Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Calypte_20anna_20[refseq_20GCF_5F000699085.1_202014-06-06] 54,736 sequences; 1,105,676,412 total letters Query= NC_023426.1 Length=245717 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq632 89.7 8e-13 >seq632 Length=6885505 Score = 89.7 bits (98), Expect = 8e-13 Identities = 296/430 (69%), Gaps = 58/430 (13%) Strand=Plus/Plus Query 107151 AAATATATAAATATCTGAATAAAGTATTTCCTTATTATTATTCAATACTATTTTTA-ATT 107209 |||||||||||||| | ||| | ||| | ||| ||| || ||| ||| |||| || Sbjct 6374730 AAATATATAAATATATTTATATATTATAT--TTA-TATATTTATATATTATATTTATATA 6374786 Query 107210 TGGGATTATAACTAGTtata-tcatataattgtatatcatatttttcaacattaataatg 107268 | ||||| || ||||| | ||||| || ||||| |||||| | | ||| || || Sbjct 6374787 T----TTATA--TA-TTATATTTATATATTTATATATTATATTTAT--ATATTTAT-ATA 6374836 Query 107269 ttatgtctatatattgatatatgtaaatttttatctaatattagtatttcattataatta 107328 |||| | |||||||| |||||| || |||| | ||||| ||| |||||| || Sbjct 6374837 TTATATTTATATATTTATATAT-TATATTTAT-----ATATTTATAT---ATTATATTT- 6374886 Query 107329 aatatatttttgtataatattggctgta-atttattaaatattaaattatcatctatttC 107387 |||||||| | ||| ||||| | || |||||| |||||| || | || ||||| Sbjct 6374887 -ATATATTTATATATTATATT---TATATATTTAT---ATATTATAT--TTATATATTTA 6374937 Query 107388 TAAGGTATCATCTTTGatata---ataaattata-taaagtattaattcatttctcattc 107443 || ||| || ||| ||||| ||| |||||| | | |||| || || | ||| Sbjct 6374938 TA---TATTATATTT-ATATATTTATATATTATATTTATATATTTAT--ATATTATATTT 6374991 Query 107444 gaata-ttattaataatatttaaata--tatagattctggcatata-atctttatgtgat 107499 ||| |||| || ||||||| ||| |||| ||| | || || || ||||| | || Sbjct 6374992 ATATATTTATATATTATATTTATATATTTATATATTAT---ATTTATATATTTATAT-AT 6375047 Query 107500 aatatacatcta---atatatgatatagatggattttcatttagaaatttatttattt-t 107555 |||| || || |||||| |||| || |||| || | | |||||| ||||| | Sbjct 6375048 TATATTTATATATTTATATATTATATTTATATATTTATATAT-TATATTTATATATTTAT 6375106 Query 107556 ataatatatt 107565 ||| |||||| Sbjct 6375107 ATATTATATT 6375116 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 785628504949120