Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Schistosoma_20haematobium_20[refseq_20GCF_5F000699445.1_202014-06- 09] 29,834 sequences; 375,894,156 total letters Query= NC_019448.1 Length=139806 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq8440 1577 0.0 seq3308 1420 0.0 seq2836 657 0.0 >seq8440 Length=882 Score = 1577 bits (1748), Expect = 0.0 Identities = 879/882 (99%), Gaps = 0/882 (0%) Strand=Plus/Minus Query 2487 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 2546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 882 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 823 Query 2547 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 2606 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 822 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 763 Query 2607 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 2666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 762 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 703 Query 2667 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 2726 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 702 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 643 Query 2727 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 2786 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 642 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 583 Query 2787 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 2846 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 582 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 523 Query 2847 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 2906 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 522 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 463 Query 2907 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 2966 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 462 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 403 Query 2967 GAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATTATCGTACCTAAGGAAGAT 3026 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 402 GAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATTATCGTACCTAAGGAAGAT 343 Query 3027 AACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAATATGTAAATAGCATCACAATG 3086 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 342 AACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAATAGTTAAATAGCATCACAATG 283 Query 3087 GAAGCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAAGGGCAATGGTACTCAGAAGATGAAAAA 3146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 282 GAAGCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAAGGGCAATGGTACTCAGAAGATGAAAAA 223 Query 3147 CGTATAATGGAAGATAACAACTTAAATCTTGAGTGGTATTATCTGCAAGACAGTGCAAAA 3206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 222 CGTATAATGGAAGATAACAACTTAAATCTTGAGTGGTATTATCTGCAAGACAGTGCAAAA 163 Query 3207 TTCATGACAGTTGAATTAAAAGGTATTGTAAGACGTTTAATTGAAGTTTACGGACAAGAG 3266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 162 TTCATGACAGTTGAATTAAAAGGTATTGTAAGACGTTTAATTGAAGTTTACGGACAAGAG 103 Query 3267 GCTATCAGTATCAAAGTTAATGGCACATTGTACATTGTAGACCAATCAGACATTGAAGAA 3326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102 GCTATCAGTATCAAAGTTAATGGCACATTGTACATTGTAGACCAATCAGACATTGAAGAA 43 Query 3327 TTACACACAACATTATTAAATATCATGAAATAAAAAATTTAT 3368 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 42 TTACACACAATATTATTAAATATCATGAAATAAAAAATTTAT 1 >seq3308 Length=2910 Score = 1420 bits (1574), Expect = 0.0 Identities = 807/824 (98%), Gaps = 0/824 (0%) Strand=Plus/Minus Query 5487 ATTAAACAATGCTAAAAAACTATACGAAACATTATTTGCTATCGAGTTTGATAGTACTAT 5546 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 824 ATTAAAAAAGGCTAAAAAACTATACGAAACATTATTTGCTATCGAGTTTGATAGTACTAT 765 Query 5547 CGAGGAAGATTGGACAATAGATAATGACTCTCTAGAAGCTAAACTATTCTTGGAGTTATC 5606 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 764 CGAGGAAGATTGGACAATAGATAATGACTCTCTAGAAGCTAAACTATTCTTGGAGTTATC 705 Query 5607 AGATGAGGGCAAAAAGGTTTATGCAATGAGTCACGCTAAGCAATGGGCAAATATTGTTAT 5666 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 704 AGATGAGGGCAAAAAGGTTTATGCAATGAGTCATGCTAAGCAATGGGCAAATATTGTTAT 645 Query 5667 GGATATGGAAGAAGAGGAATATAGAAGCTATTACGGAAATGATTTAGATTATATTTTAGA 5726 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 644 GGATATGGAAGAAGAGGAATATAGAAGCTATTACGGAAATGATTTAGATTATATTTTAGA 585 Query 5727 GGAGATGTAAAACATGAATACAAGACGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTCGATT 5786 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 584 GGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTCGATT 525 Query 5787 ATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTCGA 5846 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 524 ATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTCGA 465 Query 5847 GAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTGATGA 5906 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 464 GAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTGATGA 405 Query 5907 TGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACTCCTG 5966 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 404 TGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACTCCTG 345 Query 5967 CAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCTACAC 6026 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 344 CAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCTACAC 285 Query 6027 AGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAAT 6086 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 284 AGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAAT 225 Query 6087 GGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGNNNNNNNNNNNNTATGACCTATCTTCATTATCTACT 6146 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 224 GGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATCTACT 165 Query 6147 GAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTACA 6206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 164 GAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTACA 105 Query 6207 ATCTTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGATGAAC 6266 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 104 ATATTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGATGAAC 45 Query 6267 ATGACAAACTTATTAGAACAGGAACAATTAGAAAAAGACGTAAA 6310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 44 ATGACAAACTTATTAGAACAGGAACAATTAGAAAAAGACGTAAA 1 Score = 1375 bits (1524), Expect = 0.0 Identities = 770/775 (99%), Gaps = 0/775 (0%) Strand=Plus/Minus Query 4047 ATGAAGCAATCGAAGAATACGCATaaaaaaaCTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 4106 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2910 ATGAAGCAATCGAAGAATACGCATAAAAAAACTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 2851 Query 4107 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 4166 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2850 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 2791 Query 4167 TGTAACGTTAGTTAATCAAGAATTGTTTATGTATGCAACATTCAACAAGCAGGAAGCAGA 4226 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2790 TGTAACGTTAGTTAATCAAGAATTGTTTATGTATGCAACATTCAACAAGCAGGAAGCAGA 2731 Query 4227 AGCCAAATATCAAGAATGGTGTGACTTATATGGTCAAGAAAATGTAAGCATGGaaaaaaa 4286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2730 AGCCAAATATCAAGAATGGTGTGACTTATATGGTCAAGAAAATGTAAGCATGGAAAAAAA 2671 Query 4287 TTAAAATAAGCTGTTGACAAACTAACCGCTTCATGATAATATTAAACTATACTAAAGAAA 4346 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2670 TTAAAATAAGCTGTTGACAAACTAACCGCTTCATGATAATATTAAACTATACTAAAGAAA 2611 Query 4347 AGGAAATGATTACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCCAATTAGAGAGTCTAG 4406 ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2610 AGGTAATAATTACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCTAATTAGAGAGTCTAG 2551 Query 4407 AAAGAAAATCAGATGAGGAATTAGCAAACGGATACTATGACAGATTTGAAAGAACTTGTG 4466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2550 AAAGAAAATCAGATGAGGAATTAGCAAACGGATACTATGACAGATTTGAAAGAACTTGTG 2491 Query 4467 CACAGATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTaaa 4526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2490 CACAGATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTAAA 2431 Query 4527 aaaaTCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAAGATAGTTAAAA 4586 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2430 AAAATCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAAGATATTTAAAA 2371 Query 4587 AATACAAATAAGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAATCG 4646 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2370 AATACAAATAAGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAATCG 2311 Query 4647 TAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCGACC 4706 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2310 TAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCGACC 2251 Query 4707 ACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGACTT 4766 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2250 ACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGACTT 2191 Query 4767 CTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGAACTAGAAGAATA 4821 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2190 CTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAGAATA 2136 Score = 1164 bits (1290), Expect = 0.0 Identities = 667/688 (97%), Gaps = 0/688 (0%) Strand=Plus/Minus Query 4919 GGATTTGATTATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCAC 4978 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1715 GGATTTGATTATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCAC 1656 Query 4979 AGTTAAGGACGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACAC 5038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1655 AGTTAAGGACGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACAC 1596 Query 5039 ATCAGACATAGTAAACTTCTTTGATAGATACGAGCAGGACATTGAAGCCGTCATCACTGA 5098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1595 ATCAGACATAGTAAACTTCTTTGATAGATACGAGCAGGACATTGAAGCCGTCATCACTGA 1536 Query 5099 ATACATTGAAGAGGTTACGGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAG 5158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1535 ATACATTGAAGAGGTTACGGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAG 1476 Query 5159 AGACCTCGAGAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCA 5218 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1475 AGACCTCGAGAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCA 1416 Query 5219 ATTTGACCTAGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGA 5278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1415 ATTTGACCTAGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGA 1356 Query 5279 AGCAGACCAGGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGA 5338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1355 AGCAGACCAGGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGA 1296 Query 5339 AACGGACAAGGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCGCAAAGAATGGCACT 5398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1295 AACGGACAAGGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCGCAAAGAATGGCACT 1236 Query 5399 ATAGGAAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATC 5458 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1235 ATAGGAAGCACACAGACACACACACAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATC 1176 Query 5459 AGGAGATGTTGAAGATGAAAATTAACCAATTAAACAATGCTAAAAAACTATACGAAACAT 5518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1175 AGGAGATGTTGAAGATGAAAATTAACCAATTAAACAATGCTAAAAAACTATACGAAACAT 1116 Query 5519 TATTTGCTATCGAGTTTGATAGTACTATCGAGGAAGATTGGACAATAGATAATGACTCTC 5578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1115 TATTTGCTATCGAGTTTGATAGTACTATCGAGGAAGATTGGACAATAGATAATGACTCTC 1056 Query 5579 TAGAAGCTAAACTATTCTTGGAGTTATC 5606 |||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1055 TAGAAGATAAACTATTCTTGGAGTTATC 1028 >seq2836 Length=4769 Score = 657 bits (728), Expect = 0.0 Identities = 402/439 (92%), Gaps = 0/439 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 AGTGTATTGTATAAtttttttATAGAATATTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1725 AGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATATTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTT 1666 Query 61 CATGTTGTGatttaattaaatttttaattaatccgttttgtgttttatagtcttttacta 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1665 CATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATTAATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTA 1606 Query 121 gtttttcattttCTATAATTAANNNNNNNNNNNNNNCTTTTGTTGTATCCTCATCTACAT 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1605 GTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTAAATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACAT 1546 Query 181 AAAATTTACTTTCATATATTTCATAATATTTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1545 AAAATTTACTTTCATATATTTCATAATATTTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTG 1486 Query 241 ATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCTTTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1485 ATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCTTTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTG 1426 Query 301 ATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTGTCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1425 ATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTGTCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTT 1366 Query 361 AAATCAAATCCTTTTCTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGCGGTTGGGGTTTGT 420 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1365 AAATCAAATCCTTTTCTATAATTTTTTTATATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGT 1306 Query 421 CCCTTGCCTTACTACACTT 439 ||||||||||||||| ||| Sbjct 1305 CCCTTGCCTTACTACCCTT 1287 Score = 614 bits (680), Expect = 5e-171 Identities = 343/345 (99%), Gaps = 0/345 (0%) Strand=Plus/Minus Query 702 TGGAGTTGTGGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCCATTATATGAAAGCACAT 761 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318 Query 762 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 821 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258 Query 822 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 881 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198 Query 882 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 941 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138 Query 942 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 1001 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78 Query 1002 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCTT 1046 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 77 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCTT 33 Score = 576 bits (638), Expect = 1e-159 Identities = 325/329 (99%), Gaps = 0/329 (0%) Strand=Plus/Minus Query 139478 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTGAGGTCTGTATAATTGAAAAT 139537 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710 Query 139538 ATTAGAAGATATCCGGTTCAATTACAATTAAGTGTTGACAACTATGAAGCGGTCTGTTAT 139597 ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4709 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGGTCTGTTAT 4650 Query 139598 ACTTAGTATATAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGTAGATATAGTA 139657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4649 ACTTAGTATATAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGTAGATATAGTA 4590 Query 139658 AAGATAAGTTAAAATTTATCCTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTAGAGAATTAACCT 139717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4589 AAGATAAGTTAAAATTTATCCTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTAGAGAATTAACCT 4530 Query 139718 ACGATTTTAGAAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATTGAGGAACTACTAGGAGATGACATAG 139777 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4529 ACGATTTTAGAAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATTGAGGAACTACTAGGAGATGACATAG 4470 Query 139778 ATGTATTTGAATCTATAGTATTAGATTAC 139806 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4469 ATGTATTTGAATCTATAGTATTAGATTAC 4441 Score = 219 bits (242), Expect = 4e-52 Identities = 171/217 (79%), Gaps = 0/217 (0%) Strand=Plus/Minus Query 451 GTATAGTTATTCAGAAGTCAATACTTTTGAGTAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTCT 510 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890 Query 511 ATATAATAGTAGTTTTTAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTACATTTTCTTATT 570 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830 Query 571 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTATT 630 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770 Query 631 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTGGAGATGATT 667 || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 447084408846240