Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Nomascus_20leucogenys_20[refseq_20GCF_5F000146795.2_202012-12-08]
17,484 sequences; 2,962,060,179 total letters
Query= NC_023426.1
Length=245717
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq565 91.5 2e-13
seq1 87.8 3e-12
seq406 86.0 1e-11
seq334 84.2 3e-11
>seq565
Length=117381234
Score = 91.5 bits (100), Expect = 2e-13
Identities = 195/277 (70%), Gaps = 31/277 (11%)
Strand=Plus/Minus
Query 158420 tatattgataatataaatcataatatatgcgaattaattgtat--atgatataatCAAAA 158477
|||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| || ||||||| | |
Sbjct 38363821 TATATTGATAATATAAAT----ATATAT---AATATATTATATTGATAATATAAT--ATA 38363771
Query 158478 CAATTTCTgataatataataatttattt-taatatagatacgcccataaaattagataat 158536
|| | ||||||||||||| |||| | | |||| |||| ||||| || |||||
Sbjct 38363770 TTATAT-TGATAATATAATATATTATATATTATATTGATAAT---ATAAATATATATAAT 38363715
Query 158537 gaatta-attgataataagaatat-tctatatattaaatttgataatacaatta-ataat 158593
|||| |||||||||| ||||| | | ||||||| ||| ||||||| || || ||| |
Sbjct 38363714 ATATTATATTGATAATATAAATATATATTTATATTATATT-GATAATATAAATATATATT 38363656
Query 158594 gat-ttaaataaaacatttgaat---tatttaaattatGTTCTTATTTTTACTATAAAAA 158649
|| ||| || | || | ||| |||||| ||||| ||| || ||||||
Sbjct 38363655 TATATTATATTGATAATATAAATGTATATTTATATTAT------ATTGATAATATAAATG 38363602
Query 158650 TCCTCATATATTTTATTAATAT-AATCGAAATTATAT 158685
| |||||| ||||||||| ||| | |||||||
Sbjct 38363601 TATATTTATATTATATTAATATAAATATATATTATAT 38363565
>seq1
Length=122973662
Score = 87.8 bits (96), Expect = 3e-12
Identities = 294/431 (68%), Gaps = 49/431 (11%)
Strand=Plus/Plus
Query 107153 ATATATAAATATCTGAATAAAGTATTTCCT-TATTATTATTCA-ATACTATTTTTAATTT 107210
|||||||||||| | |||| | ||||| | ||| | |||| | ||| |||| | ||||
Sbjct 12858832 ATATATAAATATATAAATATA-TATTTAATATATAAATATTTATATA-TATTATATATTT 12858889
Query 107211 ---GGGATTATAACTAGTtatatcatataattgtatatcatatttttcaacattaataat 107267
|||||| || |||||| |||| | | ||||| |||| ||| | ||| |||||
Sbjct 12858890 ATATATATTATA--TATTTATAT-ATATTA-TATATATTATATATTTATATATTTATAAT 12858945
Query 107268 gt----tatgtctatatattgatatatgta-aatttttatcta-atattagtatttcatt 107321
| ||| | |||||||| ||| || || ||| | ||| || |||||| ||| | ||
Sbjct 12858946 ATAATATATATTTATATATTTATAAATATATAATATATATTTATATATTA-TATAT--TT 12859002
Query 107322 ataattaaatatatttttgtataatattggctgtaatttattaaatat---taaattat- 107377
||||| ||||||| ||| |||| | | |||| || || |||| || |||||
Sbjct 12859003 ATAATATAATATATATTTATATATT------TATAATATAATATATATTTATATATTATA 12859056
Query 107378 catctatttCTAAGGTATCATCTTTGatataataaattatataaagtattaattcatttc 107437
|| ||||| | | ||| || | | | || ||| | |||||||| ||| ||| || |
Sbjct 12859057 TATATATTTAT-ATATATAATATGT-AAAT-ATATAATATATAAAATATAAAT--ATATA 12859111
Query 107438 tcat-tcgaatat-tatta-ataatat-ttaaatatatagattctggcatataatcttta 107493
|| | ||||| || || ||||||| | ||||||||| | | |||||| | ||
Sbjct 12859112 ATATATAAAATATATAATATATAATATATAAAATATATAATATATAATATATAAAATATA 12859171
Query 107494 tgtgataatatacatctaatatatgatataGATGGATTTTCATTTAGAAATTTATTTATT 107553
| | |||| |||| | ||||||| || || ||| || | || ||| ||||
Sbjct 12859172 TATTATAAAATACTCCAAATATATTATGTA-------TTTTATACATAA---TATATATT 12859221
Query 107554 TTATAATATAT 107564
||||||||||
Sbjct 12859222 ATATAATATAT 12859232
>seq406
Length=121039945
Score = 86.0 bits (94), Expect = 1e-11
Identities = 248/361 (69%), Gaps = 53/361 (15%)
Strand=Plus/Plus
Query 107227 atatcatataattgtatatcatatttttcaacatta-ataatgttatgtc-tatatattg 107284
|||| ||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | || | ||||||||
Sbjct 20752623 ATATAATATAATATTATATTATATTTAT----ATTATATAATATAATATAATATATATT- 20752677
Query 107285 atatatgtaaatttttatcta--atattagtatttcattataattaaatatatttttgta 107342
|||||| ||| | ||| | |||||| ||||| ||| || |||||| | | ||
Sbjct 20752678 ATATATATAATATAATATAAATTATATTA-TATTTA--TATTATATAATATAATATATTA 20752734
Query 107343 taatattggctgtaatttattaaatattaaattatcatctat-ttCTAAGGTATCATCTT 107401
|||||| | | |||| |||| |||||| ||||| || ||| || ||| ||| ||
Sbjct 20752735 TAATATAAG-TATAAT--ATTATATATTATATTAT-ATTTATATTATAATATATAAT--- 20752787
Query 107402 TGatataataaattatataaagtattaattcatttctcattcgaatat-tattaataata 107460
|||||||| || |||||| ||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||
Sbjct 20752788 --ATATAATATATAATATAATATATTAT---ATTTAT-ATTATAATATATATTAT--ATA 20752839
Query 107461 tttaaatat-atagattctggcatataatctttatgtgataatatacatctaatatatga 107519
|||| |||| ||| ||| ||||| | |||||||| || | |||||| |
Sbjct 20752840 TTTATATATTATATATT-----ATATATT---------ATAATATAAATATTATATATTA 20752885
Query 107520 tataGATGGATTTTCATTTAGAAATT-TATTT-AT-TTTATAATATATTGAATAATCTAT 107576
|||| || | | | | ||| ||||| || |||||||||||||| ||| | |||
Sbjct 20752886 TATA------TTATATATAATATATTATATTTTATATTTATAATATATTGTATATTATAT 20752939
Query 107577 A 107577
|
Sbjct 20752940 A 20752940
>seq334
Length=143122389
Score = 84.2 bits (92), Expect = 3e-11
Identities = 249/360 (69%), Gaps = 52/360 (14%)
Strand=Plus/Plus
Query 107226 tatatcatata---attgtatatcatatttttca-acatta---ataatgttatgtctat 107278
||||| ||||| ||| ||||| |||||| | | | |||| ||||| || | |||
Sbjct 48467934 TATATAATATATTTATTATATATTATATTTATTATATATTATATATAATATTTATTATAT 48467993
Query 107279 atattgatatatgtaaatttttatctaatattagtatttcattata-attaaatatattt 107337
||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| |
Sbjct 48467994 ATA---ATATAT---AATATTTATTACATATTA-TATTT-ATTATATATTATATATAATA 48468045
Query 107338 t--tgtat--aatat-tggctgtaatttattaaatattaaatt-atcatctatt---tCT 107388
| ||||| | ||| | ||| || ||| | |||||| ||| || || |||| | |
Sbjct 48468046 TATTGTATTTATTATATATATGTCATATATAATATATTATATTTATAATATATTATATAT 48468105
Query 107389 AAGGTATCATCTTTGatataataaattatataaagtattaattcatttctcattcgaata 107448
|| ||| || ||| |||||| |||||||| | ||| | | |||| | || |||
Sbjct 48468106 AATATATTATATTT---ATAATATATTATATATAATAT-ATTATATTTATAAT----ATA 48468157
Query 107449 ttat-taata-atatttaaatatatagattctggcatataatctttatgtgataatatac 107506
|||| | ||| ||||||| ||||||| || |||| | | ||| | ||||||||
Sbjct 48468158 TTATATTATATATATTTATATATATA--TT------TATATT-TATATTT-ATAATATA- 48468206
Query 107507 atctaatatatgatataGATGGATTTTCATTTAGAAATT-TATTTATTTTATAATATATT 107565
| |||||| ||||| | ||| | | | | ||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 48468207 ---TTATATATAATATATTT--ATTATATATAATATATTATATTTATTATATAATATATT 48468261
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 785994583333280
Made in 2017 by Kirill Kryukov This page is placed in public domain using CC0 |