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BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Brassica_20napus_20[refseq_20GCF_5F000686985.1_202014-05-15]
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Query 34307 ACCGATGCGCCGGTTGCGATCCAGAACCTCTCGGCTCTTCGGATCAGCGACCGCTGAGAA 34366
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Sbjct 22717341 ACCGATGCGCCGGTTGCGATCCAGAACCTCTCGGCTCTTCGGATCAGCGACCGCTGAGAA 22717400
Query 34367 CGTCGCCCGGATCAGGAACCGCGTCATCAGACGGTGGGCTCGGATCAGGTCGATGTAGTC 34426
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Sbjct 22717401 CGTCGCCCGGATCAGGAACCGCGTCATCAGACGGTGGGCTCGGATCAGGTCGATGTAGTC 22717460
Query 34427 GGTCTTCCCGGCGTCGGTGACGAACGCCGCGAGGTTGATGTGCCCTAGGTTGCAGGGCTC 34486
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Sbjct 22717461 GGTCTTCCCGGCGTCGGTGACGAACGCCGCGAGGTTGATGTGCCCTAGGTTGCAGGGCTC 22717520
Query 34487 CCACGGCTCCAGCGTGATCTCCCCGCACGGGTTGGTGCAGACGACCTCGTTGGGCTCACC 34546
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Sbjct 22717521 CCACGGCTCCAGCGTGATCTCCCCGCACGGGTTGGTGCAGACGACCTCGTTGGGCTCACC 22717580
Query 34547 GACGTTGGACAGGCTGCTGTCCCACATCCCCGGCTCGCCGTTGCGTACGGCTCCCTCGGA 34606
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Sbjct 22717581 GACGTTGGACAGGCTGCTGTCCCACATCCCCGGCTCGCCGTTGCGTACGGCTCCCTCGGA 22717640
Query 34607 GAGAGCCTTCAGCACCCGGTGTGCCTTCGTGGAGCGCGGGTTGAGCGGGTCGACAGGAGC 34666
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Sbjct 22717641 GAGAGCCTTCAGCACCCGGTGTGCCTTCGTGGAGCGCGGGTTGAGCGGGTCGACAGGAGC 22717700
Query 34667 CTTGGCCAGGCTCCAGAACGCATCGTCCACCTCGACCGAGATGTTCGTGG---------- 34716
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Sbjct 22717701 CTTGGCCAGGCTCCAGAACGCATCGTCCACCTCGACCGAGATGTTCGTGGTCCAGTGAGA 22717760
Query 34717 -------------------------------TCCAGTGAGATCCGCTGTCCTGCTTGATG 34745
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Sbjct 22717761 TCCGCTGTCCTGCTTGATGTTGGTGAACGTCTCCAGTGAGATCCGCTGTCCTGCTTGATG 22717820
Query 34746 TTGGTGAACGTCTCGACCTGCCAGTCCGCCCAGTGCATCATCGCCATGCGAGCCGACCGG 34805
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Sbjct 22717821 TTGGTGAACGTCTCGCCCTGCCAGTCCGCCCAGTGCATCATCGCCATGCGAGCCGACCGG 22717880
Query 34806 CGAACACCTCCGGCCACCACACACTGCGCGATGGCGTGGTCGATCTCCATCGCATCGAGA 34865
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Sbjct 22717881 CGAACACCTCCGGCCACCACACACTGCGCGATGGCGTGGTCGATCTCCATCGCATCGAGA 22717940
Query 34866 CCGGTCAGCGCACCACCGTC 34885
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Sbjct 22717941 CCGGTCAGCGCACCACCTTC 22717960
>seq49
Length=878214
Score = 172 bits (190), Expect = 2e-38
Identities = 97/98 (99%), Gaps = 0/98 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 29703 CCATCGGGTTGATGATGTACCCGTTGCGCTTCGCCTCGTTGGCGAGCTTGCGGCTGTACC 29762
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Sbjct 681956 CCATCGGGTTGATGATGTACCCGTTGCGCTTCGCCTCGTTGGCGAGCTTGCGGCTGTACC 682015
Query 29763 GCGTCACTCCGGGGTACGCCTTGTCGAACCCGTCCACG 29800
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Sbjct 682016 GCGTCACTCCGGGATACGCCTTGTCGAACCCGTCCACG 682053
>seq14
Length=60807478
Score = 172 bits (190), Expect = 2e-38
Identities = 97/98 (99%), Gaps = 0/98 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 19710 CCGTTCCCGCCGGGAGTCGAGATCCCGTGGGAGACCGCTCCGTTCACGCAGTTCGTCATC 19769
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Sbjct 27571939 CCGTTCCCGCCGGGAGTCGAGATCCCGTGGGAGACCGCTCCGTTCACGCAGTTCGTCATC 27571880
Query 19770 CCGGACTACTCGTTCGAGGACGAGGAGTTCGCCAACCG 19807
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Sbjct 27571879 CCGGACTACTCGTTCGAGGACGAGGAGGTCGCCAACCG 27571842
>seq4
Length=41855496
Score = 167 bits (184), Expect = 7e-37
Identities = 96/97 (99%), Gaps = 1/97 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 4587 CGCAGGGACTACAAACGCGAGATACCCAAGCGGCAACGGGATCTGACTGTAAATCAGACG 4646
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Sbjct 36513380 CGCAGGGACTACAAACGCGAGATACCCAAGCGGCAACGGGATCTGACTGTAAATCAGACG 36513321
Query 4647 CTTCGGCTTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTCTCGCGACT 4683
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Sbjct 36513320 CTTCGGCTTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTCTCG-GACT 36513285
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 149120763326912
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