATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTAGTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTA 1577
Query 3292 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 3351
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Sbjct 1576 AATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 1517
Query 3352 TTTTTATCTGTTCCGCCATCTAAATCATCTGATatttgataatttttgaatataatttct 3411
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Sbjct 1516 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 1457
Query 3412 tttgtttctaattcatttactaataattgtgattttgCATATTGTAATACATCTTCATTG 3471
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Sbjct 1456 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTGATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTG 1397
Query 3472 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTTATAATTTTTNN 3531
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Sbjct 1396 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTC-TATAATTTTTTT 1338
Query 3532 ANNTAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACACTT 3582
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Sbjct 1337 ATATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACCCTT 1287
Score = 479 bits (530), Expect = 3e-130
Identities = 439/553 (79%), Gaps = 9/553 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 141538 AAAGGAGAGATTATAATGATAGAGATATACCTTAGTGAAAATTATGATAAGAATTTACTA 141597
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Sbjct 3478 AAAGGAGAGATTATAATGATAGAAATATATCTCAGTAAAAACTATGATAAGGATTTGCTC 3419
Query 141598 AAAGCAGAATTAAAATGGATTAAAGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATATTAAT 141657
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Sbjct 3418 AAAGCAGAATTGAAGTGGATTAAAGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAAT 3359
Query 141658 AGGAAACCTGGATTGGATGTTTATGTTAATCCCTATAGGTGTACTAAAGACGAAGTTGAA 141717
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Sbjct 3358 AGAAGCCCAGGATTAGATGTACATATTAGTCCTTTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAA 3299
Query 141718 GAATGGAGTACACTTCCTCCATTTGAAGATGATATACTTGTATTTATAGCGGAGACGTGG 141777
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Sbjct 3298 GAAATGAGCTTACATCCTCAGTTTGAAGATGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGG 3239
Query 141778 ATACATGAATATCTTAAGGGTGAATCAATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAGTATGTAAAG 141837
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Sbjct 3238 ATACATGAGTATCGTAATGGTAAATCAATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAG 3179
Query 141838 GAGATGTAACTAATGTTTAAGGTATATTATACAGTCTACCATAGAGGTAGTATGAAAACT 141897
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Sbjct 3178 GAGATGTAATTAATGGTAGAAACTTATTATACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACT 3119
Query 141898 ATTAAGGATAAGCTAGATAGAAGTAGTTTAATATACTTCTTGTATGATACTTGGTATAAA 141957
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Sbjct 3118 ATTAAGGATTACTTAAGTAGAAGTGATTTAATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAG 3059
Query 141958 GATATTAGTAACGTATTCCCTAATCACTATAATAAAGAGTTTGGGAGTAA---GAGTGAT 142014
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Sbjct 3058 GATATAAGTAATATATACCCAACAGATTATACTA---CGTATGAAACAAAATTCTGTATA 3002
Query 142015 GATATAGATATAGATAAACTTATTGAAGCGGTTAATGAGGAAGGTATATTACTTATCAAT 142074
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Sbjct 3001 GACATAGATGTAGTTAGACTAATTGAAGCGGTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATCAA- 2943
Query 142075 AGAGGTAATTATG 142087
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Sbjct 2942 --CCGTAATTATG 2932
Score = 479 bits (530), Expect = 3e-130
Identities = 439/553 (79%), Gaps = 9/553 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1707 AAAGGAGAGATTATAATGATAGAGATATACCTTAGTGAAAATTATGATAAGAATTTACTA 1766
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Sbjct 3478 AAAGGAGAGATTATAATGATAGAAATATATCTCAGTAAAAACTATGATAAGGATTTGCTC 3419
Query 1767 AAAGCAGAATTAAAATGGATTAAAGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATATTAAT 1826
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Sbjct 3418 AAAGCAGAATTGAAGTGGATTAAAGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAAT 3359
Query 1827 AGGAAACCTGGATTGGATGTTTATGTTAATCCCTATAGGTGTACTAAAGACGAAGTTGAA 1886
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Sbjct 3358 AGAAGCCCAGGATTAGATGTACATATTAGTCCTTTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAA 3299
Query 1887 GAATGGAGTACACTTCCTCCATTTGAAGATGATATACTTGTATTTATAGCGGAGACGTGG 1946
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Sbjct 3298 GAAATGAGCTTACATCCTCAGTTTGAAGATGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGG 3239
Query 1947 ATACATGAATATCTTAAGGGTGAATCAATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAGTATGTAAAG 2006
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Sbjct 3238 ATACATGAGTATCGTAATGGTAAATCAATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAG 3179
Query 2007 GAGATGTAACTAATGTTTAAGGTATATTATACAGTCTACCATAGAGGTAGTATGAAAACT 2066
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Sbjct 3178 GAGATGTAATTAATGGTAGAAACTTATTATACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACT 3119
Query 2067 ATTAAGGATAAGCTAGATAGAAGTAGTTTAATATACTTCTTGTATGATACTTGGTATAAA 2126
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Sbjct 3118 ATTAAGGATTACTTAAGTAGAAGTGATTTAATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAG 3059
Query 2127 GATATTAGTAACGTATTCCCTAATCACTATAATAAAGAGTTTGGGAGTAA---GAGTGAT 2183
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Sbjct 3058 GATATAAGTAATATATACCCAACAGATTATACTA---CGTATGAAACAAAATTCTGTATA 3002
Query 2184 GATATAGATATAGATAAACTTATTGAAGCGGTTAATGAGGAAGGTATATTACTTATCAAT 2243
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Sbjct 3001 GACATAGATGTAGTTAGACTAATTGAAGCGGTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATCAA- 2943
Query 2244 AGAGGTAATTATG 2256
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Sbjct 2942 --CCGTAATTATG 2932
Score = 381 bits (422), Expect = 6e-101
Identities = 291/347 (84%), Gaps = 6/347 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 143673 TGGAGTTGTGGCAAATGGACGGCTACAGATGTGCAGAACCTCCATTATATGAAAGCACAC 143732
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Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318
Query 143733 TAAACCACANNNNNNNNNNNNCGGCGTTAATTGTTTCTATTAATGGAAACTATGACACAG 143792
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Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258
Query 143793 TGCAGATGTTCCGCAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAAGCCAACCGGCTAGCA 143852
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Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198
Query 143853 TGTTAGTTAATGTGATTGACGATGTAATTATAATCGTATATGAAAATGTAGTGTACGGAG 143912
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Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138
Query 143913 TTCAAAACAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAAT---CCT 143969
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Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78
Query 143970 CAAGCATCTATAGTAATATAATAGGTGTAGGGGATAGCAACACACCT 144016
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Sbjct 77 TAAGA---TGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCT 34
Score = 381 bits (422), Expect = 6e-101
Identities = 291/347 (84%), Gaps = 6/347 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 3842 TGGAGTTGTGGCAAATGGACGGCTACAGATGTGCAGAACCTCCATTATATGAAAGCACAC 3901
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Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318
Query 3902 TAAACCACANNNNNNNNNNNNCGGCGTTAATTGTTTCTATTAATGGAAACTATGACACAG 3961
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Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258
Query 3962 TGCAGATGTTCCGCAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAAGCCAACCGGCTAGCA 4021
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Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198
Query 4022 TGTTAGTTAATGTGATTGACGATGTAATTATAATCGTATATGAAAATGTAGTGTACGGAG 4081
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Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138
Query 4082 TTCAAAACAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAAT---CCT 4138
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Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78
Query 4139 CAAGCATCTATAGTAATATAATAGGTGTAGGGGATAGCAACACACCT 4185
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Sbjct 77 TAAGA---TGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCT 34
Score = 295 bits (326), Expect = 6e-75
Identities = 197/217 (91%), Gaps = 3/217 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 143425 GTATAGTTATTCAGAAGTCAATACTTTTGAGTAACttttttt-aaattcttttttcttct 143483
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Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890
Query 143484 atataatagtagtttttagccctaaaaatg--tttttaaaaGAATTTGCATTTTCTTATT 143541
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Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830
Query 143542 GACTTTATTATCATATGGTAGTAATATAAAGGTACAGCAAGGGAACAGCAACAAGATATT 143601
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Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770
Query 143602 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTTGAGATGATT 143638
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Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733
Score = 295 bits (326), Expect = 6e-75
Identities = 197/217 (91%), Gaps = 3/217 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 3594 GTATAGTTATTCAGAAGTCAATACTTTTGAGTAACttttttt-aaattcttttttcttct 3652
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Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890
Query 3653 atataatagtagtttttagccctaaaaatg--tttttaaaaGAATTTGCATTTTCTTATT 3710
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Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830
Query 3711 GACTTTATTATCATATGGTAGTAATATAAAGGTACAGCAAGGGAACAGCAACAAGATATT 3770
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Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770
Query 3771 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTTGAGATGATT 3807
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Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733
Score = 233 bits (258), Expect = 2e-56
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Strand=Plus/Minus
Query 140920 TATAATGATTCATATATTTTTAACTGATAGTTATGATAATAAAGTTTTAAATACTGTACT 140979
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Sbjct 3754 TATAATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTATT 3695
Query 140980 CAGATATATTAATACTACTAGTGATAGAGAGCTTAGTTACTTAATGGGTAAAGGTGAAGC 141039
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Sbjct 3694 AGAACATATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGC 3635
Query 141040 GGATGTATGTATAGAAAAGGGAGTATTTAGTAATATAGAAGATGTTAAAATTGACTCTGA 141099
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Sbjct 3634 GGATGTATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAA 3575
Query 141100 GTTTATTGATAGAGGTAACTTATGTATACTTATAAATGAAGATGGATTAGTATGTAGTTA 141159
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Sbjct 3574 CATTATTGATGAAGGTAAACTTTGTATATTAATAAATAGAAATGGTTTAGAGTGTAGTTA 3515
Query 141160 CTACAGAGGAGAATCATGTAATGTTGGTTCCTTTGTAAAGGAGAGGTTATAATGATAGAA 141219
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Sbjct 3514 CTATAGAGGTGTATCATGTAATGTGGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAA 3455
Query 141220 AT 141221
||
Sbjct 3454 AT 3453
Score = 233 bits (258), Expect = 2e-56
Identities = 233/302 (77%), Gaps = 0/302 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1089 TATAATGATTCATATATTTTTAACTGATAGTTATGATAATAAAGTTTTAAATACTGTACT 1148
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Sbjct 3754 TATAATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTATT 3695
Query 1149 CAGATATATTAATACTACTAGTGATAGAGAGCTTAGTTACTTAATGGGTAAAGGTGAAGC 1208
| ||||| ||| | |||| |||| ||||| || |||||||| ||||| |||||
Sbjct 3694 AGAACATATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGC 3635
Query 1209 GGATGTATGTATAGAAAAGGGAGTATTTAGTAATATAGAAGATGTTAAAATTGACTCTGA 1268
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Sbjct 3634 GGATGTATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAA 3575
Query 1269 GTTTATTGATAGAGGTAACTTATGTATACTTATAAATGAAGATGGATTAGTATGTAGTTA 1328
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Sbjct 3574 CATTATTGATGAAGGTAAACTTTGTATATTAATAAATAGAAATGGTTTAGAGTGTAGTTA 3515
Query 1329 CTACAGAGGAGAATCATGTAATGTTGGTTCCTTTGTAAAGGAGAGGTTATAATGATAGAA 1388
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Sbjct 3514 CTATAGAGGTGTATCATGTAATGTGGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAA 3455
Query 1389 AT 1390
||
Sbjct 3454 AT 3453
Score = 194 bits (214), Expect = 2e-44
Identities = 172/214 (80%), Gaps = 1/214 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 140797 TTAGCTATACTTGGAATATAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTAGAGGGGATTT 140856
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Sbjct 4168 TTAGCTATACTTGGCATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAAATT 4109
Query 140857 GTCCTA-AAATAGTATACCGCTTCTATATGGAAGGCTGAGAGGTCTTAGAATTGAAAGGA 140915
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Sbjct 4108 GGTCTAGAAATATATTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATTGAAAGGA 4049
Query 140916 GAGATATAATGATTCATATATTTTTAACTGATAGTTATGATAATAAAGTTTTAAATACTG 140975
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Sbjct 4048 GAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAGTT 3989
Query 140976 TACTCAGATATATTAATACTACTAGTGATAGAGA 141009
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Sbjct 3988 TACTTGAGTACATTAATACTACTGTAGATAAAGA 3955
Score = 194 bits (214), Expect = 2e-44
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Strand=Plus/Minus
Query 966 TTAGCTATACTTGGAATATAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTAGAGGGGATTT 1025
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Sbjct 4168 TTAGCTATACTTGGCATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAAATT 4109
Query 1026 GTCCTA-AAATAGTATACCGCTTCTATATGGAAGGCTGAGAGGTCTTAGAATTGAAAGGA 1084
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Sbjct 4108 GGTCTAGAAATATATTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATTGAAAGGA 4049
Query 1085 GAGATATAATGATTCATATATTTTTAACTGATAGTTATGATAATAAAGTTTTAAATACTG 1144
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Sbjct 4048 GAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAGTT 3989
Query 1145 TACTCAGATATATTAATACTACTAGTGATAGAGA 1178
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Sbjct 3988 TACTTGAGTACATTAATACTACTGTAGATAAAGA 3955
Score = 167 bits (184), Expect = 2e-36
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Strand=Plus/Minus
Query 140162 TTTAATGTACTTAAAATAGTAAGTAGCTAC-TTATCATTTAGGGTTCTATAATTGAGAAT 140220
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Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710
Query 140221 ATTGAGAGATAATCCGCTTCAATTGTAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGGGTATGCT 140280
||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |
Sbjct 4709 ATTAGAAGATA-TCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGC-GGTCTGTT 4652
Query 140281 ATAATTAGGTATAGTCAAATTTAGGAGATGAAATAGATGATTGATATATACTTA-GGAGA 140339
||| ||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||| || ||| ||
Sbjct 4651 ATACTTA-GTATA-------TAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGT 4600
Query 140340 AGGTTATAATAAAGAATACTT-GTCTAAAGCACTCAGATTAATCAATGACCATGCTCCTA 140398
| | |||| |||||| | || | | | || | | ||| | || | ||||||
Sbjct 4599 A-GATATAGTAAAGATAAGTTAAAATTTATC-CTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTA 4542
Query 140399 GGGAGTTAAGTTATGATTTTAATAATGTAGAAGCGGATGTTAATATT 140445
| || |||| || ||||||| ||| | ||||||||||| ||||
Sbjct 4541 GAGAATTAACCTACGATTTTAGAAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATT 4495
Score = 167 bits (184), Expect = 2e-36
Identities = 215/287 (75%), Gaps = 15/287 (5%)
Strand=Plus/Minus
Query 331 TTTAATGTACTTAAAATAGTAAGTAGCTAC-TTATCATTTAGGGTTCTATAATTGAGAAT 389
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Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710
Query 390 ATTGAGAGATAATCCGCTTCAATTGTAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGGGTATGCT 449
||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |
Sbjct 4709 ATTAGAAGATA-TCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGC-GGTCTGTT 4652
Query 450 ATAATTAGGTATAGTCAAATTTAGGAGATGAAATAGATGATTGATATATACTTA-GGAGA 508
||| ||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||| || ||| ||
Sbjct 4651 ATACTTA-GTATA-------TAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGT 4600
Query 509 AGGTTATAATAAAGAATACTT-GTCTAAAGCACTCAGATTAATCAATGACCATGCTCCTA 567
| | |||| |||||| | || | | | || | | ||| | || | ||||||
Sbjct 4599 A-GATATAGTAAAGATAAGTTAAAATTTATC-CTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTA 4542
Query 568 GGGAGTTAAGTTATGATTTTAATAATGTAGAAGCGGATGTTAATATT 614
| || |||| || ||||||| ||| | ||||||||||| ||||
Sbjct 4541 GAGAATTAACCTACGATTTTAGAAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATT 4495
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 474309452159280
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