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BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Schistosoma_20haematobium_20[refseq_20GCF_5F000699445.1_202014-06- 09] 29,834 sequences; 375,894,156 total letters Query= NC_022918.1 Length=132123 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq2836 2233 0.0 seq8440 812 0.0 seq3308 760 0.0 >seq2836 Length=4769 Score = 2233 bits (2476), Expect = 0.0 Identities = 1574/1783 (88%), Gaps = 50/1783 (3%) Strand=Plus/Minus Query 1057 ATAAGGAGATGAATAATATGATTAGTATTTACTTACACAGTGGATATAGTAAAGATAAGT 1116 ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 4640 ATAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGTAGATATAGTAAAGATAAGT 4581 Query 1117 TGAAAGATATACTCAAGACAATAAGGGATTTTGCTCCTAGGGAGTTAACCTATGATTTTA 1176 | ||| ||| || || |||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct 4580 TAAAATTTATCCTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTAGAGAATTAACCTACGATTTTA 4521 Query 1177 GGAATCCAAAAGCGGATGTTAATATTGAGGAGCTACTAGGAGATGATGTAGACATATTTG 1236 | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| Sbjct 4520 GAAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATTGAGGAACTACTAGGAGATGACATAGATGTATTTG 4461 Query 1237 AATCTATAGCATTAGATTACTCTAATGATATTAATATCCTTGTAGGAGATAGTGGATACA 1296 ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4460 AATCTATAGTATTAGATTACCCTAATGATATTAATATCCTTGTGGGAGATAGTGGATACT 4401 Query 1297 CGATAGTTTATCAGAATGACTTTCTTACAATTAATGGATTGAGTATGGCTATAAGGGAGG 1356 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct 4400 CGATAGTTTATCAGAATGATTTTCTTACAATTAATGGATTGAGTATAGCTATAAAGGAGG 4341 Query 1357 TAGTAAGATGGA---------TAAAGTATTAGAGTTTGTTATGAGTTATTTACTGTATCT 1407 |||||||||| || | |||||| |||||| | || |||| || | Sbjct 4340 TAGTAAGATGATAGGTCAAATTATACTATTAGCTATTGTTAGTA--TAGTTACAATAGGT 4283 Query 1408 TATAATGGGATTTATAGGTGTATG----GTTAGGAAGT-TTAATTATAGGGATG--AATA 1460 | | | ||||| || | |||| ||| ||| |||| ||| |||| ||| Sbjct 4282 TGTG-TAGGATT-ATTTTTCTATGAGACGTTCAAGAGTATTAAGTAT---GATGCTAATG 4228 Query 1461 TTAACCCTTTTACAAGT--TGG--GTACCTTA-TGT-AGTTGCTCTAAT-AGTATCTGTA 1513 ||| |||| | | ||| ||| ||| ||| |||| | | | ||| || | Sbjct 4227 ATAAAATCTTTATGATTACTGGAAGTATATTAATGTTAGTTATTATCGTTAGTGG-TGCA 4169 Query 1514 TCAGAGTATATATTTAAATATTATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATG 1573 | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4168 TTAGC---TATACTTGGC----ATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATG 4116 Query 1574 ATAAATTGGTCTAGAAATATACTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGATAGGGCTTAGAATT 1633 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4115 ATAAATTGGTCTAGAAATATATTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATT 4056 Query 1634 GAAAGGAGAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAAGATTATAATAAAGAAACATTA 1693 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 4055 GAAAGGAGAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTA 3996 Query 1694 AGGAATTTACTTGAGTATATTAATACTACTGTAGGTAGGGAATTAACTTATGGTATTAAT 1753 |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 3995 AGGAGTTTACTTGAGTACATTAATACTACTGTAGATAAAGAATTAACTTATGGTATTAAT 3936 Query 1754 ACAGACTATGATAAGGATGTCGTGATTGAAACCGATGACCCCATAGATGAGGAGAATACG 1813 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3935 ACAGACTATGATAAGGATGTAGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGAATACG 3876 Query 1814 ATTGATTTATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAGGTA 1873 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3875 ATTGATTTATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAATTA 3816 Query 1874 TACTGTAAGGCATTTGTTAATGGGGAACCTGTTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGATG 1933 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3815 TACTGTAAGGCATTTGTTAATGGGGAACCTATTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGATG 3756 Query 1934 TTATAATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATTCCAAAGCTTTAAAGAAAGTAT 1993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct 3755 TTATAATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTAT 3696 Query 1994 TAGAACATATTGATAATTGTAGTAGTAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAG 2053 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3695 TAGAACATATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAG 3636 Query 2054 CGGATGTATGTATAGAGAAAAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAA 2113 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3635 CGGATGTATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAA 3576 Query 2114 ACATTATTGATGAAGGTAAACTCTGTGTGTTAATAAATAGACATGGTTTAGAATGTAGTT 2173 |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct 3575 ACATTATTGATGAAGGTAAACTTTGTATATTAATAAATAGAAATGGTTTAGAGTGTAGTT 3516 Query 2174 ACTATAGAGGTGTATCCTGTAATATTGGTGCCTTCGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGA 2233 |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3515 ACTATAGAGGTGTATCATGTAATGTGGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGA 3456 Query 2234 AATATACCTTAGTGAGAATTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATTAA 2293 |||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3455 AATATATCTCAGTAAAAACTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATTAA 3396 Query 2294 AGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGTCCAGGATTAGATGTACA 2353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3395 AGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGCCCAGGATTAGATGTACA 3336 Query 2354 TATTAATACTTACTATAAATGTACTAAAGATGAAGTAGAAGAAATGAGCTTACATCCTCA 2413 ||||| | || | || || ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3335 TATTAGTCCT---TTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAAGAAATGAGCTTACATCCTCA 3279 Query 2414 GTTTGAAGATGATATATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGG 2473 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3278 GTTTGAAGATGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGG 3219 Query 2474 TAAATCAATAGGTGTAGATAGCATGGAGGAGTATGTAAAGGAGATGTAGTGAATGCTTAA 2533 ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||| | | Sbjct 3218 TAAATCAATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAGGAGATGTAATTAATGGTAGA 3159 Query 2534 AGTATATTATACAGTTTATCATAGGCAGAGTATGAAAACGATTAAGGATAAGTTAGATAG 2593 | ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||| | ||| ||| Sbjct 3158 AACTTATTATACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACTATTAAGGATTACTTAAGTAG 3099 Query 2594 AAGTGATTTAATTGACTTCCTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCC 2653 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3098 AAGTGATTTAATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCC 3039 Query 2654 AACAGATTATACTACGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGATAGATTAAT 2713 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct 3038 AACAGATTATACTACGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGTTAGACTAAT 2979 Query 2714 TGAAGCGGTTAATAGAGAAGGCATATTACTTATTAACCGTAGTAATTATATTACACTAAG 2773 ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| || Sbjct 2978 TGAAGCGGTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATCAACCGTAAT-----TATGAC----GT 2928 Query 2774 AGAGTGGTAGGATGTTGACAAATCATAAGTAGTGTGGTATAAT 2816 ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2927 AGAGTTATAGGATGTTGACAAATTGTAAGTAGTGTGGTATAAT 2885 Score = 720 bits (798), Expect = 0.0 Identities = 438/470 (93%), Gaps = 1/470 (0%) Strand=Plus/Minus Query 3677 CAAAAATAAATACACTAGGA-TATTATTCCCAGTGTATTGTATAAtttttttATAGAATA 3735 |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1756 CAAAAAAAAATACACCAGGAATATTATTCCCAGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATA 1697 Query 3736 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGatttaattaaatttttaatt 3795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1696 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 1637 Query 3796 aatccgttttgtgttttatagtcttttattagtttttcattttCTATAATTAAATTATTA 3855 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1636 AATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTAGTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTA 1577 Query 3856 AATTCCTCTTCTGTTGTATTCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 3915 ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1576 AATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 1517 Query 3916 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 3975 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1516 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 1457 Query 3976 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAGTTGTGATTTTGCATATTGTAATACATCTTCATTG 4035 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1456 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTGATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTG 1397 Query 4036 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTATANNNNNNNNN 4095 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1396 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTATAATTTTTTTA 1337 Query 4096 NNNNNNNNNNNNNGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACACTT 4145 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1336 TATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACCCTT 1287 Score = 551 bits (610), Expect = 5e-152 Identities = 329/345 (95%), Gaps = 0/345 (0%) Strand=Plus/Minus Query 4405 TGGAGTTGTGGCAAATGGACGGCTACAGATGTACAGAACCGCCATTATATGAAAGCACAT 4464 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318 Query 4465 TAAACCATACACGCACATATACGGCTTTAATAGTAAGCATTAAAGGAAACTATGACACTG 4524 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258 Query 4525 TTCAAATGTTCCGCAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGAGCAAGCCCAACCGGCTAGCA 4584 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198 Query 4585 TGTTAGTAAATGTAATTGATGATGTGATTATAATCGTATATGAAAATGTTGTTTATGGAG 4644 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138 Query 4645 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTGTTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 4704 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78 Query 4705 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCTT 4749 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 77 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCTT 33 Score = 304 bits (336), Expect = 1e-77 Identities = 199/217 (92%), Gaps = 3/217 (1%) Strand=Plus/Minus Query 4157 GTATAGTTATTCATAAGTCAATACTTTTGAGTAACttttttt-aaattcttttttcttct 4215 ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890 Query 4216 atataatagtagtttttagccctaaaaa--gttttttaaaagaatttgtattttCTTATT 4273 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830 Query 4274 GACTTATTAATCATATGGTAGTAGTATTAAGGTACAGCAAGGGAACAGCAACAAGATATT 4333 ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770 Query 4334 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTGGAGATGATT 4370 || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733 Score = 178 bits (196), Expect = 1e-39 Identities = 122/134 (91%), Gaps = 3/134 (2%) Strand=Plus/Minus Query 696 TTTAATGTACTTAAAATCTTAAGTAGCTCC-TTATCATTTAGGTCTGTTTAATTGAGAAT 754 |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710 Query 755 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAAGTGTTGACAACTATGAAGCGGTTATGGTA 814 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || Sbjct 4709 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGG-TCTGTTA 4651 Query 815 TAATTAGT-TATAA 827 || ||||| ||||| Sbjct 4650 TACTTAGTATATAA 4637 >seq8440 Length=882 Score = 812 bits (900), Expect = 0.0 Identities = 477/495 (96%), Gaps = 0/495 (0%) Strand=Plus/Minus Query 6213 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 6272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 882 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 823 Query 6273 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 6332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 822 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 763 Query 6333 GGGCAAGCAATTTTAAATGGTCGTTACTTTGACGGATACAGTAAAGGTGAACTTGAAGAA 6392 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| Sbjct 762 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 703 Query 6393 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTAGTTATGCGTCATTGGGGTACACAAACA 6452 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 702 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 643 Query 6453 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAACTCAGAC 6512 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 642 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 583 Query 6513 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTTCTTAGGAATTGAACCAAATTTTAGATACCTA 6572 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || Sbjct 582 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 523 Query 6573 CCAAGCAAAGACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTTCAAGCC 6632 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 522 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 463 Query 6633 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 6692 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 462 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 403 Query 6693 GGATTGATGAAAATG 6707 | ||||||||||||| Sbjct 402 GAATTGATGAAAATG 388 Score = 645 bits (714), Expect = 3e-180 Identities = 395/420 (94%), Gaps = 0/420 (0%) Strand=Plus/Minus Query 7251 ACAAATCAAAGAGAAAAGGAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATT 7310 ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 ACAAAATAAACTGAAAAGGAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATT 361 Query 7311 ATCGTACCTAAGGAAGATAACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAATAT 7370 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 ATCGTACCTAAGGAAGATAACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAATAG 301 Query 7371 GTAAACAGTATCACAATGGAAGCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAGGGGCAATGG 7430 |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 300 TTAAATAGCATCACAATGGAAGCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAAGGGCAATGG 241 Query 7431 TACTCAGAAGATGAAAAGCGTATCATGGAAGATAATAACTTAAATCTTGAATGGTATTAT 7490 ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 240 TACTCAGAAGATGAAAAACGTATAATGGAAGATAACAACTTAAATCTTGAGTGGTATTAT 181 Query 7491 ATGAAAGACAGTGCAAAATTTATGACAGTTGAACTAAAAGGCATTGTAAGACGCTTAATT 7550 || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 180 CTGCAAGACAGTGCAAAATTCATGACAGTTGAATTAAAAGGTATTGTAAGACGTTTAATT 121 Query 7551 GAAGTTTACGGACAAGAAGCAATAAGCATTAAAGTTAATGGCACATTGTACATTGTAGAC 7610 ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 GAAGTTTACGGACAAGAGGCTATCAGTATCAAAGTTAATGGCACATTGTACATTGTAGAC 61 Query 7611 CAATCAGACATTGAAGAATTACACACAACATTATTAAATATCATGAAATAAAAAATTTAT 7670 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 60 CAATCAGACATTGAAGAATTACACACAATATTATTAAATATCATGAAATAAAAAATTTAT 1 >seq3308 Length=2910 Score = 760 bits (842), Expect = 0.0 Identities = 489/530 (92%), Gaps = 3/530 (1%) Strand=Plus/Minus Query 8302 ATGAAGCAATTGAAGAATACGCATaaaaaaaCTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 8361 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2910 ATGAAGCAATCGAAGAATACGCATAAAAAAACTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 2851 Query 8362 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 8421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2850 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 2791 Query 8422 CGTAACATTAGTTAATGGAGAATTATTCATGTTTGCAACATTTAAGAAAGCAG-AGGCAG 8480 ||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||| || || |||| | |||| Sbjct 2790 TGTAACGTTAGTTAATCAAGAATTGTTTATGTATGCAACATTCAACAA-GCAGGAAGCAG 2732 Query 8481 AAAATAAATATCAAGAATGGTGTGACTTGTACGGTCAAGAAAATGTGAGCATGGaaaaaa 8540 || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2731 AAGCCAAATATCAAGAATGGTGTGACTTATATGGTCAAGAAAATGTAAGCATGGAAAAAA 2672 Query 8541 aTTAAAATAAGCGGTTGACAAACTAACCGCTTCATGGTAATATTAAACTATACTAAAGAA 8600 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2671 ATTAAAATAAGCTGTTGACAAACTAACCGCTTCATGATAATATTAAACTATACTAAAGAA 2612 Query 8601 AAGGAAATGATGACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCCAACTTGAAAGACTA 8660 |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||| Sbjct 2611 AAGGTAATAATTACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCTAATTAGAGAGTCTA 2552 Query 8661 GAAAGAAAATCAGATGAGCAACTAGCAAACGGATATTATGAAGCCTTTGAAAGAACTTGC 8720 |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 2551 GAAAGAAAATCAGATGAGGAATTAGCAAACGGATACTATGACAGATTTGAAAGAACTTGT 2492 Query 8721 GCACAAATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTaa 8780 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2491 GCACAGATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTAA 2432 Query 8781 aaaaaT-TAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTAGATGTTATTATTAA 8829 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct 2431 AAAAATCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAA 2382 Score = 738 bits (818), Expect = 0.0 Identities = 499/562 (89%), Gaps = 19/562 (3%) Strand=Plus/Minus Query 9951 TAAAGGAGATGTTGAACATGAACACAAGAAGGGTAAACAAAGCTTTAAATGAAGCAGTTA 10010 || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| Sbjct 588 TAGAGGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTC 529 Query 10011 GATTATTAGACAAGCAAATAGCAGACACACAGAAAACAATGCAGGAGTTAAATAACCAAC 10070 |||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||| Sbjct 528 GATTATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAAC 469 Query 10071 ---------AGATAAGAGCTAAGCAGGAGCTAATGACATTAGTTGATGCTATGACTGGTG 10121 | |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 468 TCGAGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTG 409 Query 10122 ATGATGAGTAATGAACATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACT 10181 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 408 ATGATGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACT 349 Query 10182 CCTGCAGGAGCAGAATAATATTAATAATGTAATGATAGATGACTACATCACAGAAGAGCT 10241 ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 348 CCTGCAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCT 289 Query 10242 TCACAGACGCACACAGAGAAGCGGAGCAATACAAATAGACAATAACACCGCTTCATATAG 10301 ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 288 ACACAGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAG 229 Query 10302 TAATGACTCATATGGTAGCTTAGAAGAG----------CTTATGACCTATCTTCATTATC 10351 ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 228 TAATGGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATC 169 Query 10352 TACTGATGAGATTAAAGAACTGCTTGAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTT 10411 |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 168 TACTGAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTT 109 Query 10412 TACAATCTTTTAGTTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGAT 10471 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 108 TACAATATTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGAT 49 Query 10472 GAACATGAGAGACTTACAAGAA 10493 |||||||| | ||||| |||| Sbjct 48 GAACATGACAAACTTATTAGAA 27 Score = 309 bits (342), Expect = 3e-79 Identities = 248/298 (83%), Gaps = 12/298 (4%) Strand=Plus/Minus Query 8938 AAGAAAAT-TaaaaaaaGTGTTGACACTTtaaaaaatacatgttaatataaatatat--- 8993 || ||||| |||| || | |||||||||| | ||||||||||||| || |||| Sbjct 2433 AAAAAAATCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAAGATATTTA 2374 Query 8994 ------actaa--agaaaaggaattgataaaaatgaaattattaaaCAGAGACAACGAAA 9045 || || |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || |||| Sbjct 2373 AAAAATACAAATAAGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAA 2314 Query 9046 TCGTAATTAGCATAGCAACATTAGAGAGCGTAAAACAAGCCTTAATTTGGGAATACATCG 9105 |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct 2313 TCGTAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCG 2254 Query 9106 ACCACATAGATAATAACATCCTAGACAGTGAAATCTATGACCAAGAAGCGGTTGTCGTTA 9165 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || | Sbjct 2253 ACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGA 2194 Query 9166 CTTCTAAGACTCTACAATCAATCAAATTTGCAGACACTATGGAAGACCTGCAGGAATA 9223 ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| Sbjct 2193 CTTCTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAGAATA 2136 Score = 118 bits (130), Expect = 9e-22 Identities = 73/77 (95%), Gaps = 2/77 (3%) Strand=Plus/Minus Query 9695 AGGAAGCACATAGAGACACACA--GAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAG 9752 |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1233 AGGAAGCACACAGACACACACACAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAG 1174 Query 9753 GAGATGTTGAAGATGAA 9769 ||||||||||||||||| Sbjct 1173 GAGATGTTGAAGATGAA 1157 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 422515116831816