Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Picea_20abies_20[ConGenIE_20PRJEB1822-1.0_202015-05-12] 10,253,695 sequences; 12,301,475,675 total letters Query= NC_022749.1 Length=39758 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq33157 1382 0.0 seq53858 526 5e-145 seq519200 109 1e-19 >seq33157 Length=33566 Score = 1382 bits (1532), Expect = 0.0 Identities = 768/769 (99%), Gaps = 0/769 (0%) Strand=Plus/Plus Query 35185 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG 35244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7685 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG 7744 Query 35245 CTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCA 35304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7745 CTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCA 7804 Query 35305 AAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGC 35364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7805 AAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGC 7864 Query 35365 AGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGA 35424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7865 AGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGA 7924 Query 35425 ATGGCGTTGGATGCCGGGCAACAGCCCGCATTATGGGCGTTGGCCTCAACACGATTTTAC 35484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7925 ATGGCGTTGGATGCCGGGCAACAGCCCGCATTATGGGCGTTGGCCTCAACACGATTTTAC 7984 Query 35485 GTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAGCCGGGCAGTGACGT 35544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7985 GTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACAGCCGGGCAGTGACGT 8044 Query 35545 CATCGTCTGCGCGGAAATGGACGAACAGTGGGGCTATGTCGGGGCTAAATCGCGCCAGCG 35604 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8045 CATCGTCTGCGCGGAAATGGACGAACAGTGGGGCTATGTCGGGGCTAAATCGCGCCAGCG 8104 Query 35605 CTGGCTGTTTTACGCGTATGACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGA 35664 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8105 CTGGCTGTTTTACGCGTATGACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGA 8164 Query 35665 ACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGAT 35724 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8165 ACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGAT 8224 Query 35725 ATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAAT 35784 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8225 ATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAAT 8284 Query 35785 CAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTAAATCTGAGGCAGCACCTGGC 35844 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 8285 CAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGC 8344 Query 35845 ACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCAT 35904 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8345 ACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCAT 8404 Query 35905 CGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACC 35953 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8405 CGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACC 8453 >seq53858 Length=26476 Score = 526 bits (582), Expect = 5e-145 Identities = 293/294 (99%), Gaps = 0/294 (0%) Strand=Plus/Minus Query 35660 GGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTG 35719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 26476 GGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTG 26417 Query 35720 GTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCAC 35779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 26416 GTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCAC 26357 Query 35780 GTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTAAATCTGAGGCAGCAC 35839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 26356 GTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCAC 26297 Query 35840 CTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAA 35899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 26296 CTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAA 26237 Query 35900 GTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACC 35953 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 26236 GTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACC 26183 >seq519200 Length=4173 Score = 109 bits (120), Expect = 1e-19 Identities = 60/60 (100%), Gaps = 0/60 (0%) Strand=Plus/Plus Query 35212 GTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT 35271 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2479 GTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT 2538 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 111627482914800