Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Papio_20anubis_20[genbank_20GCA_5F000264685.2_202017-04-20] 63,234 sequences; 2,959,356,508 total letters Query= NC_023426.1 Length=245717 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq9 84.2 3e-11 >seq9 Length=125784921 Score = 84.2 bits (92), Expect = 3e-11 Identities = 252/367 (69%), Gaps = 38/367 (10%) Strand=Plus/Minus Query 107225 ttatatcatataattgtat-atcatatttttcaacattaataatgttatgtctatatatt 107283 |||||| ||||| |||||| || |||| || | || || || ||| |||||||| Sbjct 6889564 TTATATAATATA-TTGTATTATTATATATTATACAATATATTATTGTATTATTATATATT 6889506 Query 107284 gatatatgtaaatttttatctaatat-tagtatttcattata-atta---aatatatttt 107338 ||||| || ||| |||| || || || ||| | |||||| |||| |||||||| | Sbjct 6889505 -ATATAA-TATATTATTATATATCATATAATATATTATTATATATTATATAATATATTAT 6889448 Query 107339 tgtataatattggctgtaatttattaaatattaaattatcatctatttCTAAGGTATCAT 107398 |||||| ||| ||||| |||||| ||| || ||| | | | ||| || Sbjct 6889447 TGTATATTATA----------TATTATATATTATTGTATTAT-TATATATTA--TATAAT 6889401 Query 107399 CTTTGatataataaattata-taaagtattaattcatttctcattcgaatattatta-at 107456 | | |||||||| ||||| | | ||||| | || | | ||| ||||||||| || Sbjct 6889400 ATATTATATAATATATTATTCTTATATATTATATAATATATTATT---ATATTATTATAT 6889344 Query 107457 aatatttaa-atat-atag-attctggc--atataatct-ttatgtgataatatacatct 107510 | | | ||| |||| ||| ||| || ||||||| | |||| |||||||| | | Sbjct 6889343 ATTTTATAATATATTATATTATTATGTATTATATAATATATTAT---ATAATATAT-TAT 6889288 Query 107511 aatatatgatataGATGGATTTTCATTTAGAAATTTATTTATTTTATAATATATTGAATA 107570 |||||| ||||| | || | || || | ||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 6889287 TATATATTATATAT-TATTTTATTATATATTATATTATTTATTTTATTATATATTATATA 6889229 Query 107571 ATCTATA 107577 || |||| Sbjct 6889228 ATATATA 6889222 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 785544994423280