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BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Saccharina_20japonica_20[genbank_20GCA_5F000978595.1_202015-04-22] 13,327 sequences; 543,425,876 total letters Query= NC_001993.1 Length=236120 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq4430 91.5 2e-13 >seq4430 Length=9241 Score = 91.5 bits (100), Expect = 2e-13 Identities = 534/808 (66%), Gaps = 84/808 (10%) Strand=Plus/Plus Query 228280 aattataatataaatatttCATCATTACCaaaaacattaattaa-attaaatattagttc 228338 ||| ||||||||||||| || ||| || | || |||||| ||| || | || | Sbjct 1466 AATAATAATATAAATATAATATATTTAT-AATTATAT-AATTAATATTTAAAAATAAATT 1523 Query 228339 atgtaatataaaaaatactaattttataattaatttagataatttGAA--AGAATTAGAT 228396 || |||||||| || |||| ||| ||||||| ||| || || | ||| || Sbjct 1524 AT---ATATAAAATATTTTAATATTAA---TAATTTAAATATATTTAATTATAATATTAT 1577 Query 228397 ATATCTAGAAATTTTAATAT---AAATATTTCATCATTACCAAA----ATCATTAATCAA 228449 |||| || ||| ||||||| ||||||| || |||| | | || |||||| | Sbjct 1578 ATATATAATAATATTAATATTTAAAATATTATATAATTATTATATATAATTATTAATATA 1637 Query 228450 ATTAAATATTAGGAC--ATGTTATATAAAAAATACTAATTTTATAATTAATT--TAGATA 228505 ||||| ||| | | || ||| ||| | | | || | |||||||||||| || ||| Sbjct 1638 ATTAATTATAAAAAATAATATTAAATATATATAAATA-TATTATAATTAATTATTATATA 1696 Query 228506 ATTTGAAAGAATTAGATATATCTAGAAATTTTAATA-TAAATATTTCATCATTACCAAAA 228564 | || | | ||| |||||| | |||| | || | |||| || | || |||| || | Sbjct 1697 AATT-ATATAAT---ATATATA-ATAAATATAAAAAATAAAAATAT-AT-ATTA--AATA 1747 Query 228565 TCATTGATTACAT--TAAATATTAATTCATGTTATATAAAACACACTAATTTTATAAATG 228622 | ||| |||| || || ||||||||| | | ||| ||| | | ||| | || || | Sbjct 1748 TAATTAATTATATAATATATATTAATTTAAATAATA--AAATATAATAAATATAAAATTT 1805 Query 228623 ATTTATATAATTTGAAGGAATTGGATA-TATCTAGAAATTATAATATAA-ATATTTCATC 228680 | |||| |||| | ||| ||| ||| || |||| | |||| || |||||| || Sbjct 1806 AATTATTTAATATTTTTTAATAATATAATAT-TATAAATAA-AATAAAATATATTT-ATA 1862 Query 228681 ATTACCAAAATCATTAATCAAATTAAATATTAGTGATTGCGATATTAAAAATACTAATTT 228740 |||| | | |||| ||| || ||| || ||| | ||||| |||| | | Sbjct 1863 ATTATTATATATATTATATAAAATATATAATAT--ATTTTTAAATTAATAATAATTAAAA 1920 Query 228741 TATAAATGATTTAGATAATTTGA-AAGA-ATTAGATATATCTAACA---ATTATAATATA 228795 |||||| | | | || |||| | || | |||| ||| || ||| | ||||||| ||| Sbjct 1921 TATAAA--AATAAAATTATTTTATAATATATTATATAAATATAATATATATTATAA-ATA 1977 Query 228796 A-ATATTTCATCATTACCAAAAACATTGACTACATTAAATATTAGTTCATGTAATATAAA 228854 | ||||| || |||| || || ||| || ||||| || | || | ||||| | Sbjct 1978 ATATATTAAATAATTA--AATAATATTATATAT-TTAAAAATAATTTATTATAATA---A 2031 Query 228855 AAATACtaattttataattaatttagataatttgaaagaattaga-tatatctaaaaat- 228912 | ||| |||||| ||| |||| | | ||| || ||||| | ||||| | || || Sbjct 2032 ATATAATAATTTAATATATAATATTTAATATTAAAATAAATTAAAATATATATTAATATA 2091 Query 228913 -tttaatataaatatttCATCATTACCAAAATCATTGATT-ACATTAAATATTAATTCAT 228970 | ||||||||||||| | |||| | || || ||| | ||| |||| ||| || Sbjct 2092 ATATAATATAAATATTATTTGATTAT--ATATTATAAATTTATATTTTATAT--ATTAAT 2147 Query 228971 GTTATATAAACCATACTAATTTTATAAATGATTTATATAATTTGAAAGA---ATTAGATA 229027 ||||||| ||| |||| |||||| ||||||| | ||| | |||| ||| Sbjct 2148 A--ATATAAAATATATTAATA--ATAAAT-----ATATAATATTAAATATTAATTATATA 2198 Query 229028 T----ATCTAAC-AATTATAATATAAAT 229050 || ||| ||||||||||||||| Sbjct 2199 ATAAAATATAATTAATTATAATATAAAT 2226 Score = 87.8 bits (96), Expect = 3e-12 Identities = 419/635 (66%), Gaps = 72/635 (11%) Strand=Plus/Minus Query 8996 ATTTTAATATTAATTAATGGTTCTAAAAATTTAAAATCTATAATATCACAATCTTTACAG 9055 || ||||||||||| ||| | | |||||| | |||||||| ||| | || | Sbjct 1089 ATATTAATATTAATAAATATATATTAAAATTAA-----TATAATAT---AATATATATAA 1038 Query 9056 TAA--AATCCATTTATTGATATTGGCAATTTACATTCA-GATATATTTGAATATGTATTA 9112 | | ||| ||| ||| ||||| ||| ||| | |||||||| ||| | ||||| Sbjct 1037 TTATTAATTAATTAATT-ATATTATATATTATTATTTATTATATATTTAAATTTATATTA 979 Query 9113 TATGAT-ATATCTAATAAT--TGTAGATTAGGtaaat---tttctaaaaatttaaaatct 9166 ||| || ||| |||| || | || |||| ||||| ||| | | |||||| | Sbjct 978 TATTATAATAATTAATTATTATATAAATTA-ATAAATATATTTATTATTATTTAA----T 924 Query 9167 ataatattacatttttcacaatttaaattttttatatattCGGGTTTATAATGTGAAAAA 9226 | || ||| || || | ||| || | | | |||||| ||||||| | | || Sbjct 923 TTTATTTTATTTTATTTATAATATATAATATATATATA------TTTATAAAATTATAAT 870 Query 9227 TAGTTATATTGTATTGGTATATTTAATTGATAATTATAATATTGAAATATT-TAACATGT 9285 || ||||||| ||| || ||| | || |||| || ||||| |||||| || || | Sbjct 869 TATTTATATT-TAT---TAAATTAATTTTATAA--ATTATATT--AATATTAGAATATAT 818 Query 9286 TTTTGCTAATTTATGCTTATTCTCATTATCTAAATATGTTAATATATCCTCATAACaata 9345 |||| |||| || |||| ||| ||||||| || | |||| | ||| || Sbjct 817 TTTTATTAATATAATATTAT-----ATATATAAATATATTTA-ATATAAT--TAATAAAT 766 Query 9346 taaattaat----attattcattttttat-tattaatgtaaaatatgtaaaatttcaaaa 9400 ||||||||| || ||| ||| | ||| | ||| | |||||| | || ||||| | || Sbjct 765 TAAATTAATTATAATAATTAATTATATATATTTTATTATAAAAT-TATATAATTTAATAA 707 Query 9401 ----aatattgtattta-tatataatggttttaa----aaaattaaagtctataatatta 9451 ||||| || ||| | ||||| | |||| ||||||| | |||||| ||| Sbjct 706 TTTTTATATTATAATTATTTTATAAATTTATTAAATATAAAATTA---TATATAATTTTA 650 Query 9452 catttaggatt-tttaaatat-atctatatttgatttttattttttcacattaagtaatt 9509 |||| ||| | || |||| || ||||| | || | |||| | | | |||| ||||| Sbjct 649 ATTTTATAATTATATATATATAATTTATATATTATATATATTATATTATATTATATAATT 590 Query 9510 -attttatttaatgatggtggtaatttatatttattaataactttttttttATATTCAGA 9568 ||||||| | | || | || || ||| ||||| |||| |||| | |||||| | | Sbjct 589 AATTTTATATTTTAAT-ATATTATTTAATAATTATT-ATAATTTTTAATATATATT-ATA 533 Query 9569 TAGAGTTAATATTTGTAAGTTTATTAATGATTCTA 9603 | | ||||| | | ||||||||| ||| || Sbjct 532 TTTATATAATAAT--ATATTTTATTAATTATTATA 500 Score = 84.2 bits (92), Expect = 3e-11 Identities = 566/863 (66%), Gaps = 97/863 (11%) Strand=Plus/Plus Query 228184 aaatcgttaattaa-attaaatatt----agtaattgtaatataataaatgctagttctt 228238 |||| |||| ||| |||| ||||| | ||||| || |||||||||| || | || Sbjct 1985 AAATAATTAAATAATATTATATATTTAAAAATAATT-TATTATAATAAATA-TAATAATT 2042 Query 228239 taaaaaatt-taattaat-ttaaaagaattggatatatctaacaat----tataatataa 228292 ||| | || || ||||| |||||| || | | |||| || ||| |||||||||| Sbjct 2043 TAATATATAATATTTAATATTAAAATAAATTAAAATATATATTAATATAATATAATATAA 2102 Query 228293 atatttCATCATTACCaaaaacattaattaaattaaatattagttcatg-taatataaaa 228351 ||||| | |||| | |||| | || ||| || ||| | | |||||||||| Sbjct 2103 ATATTATTTGATTAT-----ATATTA-TAAATTTATATTTTATATATTAATAATATAAAA 2156 Query 228352 aatactaattttata-at-taat-ttagataatt-tGAAAGAATTAGATATATCTAGAAA 228407 ||| |||| || | || |||| ||| ||| | | | | ||| | ||||| || | Sbjct 2157 TATATTAATAATAAATATATAATATTAAATATTAATTATATAATAAAATATAATTA---A 2213 Query 228408 TTTTAATATAAAT-ATTTCATC-ATTACCAAAATCATTAATCAAATTAAA--TATTAGGA 228463 || |||||||||| | || || | || | | | |||||| | |||| ||||| | Sbjct 2214 TTATAATATAAATTAATTAATATAATATAATATTTATTAATATATATAAAAATATTA--A 2271 Query 228464 CATGTTATATAAAAAATACTAATTTTATAATTAATTTAGATAATTTGAAAGAATTAGATA 228523 || |||||||||||| |||| | || |||| || ||| || || || || ||| Sbjct 2272 AATAAAATATAAAAAATATAAATT--AAAAATAATATA-ATATATT-AATTAAATAAATA 2327 Query 228524 TATCTAGAAATTTTAATATAAATATTTCATCATTACCAAAATCATTGATTACATTAAATA 228583 || | || | |||||| |||||| | || | |||| ||| || || | ||| Sbjct 2328 AATAATAATATATAAATATATATATTT--TTAT-ATATAAATAATTATATATAT-ATATA 2383 Query 228584 TTAATTCATGTTATATAAAACACACTAATTTTATAAATGATTTAT-ATAATTTGAAGGAA 228642 | |||| || || |||| || |||||||||| ||| || ||||| | | Sbjct 2384 TAAATTAATAATA---AAAA-----TATTTTTATAAATAATTAATTATAATATTTA---- 2431 Query 228643 TTGGATATATCTAGAAATTATA--ATATAAATATTTCATCA------TTACCAAAATC-A 228693 || |||||| || |||||| ||||| |||| | || | ||| |||| | Sbjct 2432 TT--ATATATATAATTATTATATTATATATATATATAATAAATTATATTATATAAATATA 2489 Query 228694 TTAATCAAATTAAATATT-AGTGATTGCGATATTAAAAATACTAATTTTATAAATGATTT 228752 ||| | |||||||||||| | ||| | || | |||| || | |||| | | |||| Sbjct 2490 TTATTAAAATTAAATATTAAAAAATTAATAAATATATAATATTATTATTAT-ATTAATTT 2548 Query 228753 AGATAATTTGAAAGAATTAGATATATCTAACAATTATAATATAAATATTTCATCATTACC 228812 ||||| | | | | || ||| | | | ||||||| || |||||||| || Sbjct 2549 --ATAATATTATATTA-TATTTATTTTTTATAATTATATTAAAAATATTTAAT------- 2598 Query 228813 AAAAACAT---TGACTACATTAAATATTAGTTCAT-GTAATATAAAAAATACtaatttta 228868 ||||| || | | || | ||||||||| | || |||||| |||| || | || Sbjct 2599 AAAAATATTAATAATTATAATAAATATTAAATTATCATAATATTAAAA----TATATATA 2654 Query 228869 taattaatttagataatttgaaagaattagatatatctaaaaattttaatataaatattt 228928 || ||||| ||| | | | |||| ||||| ||| ||| ||||||| || | Sbjct 2655 TATTTAAT----ATATTATATATATATTA-TTATATTTAATAATAAGAATATAATTA--T 2707 Query 228929 CATCATTACCAAAATCATTGATT-ACATTAAAT-ATTAAT-TCATGTTATATAAACCATA 228985 || || | ||||| || ||| | |||| || |||||| | | ||||||||| || Sbjct 2708 AATAATAAAAAAAATTATATATTAAAATTATATAATTAATATAAAATTATATAAATATTA 2767 Query 228986 CTA-ATTTTATAAATGATTTATA 229007 || |||| ||| || ||||||| Sbjct 2768 TTATATTTAATATAT-ATTTATA 2789 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 755330150473600