Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Schistosoma_20haematobium_20[refseq_20GCF_5F000699445.1_202014-06-
09] 29,834 sequences; 375,894,156 total letters
Query= NC_022918.1
Length=132123
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq2836 2233 0.0
seq8440 812 0.0
seq3308 760 0.0
>seq2836
Length=4769
Score = 2233 bits (2476), Expect = 0.0
Identities = 1574/1783 (88%), Gaps = 50/1783 (3%)
Strand=Plus/Minus
Query 1057 ATAAGGAGATGAATAATATGATTAGTATTTACTTACACAGTGGATATAGTAAAGATAAGT 1116
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Sbjct 4640 ATAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGTAGATATAGTAAAGATAAGT 4581
Query 1117 TGAAAGATATACTCAAGACAATAAGGGATTTTGCTCCTAGGGAGTTAACCTATGATTTTA 1176
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Sbjct 4580 TAAAATTTATCCTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTAGAGAATTAACCTACGATTTTA 4521
Query 1177 GGAATCCAAAAGCGGATGTTAATATTGAGGAGCTACTAGGAGATGATGTAGACATATTTG 1236
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Sbjct 4520 GAAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATTGAGGAACTACTAGGAGATGACATAGATGTATTTG 4461
Query 1237 AATCTATAGCATTAGATTACTCTAATGATATTAATATCCTTGTAGGAGATAGTGGATACA 1296
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Sbjct 4460 AATCTATAGTATTAGATTACCCTAATGATATTAATATCCTTGTGGGAGATAGTGGATACT 4401
Query 1297 CGATAGTTTATCAGAATGACTTTCTTACAATTAATGGATTGAGTATGGCTATAAGGGAGG 1356
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Sbjct 4400 CGATAGTTTATCAGAATGATTTTCTTACAATTAATGGATTGAGTATAGCTATAAAGGAGG 4341
Query 1357 TAGTAAGATGGA---------TAAAGTATTAGAGTTTGTTATGAGTTATTTACTGTATCT 1407
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Sbjct 4340 TAGTAAGATGATAGGTCAAATTATACTATTAGCTATTGTTAGTA--TAGTTACAATAGGT 4283
Query 1408 TATAATGGGATTTATAGGTGTATG----GTTAGGAAGT-TTAATTATAGGGATG--AATA 1460
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Sbjct 4282 TGTG-TAGGATT-ATTTTTCTATGAGACGTTCAAGAGTATTAAGTAT---GATGCTAATG 4228
Query 1461 TTAACCCTTTTACAAGT--TGG--GTACCTTA-TGT-AGTTGCTCTAAT-AGTATCTGTA 1513
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Sbjct 4227 ATAAAATCTTTATGATTACTGGAAGTATATTAATGTTAGTTATTATCGTTAGTGG-TGCA 4169
Query 1514 TCAGAGTATATATTTAAATATTATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATG 1573
| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4168 TTAGC---TATACTTGGC----ATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATG 4116
Query 1574 ATAAATTGGTCTAGAAATATACTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGATAGGGCTTAGAATT 1633
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Sbjct 4115 ATAAATTGGTCTAGAAATATATTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATT 4056
Query 1634 GAAAGGAGAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAAGATTATAATAAAGAAACATTA 1693
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Sbjct 4055 GAAAGGAGAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTA 3996
Query 1694 AGGAATTTACTTGAGTATATTAATACTACTGTAGGTAGGGAATTAACTTATGGTATTAAT 1753
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Sbjct 3995 AGGAGTTTACTTGAGTACATTAATACTACTGTAGATAAAGAATTAACTTATGGTATTAAT 3936
Query 1754 ACAGACTATGATAAGGATGTCGTGATTGAAACCGATGACCCCATAGATGAGGAGAATACG 1813
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3935 ACAGACTATGATAAGGATGTAGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGAATACG 3876
Query 1814 ATTGATTTATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAGGTA 1873
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3875 ATTGATTTATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAATTA 3816
Query 1874 TACTGTAAGGCATTTGTTAATGGGGAACCTGTTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGATG 1933
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Sbjct 3815 TACTGTAAGGCATTTGTTAATGGGGAACCTATTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGATG 3756
Query 1934 TTATAATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATTCCAAAGCTTTAAAGAAAGTAT 1993
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Sbjct 3755 TTATAATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTAT 3696
Query 1994 TAGAACATATTGATAATTGTAGTAGTAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAG 2053
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Sbjct 3695 TAGAACATATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAG 3636
Query 2054 CGGATGTATGTATAGAGAAAAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAA 2113
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Sbjct 3635 CGGATGTATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAA 3576
Query 2114 ACATTATTGATGAAGGTAAACTCTGTGTGTTAATAAATAGACATGGTTTAGAATGTAGTT 2173
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Sbjct 3575 ACATTATTGATGAAGGTAAACTTTGTATATTAATAAATAGAAATGGTTTAGAGTGTAGTT 3516
Query 2174 ACTATAGAGGTGTATCCTGTAATATTGGTGCCTTCGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGA 2233
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Sbjct 3515 ACTATAGAGGTGTATCATGTAATGTGGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGA 3456
Query 2234 AATATACCTTAGTGAGAATTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATTAA 2293
|||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3455 AATATATCTCAGTAAAAACTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATTAA 3396
Query 2294 AGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGTCCAGGATTAGATGTACA 2353
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Sbjct 3395 AGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGCCCAGGATTAGATGTACA 3336
Query 2354 TATTAATACTTACTATAAATGTACTAAAGATGAAGTAGAAGAAATGAGCTTACATCCTCA 2413
||||| | || | || || ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3335 TATTAGTCCT---TTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAAGAAATGAGCTTACATCCTCA 3279
Query 2414 GTTTGAAGATGATATATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGG 2473
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3278 GTTTGAAGATGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGG 3219
Query 2474 TAAATCAATAGGTGTAGATAGCATGGAGGAGTATGTAAAGGAGATGTAGTGAATGCTTAA 2533
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Sbjct 3218 TAAATCAATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAGGAGATGTAATTAATGGTAGA 3159
Query 2534 AGTATATTATACAGTTTATCATAGGCAGAGTATGAAAACGATTAAGGATAAGTTAGATAG 2593
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Sbjct 3158 AACTTATTATACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACTATTAAGGATTACTTAAGTAG 3099
Query 2594 AAGTGATTTAATTGACTTCCTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCC 2653
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Sbjct 3098 AAGTGATTTAATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCC 3039
Query 2654 AACAGATTATACTACGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGATAGATTAAT 2713
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Sbjct 3038 AACAGATTATACTACGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGTTAGACTAAT 2979
Query 2714 TGAAGCGGTTAATAGAGAAGGCATATTACTTATTAACCGTAGTAATTATATTACACTAAG 2773
||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||
Sbjct 2978 TGAAGCGGTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATCAACCGTAAT-----TATGAC----GT 2928
Query 2774 AGAGTGGTAGGATGTTGACAAATCATAAGTAGTGTGGTATAAT 2816
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Sbjct 2927 AGAGTTATAGGATGTTGACAAATTGTAAGTAGTGTGGTATAAT 2885
Score = 720 bits (798), Expect = 0.0
Identities = 438/470 (93%), Gaps = 1/470 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3677 CAAAAATAAATACACTAGGA-TATTATTCCCAGTGTATTGTATAAtttttttATAGAATA 3735
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Sbjct 1756 CAAAAAAAAATACACCAGGAATATTATTCCCAGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATA 1697
Query 3736 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGatttaattaaatttttaatt 3795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 1637
Query 3796 aatccgttttgtgttttatagtcttttattagtttttcattttCTATAATTAAATTATTA 3855
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Sbjct 1636 AATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTAGTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTA 1577
Query 3856 AATTCCTCTTCTGTTGTATTCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 3915
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Sbjct 1576 AATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 1517
Query 3916 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 3975
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Sbjct 1516 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 1457
Query 3976 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAGTTGTGATTTTGCATATTGTAATACATCTTCATTG 4035
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Sbjct 1456 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTGATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTG 1397
Query 4036 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTATANNNNNNNNN 4095
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Sbjct 1396 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTATAATTTTTTTA 1337
Query 4096 NNNNNNNNNNNNNGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACACTT 4145
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Sbjct 1336 TATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACCCTT 1287
Score = 551 bits (610), Expect = 5e-152
Identities = 329/345 (95%), Gaps = 0/345 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4405 TGGAGTTGTGGCAAATGGACGGCTACAGATGTACAGAACCGCCATTATATGAAAGCACAT 4464
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Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318
Query 4465 TAAACCATACACGCACATATACGGCTTTAATAGTAAGCATTAAAGGAAACTATGACACTG 4524
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Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258
Query 4525 TTCAAATGTTCCGCAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGAGCAAGCCCAACCGGCTAGCA 4584
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Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198
Query 4585 TGTTAGTAAATGTAATTGATGATGTGATTATAATCGTATATGAAAATGTTGTTTATGGAG 4644
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Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138
Query 4645 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTGTTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 4704
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Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78
Query 4705 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCTT 4749
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Sbjct 77 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCTT 33
Score = 304 bits (336), Expect = 1e-77
Identities = 199/217 (92%), Gaps = 3/217 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 4157 GTATAGTTATTCATAAGTCAATACTTTTGAGTAACttttttt-aaattcttttttcttct 4215
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890
Query 4216 atataatagtagtttttagccctaaaaa--gttttttaaaagaatttgtattttCTTATT 4273
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Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830
Query 4274 GACTTATTAATCATATGGTAGTAGTATTAAGGTACAGCAAGGGAACAGCAACAAGATATT 4333
||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |
Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770
Query 4334 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTGGAGATGATT 4370
|| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733
Score = 178 bits (196), Expect = 1e-39
Identities = 122/134 (91%), Gaps = 3/134 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 696 TTTAATGTACTTAAAATCTTAAGTAGCTCC-TTATCATTTAGGTCTGTTTAATTGAGAAT 754
|||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710
Query 755 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAAGTGTTGACAACTATGAAGCGGTTATGGTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||
Sbjct 4709 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGG-TCTGTTA 4651
Query 815 TAATTAGT-TATAA 827
|| ||||| |||||
Sbjct 4650 TACTTAGTATATAA 4637
>seq8440
Length=882
Score = 812 bits (900), Expect = 0.0
Identities = 477/495 (96%), Gaps = 0/495 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6213 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 6272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 823
Query 6273 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 6332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 763
Query 6333 GGGCAAGCAATTTTAAATGGTCGTTACTTTGACGGATACAGTAAAGGTGAACTTGAAGAA 6392
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||
Sbjct 762 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 703
Query 6393 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTAGTTATGCGTCATTGGGGTACACAAACA 6452
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 702 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 643
Query 6453 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAACTCAGAC 6512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 642 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 583
Query 6513 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTTCTTAGGAATTGAACCAAATTTTAGATACCTA 6572
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||
Sbjct 582 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 523
Query 6573 CCAAGCAAAGACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTTCAAGCC 6632
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 522 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 463
Query 6633 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 6692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 403
Query 6693 GGATTGATGAAAATG 6707
| |||||||||||||
Sbjct 402 GAATTGATGAAAATG 388
Score = 645 bits (714), Expect = 3e-180
Identities = 395/420 (94%), Gaps = 0/420 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7251 ACAAATCAAAGAGAAAAGGAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATT 7310
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 ACAAAATAAACTGAAAAGGAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATT 361
Query 7311 ATCGTACCTAAGGAAGATAACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAATAT 7370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 ATCGTACCTAAGGAAGATAACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAATAG 301
Query 7371 GTAAACAGTATCACAATGGAAGCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAGGGGCAATGG 7430
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 300 TTAAATAGCATCACAATGGAAGCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAAGGGCAATGG 241
Query 7431 TACTCAGAAGATGAAAAGCGTATCATGGAAGATAATAACTTAAATCTTGAATGGTATTAT 7490
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 240 TACTCAGAAGATGAAAAACGTATAATGGAAGATAACAACTTAAATCTTGAGTGGTATTAT 181
Query 7491 ATGAAAGACAGTGCAAAATTTATGACAGTTGAACTAAAAGGCATTGTAAGACGCTTAATT 7550
|| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 180 CTGCAAGACAGTGCAAAATTCATGACAGTTGAATTAAAAGGTATTGTAAGACGTTTAATT 121
Query 7551 GAAGTTTACGGACAAGAAGCAATAAGCATTAAAGTTAATGGCACATTGTACATTGTAGAC 7610
||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 GAAGTTTACGGACAAGAGGCTATCAGTATCAAAGTTAATGGCACATTGTACATTGTAGAC 61
Query 7611 CAATCAGACATTGAAGAATTACACACAACATTATTAAATATCATGAAATAAAAAATTTAT 7670
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 CAATCAGACATTGAAGAATTACACACAATATTATTAAATATCATGAAATAAAAAATTTAT 1
>seq3308
Length=2910
Score = 760 bits (842), Expect = 0.0
Identities = 489/530 (92%), Gaps = 3/530 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 8302 ATGAAGCAATTGAAGAATACGCATaaaaaaaCTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 8361
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2910 ATGAAGCAATCGAAGAATACGCATAAAAAAACTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 2851
Query 8362 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 8421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2850 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 2791
Query 8422 CGTAACATTAGTTAATGGAGAATTATTCATGTTTGCAACATTTAAGAAAGCAG-AGGCAG 8480
||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||| || || |||| | ||||
Sbjct 2790 TGTAACGTTAGTTAATCAAGAATTGTTTATGTATGCAACATTCAACAA-GCAGGAAGCAG 2732
Query 8481 AAAATAAATATCAAGAATGGTGTGACTTGTACGGTCAAGAAAATGTGAGCATGGaaaaaa 8540
|| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2731 AAGCCAAATATCAAGAATGGTGTGACTTATATGGTCAAGAAAATGTAAGCATGGAAAAAA 2672
Query 8541 aTTAAAATAAGCGGTTGACAAACTAACCGCTTCATGGTAATATTAAACTATACTAAAGAA 8600
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671 ATTAAAATAAGCTGTTGACAAACTAACCGCTTCATGATAATATTAAACTATACTAAAGAA 2612
Query 8601 AAGGAAATGATGACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCCAACTTGAAAGACTA 8660
|||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||
Sbjct 2611 AAGGTAATAATTACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCTAATTAGAGAGTCTA 2552
Query 8661 GAAAGAAAATCAGATGAGCAACTAGCAAACGGATATTATGAAGCCTTTGAAAGAACTTGC 8720
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2551 GAAAGAAAATCAGATGAGGAATTAGCAAACGGATACTATGACAGATTTGAAAGAACTTGT 2492
Query 8721 GCACAAATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTaa 8780
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491 GCACAGATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTAA 2432
Query 8781 aaaaaT-TAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTAGATGTTATTATTAA 8829
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2431 AAAAATCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAA 2382
Score = 738 bits (818), Expect = 0.0
Identities = 499/562 (89%), Gaps = 19/562 (3%)
Strand=Plus/Minus
Query 9951 TAAAGGAGATGTTGAACATGAACACAAGAAGGGTAAACAAAGCTTTAAATGAAGCAGTTA 10010
|| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||
Sbjct 588 TAGAGGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTC 529
Query 10011 GATTATTAGACAAGCAAATAGCAGACACACAGAAAACAATGCAGGAGTTAAATAACCAAC 10070
|||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 528 GATTATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAAC 469
Query 10071 ---------AGATAAGAGCTAAGCAGGAGCTAATGACATTAGTTGATGCTATGACTGGTG 10121
| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 468 TCGAGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTG 409
Query 10122 ATGATGAGTAATGAACATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACT 10181
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 ATGATGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACT 349
Query 10182 CCTGCAGGAGCAGAATAATATTAATAATGTAATGATAGATGACTACATCACAGAAGAGCT 10241
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Sbjct 348 CCTGCAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCT 289
Query 10242 TCACAGACGCACACAGAGAAGCGGAGCAATACAAATAGACAATAACACCGCTTCATATAG 10301
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Sbjct 288 ACACAGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAG 229
Query 10302 TAATGACTCATATGGTAGCTTAGAAGAG----------CTTATGACCTATCTTCATTATC 10351
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Sbjct 228 TAATGGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATC 169
Query 10352 TACTGATGAGATTAAAGAACTGCTTGAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTT 10411
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Sbjct 168 TACTGAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTT 109
Query 10412 TACAATCTTTTAGTTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGAT 10471
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Sbjct 108 TACAATATTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGAT 49
Query 10472 GAACATGAGAGACTTACAAGAA 10493
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Sbjct 48 GAACATGACAAACTTATTAGAA 27
Score = 309 bits (342), Expect = 3e-79
Identities = 248/298 (83%), Gaps = 12/298 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 8938 AAGAAAAT-TaaaaaaaGTGTTGACACTTtaaaaaatacatgttaatataaatatat--- 8993
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Sbjct 2433 AAAAAAATCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAAGATATTTA 2374
Query 8994 ------actaa--agaaaaggaattgataaaaatgaaattattaaaCAGAGACAACGAAA 9045
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Sbjct 2373 AAAAATACAAATAAGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAA 2314
Query 9046 TCGTAATTAGCATAGCAACATTAGAGAGCGTAAAACAAGCCTTAATTTGGGAATACATCG 9105
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Sbjct 2313 TCGTAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCG 2254
Query 9106 ACCACATAGATAATAACATCCTAGACAGTGAAATCTATGACCAAGAAGCGGTTGTCGTTA 9165
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Sbjct 2253 ACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGA 2194
Query 9166 CTTCTAAGACTCTACAATCAATCAAATTTGCAGACACTATGGAAGACCTGCAGGAATA 9223
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Sbjct 2193 CTTCTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAGAATA 2136
Score = 118 bits (130), Expect = 9e-22
Identities = 73/77 (95%), Gaps = 2/77 (3%)
Strand=Plus/Minus
Query 9695 AGGAAGCACATAGAGACACACA--GAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAG 9752
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Sbjct 1233 AGGAAGCACACAGACACACACACAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAG 1174
Query 9753 GAGATGTTGAAGATGAA 9769
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Sbjct 1173 GAGATGTTGAAGATGAA 1157
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 422515116831816
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