Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Adineta_20vaga_20[genbank_20GCA_5F000513175.1_202013-11-26] 36,167 sequences; 217,933,776 total letters Query= NC_001416.1 Length=48502 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq1298 6495 0.0 seq22089 551 2e-152 seq22794 535 1e-147 seq27943 295 2e-75 seq3084 116 1e-21 >seq1298 Length=11968 Score = 6495 bits (7202), Expect = 0.0 Identities = 3606/3609 (99%), Gaps = 0/3609 (0%) Strand=Plus/Plus Query 34500 GATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTAT 34559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7234 GATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTAT 7293 Query 34560 ATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTT 34619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7294 ATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTT 7353 Query 34620 AATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCG 34679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7354 AATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCG 7413 Query 34680 CTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTGCCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAG 34739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7414 CTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTGCCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAG 7473 Query 34740 CTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACA 34799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7474 CTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACA 7533 Query 34800 GAAGAGCAATCTATGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACA 34859 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7534 GAAGAGCAATCTATGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACA 7593 Query 34860 TCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTT 34919 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7594 TCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTT 7653 Query 34920 TCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTA 34979 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7654 TCCCGATGGAATGGGAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTA 7713 Query 34980 GTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTA 35039 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7714 GTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTA 7773 Query 35040 GATAAGAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTC 35099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7774 GATAAGAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTC 7833 Query 35100 GCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGCAGGTTGCTTTC 35159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7834 GCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGCAGGTTGCTTTC 7893 Query 35160 AATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTAC 35219 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7894 AATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTAC 7953 Query 35220 TCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTAC 35279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7954 TCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTAC 8013 Query 35280 CCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCG 35339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8014 CCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCG 8073 Query 35340 GCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCA 35399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8074 GCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCA 8133 Query 35400 GTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGC 35459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8134 GTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGC 8193 Query 35460 ACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTG 35519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8194 ACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTG 8253 Query 35520 CCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCT 35579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8254 CCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCT 8313 Query 35580 GATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCA 35639 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8314 GATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCA 8373 Query 35640 CCGCAGATGGTTATCTGTATGttttttatatgaatttattttttGCAGGGGGGCATTGTT 35699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8374 CCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTT 8433 Query 35700 TGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATA 35759 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8434 TGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATA 8493 Query 35760 AATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGG 35819 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8494 AATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGG 8553 Query 35820 CCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGA 35879 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8554 CCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGA 8613 Query 35880 ATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTG 35939 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8614 ATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTG 8673 Query 35940 GAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAG 35999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8674 GAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAG 8733 Query 36000 ACAATAACTACCGATGTCATATACCCATACTCTCTAATCTTGGCCAGTCGGCGCGTTCTG 36059 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8734 ACAATAACTACCGATGTCATATACCCATACTCTCTAATCTTGGCCAGTCGGCGCGTTCTG 8793 Query 36060 CTTCCGATTAGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGAT 36119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8794 CTTCCGATTAGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGAT 8853 Query 36120 GACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGG 36179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8854 GACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGG 8913 Query 36180 CGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCA 36239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8914 CGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCA 8973 Query 36240 GGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGC 36299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8974 GGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGC 9033 Query 36300 CTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCA 36359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9034 CTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCA 9093 Query 36360 GCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGA 36419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9094 GCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGA 9153 Query 36420 TAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAAT 36479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9154 TAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAAT 9213 Query 36480 TGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTT 36539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9214 TGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTT 9273 Query 36540 GGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAG 36599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9274 GGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAG 9333 Query 36600 ACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCG 36659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9334 ACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCG 9393 Query 36660 ATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGA 36719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9394 ATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGA 9453 Query 36720 ACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGAT 36779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9454 ACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGAT 9513 Query 36780 GTGGTCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGTCGCCTTCAACAAACAAAAAA 36839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9514 GTGGTCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGTCGCCTTCAACAAACAAAAAA 9573 Query 36840 GATGGGAATCCCAATGATTCGTCATCTGCGAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGCT 36899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9574 GATGGGAATCCCAATGATTCGTCATCTGCGAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGCT 9633 Query 36900 TTAGAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTT 36959 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9634 TTAGAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTT 9693 Query 36960 TTTCCATCGATTTTATGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCA 37019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9694 TTTCCATCGATTTTATGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCA 9753 Query 37020 GCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTT 37079 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9754 GCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTT 9813 Query 37080 TTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATG 37139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9814 TTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATG 9873 Query 37140 TTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGC 37199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9874 TTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGC 9933 Query 37200 TATGCGCCGACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGC 37259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9934 TATGCGCCGACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGC 9993 Query 37260 GATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTT 37319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9994 GATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTT 10053 Query 37320 TAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATC 37379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10054 TAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATC 10113 Query 37380 ACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAG 37439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10114 ACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAG 10173 Query 37440 AATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGCGGTCATGGAATTACC 37499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10174 AATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGCGGTCATGGAATTACC 10233 Query 37500 TTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTC 37559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10234 TTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTC 10293 Query 37560 CGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGA 37619 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10294 CGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTTAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGA 10353 Query 37620 AAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACAT 37679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10354 AAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACAT 10413 Query 37680 CTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTT 37739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10414 CTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTT 10473 Query 37740 TGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAAC 37799 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10474 TGTAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAAC 10533 Query 37800 GCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCAtt 37859 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10534 GCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATT 10593 Query 37860 tttctttttttCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAA 37919 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10594 TTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAA 10653 Query 37920 TGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACAC 37979 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10654 TGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACAC 10713 Query 37980 CGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTG 38039 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10714 CGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTG 10773 Query 38040 TATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGC 38099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10774 TATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGC 10833 Query 38100 TAAAGATCT 38108 ||||||||| Sbjct 10834 TAAAGATCT 10842 Score = 576 bits (638), Expect = 4e-160 Identities = 340/361 (94%), Gaps = 0/361 (0%) Strand=Plus/Plus Query 38814 AGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTG 38873 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 AGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTG 70 Query 38874 GAATAAACCAATGGACAGAATCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGT 38933 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 71 GAATAAACCAATGGACAGAATCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGT 130 Query 38934 CAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGG 38993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 131 CAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGG 190 Query 38994 CGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAA 39053 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 191 CGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAA 250 Query 39054 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACA 39113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 251 ATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACA 310 Query 39114 GGGGGACACAAAAGACACTATTACaaaagaaaaaagaaaaGATTATTCGTCAGAGAATTC 39173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 311 GGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTC 370 Query 39174 T 39174 | Sbjct 371 T 371 Score = 576 bits (638), Expect = 4e-160 Identities = 340/361 (94%), Gaps = 0/361 (0%) Strand=Plus/Plus Query 38814 AGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTG 38873 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10837 AGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTG 10896 Query 38874 GAATAAACCAATGGACAGAATCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGT 38933 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10897 GAATAAACCAATGGACAGAATCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGT 10956 Query 38934 CAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGG 38993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10957 CAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGG 11016 Query 38994 CGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAA 39053 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11017 CGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAA 11076 Query 39054 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACA 39113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11077 ATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACA 11136 Query 39114 GGGGGACACAAAAGACACTATTACaaaagaaaaaagaaaaGATTATTCGTCAGAGAATTC 39173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11137 GGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTC 11196 Query 39174 T 39174 | Sbjct 11197 T 11197 >seq22089 Length=356 Score = 551 bits (610), Expect = 2e-152 Identities = 314/320 (98%), Gaps = 0/320 (0%) Strand=Plus/Minus Query 400 GCAGGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTAC 459 ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 355 GCAGGCCAGCGAGACAGATCTCCAGCCAGGGACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTAC 296 Query 460 GCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGA 519 ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 295 GCGTGCGCAGGCCGATGCACAGGAGCTGAAAAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGA 236 Query 520 AACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGA 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 235 AACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGA 176 Query 580 CGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTT 639 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 175 CGGGATCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTT 116 Query 640 CCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACC 699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 115 CCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACC 56 Query 700 GGGGTTGCTGAGTGAATATA 719 |||||||||||||||||||| Sbjct 55 GGGGTTGCTGAGTGAATATA 36 >seq22794 Length=343 Score = 535 bits (592), Expect = 1e-147 Identities = 325/344 (94%), Gaps = 2/344 (1%) Strand=Plus/Plus Query 22139 CTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCG 22198 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 1 CTGTTTTCAACAGTGATGAGTCATCGTGGCATCTCGTTGAAGATCATCGGGGTAAAACGG 60 Query 22199 TCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAA 22258 | |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTTATGACGTRGCKTCMGGSGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAA 120 Query 22259 ATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGA 22318 || |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATGTTACCTGGTTATCGCCGGAAGGGGAGTTTCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGA 180 Query 22319 AGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACaaaaaaaaGCC 22378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 181 AGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAACAA-CC 239 Query 22379 TGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTG-CAGATCTGGAAATT 22437 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 240 TGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGACAGATCTGGAAATT 299 Query 22438 GCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTA 22481 |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 300 GCAACGGAGGAAGAAATCTCGTTGCTGGAAGCATGGAAAAAGTA 343 >seq27943 Length=261 Score = 295 bits (326), Expect = 2e-75 Identities = 219/256 (86%), Gaps = 0/256 (0%) Strand=Plus/Minus Query 20046 GATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGACTCAGCA 20105 |||||||| ||||||| | ||| || ||| || | ||||||| | ||||||||| Sbjct 256 GATGCCAGCACATCAGCCCGTGAGGCGGCAACCCATGCGGCTGATGCTGCGGACTCAGCA 197 Query 20106 CGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGC 20165 ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||| || Sbjct 196 CGCGCAGCCAGCACGTCAGCCGGACAGGCCGCGTCGTCGGCTCAGTCAGCGTCTTCCAGC 137 Query 20166 GCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCC 20225 |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| Sbjct 136 GCAGGAACGGCATCAACAAAGGCCACTGAAGCATCAAAAAGTGCTGCCGCTGCAGAGTCC 77 Query 20226 TCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCA 20285 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 76 TCAAAAAGCGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTTCA 17 Query 20286 GCGTCACAACAATCAG 20301 ||||||| |||||||| Sbjct 16 GCGTCACTACAATCAG 1 >seq3084 Length=1747 Score = 116 bits (128), Expect = 1e-21 Identities = 72/77 (94%), Gaps = 0/77 (0%) Strand=Plus/Plus Query 40294 GGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCT 40353 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | Sbjct 392 GGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAAGAGCTTCTGTGCACAGGACGTTGCCGCGGT 451 Query 40354 AACAGGCGCAACAGTAA 40370 |||||||||||| |||| Sbjct 452 AACAGGCGCAACCGTAA 468 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 155018193695456