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BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Schistosoma_20haematobium_20[refseq_20GCF_5F000699445.1_202014-06- 09] 29,834 sequences; 375,894,156 total letters Query= NC_022920.1 Length=139738 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq2836 2076 0.0 seq3308 794 0.0 seq8440 217 1e-51 >seq2836 Length=4769 Score = 2076 bits (2302), Expect = 0.0 Identities = 1463/1656 (88%), Gaps = 50/1656 (3%) Strand=Plus/Minus Query 1 AAAAGCGGATGTTAATATTGAGGAGCTACTAGGAGATGATGTAGACATATTTGAATCTAT 60 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 4513 AAAAGCGGATGTTCGTATTGAGGAACTACTAGGAGATGACATAGATGTATTTGAATCTAT 4454 Query 61 AGCATTAGATTACTCTAATGATATTAATATCCTTGTAGGAGATAGTGGATACACGATAGT 120 || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4453 AGTATTAGATTACCCTAATGATATTAATATCCTTGTGGGAGATAGTGGATACTCGATAGT 4394 Query 121 TTATCAGAATGACTTTCTTACAATTAATGGATTGAGTATGGCTATAAGGGAGGTAGTAAG 180 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 4393 TTATCAGAATGATTTTCTTACAATTAATGGATTGAGTATAGCTATAAAGGAGGTAGTAAG 4334 Query 181 ATGGA---------TAAAGTATTAGAGTTTGTTATGAGTTATTTACTGTATCTTATAATG 231 ||| || | |||||| |||||| | || |||| || || | | Sbjct 4333 ATGATAGGTCAAATTATACTATTAGCTATTGTTAGTA--TAGTTACAATAGGTTGTG-TA 4277 Query 232 GGATTTATAGGTGTATG----GTTAGGAAGT-TTAATTATAGGGATG--AATATTAACCC 284 ||||| || | |||| ||| ||| |||| ||| |||| ||| ||| Sbjct 4276 GGATT-ATTTTTCTATGAGACGTTCAAGAGTATTAAGTAT---GATGCTAATGATAAAAT 4221 Query 285 TTTTACAAGT--TGG--GTACCTTA-TGT-AGTTGCTCTAAT-AGTATCTGTATCAGAGT 337 |||| | | ||| ||| ||| ||| |||| | | | ||| || || || Sbjct 4220 CTTTATGATTACTGGAAGTATATTAATGTTAGTTATTATCGTTAGTGG-TGCATTAGC-- 4164 Query 338 ATATATTTAAATATTATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAAATT 397 |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4163 -TATACTTGGC----ATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAAATT 4109 Query 398 GGTCTAGAAATATACTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGATAGGGCTTAGAATTGAAAGGA 457 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 4108 GGTCTAGAAATATATTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATTGAAAGGA 4049 Query 458 GAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAAGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAATT 517 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4048 GAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAGTT 3989 Query 518 TACTTGAGTATATTAATACTACTGTAGGTAGGGAATTAACTTATGGTATTAATACAGACT 577 |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3988 TACTTGAGTACATTAATACTACTGTAGATAAAGAATTAACTTATGGTATTAATACAGACT 3929 Query 578 ATGATAAGGATGTCGTGATTGAAACCGATGACCCCATAGATGAGGAGAATACGATTGATT 637 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3928 ATGATAAGGATGTAGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGAATACGATTGATT 3869 Query 638 TATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAGGTATACTGTA 697 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3868 TATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAATTATACTGTA 3809 Query 698 AGGCATTTGTTAATGGGGAACCTGTTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGATGTTATAAT 757 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3808 AGGCATTTGTTAATGGGGAACCTATTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGATGTTATAAT 3749 Query 758 GATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATTCCAAAGCTTTAAAGAAAGTATTAGAACA 817 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3748 GATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTATTAGAACA 3689 Query 818 TATTGATAATTGTAGTAGTAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGCGGATGT 877 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3688 TATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGCGGATGT 3629 Query 878 ATGTATAGAGAAAAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAACATTAT 937 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3628 ATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAACATTAT 3569 Query 938 TGATGAAGGTAAACTCTGTGTGTTAATAAATAGACATGGTTTAGAATGTAGTTACTATAG 997 ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3568 TGATGAAGGTAAACTTTGTATATTAATAAATAGAAATGGTTTAGAGTGTAGTTACTATAG 3509 Query 998 AGGTGTATCCTGTAATATTGGTGCCTTCGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAAATATAC 1057 ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3508 AGGTGTATCATGTAATGTGGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAAATATAT 3449 Query 1058 CTTAGTGAGAATTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATTAAAGAGACC 1117 || ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3448 CTCAGTAAAAACTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATTAAAGAGACC 3389 Query 1118 GCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGTCCAGGATTAGATGTACATATTAAT 1177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct 3388 GCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGCCCAGGATTAGATGTACATATTAGT 3329 Query 1178 ACTTACTATAAATGTACTAAAGATGAAGTAGAAGAAATGAGCTTACATCCTCAGTTTGAA 1237 || | || || ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3328 CCT---TTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAAGAAATGAGCTTACATCCTCAGTTTGAA 3272 Query 1238 GATGATATATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGGTAAATCA 1297 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3271 GATGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGGTAAATCA 3212 Query 1298 ATAGGTGTAGATAGCATGGAGGAGTATGTAAAGGAGATGTAGTGAATGCTTAAAGTATAT 1357 |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||| | || ||| Sbjct 3211 ATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAGGAGATGTAATTAATGGTAGAAACTTAT 3152 Query 1358 TATACAGTTTATCATAGGCAGAGTATGAAAACGATTAAGGATAAGTTAGATAGAAGTGAT 1417 |||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| Sbjct 3151 TATACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACTATTAAGGATTACTTAAGTAGAAGTGAT 3092 Query 1418 TTAATTGACTTCCTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCCAACAGAT 1477 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3091 TTAATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCCAACAGAT 3032 Query 1478 TATACTACGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGATAGATTAATTGAAGCG 1537 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 3031 TATACTACGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGTTAGACTAATTGAAGCG 2972 Query 1538 GTTAATAGAGAAGGCATATTACTTATTAACCGTAGTAATTATATTACACTAAGAGAGTGG 1597 |||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| || ||||| Sbjct 2971 GTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATCAACCGTAAT-----TATGAC----GTAGAGTTA 2921 Query 1598 TAGGATGTTGACAAATCATAAGTAGTGTGGTATAAT 1633 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2920 TAGGATGTTGACAAATTGTAAGTAGTGTGGTATAAT 2885 Score = 720 bits (798), Expect = 0.0 Identities = 438/470 (93%), Gaps = 1/470 (0%) Strand=Plus/Minus Query 2494 CAAAAATAAATACACTAGGA-TATTATTCCCAGTGTATTGTATAAtttttttATAGAATA 2552 |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1756 CAAAAAAAAATACACCAGGAATATTATTCCCAGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATA 1697 Query 2553 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGatttaattaaatttttaatt 2612 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1696 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 1637 Query 2613 aatccgttttgtgttttatagtcttttattagtttttcattttCTATAATTAAATTATTA 2672 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1636 AATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTAGTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTA 1577 Query 2673 AATTCCTCTTCTGTTGTATTCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 2732 ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1576 AATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 1517 Query 2733 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 2792 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1516 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 1457 Query 2793 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAGTTGTGATTTTGCATATTGTAATACATCTTCATTG 2852 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1456 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTGATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTG 1397 Query 2853 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTATANNNNNNNNN 2912 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1396 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTATAATTTTTTTA 1337 Query 2913 NNNNNNNNNNNNNGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACACTT 2962 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1336 TATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACCCTT 1287 Score = 482 bits (534), Expect = 2e-131 Identities = 316/347 (91%), Gaps = 6/347 (2%) Strand=Plus/Minus Query 3222 TGGAGTTGTGGCAAATGGACGGCTACAGATGTACAGAACCGCCATTATATGAAAGCACAT 3281 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318 Query 3282 TAAACCATACACGCACATATACGGCTTTAATAGTAAGCATTAAAGGAAACTATGACACTG 3341 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258 Query 3342 TTCAAATGTTCCGCAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGAGCAAGCCCAACCGGCTAGCA 3401 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198 Query 3402 TGTTAGTAAATGTAATTGATGATGTGATTATAATCGTATATGAAAATGTTGTTTATGGAG 3461 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138 Query 3462 TTCAAGACAAAGAAATAAAATTTGTTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAAT---CCT 3518 | || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78 Query 3519 CAAGCATCTATAGTAATATAATAGGTGTAGGGGATAGCAACACACCT 3565 ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 77 TAAGA---TGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCT 34 Score = 304 bits (336), Expect = 1e-77 Identities = 199/217 (92%), Gaps = 3/217 (1%) Strand=Plus/Minus Query 2974 GTATAGTTATTCATAAGTCAATACTTTTGAGTAACttttttt-aaattcttttttcttct 3032 ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890 Query 3033 atataatagtagtttttagccctaaaaa--gttttttaaaagaatttgtattttCTTATT 3090 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830 Query 3091 GACTTATTAATCATATGGTAGTAGTATTAAGGTACAGCAAGGGAACAGCAACAAGATATT 3150 ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770 Query 3151 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTGGAGATGATT 3187 || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733 Score = 178 bits (196), Expect = 1e-39 Identities = 122/134 (91%), Gaps = 3/134 (2%) Strand=Plus/Minus Query 139251 TTTAATGTACTTAAAATCTTAAGTAGCTCC-TTATCATTTAGGTCTGTTTAATTGAGAAT 139309 |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710 Query 139310 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAAGTGTTGACAACTATGAAGCGGTTATGGTA 139369 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || Sbjct 4709 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGG-TCTGTTA 4651 Query 139370 TAATTAGT-TATAA 139382 || ||||| ||||| Sbjct 4650 TACTTAGTATATAA 4637 Score = 158 bits (174), Expect = 1e-33 Identities = 111/127 (87%), Gaps = 0/127 (0%) Strand=Plus/Minus Query 139612 ATAAGGAGATGAATAATATGATTAGTATTTACTTACACAGTGGATATAGTAAAGATAAGT 139671 ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 4640 ATAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGTAGATATAGTAAAGATAAGT 4581 Query 139672 TGAAAGATATACTCAAGACAATAAGGGATTTTGCTCCTAGGGAGTTAACCTATGATTTTA 139731 | ||| ||| || || |||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct 4580 TAAAATTTATCCTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTAGAGAATTAACCTACGATTTTA 4521 Query 139732 GGAATCC 139738 | ||||| Sbjct 4520 GAAATCC 4514 >seq3308 Length=2910 Score = 794 bits (880), Expect = 0.0 Identities = 527/588 (90%), Gaps = 19/588 (3%) Strand=Plus/Minus Query 7478 TAAAGGAGATGTTGAACATGAACACAAGAAGGGTAAACAAAGCTTTAAATGAAGCAGTTA 7537 || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| Sbjct 588 TAGAGGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTC 529 Query 7538 GATTATTAGACAAGCAAATAGCAGACACACAGAAAACAATGCAGGAGTTAAATAACCAAC 7597 |||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||| Sbjct 528 GATTATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAAC 469 Query 7598 ---------AGATAAGAGCTAAGCAGGAGCTAATGACATTAGTTGATGCTATGACTGGTG 7648 | |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 468 TCGAGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTG 409 Query 7649 ATGATGAGTAATGAACATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACT 7708 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 408 ATGATGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACT 349 Query 7709 CCTGCAGGAGCAGAATAATATTAATAATGTAATGATAGATGACTACATCACAGAAGAGCT 7768 ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 348 CCTGCAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCT 289 Query 7769 TCACAGACGCACACAGAGAAGCGGAGCAATACAAATAGACAATAACACCGCTTCATATAG 7828 ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 288 ACACAGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAG 229 Query 7829 TAATGACTCATATGGTAGCTTAGAAGAG----------CTTATGACCTATCTTCATTATC 7878 ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 228 TAATGGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATC 169 Query 7879 TACTGATGAGATTAAAGAACTGCTTGAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTT 7938 |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 168 TACTGAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTT 109 Query 7939 TACAATCTTTTAGTTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGAT 7998 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 108 TACAATATTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGAT 49 Query 7999 GAACATGAGAGACTTATTAGAACAGGAACAATTAGAAAAAGACGTAAA 8046 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 48 GAACATGACAAACTTATTAGAACAGGAACAATTAGAAAAAGACGTAAA 1 Score = 760 bits (842), Expect = 0.0 Identities = 489/530 (92%), Gaps = 3/530 (1%) Strand=Plus/Minus Query 5829 ATGAAGCAATTGAAGAATACGCATaaaaaaaCTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 5888 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2910 ATGAAGCAATCGAAGAATACGCATAAAAAAACTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 2851 Query 5889 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 5948 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2850 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 2791 Query 5949 CGTAACATTAGTTAATGGAGAATTATTCATGTTTGCAACATTTAAGAAAGCAG-AGGCAG 6007 ||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||| || || |||| | |||| Sbjct 2790 TGTAACGTTAGTTAATCAAGAATTGTTTATGTATGCAACATTCAACAA-GCAGGAAGCAG 2732 Query 6008 AAAATAAATATCAAGAATGGTGTGACTTGTACGGTCAAGAAAATGTGAGCATGGaaaaaa 6067 || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2731 AAGCCAAATATCAAGAATGGTGTGACTTATATGGTCAAGAAAATGTAAGCATGGAAAAAA 2672 Query 6068 aTTAAAATAAGCGGTTGACAAACTAACCGCTTCATGGTAATATTAAACTATACTAAAGAA 6127 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2671 ATTAAAATAAGCTGTTGACAAACTAACCGCTTCATGATAATATTAAACTATACTAAAGAA 2612 Query 6128 AAGGAAATGATGACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCCAACTTGAAAGACTA 6187 |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||| Sbjct 2611 AAGGTAATAATTACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCTAATTAGAGAGTCTA 2552 Query 6188 GAAAGAAAATCAGATGAGCAACTAGCAAACGGATATTATGAAGCCTTTGAAAGAACTTGC 6247 |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 2551 GAAAGAAAATCAGATGAGGAATTAGCAAACGGATACTATGACAGATTTGAAAGAACTTGT 2492 Query 6248 GCACAAATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTaa 6307 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2491 GCACAGATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTAA 2432 Query 6308 aaaaaT-TAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTAGATGTTATTATTAA 6356 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct 2431 AAAAATCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAA 2382 Score = 309 bits (342), Expect = 3e-79 Identities = 248/298 (83%), Gaps = 12/298 (4%) Strand=Plus/Minus Query 6465 AAGAAAAT-TaaaaaaaGTGTTGACACTTtaaaaaatacatgttaatataaatatat--- 6520 || ||||| |||| || | |||||||||| | ||||||||||||| || |||| Sbjct 2433 AAAAAAATCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAAGATATTTA 2374 Query 6521 ------actaa--agaaaaggaattgataaaaatgaaattattaaaCAGAGACAACGAAA 6572 || || |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || |||| Sbjct 2373 AAAAATACAAATAAGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAA 2314 Query 6573 TCGTAATTAGCATAGCAACATTAGAGAGCGTAAAACAAGCCTTAATTTGGGAATACATCG 6632 |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct 2313 TCGTAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCG 2254 Query 6633 ACCACATAGATAATAACATCCTAGACAGTGAAATCTATGACCAAGAAGCGGTTGTCGTTA 6692 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || | Sbjct 2253 ACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGA 2194 Query 6693 CTTCTAAGACTCTACAATCAATCAAATTTGCAGACACTATGGAAGACCTGCAGGAATA 6750 ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| Sbjct 2193 CTTCTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAGAATA 2136 Score = 118 bits (130), Expect = 9e-22 Identities = 73/77 (95%), Gaps = 2/77 (3%) Strand=Plus/Minus Query 7222 AGGAAGCACATAGAGACACACA--GAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAG 7279 |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1233 AGGAAGCACACAGACACACACACAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAG 1174 Query 7280 GAGATGTTGAAGATGAA 7296 ||||||||||||||||| Sbjct 1173 GAGATGTTGAAGATGAA 1157 >seq8440 Length=882 Score = 217 bits (240), Expect = 1e-51 Identities = 270/363 (74%), Gaps = 29/363 (8%) Strand=Plus/Minus Query 4754 ACAAATCAAACAGAAAAGGAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATT 4813 ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 ACAAAATAAACTGAAAAGGAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATT 361 Query 4814 ATCGTACCTCAAAAAGATAATAACGGTGTTGAAATCTCAAGCCCTGAAATTAAA-AATAC 4872 ||||||||| | ||||||| ||||| ||||| || || | |||||| |||| Sbjct 360 ATCGTACCTAAGGAAGATAACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAATA- 302 Query 4873 AGTGAATAACATCAC--TAGAATTGCGGGCGGTTGCACTATCACAGACGTTAAAGGTCAA 4930 | |||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| Sbjct 301 GTTAAATAGCATCACAATGGAA--GCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAAGGGCAA 244 Query 4931 TGGTGGTCAGACGATGAAAAACGTATTATGGAAGATGATAATCTTAATTATGAATGGTAC 4990 |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || | ||| ||| ||||| Sbjct 243 TGGTACTCAGAAGATGAAAAACGTATAATGGAAGATAACAACTTAAATCTTGAGTGGTAT 184 Query 4991 TATAACAAAGATA-TACAAGACGTAAACGACCAACAAGGTTTATTAAAAGGTTTATCAAC 5049 ||| |||| | | ||| | | | ||| || | ||||||||| Sbjct 183 TATCTGCAAGACAGTGCAAAA--TTCATGAC-----AGTTGAATTAAAAGG--------- 140 Query 5050 TATTGCAAGAATTTTAATAACTGAA---TACGGTCAAGAAGCAATCAGTATTAAAATCAA 5106 ||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || Sbjct 139 TATTGTAAGACGTTTAAT---TGAAGTTTACGGACAAGAGGCTATCAGTATCAAAGTTAA 83 Query 5107 TGG 5109 ||| Sbjct 82 TGG 80 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 446866889994720