Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Schistosoma_20haematobium_20[refseq_20GCF_5F000699445.1_202014-06- 09] 29,834 sequences; 375,894,156 total letters Query= NC_025426.1 Length=140807 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq2836 1903 0.0 seq8440 1577 0.0 seq3308 1425 0.0 >seq2836 Length=4769 Score = 1903 bits (2110), Expect = 0.0 Identities = 1092/1115 (98%), Gaps = 1/1115 (0%) Strand=Plus/Minus Query 79834 TGTAAGGAGGAAATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACAT 79893 || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4056 TGAAAGGAG-AGATATAATGATTCATATATTTGTAAAAGAGGATTATAATAAAGAAACAT 3998 Query 79894 TAAGGAGTTTACTTGAATATATTAATGATACTGTAGGTAGGGAATTAACTTATGGTATTA 79953 |||||||||||||||| || |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 3997 TAAGGAGTTTACTTGAGTACATTAATACTACTGTAGATAAAGAATTAACTTATGGTATTA 3938 Query 79954 ATACAGACTATGATAAGGATGTAGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGAATA 80013 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3937 ATACAGACTATGATAAGGATGTAGTGATTGAAACCGATGACCCTATAGATGAGGAGAATA 3878 Query 80014 CGATTGATTTATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAAT 80073 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3877 CGATTGATTTATCAAATCTTCCTCACTTTAAAGATGACTTATGTATTCTTATAGAAGAAT 3818 Query 80074 TATACTGTAAGGCATTTGTTAATGGGGAACCTATTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGA 80133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3817 TATACTGTAAGGCATTTGTTAATGGGGAACCTATTATTATACGTAAGTATGTAGAGGGGA 3758 Query 80134 TGTTATAATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGT 80193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3757 TGTTATAATGATTATAATATTTTTAACTGAAAAATATGATGCCAAGGCTTTAAAGAAAGT 3698 Query 80194 ATTAGAACATATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGA 80253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3697 ATTAGAACATATTGATAATTGTAGTAGCAGAGGTCTTAGCTATTTAATGGGAAAAGGAGA 3638 Query 80254 AGCGGATGTATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTC 80313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3637 AGCGGATGTATGTATAGAGAAGAATGTATTCAGAGAAAGAGATGATGTAAGGATTAACTC 3578 Query 80314 AAACATTATTGATGAAGGTAAACTTTGTATACTCATAAATAAAAATGGTTTAGAATGTAG 80373 ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct 3577 AAACATTATTGATGAAGGTAAACTTTGTATATTAATAAATAGAAATGGTTTAGAGTGTAG 3518 Query 80374 TTACTATAGAGGTGTATCATGTAATATTGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATA 80433 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3517 TTACTATAGAGGTGTATCATGTAATGTGGGTGCCTTTGTAAAGGAGAGATTATAATGATA 3458 Query 80434 GAAATATATCTCAGTGAAAACTATGATAGGGATTTACTCAAAGCAGAATTAAAATGGATT 80493 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| Sbjct 3457 GAAATATATCTCAGTAAAAACTATGATAAGGATTTGCTCAAAGCAGAATTGAAGTGGATT 3398 Query 80494 AAAGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGCCCAGGATTAGATGTA 80553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3397 AAAGAGACCGCTTCAAGAGAACTAACTTATGATGTTAATAGAAGCCCAGGATTAGATGTA 3338 Query 80554 CATATTAGTCCTTTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAAGAAATGAGCTTACATCCTCAG 80613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3337 CATATTAGTCCTTTTAGATATACCAAGGATGAGGTTGAAGAAATGAGCTTACATCCTCAG 3278 Query 80614 TTTGAAGATGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGGT 80673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3277 TTTGAAGATGATGTATGTGTATTTATAGCTGAAACATGGATACATGAGTATCGTAATGGT 3218 Query 80674 AAATCAATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAGGAGATGTAATTAATGGTAGAA 80733 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3217 AAATCAATAGGTGTAGATAGTATGGAAGAATATGTAAAGGAGATGTAATTAATGGTAGAA 3158 Query 80734 ACTTATTATACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACTATTAAGGATTACTTAAGTAGA 80793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3157 ACTTATTATACAGTATATCATAAGAATAGTATGAAAACTATTAAGGATTACTTAAGTAGA 3098 Query 80794 AGTGATTTAATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCCA 80853 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3097 AGTGATTTAATTGACTTCTTATATAAGACTTGGCATAAGGATATAAGTAATATATACCCA 3038 Query 80854 ACAGATTATACTACGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGTTAGATTAATT 80913 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3037 ACAGATTATACTACGTATGAAACAAAATTCTGTATAGACATAGATGTAGTTAGACTAATT 2978 Query 80914 GAAGCGGTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATTAA 80948 |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2977 GAAGCGGTTAATGAAGAAGGTGTATTACTTATCAA 2943 Score = 697 bits (772), Expect = 0.0 Identities = 430/470 (91%), Gaps = 1/470 (0%) Strand=Plus/Minus Query 82084 CAAAAAGAAATACACTAGGA-TATTATTCCCAGTGTATTGTATAAtttttttATAGAATA 82142 |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1756 CAAAAAAAAATACACCAGGAATATTATTCCCAGTGTATTGTATAATTTTTTTATAGAATA 1697 Query 82143 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGatttaattaaatttttaatt 82202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1696 TTTATAACATTGTATTCAAATTCATTTACTTCATGTTGTGATTTAATTAAATTTTTAATT 1637 Query 82203 aatccgttttgtgttttatagtcttttactagtttttcattttCTATAATTAANNNNNNN 82262 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1636 AATCCGTTTTGTGTTTTATAGTCTTTTACTAGTTTTTCATTTTCTATAATTAAATTATTA 1577 Query 82263 NNNNNNNCTTTTGTTGTATCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 82322 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1576 AATTCTTCTTTTGTTGTATCCTCATCTACATAAAATTTACTTTCATATATTTCATAATAT 1517 Query 82323 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 82382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1516 TTTTTATCTGTTCCGTTATCAATATCATCTGATATTTGATAATTTTTGAATACAATTTCT 1457 Query 82383 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTGATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTG 82442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1456 TTTGTTTCTAATTCATTTACTAATAATTGTGATTTTGCATATTGTAATACGTCTTCATTG 1397 Query 82443 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTATANNNNNNNNN 82502 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1396 TCCCACATTGGAATATAGTTTATTTTCATTTAAATCAAATCCTTTTCTATAATTTTTTTA 1337 Query 82503 NNNNNNNNNNNNNGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACACTT 82552 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1336 TATAATATTTGTAGAAGCGGTTGGGGTTTGTCCCTTGCCTTACTACCCTT 1287 Score = 614 bits (680), Expect = 5e-171 Identities = 343/345 (99%), Gaps = 0/345 (0%) Strand=Plus/Minus Query 82815 TGGAGTTGTGGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCCATTATATGAAAGCACAT 82874 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 377 TGGAGTTGTTGCAAATGGACGGATACAGATGTACAGAACCGCAATTATATGAAAGCACAT 318 Query 82875 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 82934 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 317 TAAACCACACACGCACATATACGGCTTTAATCGTAAGCATTAAGGGAAACTATGACACTG 258 Query 82935 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 82994 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 257 TTCAAATGTTCCGTAAAACGCCTATAATGAGCATGAGAGGGCAAGCGCAACCGGCTAGCA 198 Query 82995 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 83054 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 197 TGTTAGTAAATGTAATTGATGACGTGATTATAATCGTATATGAAAATACGGTTTACGGGG 138 Query 83055 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 83114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 137 TACAGAATAAAGAAATAAAATTTATTGAAGAAATTTAAAAATAGGGGTTGCAATACCCCT 78 Query 83115 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCtt 83159 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 77 TAAGATGTAGTAATATAATAGATGTAAGGGATAGCAACACACCTT 33 Score = 549 bits (608), Expect = 2e-151 Identities = 310/314 (99%), Gaps = 0/314 (0%) Strand=Plus/Minus Query 79052 TATAAAGGAGGTAGTAAAATGATAGGTCAAATTATACTATTAGCTATTGTTAGTATAGTT 79111 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4351 TATAAAGGAGGTAGTAAGATGATAGGTCAAATTATACTATTAGCTATTGTTAGTATAGTT 4292 Query 79112 ACAATAGGTTGTGTAGGATTATTTTTCTATGAGACGTTCAAGAGTATTAAGTATGATGCT 79171 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4291 ACAATAGGTTGTGTAGGATTATTTTTCTATGAGACGTTCAAGAGTATTAAGTATGATGCT 4232 Query 79172 AATGATAAAATCTTTATGATTACTGGGAGTATATTAATGTTAGTTATTATCGTTAGTGGT 79231 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4231 AATGATAAAATCTTTATGATTACTGGAAGTATATTAATGTTAGTTATTATCGTTAGTGGT 4172 Query 79232 GCATTAGCTATACTTGGCATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAA 79291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4171 GCATTAGCTATACTTGGCATTTAGAGCTCATTTAAGAAGCGGTTAAGTAGTTCATGATAA 4112 Query 79292 ATTGGTCTAGAAATATATGACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGTTTAGAATTGAAA 79351 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4111 ATTGGTCTAGAAATATATTACCGCTTCTCTATGGAAGGCTGAGAGGGCTTAGAATTGAAA 4052 Query 79352 GGAGAGATATAATG 79365 |||||||||||||| Sbjct 4051 GGAGAGATATAATG 4038 Score = 219 bits (242), Expect = 4e-52 Identities = 171/217 (79%), Gaps = 0/217 (0%) Strand=Plus/Minus Query 82564 GTATAGTTATTCAGAAGTCAATACTTTTGAGTAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTCT 82623 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 949 GTATAGTTATTCAGAAGTCACAACTTTTGAGTAACTTTTTTTTAAATTCTTTTTTCTTCT 890 Query 82624 ATATAATAGTAGTTTTTAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTACATTTTCTTATT 82683 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 889 ATATAATAGTAGTTTTTAGCCCTAAAAAAAGTTTTTTAAAAGAATTTACATTTTCTTATT 830 Query 82684 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTATT 82743 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 829 GACTTATTAATCATATGATAGTAATATAAAGGTACAGCAAGAGAACAGCAACAAGGTAGT 770 Query 82744 AGAATTATATaaaaaaaTTATTTAATTGGAGATGATT 82780 || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 769 AGCATTATATACAAAAATTATTCAATTGGAGACGATT 733 Score = 197 bits (218), Expect = 1e-45 Identities = 122/129 (95%), Gaps = 1/129 (1%) Strand=Plus/Minus Query 78293 TTTAATGTACCTAAAATCGTAAGTAGCTCC-TTATCATTTAGGTCTGTTTAATTGAGAAT 78351 ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4769 TTTAATGTACCTAAAATAGTAAGTAGCCCCCTTATCATTTAGGTCTGTATAATTGAGAAT 4710 Query 78352 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAAAGGTTGACAACTATGAAGCGGTATGTTAT 78411 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4709 ATTAGAAGATATCCGCTTCAATTACAATTAATTGTTGACAACTATGAAGCGGTCTGTTAT 4650 Query 78412 ACTTAGTAT 78420 ||||||||| Sbjct 4649 ACTTAGTAT 4641 >seq8440 Length=882 Score = 1577 bits (1748), Expect = 0.0 Identities = 879/882 (99%), Gaps = 0/882 (0%) Strand=Plus/Minus Query 84601 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 84660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 882 ATTGACAGTCACTTGAAACCATGATATTATTAAGATAACAAAAAACAAACAGAAAAGGAA 823 Query 84661 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 84720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 822 TTGATTATAATGAAATTTATCAAAACTATCGAAAACTTATTAGAAAAAGCAGAAAACAAA 763 Query 84721 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 84780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 762 GGGCAAGCAATTTTAAACGGTCGTTACTTTGACGGGTATAGCAAAGGTGAGCTTGAGGAA 703 Query 84781 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 84840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 702 AAATATGCAATTGAAATTGATGGCAACAAATTGATTATGCGTCACTGGGGTACACAAACA 643 Query 84841 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 84900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 642 ATTGAGATTGACTTAAGCATAAATGAGATTGTTTCATATTACGGTGAAAGCAATTCAGAC 583 Query 84901 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 84960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 582 CGTGACAGTTTAAACACACTTGTATATTGCTTAGGAATTGCGCCAAACTTTAGATACTTA 523 Query 84961 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 85020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 522 CCAAGCAAAAACTTATTCATTTACGAAAATTAATTAAATAAAGGGCTTGACTTCCAAGCC 463 Query 85021 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 85080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 462 CTACCATGTTATTATTAAATTGTAAGGTAATCAAGCACAACGACAAAATAAACTGAAAAG 403 Query 85081 GAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATTATCGTACCTAAGGAAGAT 85140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 402 GAATTGATGAAAATGTTCAAATTACAAAATAAAGTGGAAATTATCGTACCTAAGGAAGAT 343 Query 85141 AACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAATATGTAAATAGCATCACAATG 85200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 342 AACAACGGCGTTGAGATTGCAGACAAACGTATTAAAGAATAGTTAAATAGCATCACAATG 283 Query 85201 GAAGCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAAGGGCAATGGTACTCAGAAGATGAAAAA 85260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 282 GAAGCGGGCGGTTGTACTATTACAGAAATTAAAGGGCAATGGTACTCAGAAGATGAAAAA 223 Query 85261 CGTATAATGGAAGATAACAACTTAAATCTTGAGTGGTATTATCTGCAAGACAGTGCAAAA 85320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 222 CGTATAATGGAAGATAACAACTTAAATCTTGAGTGGTATTATCTGCAAGACAGTGCAAAA 163 Query 85321 TTCATGACAGTTGAATTAAAAGGTATTGTAAGACGTTTAATTGAAGTTTACGGACAAGAG 85380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 162 TTCATGACAGTTGAATTAAAAGGTATTGTAAGACGTTTAATTGAAGTTTACGGACAAGAG 103 Query 85381 GCTATCAGTATCAAAGTTAATGGCACATTGTACATTGTAGACCAATCAGACATTGAAGAA 85440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102 GCTATCAGTATCAAAGTTAATGGCACATTGTACATTGTAGACCAATCAGACATTGAAGAA 43 Query 85441 TTACACACAACATTATTAAATATCATGAAATAAAAAATTTAT 85482 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 42 TTACACACAATATTATTAAATATCATGAAATAAAAAATTTAT 1 >seq3308 Length=2910 Score = 1425 bits (1580), Expect = 0.0 Identities = 808/824 (98%), Gaps = 0/824 (0%) Strand=Plus/Minus Query 87592 ATTAAACAATGCTAAAAAACTATACGAAACATTATTTGCTATCGAGTTTGATAGTACTAT 87651 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 824 ATTAAAAAAGGCTAAAAAACTATACGAAACATTATTTGCTATCGAGTTTGATAGTACTAT 765 Query 87652 CGAGGAAGATTGGACAATAGATAATGACTCTCTAGAAGCTAAACTATTCTTGGAGTTATC 87711 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 764 CGAGGAAGATTGGACAATAGATAATGACTCTCTAGAAGCTAAACTATTCTTGGAGTTATC 705 Query 87712 AGATGAGGGCAAAAAGGTTTATGCAATGAGTCACGCTAAGCAATGGGCAAATATTGTTAT 87771 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 704 AGATGAGGGCAAAAAGGTTTATGCAATGAGTCATGCTAAGCAATGGGCAAATATTGTTAT 645 Query 87772 GGATATGGAAGAAGAGGAATATAGAAGCTATTACGGAAATGATTTAGATTATATTTTAGA 87831 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 644 GGATATGGAAGAAGAGGAATATAGAAGCTATTACGGAAATGATTTAGATTATATTTTAGA 585 Query 87832 GGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTCGATT 87891 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 584 GGAGATGTAAAACATGAATACAAGAAGGGTAAACAAAGCGTTAAACGAAGCGGTTCGATT 525 Query 87892 ATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTCGA 87951 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 524 ATTAGATGAGCAAATAGCAGACACTCAAAAGACTATGCAGGAGTTGAATAAACAACTCGA 465 Query 87952 GAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTGATGA 88011 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 464 GAAGCAAATAAAGGCTAAGCAAGAGCTAATGATATTAGTTGATGTTATGACTGGTGATGA 405 Query 88012 TGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACTCCTG 88071 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 404 TGAGTAATGAGCATTAGAGAGGTTCATAATGTCGTTAAGAGTGCAAAGAGCAAACTCCTG 345 Query 88072 CAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCTACAC 88131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 344 CAGGAACATAATAATATTAATAATGTAATCATAGATGACTACATCACAGAAGAGCTACAC 285 Query 88132 AGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAAT 88191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 284 AGACGCACACAGGGAAGCGGAACAATACAGATGAACAATAACACCGCTTCATATAGTAAT 225 Query 88192 GGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGNNNNNNNNNNNNTATGACCTATCTTCATTATCTACT 88251 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 224 GGCTCATATGGTAGCTTAGAAGAGCTTAGAGAAGCTTATGACCTATCTTCATTATCTACT 165 Query 88252 GAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTACA 88311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 164 GAGGAGATTAAAGAACTAATACAAACATTTGTTTAAATTATTTTATCAAAACGCTTTACA 105 Query 88312 ATCTTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGATGAAC 88371 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 104 ATATTTTAATTTGTATGATATAATGAACTTAACAAATTAAAAGAAAAGGAAATGATGAAC 45 Query 88372 ATGACAAACTTATTAGAACAGGAACAATTAGAAAAAGACGTAAA 88415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 44 ATGACAAACTTATTAGAACAGGAACAATTAGAAAAAGACGTAAA 1 Score = 1314 bits (1456), Expect = 0.0 Identities = 756/775 (98%), Gaps = 11/775 (1%) Strand=Plus/Minus Query 86161 ATGAAGCAATCGAAGAATACGCATaaaaaaaCTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 86220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2910 ATGAAGCAATCGAAGAATACGCATAAAAAAACTTAATAAAAGGGGTTGACATTCAACCCC 2851 Query 86221 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 86280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2850 TACCATGTTAATATTAATATATACCAAATGAGAGGAATTGATAATTATGAGATACGAAAT 2791 Query 86281 TGTAACGTTAGTTAATCAAGAATTGTTTATGTATGCAACATTCAACAAGCAGGAAGCAGA 86340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2790 TGTAACGTTAGTTAATCAAGAATTGTTTATGTATGCAACATTCAACAAGCAGGAAGCAGA 2731 Query 86341 AGCCAAATATCAAGAATGGTGTGACTTATATGGTCAAGAAAATGTAAGCATGGaaaaaaa 86400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2730 AGCCAAATATCAAGAATGGTGTGACTTATATGGTCAAGAAAATGTAAGCATGGAAAAAAA 2671 Query 86401 TTAAAATAAGCTGTTGACAAACTAACCGCTTCATGATAATATTAAACTATACTAAAGAAA 86460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2670 TTAAAATAAGCTGTTGACAAACTAACCGCTTCATGATAATATTAAACTATACTAAAGAAA 2611 Query 86461 AGGAAATGATTACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCCAATTAGAGAGTCTAG 86520 ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2610 AGGTAATAATTACAATGACAAAAACAATCAAACAATTAGAAAGCTAATTAGAGAGTCTAG 2551 Query 86521 AAAGAAAATCAGATGAGGAATTAGCAAACGGATACTATGACAGATTTGAAAGAACTTGTG 86580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2550 AAAGAAAATCAGATGAGGAATTAGCAAACGGATACTATGACAGATTTGAAAGAACTTGTG 2491 Query 86581 CACAGATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTaaa 86640 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2490 CACAGATTAGAGAATTAGACCTACAAATCGAATTAAAAAAGAACTCAGAAACTGTTTAAA 2431 Query 86641 aaaaTCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTAGATGTTATTATTAATATAT------ 86694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| Sbjct 2430 AAAATCTAAATAAGGGGTTGACACTTAACCCCTTACATGTTAATATTAAGATATTTAAAA 2371 Query 86695 ACTA-----AAGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAATCG 86749 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2370 AATACAAATAAGAAAAGGAATTGATACAAATGAAATTAATCAATAGAGATAATGAAATCG 2311 Query 86750 TAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCGACC 86809 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2310 TAATTAGCATAGCAACACTTGAGAGCGTAAAACAAGCCCTAATTTGGGAGTACATCGACC 2251 Query 86810 ACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGACTT 86869 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2250 ACTTAGATAATAACATCCTAGACAGTAAAATTTACGACCAAGAAGCGGTTGTGGTGACTT 2191 Query 86870 CTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGAACTAGAAGAATA 86924 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2190 CTGACACTCTACAGTCAATCAAATTTGCGGACACTATGGAAGGACTAGAAGAATA 2136 Score = 1178 bits (1306), Expect = 0.0 Identities = 699/742 (94%), Gaps = 2/742 (0%) Strand=Plus/Minus Query 86970 CCCTAGCATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTTGA 87029 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1767 CCCTAGCATATAGATGGTAATATAAGAGTATAGAAAAAATAAAAAAAGAAAAGGATTTGA 1708 Query 87030 TTATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGG 87089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1707 TTATTATGACAAATACAATACAAGCATTTTTACAAGGACAAGAAGCAAGCACAGTTAAGG 1648 Query 87090 ACGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACA 87149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1647 ACGTAGCAACTCATGGAGTACAAAGCGGAGCAATTGGCAAATTAATCTACACATCAGACA 1588 Query 87150 TAGTAAACTTCTTTGATAGATACGAGCAGGACATTGAAGCCGTCATCACTGAATACATTG 87209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1587 TAGTAAACTTCTTTGATAGATACGAGCAGGACATTGAAGCCGTCATCACTGAATACATTG 1528 Query 87210 AAGAGGTTACGGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCG 87269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1527 AAGAGGTTACGGGACAACAATATTATGACTTATTGAACTATGAGCTTATGAGAGACCTCG 1468 Query 87270 AGAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACC 87329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1467 AGAATTATGCAAATGTAGAATTTGAAGACGAAGACGAATATAATAACATTCAATTTGACC 1408 Query 87330 TAGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACC 87389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1407 TAGCAGAAAACATTGCTTCTGATGAGGTTGAAGGATTTGAAGACATGGACGAAGCAGACC 1348 Query 87390 AGGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACGGACA 87449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1347 AGGCGGAAGCAATCTATGAGGCTATGGATGATGTTGAATTAGAACTACAAGAAACGGACA 1288 Query 87450 AGGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCGCAAAGAATGGCACTATAGGAAG 87509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1287 AGGTTCAATATGTTAATCTAGCGGTTGAGATTGTAGCGCAAAGAATGGCACTATAGGAAG 1228 Query 87510 CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAGGAGA 87569 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1227 CA--CACAGACACACACACAGAGAAGCTTAACCGCTTCTCTAATACAATTAATCAGGAGA 1170 Query 87570 TGTTGAAGATGAAAATTAACCAATTAAACAATGCTAAAAAACTATACGAAACATTATTTG 87629 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1169 TGTTGAAGATGAAAATTAACCAATTAAACAATGCTAAAAAACTATACGAAACATTATTTG 1110 Query 87630 CTATCGAGTTTGATAGTACTATCGAGGAAGATTGGACAATAGATAATGACTCTCTAGAAG 87689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1109 CTATCGAGTTTGATAGTACTATCGAGGAAGATTGGACAATAGATAATGACTCTCTAGAAG 1050 Query 87690 CTAAACTATTCTTGGAGTTATC 87711 ||||||||||||||||||||| Sbjct 1049 ATAAACTATTCTTGGAGTTATC 1028 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 450286414292880