Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Schistosoma_20haematobium_20[refseq_20GCF_5F000699445.1_202014-06- 09] 29,834 sequences; 375,894,156 total letters Query= NC_025416.1 Length=141907 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq2836 2331 0.0 seq8440 957 0.0 seq3308 545 2e-150 >seq2836 Length=4769 Score = 2331 bits (2584), Expect = 0.0 Identities = 1553/1724 (90%), Gaps = 11/1724 (1%) Strand=Plus/Minus Query 139284 TTAATATGTAAGGAGATGAATAATATGATTGATATCTATTTACACAGTGAATATGATAAA 139343 ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| Sbjct 4647 TTAGTATATAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGTAGATATAGTAAA 4588 Query 139344 GATAAGTTAAAATTTATCCTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTAGAGAGTTAACCTAT 139403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4587 GATAAGTTAAAATTTATCCTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTAGAGAATTAACCTAC 4528 Query 139404 GATTTTAGGAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATTGAGGAACTACTAGGAGATGACATAGAT 139463 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4527 GATTTTAGAAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATTGAGGAACTACTAGGAGATGACATAGAT 4468 Query 139464 GTATTTGAATCTATAGTATTAGATTACCCTAATGATATTAATATCCTTGTAGGAGATAGT 139523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4467 GTATTTGAATCTATAGTATTAGATTACCCTAATGATATTAATATCCTTGTGGGAGATAGT 4408 Query 139524 GGTTATACGATAGTTTATCAGAATGATTTTCTTACAATTAATGGATTGAGAATGGCTATA 139583 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 4407 GGATACTCGATAGTTTATCAGAATGATTTTCTTACAATTAATGGATTGAGTATAGCTATA 4348 Query 139584 AAGGAGGTAGTAAAATGATAGGTCAAATTATACTATTAGCTATTGTTAGTATAGTTACAA 139643 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4347 AAGGAGGTAGTAAGATGATAGGTCAAATTATACTATTAGCTATTGTTAGTATAGTTACAA 4288 Query 139644 TAGGTTGTGTAGGTTTATTTTTCTATGAGACGTTCAAGAGTATTAAGTATGATGCTAATG 139703 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4287 TAGGTTGTGTAGGATTATTTTTCTATGAGACGTTCAAGAGTATTAAGTATGATGCTAATG 4228 Query 139704 ATAAAATCTTTATGGTTACTGGGAGTATATTAATGTTAGTTATTATCGTTAGCGGTACAT 139763 |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct 4227 ATAAAATCTTTATGATTACTGGAAGTATATTAATGTTAGTTATTATCGTTAGTGGTGCAT 4168 Query 139764 TAGCTATACTTGGCATTTAGAGCTTATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAAATTG 139823 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4167 TAGCTATACTTGGCATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAAATTG 4108 Query 139824 GTTTAAGGGTATAATAGATGCTCTGTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATTGAAAGGAG 139883 || || |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4107 GTCTAGAAATATATTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATTGAAAGGAG 4048 Query 139884 GGGATTATAATTATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAGT 139943 | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4047 AGA--TATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAGT 3990 Query 139944 TTACTTGAGTATATTAATGATACTGTAGGTAGGGAATTAACTTATGGTATTAATACAGAC 140003 ||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3989 TTACTTGAGTACATTAATACTACTGTAGATAAAGAATTAACTTATGGTATTAATACAGAC 3930 Query 140004 TATGATAAGGATGTAGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGAATACGATTGAT 140063 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3929 TATGATAAGGATGTAGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGAATACGATTGAT 3870 Query 140064 TTATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAATTATACTGT 140123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3869 TTATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAATTATACTGT 3810 Query 140124 AAAGCATTTGTTAATGGGGAACCTGTTATTATACGTAAGTATGTAGAGGAGATGTTATAA 140183 || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3809 AAGGCATTTGTTAATGGGGAACCTATTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGATGTTATAA 3750 Query 140184 TGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATTCCAAGGCTTTAAAGAAAGTATTAGAAC 140243 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3749 TGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTATTAGAAC 3690 Query 140244 ATATTGATAATTGTAGTAGTAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGCGGATG 140303 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3689 ATATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGCGGATG 3630 Query 140304 TATGTATAGAGAAAAATGTATTTAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAACATTA 140363 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3629 TATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAACATTA 3570 Query 140364 TTGATGAAGGTAAACTCTGTGTGTTAATAAATAGACATGGTTTAGAATGTAGTTACTATA 140423 |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3569 TTGATGAAGGTAAACTTTGTATATTAATAAATAGAAATGGTTTAGAGTGTAGTTACTATA 3510 Query 140424 GAGGTGTATCATGTAATATTGGTGCCTTCGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAGATATA 140483 ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3509 GAGGTGTATCATGTAATGTGGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAAATATA 3450 Query 140484 TCTCAGTGAGAATTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAATGGATTAAGGAGAC 140543 ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 3449 TCTCAGTAAAAACTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATTAAAGAGAC 3390 Query 140544 CGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGGAAACCTGGATTGGATGTTTATGTTAA 140603 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| || ||| Sbjct 3389 CGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGCCCAGGATTAGATGTACATATTAG 3330 Query 140604 TCCCTATAGGTGTACTAAAGACGAAGTTGAAGAATGGAGTACACTTCCTCCATTTGAAGA 140663 ||| | ||| | ||| || || || ||||||||| ||| || ||||| |||||||| Sbjct 3329 TCCTTTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAAGAAATGAGCTTACATCCTCAGTTTGAAGA 3270 Query 140664 TGATATACTTGTATTTATAGCGGAGACGTGGATACATGAATACCATAGAGGTAAATCAAT 140723 |||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || | || ||||||||||| Sbjct 3269 TGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGGTAAATCAAT 3210 Query 140724 AGGTGTAGATAGTATGGAAGAGTATGTAAAGGAGATGTAAGTAATGTTTAAAGTATATTA 140783 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| Sbjct 3209 AGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAGGAGATGTAATTAATGGTAGAAACTTATTA 3150 Query 140784 TACAGTCTACCATAGAGGTAGTATGAAAACAATTAAGGATAAGCTAGATAGAAGTAGTTT 140843 |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||| Sbjct 3149 TACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACTATTAAGGATTACTTAAGTAGAAGTGATTT 3090 Query 140844 AATATACTTCTTGTATGACACTTGGTATAAAGATATTAGTAACGTATTCCCTAATCACTA 140903 ||| ||||||| ||| | |||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| | | || Sbjct 3089 AATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCCAACAGATTA 3030 Query 140904 TAATAAAGAGTTTGGGAGTAA---GAGTGATGATATAGATATAGATAAACTTATTGAAGC 140960 || || || || | || || || |||||| ||| || ||| |||||||| Sbjct 3029 TACTA---CGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGTTAGACTAATTGAAGC 2973 Query 140961 GGTTAATGAGGAAGGTATATTACTTATCAATAGAGGTAATTATG 141004 ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2972 GGTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATCAA---CCGTAATTATG 2932 Score = 621 bits (688), Expect = 3e-173 Identities = 395/440 (90%), Gaps = 1/440 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 AGTGTATTGTATAAtttttttATAGAATATTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1725 AGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATATTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTT 1666 Query 61 CATGTTGTGatttaattaaatttttaattaatccgttttgtgttttgtaatcttttatta 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || Sbjct 1665 CATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATTAATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTA 1606 Query 121 gtttttCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTGTATCCTCATCTACAT 180 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1605 GTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTAAATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACAT 1546 Query 181 AAAATTTACTTTCATATATTTCATAATATTTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1545 AAAATTTACTTTCATATATTTCATAATATTTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTG 1486 Query 241 ATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCTTTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAGTTGTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1485 ATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCTTTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTG 1426 Query 301 ATTTTGCATACTGTAATACGTCTTCATTGTCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTT 360 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1425 ATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTGTCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTT 1366 Query 361 AAATCAAATCCTTTTCTTATAATTTTTNNANNTAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTG 420 |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1365 AAATCAAATCCTTTTC-TATAATTTTTTTATATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTG 1307 Query 421 TCCCTTGCCTTACTACACTT 440 |||||||||||||||| ||| Sbjct 1306 TCCCTTGCCTTACTACCCTT 1287 Score = 560 bits (620), Expect = 1e-154 Identities = 331/345 (96%), Gaps = 0/345 (0%) Strand=Plus/Minus Query 700 TGGAGTTGTGGCAGATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCCATTATATGAAAGCACAT 759 ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318 Query 760 TAAACCATACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAAGGAAACTACGACACTG 819 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258 Query 820 TTCAAATGTTCCGCAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCCCAACCGGCTAGCA 879 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198 Query 880 TGTTAGTAAATGTAATTGATGATGTGATTATAATCGTATATGAAAATGTTGTTTACGGGG 939 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138 Query 940 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTGTTGAAGAAATTTAAAAATAAGGGTTGCAATACCCCT 999 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78 Query 1000 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCTT 1044 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 77 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCTT 33 Score = 300 bits (332), Expect = 1e-76 Identities = 198/217 (91%), Gaps = 3/217 (1%) Strand=Plus/Minus Query 452 GTATAGTTATTCAGAAGTCAATACTTTTGAGTAACttttttt-aaattcttttttcttct 510 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890 Query 511 atataatagtagtttttagccctaaaaatg--tttttaaaaGAATTTGCATTTTCTTATT 568 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830 Query 569 GACTTTATTATCATATGGTAGTAATATAAAGGTACAGCAAGGGAACAGCAACAAGATATT 628 ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770 Query 629 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTGGAGATGATT 665 || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733 Score = 167 bits (184), Expect = 2e-36 Identities = 119/134 (89%), Gaps = 2/134 (1%) Strand=Plus/Minus Query 138954 TTTAATGTACCTAAAATCGTAAGTAGCTCC-TTATCATTTAGGTCTGTTTAATTGAGAAT 139012 ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710 Query 139013 ATTGAAAGATATCCGCTTCAAATGTAATTAAGTGTTGACAACTATGAAGCGGTTATGGTA 139072 ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | || || Sbjct 4709 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGG-TCTGTTA 4651 Query 139073 TAATTAATATATAA 139086 || ||| ||||||| Sbjct 4650 TACTTAGTATATAA 4637 >seq8440 Length=882 Score = 957 bits (1060), Expect = 0.0 Identities = 722/843 (86%), Gaps = 29/843 (3%) Strand=Plus/Minus Query 3178 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 3237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 882 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 823 Query 3238 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAACTAAAGCAGAAAACAAA 3297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 822 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 763 Query 3298 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGATATAGCAAGGGTGAGCTTGAGGAA 3357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 762 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 703 Query 3358 AAATATGCAATCGAAATTGATGGCAACAAATTAATTATGAGACATTGGGGCACACAAACA 3417 ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||| Sbjct 702 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 643 Query 3418 ATTGAGATTGACTTAAGCGTAAATGAAATTGTTTCATACTATGGTGAAAGCAACTCAGAC 3477 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| Sbjct 642 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 583 Query 3478 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 3537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 582 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 523 Query 3538 CCAAGCAAAGACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTTCAAGCC 3597 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 522 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 463 Query 3598 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 3657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 462 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 403 Query 3658 GAATTGATGAAAATGTTTAAATTACAAAATAAAGTGGAAATTATCGTACCTAAATATACT 3717 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 402 GAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATTATCGTACCTAAGGAAGAT 343 Query 3718 AATAGTGGTAAAGAGATTTCAAGCCCTGCAATTAAAGAAGCGGTTAACAATGCAACTAAA 3777 || | || |||||| || | ||||||||| ||||| | ||| | | | Sbjct 342 AACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAA-TAGTTAA-ATAGCATC-ACA 286 Query 3778 AT---ATGTGGAGGTTGTACGATAACTGAAATCAAGGGACAATGGTGGTCAGACGATGAG 3834 || | || |||||||| || || ||||| || || ||||||| ||||| ||||| Sbjct 285 ATGGAAGCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAAGGGCAATGGTACTCAGAAGATGAA 226 Query 3835 CAACGTATTATGGAAGATGACAACTTAAATCTTGAGTGGTACTATGACAAAGGTATGCAA 3894 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||| Sbjct 225 AAACGTATAATGGAAGATAACAACTTAAATCTTGAGTGGTATTA---------TCTGCAA 175 Query 3895 GACATGAACGACCAACAAGGGTTATTACA--AGCCTTATCAAAG--ATTGCTAGACAATT 3950 |||| | ||| | | || ||| | ||| |||| |||| |||| || Sbjct 174 GACA-----GTGCAAAA---TTCATGACAGTTGAATTA--AAAGGTATTGTAAGACGTTT 125 Query 3951 GATTGTATTCTATGAACAAGAGGCAATCAGTATAAAAATTAATGGTACACTATATATTAT 4010 |||| | | || | ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| | || ||| | Sbjct 124 AATTGAAGTTTACGGACAAGAGGCTATCAGTATCAAAGTTAATGGCACATTGTACATTGT 65 Query 4011 AGA 4013 ||| Sbjct 64 AGA 62 >seq3308 Length=2910 Score = 545 bits (604), Expect = 2e-150 Identities = 398/466 (85%), Gaps = 0/466 (0%) Strand=Plus/Minus Query 6352 AGGAGATGTTGAACATGAACACAAGAAGAGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCAGTTAGAT 6411 ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct 585 AGGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTCGAT 526 Query 6412 TATTAGACAAGCAAATAGCAGACACACAGAAGACAATGCAAGAATTAAATAAACAACTAG 6471 ||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| | Sbjct 525 TATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTCG 466 Query 6472 AACAACAGATAAAGGCTAAGCAGGAGCTAATGACATTAGTGGATGCTATGACTGGTGATG 6531 | | || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| Sbjct 465 AGAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTGATG 406 Query 6532 ATGAGTAATGAACATTAGAGAGGTTCACAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGTAAACTCCT 6591 ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 405 ATGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACTCCT 346 Query 6592 GCAGGAGCAGGTTCACCCAACGGATAACCTCATAGAGCAGTACATCAATAATGAGCTACA 6651 |||||| || | | | || ||||||| | ||||||| | |||||||| Sbjct 345 GCAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCTACA 286 Query 6652 CAGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAA 6711 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 285 CAGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAA 226 Query 6712 TGGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGNNNNNNNNNNNNTATGACCTATCTTCATTATCTAC 6771 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 225 TGGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATCTAC 166 Query 6772 TGATGAGATTAAAGAACTGCTTGAAACATTTGTTTAAATTTATTTA 6817 ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| Sbjct 165 TGAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTA 120 Score = 457 bits (506), Expect = 8e-124 Identities = 285/305 (93%), Gaps = 1/305 (0%) Strand=Plus/Minus Query 4982 AAGCGGTTGACAAACTAACCGCTTCATGATAATATTAAACTATACTAAAGAAAAGGAAAT 5041 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2663 AAGCTGTTGACAAACTAACCGCTTCATGATAATATTAAACTATACTAAAGAAAAGGTAAT 2604 Query 5042 GATTACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCCAATTAGAGAGACTAGAAAGAAA 5101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct 2603 AATTACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCTAATTAGAGAGTCTAGAAAGAAA 2544 Query 5102 ATCAGATGAAGAATTAGCAAACGGATACTATGAAGCATTTGAAAGAACTTGCGCACAGAT 5161 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2543 ATCAGATGAGGAATTAGCAAACGGATACTATGACAGATTTGAAAGAACTTGTGCACAGAT 2484 Query 5162 TAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAATTCAGAAACTGTTTaaaaaaaTCT 5221 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2483 TAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTAAAAAAATCT 2424 Query 5222 AAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTAAATGTTAATATTAATACA-TAAGGTAAAACAA 5280 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | | || |||| Sbjct 2423 AAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAAGATATTTAAAAAATACAA 2364 Query 5281 ATAAG 5285 ||||| Sbjct 2363 ATAAG 2359 Score = 408 bits (452), Expect = 4e-109 Identities = 269/298 (90%), Gaps = 11/298 (4%) Strand=Plus/Minus Query 5372 AAGAAAATTaaaaaaaGGTCTTGACACCTTAAACAATAAATGATAATATTAAACTAT--- 5428 || ||||| ||| |||| ||||||| | | | || ||| ||||||||| ||| Sbjct 2433 AAAAAAATCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAAGATATTTA 2374 Query 5429 ------ACTAA--AGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAA 5480 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2373 AAAAATACAAATAAGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAA 2314 Query 5481 TCGTAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCG 5540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2313 TCGTAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCG 2254 Query 5541 ACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGA 5600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2253 ACCACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGA 2194 Query 5601 CTTCTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGAACTAGAAGAATA 5658 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2193 CTTCTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAGAATA 2136 Score = 129 bits (142), Expect = 5e-25 Identities = 74/76 (97%), Gaps = 0/76 (0%) Strand=Plus/Minus Query 4764 ATGAAGCAATCGAAGAATATGCATaaaaaaaCTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 4823 ||||||||||||||||||| 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