Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Schistosoma_20haematobium_20[refseq_20GCF_5F000699445.1_202014-06- 09] 29,834 sequences; 375,894,156 total letters Query= NC_007066.1 Length=138715 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq2836 1481 0.0 seq3308 940 0.0 seq8440 827 0.0 >seq2836 Length=4769 Score = 1481 bits (1642), Expect = 0.0 Identities = 1079/1246 (87%), Gaps = 16/1246 (1%) Strand=Plus/Minus Query 96512 TTAGCTATACTTGGAATATAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTAGAGGGGATTT 96571 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct 4168 TTAGCTATACTTGGCATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAAATT 4109 Query 96572 GTCCTA-AAATAGTATACCGCTTCTATATGGAAGGCTGAGAGGTCTTAGAATTGAAAGGA 96630 | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4108 GGTCTAGAAATATATTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATTGAAAGGA 4049 Query 96631 GAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAGTT 96690 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4048 GAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAGTT 3989 Query 96691 TACTTGAGTATATTAATGATACTGTAGGTAGGGAATTAACTTATGGTATTAATACAGACT 96750 |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3988 TACTTGAGTACATTAATACTACTGTAGATAAAGAATTAACTTATGGTATTAATACAGACT 3929 Query 96751 ATGATAAGGATGTCGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGGATACAATTGAGT 96810 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | Sbjct 3928 ATGATAAGGATGTAGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGAATACGATTGATT 3869 Query 96811 TATCAGGTA---CAAACATGTTCAAGGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAGCTATACT 96867 ||||| | | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3868 TATCAAATCTTCCTCAC---TTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAATTATACT 3812 Query 96868 GTAAGGCATTTGTTAATGGTGAACCTGTTATTATACGTAAGTATGTAGAGGAGATGTTAT 96927 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3811 GTAAGGCATTTGTTAATGGGGAACCTATTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGATGTTAT 3752 Query 96928 AATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTATTAGA 96987 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3751 AATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTATTAGA 3692 Query 96988 ACATATTGATAATTGTAGTAGTAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGCGGA 97047 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3691 ACATATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGCGGA 3632 Query 97048 TGTATGTATAGAGAAAAATGTATTTAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAACAT 97107 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3631 TGTATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAACAT 3572 Query 97108 TATTGATGAAGGTAAACTTTGTATACTAATAAATAGACATGGTTTAGAATGTAGCTACTA 97167 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| Sbjct 3571 TATTGATGAAGGTAAACTTTGTATATTAATAAATAGAAATGGTTTAGAGTGTAGTTACTA 3512 Query 97168 TAGAGGTATATCATGTAATATTGGTTCCTTCGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAGATA 97227 ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3511 TAGAGGTGTATCATGTAATGTGGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAAATA 3452 Query 97228 TACCTTAGTGAAAATTATGATAAGAATTTACTAAAAGCAGAATTAAAATGGATTAAAGAG 97287 || || ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 3451 TATCTCAGTAAAAACTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATTAAAGAG 3392 Query 97288 ACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGTCCAGGATTGGATGTTTATGTT 97347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || Sbjct 3391 ACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGCCCAGGATTAGATGTACATATT 3332 Query 97348 AATCCCTATAGGTGTACTAAAGACGAAGTTGAAGAATGGAGTACACTTCCTCCATTTGAA 97407 | ||| | ||| | ||| || || || ||||||||| ||| || ||||| |||||| Sbjct 3331 AGTCCTTTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAAGAAATGAGCTTACATCCTCAGTTTGAA 3272 Query 97408 GATGATATACTTGTATTTATAGCGGAGACGTGGATACATGAATATCTTAAGGGTGAATCA 97467 |||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| Sbjct 3271 GATGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGGTAAATCA 3212 Query 97468 ATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAGTATGTAAAGGAGATGTAACTAATGTTTAAGGTATAT 97527 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||| Sbjct 3211 ATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAGGAGATGTAATTAATGGTAGAAACTTAT 3152 Query 97528 TATACAGTCTACCATAGAGGTAGTATGAAAACTATTAAGGATAAGCTAGATAGAAGTAGT 97587 |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||| | Sbjct 3151 TATACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACTATTAAGGATTACTTAAGTAGAAGTGAT 3092 Query 97588 TTAATATACTTCTTGTATGATACTTGGTATAAAGATATTAGTAACGTATTCCCTAATCAC 97647 ||||| ||||||| ||| | |||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| | | Sbjct 3091 TTAATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCCAACAGAT 3032 Query 97648 TATAATAAAGAGTTTGGGAGTAA---GAGTGATGATATAGATATAGATAAACTTATTGAA 97704 |||| || || || | || || || |||||| ||| || ||| |||||| Sbjct 3031 TATACTA---CGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGTTAGACTAATTGAA 2975 Query 97705 GCGGTTAATGAGGAAGGTATATTACTTATCAATAGAGGTAATTATG 97750 ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2974 GCGGTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATCAA---CCGTAATTATG 2932 Score = 590 bits (654), Expect = 6e-164 Identities = 405/471 (86%), Gaps = 2/471 (0%) Strand=Plus/Minus Query 98605 CAAAAATAAATACACTAGGA-TATTATTCCTAGTGTATTATATAAtttttttATAGAATA 98663 |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1756 CAAAAAAAAATACACCAGGAATATTATTCCCAGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATA 1697 Query 98664 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 98723 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1696 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 1637 Query 98724 AATCCGTTTTGTGTTTTATACTCTTTTATTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 98783 |||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 1636 AATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTAGTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTA 1577 Query 98784 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 98843 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1576 AATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 1517 Query 98844 TTTTTATCTGTTCCGCCATCTAAATCATCTGATatttgataatttttgaatataatttct 98903 ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1516 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 1457 Query 98904 tttgtttctaattcatttactaataattgtgattttgCATATTGTAATACATCTTCATTG 98963 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1456 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTGATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTG 1397 Query 98964 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTTATAATTTTTNN 99023 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1396 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTC-TATAATTTTTTT 1338 Query 99024 ANNTAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACACTT 99074 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1337 ATATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACCCTT 1287 Score = 419 bits (464), Expect = 2e-112 Identities = 302/347 (87%), Gaps = 6/347 (2%) Strand=Plus/Minus Query 99334 TGGAGTTGTGGCAAATGGACGGCTACAGATGTGCAGAACCTCCATTATATGAAAGCACAC 99393 ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318 Query 99394 TAAACCATACACGCACATATACGGCGTTAATTGTTTCTATTAATGGAAACTATGACACAG 99453 ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| | Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258 Query 99454 TGCAGATGTTCCGCAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAAGCCAACCGGCTAGCA 99513 | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198 Query 99514 TGTTAGTTAATGTGATTGACGATGTAATTATAATCGTATATGAAAATGTAGTGTACGGAG 99573 ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||| | Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138 Query 99574 TTCAAAACAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAAT---CCT 99630 | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78 Query 99631 CAAGCATCTATAGTAATATAATAGGTGTAGGGGATAGCAACACACCT 99677 ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 77 TAAGA---TGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCT 34 Score = 300 bits (332), Expect = 1e-76 Identities = 198/217 (91%), Gaps = 3/217 (1%) Strand=Plus/Minus Query 99086 GTATAGTTATTCAGAAGTCAATACTTTTGAGTAACttttttt-aaattcttttttcttct 99144 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890 Query 99145 atataatagtagtttttagccctaaaaatg--tttttaaaaGAATTTGCATTTTCTTATT 99202 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830 Query 99203 GACTTTATTATCATATGGTAGTAATATAAAGGTACAGCAAGGGAACAGCAACAAGATATT 99262 ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770 Query 99263 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTGGAGATGATT 99299 || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733 Score = 167 bits (184), Expect = 2e-36 Identities = 215/287 (75%), Gaps = 15/287 (5%) Strand=Plus/Minus Query 95877 TTTAATGTACTTAAAATAGTAAGTAGCTAC-TTATCATTTAGGGTTCTATAATTGAGAAT 95935 |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710 Query 95936 ATTGAGAGATAATCCGCTTCAATTGTAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGGGTATGCT 95995 ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | Sbjct 4709 ATTAGAAGATA-TCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGC-GGTCTGTT 4652 Query 95996 ATAATTAGGTATAGTCAAATTTAGGAGATGAAATAGATGATTGATATATACTTA-GGAGA 96054 ||| ||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||| || ||| || Sbjct 4651 ATACTTA-GTATA-------TAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGT 4600 Query 96055 AGGTTATAATAAAGAATACTT-GTCTAAAGCACTCAGATTAATCAATGACCATGCTCCTA 96113 | | |||| |||||| | || | | | || | | ||| | || | |||||| Sbjct 4599 A-GATATAGTAAAGATAAGTTAAAATTTATC-CTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTA 4542 Query 96114 GGGAGTTAAGTTATGATTTTAATAATGTAGAAGCGGATGTTAATATT 96160 | || |||| || ||||||| ||| | ||||||||||| |||| Sbjct 4541 GAGAATTAACCTACGATTTTAGAAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATT 4495 >seq3308 Length=2910 Score = 940 bits (1042), Expect = 0.0 Identities = 569/610 (93%), Gaps = 12/610 (2%) Strand=Plus/Minus Query 102552 CCTAACATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTTGAT 102611 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1766 CCTAGCATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGAAAAAATAAAAAAAGAAAAGGATTTGAT 1707 Query 102612 TATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGGA 102671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1706 TATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGGA 1647 Query 102672 CGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACGT 102731 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1646 CGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACAT 1587 Query 102732 AGTAAACTTCTTTGATAGTTACGAGCAGGACATTGAAGCGGTCATCACTGAATACATTGA 102791 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1586 AGTAAACTTCTTTGATAGATACGAGCAGGACATTGAAGCCGTCATCACTGAATACATTGA 1527 Query 102792 AGAGGTTACAGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCGA 102851 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1526 AGAGGTTACGGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCGA 1467 Query 102852 GAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACCT 102911 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1466 GAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACCT 1407 Query 102912 AGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACCG 102971 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1406 AGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACCA 1347 Query 102972 GGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACTGACAA 103031 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1346 GGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACGGACAA 1287 Query 103032 GGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCTCAAAGAATGGCACTATAGAAAGC 103091 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct 1286 GGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCGCAAAGAATGGCACTATAGGAAGC 1227 Query 103092 ACA------------CAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAGGAGATGT 103139 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1226 ACACAGACACACACACAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAGGAGATGT 1167 Query 103140 TGAAGATGAA 103149 |||||||||| Sbjct 1166 TGAAGATGAA 1157 Score = 782 bits (866), Expect = 0.0 Identities = 522/585 (89%), Gaps = 0/585 (0%) Strand=Plus/Minus Query 103131 AGGAGATGTTGAAGATGAATACAAGACGGGTAAACAGAGCGTTAAACGAAGCAGTTAGAT 103190 ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| Sbjct 585 AGGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTCGAT 526 Query 103191 TATTAGATGAACAAATAGCAGATACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTAG 103250 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 525 TATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTCG 466 Query 103251 AGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGGTATTAGTTGATGTTATGAATGGTGATG 103310 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 465 AGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTGATG 406 Query 103311 ATGAGTAATGAACATTAGAGAGGTTCACAATGTCGTTAAGAGTGCTAAGAGCAAACTCCT 103370 ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 405 ATGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACTCCT 346 Query 103371 GCAGGAGCAGGCTCACCCAACGGATAACCTCATAGAGCAGTACATCAATGATGAGCTACA 103430 |||||| || | | | || ||||||| | ||||||| || |||||||| Sbjct 345 GCAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCTACA 286 Query 103431 CAGACGCACACAGAGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAATACTACTTCATATAGTAA 103490 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 285 CAGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAA 226 Query 103491 TAGCCCATATGGTAGCTTAGAAGAGNNNNNNNNNNNTTATGACCTATCGTCATTATCTAC 103550 | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 225 TGGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATCTAC 166 Query 103551 TGGTGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTAC 103610 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 165 TGAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTAC 106 Query 103611 AATCTTTTAGTTTGTATGGTATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGATGAA 103670 ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 105 AATATTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGATGAA 46 Query 103671 CATGAGAAACTTATTAGAGCAGGAACAATTAGAAAAAGATGTAAA 103715 ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 45 CATGACAAACTTATTAGAACAGGAACAATTAGAAAAAGACGTAAA 1 Score = 306 bits (338), Expect = 3e-78 Identities = 213/243 (88%), Gaps = 13/243 (5%) Strand=Plus/Minus Query 102263 AAATAAACTGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAATCGTA 102322 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2365 AAATAA---GAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAATCGTA 2309 Query 102323 ATTAGCATAGCAACGCATAGCAACACTTGAGAGTGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTA 102382 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2308 ATTAGCATAGCAAC----------ACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTA 2259 Query 102383 CATCGACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAAAGAAATACATGACCAGGAAGCGGTTGT 102442 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| Sbjct 2258 CATCGACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGT 2199 Query 102443 TATTACTTCAGACACTTTGCAATCACTCAAATTTGCGGACACTATGGAAGAACTAGAAGA 102502 | ||||| |||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2198 GGTGACTTCTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAGA 2139 Query 102503 ATA 102505 ||| Sbjct 2138 ATA 2136 >seq8440 Length=882 Score = 827 bits (916), Expect = 0.0 Identities = 486/504 (96%), Gaps = 3/504 (1%) Strand=Plus/Minus Query 101798 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 101857 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 882 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 823 Query 101858 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 101917 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 822 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 763 Query 101918 GGGCAAGCAATTTTAAATGGTCGTTACTTTGACGGATATAGTAAAGGTGAACTTGAAGAA 101977 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| Sbjct 762 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 703 Query 101978 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTAATTATGCGTCATTGGGGTACACAAACA 102037 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 702 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 643 Query 102038 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 102097 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 642 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 583 Query 102098 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGAACCAAACTTTAGATACTTA 102157 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 582 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 523 Query 102158 CCAAGCAAAGACTTGTTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTTCAAGCC 102217 ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 522 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 463 Query 102218 CTACAATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 102277 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 462 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 403 Query 102278 GAATTGATACAAATG---AAATTA 102298 |||||||| ||||| |||||| Sbjct 402 GAATTGATGAAAATGTTCAAATTA 379 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 443594510802000