Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Schistosoma_20haematobium_20[refseq_20GCF_5F000699445.1_202014-06- 09] 29,834 sequences; 375,894,156 total letters Query= NC_025417.1 Length=140903 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq2836 1481 0.0 seq3308 874 0.0 seq8440 818 0.0 >seq2836 Length=4769 Score = 1481 bits (1642), Expect = 0.0 Identities = 1079/1246 (87%), Gaps = 16/1246 (1%) Strand=Plus/Minus Query 976 TTAGCTATACTTGGAATATAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTAGAGGGGATTT 1035 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct 4168 TTAGCTATACTTGGCATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAAATT 4109 Query 1036 GTCCTA-AAATAGTATACCGCTTCTATATGGAAGGCTGAGAGGTCTTAGAATTGAAAGGA 1094 | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4108 GGTCTAGAAATATATTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATTGAAAGGA 4049 Query 1095 GAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAGTT 1154 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4048 GAGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACATTAAGGAGTT 3989 Query 1155 TACTTGAGTATATTAATGATACTGTAGGTAGGGAATTAACTTATGGTATTAATACAGACT 1214 |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3988 TACTTGAGTACATTAATACTACTGTAGATAAAGAATTAACTTATGGTATTAATACAGACT 3929 Query 1215 ATGATAAGGATGTCGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGGATACAATTGAGT 1274 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | Sbjct 3928 ATGATAAGGATGTAGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGAATACGATTGATT 3869 Query 1275 TATCAGGTA---CAAACATGTTCAAGGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAGCTATACT 1331 ||||| | | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3868 TATCAAATCTTCCTCAC---TTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAATTATACT 3812 Query 1332 GTAAGGCATTTGTTAATGGTGAACCTGTTATTATACGTAAGTATGTAGAGGAGATGTTAT 1391 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3811 GTAAGGCATTTGTTAATGGGGAACCTATTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGATGTTAT 3752 Query 1392 AATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTATTAGA 1451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3751 AATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGTATTAGA 3692 Query 1452 ACATATTGATAATTGTAGTAGTAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGCGGA 1511 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3691 ACATATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGAAGCGGA 3632 Query 1512 TGTATGTATAGAGAAAAATGTATTTAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAACAT 1571 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3631 TGTATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTCAAACAT 3572 Query 1572 TATTGATGAAGGTAAACTTTGTATACTAATAAATAGACATGGTTTAGAATGTAGCTACTA 1631 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| Sbjct 3571 TATTGATGAAGGTAAACTTTGTATATTAATAAATAGAAATGGTTTAGAGTGTAGTTACTA 3512 Query 1632 TAGAGGTATATCATGTAATATTGGTTCCTTCGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAGATA 1691 ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3511 TAGAGGTGTATCATGTAATGTGGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATAGAAATA 3452 Query 1692 TACCTTAGTGAAAATTATGATAAGAATTTACTAAAAGCAGAATTAAAATGGATTAAAGAG 1751 || || ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 3451 TATCTCAGTAAAAACTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATTAAAGAG 3392 Query 1752 ACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGTCCAGGATTGGATGTTTATGTT 1811 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || Sbjct 3391 ACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGCCCAGGATTAGATGTACATATT 3332 Query 1812 AATCCCTATAGGTGTACTAAAGACGAAGTTGAAGAATGGAGTACACTTCCTCCATTTGAA 1871 | ||| | ||| | ||| || || || ||||||||| ||| || ||||| |||||| Sbjct 3331 AGTCCTTTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAAGAAATGAGCTTACATCCTCAGTTTGAA 3272 Query 1872 GATGATATACTTGTATTTATAGCGGAGACGTGGATACATGAATATCTTAAGGGTGAATCA 1931 |||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| Sbjct 3271 GATGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGGTAAATCA 3212 Query 1932 ATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAGTATGTAAAGGAGATGTAACTAATGTTTAAGGTATAT 1991 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||| Sbjct 3211 ATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAGGAGATGTAATTAATGGTAGAAACTTAT 3152 Query 1992 TATACAGTCTACCATAGAGGTAGTATGAAAACTATTAAGGATAAGCTAGATAGAAGTAGT 2051 |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||| | Sbjct 3151 TATACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACTATTAAGGATTACTTAAGTAGAAGTGAT 3092 Query 2052 TTAATATACTTCTTGTATGATACTTGGTATAAAGATATTAGTAACGTATTCCCTAATCAC 2111 ||||| ||||||| ||| | |||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| | | Sbjct 3091 TTAATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCCAACAGAT 3032 Query 2112 TATAATAAAGAGTTTGGGAGTAA---GAGTGATGATATAGATATAGATAAACTTATTGAA 2168 |||| || || || | || || || |||||| ||| || ||| |||||| Sbjct 3031 TATACTA---CGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGTTAGACTAATTGAA 2975 Query 2169 GCGGTTAATGAGGAAGGTATATTACTTATCAATAGAGGTAATTATG 2214 ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2974 GCGGTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATCAA---CCGTAATTATG 2932 Score = 590 bits (654), Expect = 6e-164 Identities = 405/471 (86%), Gaps = 2/471 (0%) Strand=Plus/Minus Query 3071 CAAAAATAAATACACTAGGA-TATTATTCCTAGTGTATTATATAAtttttttATAGAATA 3129 |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1756 CAAAAAAAAATACACCAGGAATATTATTCCCAGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATA 1697 Query 3130 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 3189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1696 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 1637 Query 3190 AATCCGTTTTGTGTTTTATACTCTTTTATTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 3249 |||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 1636 AATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTAGTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTA 1577 Query 3250 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 3309 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1576 AATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 1517 Query 3310 TTTTTATCTGTTCCGCCATCTAAATCATCTGATatttgataatttttgaatataatttct 3369 ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1516 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 1457 Query 3370 tttgtttctaattcatttactaataattgtgattttgCATATTGTAATACATCTTCATTG 3429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1456 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTGATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTG 1397 Query 3430 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTTATAATTTTTNN 3489 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1396 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTC-TATAATTTTTTT 1338 Query 3490 ANNTAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACACTT 3540 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1337 ATATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACCCTT 1287 Score = 419 bits (464), Expect = 2e-112 Identities = 302/347 (87%), Gaps = 6/347 (2%) Strand=Plus/Minus Query 3800 TGGAGTTGTGGCAAATGGACGGCTACAGATGTGCAGAACCTCCATTATATGAAAGCACAC 3859 ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318 Query 3860 TAAACCATACACGCACATATACGGCGTTAATTGTTTCTATTAATGGAAACTATGACACAG 3919 ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| | Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258 Query 3920 TGCAGATGTTCCGCAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAAGCCAACCGGCTAGCA 3979 | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198 Query 3980 TGTTAGTTAATGTGATTGACGATGTAATTATAATCGTATATGAAAATGTAGTGTACGGAG 4039 ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||| | Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138 Query 4040 TTCAAAACAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAAT---CCT 4096 | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78 Query 4097 CAAGCATCTATAGTAATATAATAGGTGTAGGGGATAGCAACACACCT 4143 ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 77 TAAGA---TGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCT 34 Score = 300 bits (332), Expect = 1e-76 Identities = 198/217 (91%), Gaps = 3/217 (1%) Strand=Plus/Minus Query 3552 GTATAGTTATTCAGAAGTCAATACTTTTGAGTAACttttttt-aaattcttttttcttct 3610 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890 Query 3611 atataatagtagtttttagccctaaaaatg--tttttaaaaGAATTTGCATTTTCTTATT 3668 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830 Query 3669 GACTTTATTATCATATGGTAGTAATATAAAGGTACAGCAAGGGAACAGCAACAAGATATT 3728 ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770 Query 3729 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTGGAGATGATT 3765 || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733 Score = 167 bits (184), Expect = 2e-36 Identities = 215/287 (75%), Gaps = 15/287 (5%) Strand=Plus/Minus Query 341 TTTAATGTACTTAAAATAGTAAGTAGCTAC-TTATCATTTAGGGTTCTATAATTGAGAAT 399 |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710 Query 400 ATTGAGAGATAATCCGCTTCAATTGTAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGGGTATGCT 459 ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | Sbjct 4709 ATTAGAAGATA-TCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGC-GGTCTGTT 4652 Query 460 ATAATTAGGTATAGTCAAATTTAGGAGATGAAATAGATGATTGATATATACTTA-GGAGA 518 ||| ||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||| || ||| || Sbjct 4651 ATACTTA-GTATA-------TAAGGAGATGAATAATATGATTGATATTTATTTACACAGT 4600 Query 519 AGGTTATAATAAAGAATACTT-GTCTAAAGCACTCAGATTAATCAATGACCATGCTCCTA 577 | | |||| |||||| | || | | | || | | ||| | || | |||||| Sbjct 4599 A-GATATAGTAAAGATAAGTTAAAATTTATC-CTTAAAGCAATAAGGGATTTTTCTCCTA 4542 Query 578 GGGAGTTAAGTTATGATTTTAATAATGTAGAAGCGGATGTTAATATT 624 | || |||| || ||||||| ||| | ||||||||||| |||| Sbjct 4541 GAGAATTAACCTACGATTTTAGAAATCCAAAAGCGGATGTTCGTATT 4495 >seq3308 Length=2910 Score = 874 bits (968), Expect = 0.0 Identities = 518/547 (95%), Gaps = 0/547 (0%) Strand=Plus/Minus Query 6984 CCTAACATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTTGAT 7043 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1766 CCTAGCATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGAAAAAATAAAAAAAGAAAAGGATTTGAT 1707 Query 7044 TATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGGA 7103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1706 TATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGGA 1647 Query 7104 CGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACGT 7163 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1646 CGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACAT 1587 Query 7164 AGTAAACTTCTTTGATAGTTACGAGCAGGACATTGAAGCGGTCATCACTGAATACATTGA 7223 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1586 AGTAAACTTCTTTGATAGATACGAGCAGGACATTGAAGCCGTCATCACTGAATACATTGA 1527 Query 7224 AGAGGTTACAGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCGA 7283 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1526 AGAGGTTACGGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCGA 1467 Query 7284 GAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACCT 7343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1466 GAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACCT 1407 Query 7344 AGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACCG 7403 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1406 AGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACCA 1347 Query 7404 GGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACTGACAA 7463 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1346 GGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACGGACAA 1287 Query 7464 GGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCTCAAAGAATGGCACTATAGAAAGC 7523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct 1286 GGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCGCAAAGAATGGCACTATAGGAAGC 1227 Query 7524 ACACAGA 7530 ||||||| Sbjct 1226 ACACAGA 1220 Score = 398 bits (440), Expect = 7e-106 Identities = 254/280 (91%), Gaps = 0/280 (0%) Strand=Plus/Minus Query 7522 GCACACAGAGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAATACTACTTCATATAGTAATAGCC 7581 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || Sbjct 280 GCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAATGGCT 221 Query 7582 CATATGGTAGCTTAGAAGAGNNNNNNNNNNNTTATGACCTATCGTCATTATCTACTGGTG 7641 |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct 220 CATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATCTACTGAGG 161 Query 7642 AGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTACAATCT 7701 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 160 AGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTACAATAT 101 Query 7702 TTTAGTTTGTATGGTATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGATGAACATGA 7761 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 100 TTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGATGAACATGA 41 Query 7762 GAAACTTATTAGAGCAGGAACAATTAGAAAAAGATGTAAA 7801 |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 40 CAAACTTATTAGAACAGGAACAATTAGAAAAAGACGTAAA 1 Score = 329 bits (364), Expect = 3e-85 Identities = 213/233 (91%), Gaps = 3/233 (1%) Strand=Plus/Minus Query 6705 AAATAAACTGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAATCGTA 6764 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2365 AAATAA---GAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAATCGTA 2309 Query 6765 ATTAGCATAGCAACACTTGAGAGTGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCGACCAC 6824 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2308 ATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCGACCAC 2249 Query 6825 TTAGATAATAACATCCTAGACAAAGAAATACATGACCAGGAAGCGGTTGTTATTACTTCA 6884 |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| | ||||| Sbjct 2248 TTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGACTTCT 2189 Query 6885 GACACTTTGCAATCACTCAAATTTGCGGACACTATGGAAGAACTAGAAGAATA 6937 |||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2188 GACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAGAATA 2136 >seq8440 Length=882 Score = 818 bits (906), Expect = 0.0 Identities = 484/504 (96%), Gaps = 3/504 (1%) Strand=Plus/Minus Query 6240 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 6299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 882 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 823 Query 6300 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 6359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 822 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 763 Query 6360 GGGCAAGCAATTTTAAATGGTCGTTACTTTGACGGATATAGTAAAGGTGAACTTGAAGAA 6419 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| Sbjct 762 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 703 Query 6420 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTAGTTATGCGTCATTGGGGTACACAAACA 6479 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 702 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 643 Query 6480 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAACTCAGAC 6539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 642 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 583 Query 6540 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGAACCAAACTTTAGATACTTA 6599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 582 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 523 Query 6600 CCAAGCAAAGACTTGTTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTTCAAGCC 6659 ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 522 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 463 Query 6660 CTACAATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 6719 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 462 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 403 Query 6720 GAATTGATACAAATG---AAATTA 6740 |||||||| ||||| |||||| Sbjct 402 GAATTGATGAAAATGTTCAAATTA 379 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 450593499730320