Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Reticulascus_20tulasneorum_20[genbank_20GCA_5F001557505.1_202016-02-
10] 36 sequences; 42,868,360 total letters
Query= AAMG01000911.1
Length=280
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq24 352 5e-95
seq23 352 5e-95
seq22 352 5e-95
seq21 352 5e-95
seq20 352 5e-95
seq19 352 5e-95
seq17 352 5e-95
seq7 352 5e-95
>seq24
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Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
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Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 11234 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 11176
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 11175 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 11116
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 11115 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 11097
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Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 19871 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 19812
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 19811 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 19753
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 19752 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 19694
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 19693 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 19634
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 19633 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 19615
Score = 345 bits (382), Expect = 7e-93
Identities = 235/259 (91%), Gaps = 4/259 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 2836 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCC-AGAACATCTAAGGGCATCACAG 2778
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 2777 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 2719
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 2718 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 2660
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 2659 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 2600
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 2599 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 2581
>seq23
Length=28992
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 12627 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 12568
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 12567 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 12509
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 12508 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 12450
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 12449 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 12390
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 12389 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 12371
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 21146 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 21087
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 21086 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 21028
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 21027 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 20969
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 20968 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 20909
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 20908 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 20890
Score = 324 bits (358), Expect = 2e-86
Identities = 232/259 (90%), Gaps = 6/259 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 4120 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGG-CATCACAG 4062
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 4061 ACCTGTTAT-GCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 4004
Query 121 CAC-CAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 4003 CGTACTGCCAAAGCATACGGG-CTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 3945
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 3944 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCA-CACCACCCACAAAATCAAG 3886
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 3885 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 3867
>seq22
Length=27813
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 3721 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 3780
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 3781 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 3839
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 3840 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 3898
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 3899 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 3958
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 3959 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 3977
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 15127 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 15068
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 15067 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 15009
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 15008 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 14950
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 14949 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 14890
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 14889 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 14871
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 23642 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 23583
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 23582 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 23524
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 23523 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 23465
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 23464 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 23405
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 23404 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 23386
>seq21
Length=35818
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
|||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2201 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 2142
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 2141 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 2083
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 2082 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 2024
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 2023 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 1964
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 1963 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 1945
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 10720 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 10661
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 10660 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 10602
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 10601 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 10543
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 10542 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 10483
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 10482 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 10464
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
|||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19240 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 19181
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 19180 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 19122
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 19121 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 19063
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 19062 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 19003
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 19002 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 18984
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
|||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27760 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 27701
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 27700 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 27642
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 27641 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 27583
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 27582 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 27523
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 27522 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 27504
>seq20
Length=21278
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
|||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7551 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 7610
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 7611 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 7669
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 7670 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 7728
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 7729 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 7788
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 7789 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 7807
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
|||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13058 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 12999
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 12998 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 12940
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 12939 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 12881
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 12880 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 12821
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 12820 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 12802
>seq19
Length=24101
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
|||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3399 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 3340
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3339 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 3281
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3280 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 3222
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 3221 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 3162
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 3161 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 3143
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 11919 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 11860
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 11859 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 11801
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 11800 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 11742
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 11741 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 11682
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 11681 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 11663
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 15427 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 15486
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 15487 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 15545
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 15546 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 15604
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 15605 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 15664
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||| ||||||||||
Sbjct 15665 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 15683
Score = 192 bits (212), Expect = 9e-47
Identities = 139/157 (89%), Gaps = 3/157 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 23947 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 24006
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 24007 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTG-AGCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 24065
Query 121 CACCAACCATAGTCGAT-GGGGCTATTTAGCAGGTTA 156
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Sbjct 24066 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTA 24101
>seq17
Length=2260672
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 2258153 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 2258094
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 2258093 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 2258035
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 2258034 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 2257976
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 2257975 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 2257916
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 2257915 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 2257897
>seq7
Length=32167
Score = 352 bits (390), Expect = 5e-95
Identities = 236/259 (91%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 7542 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 7483
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 7482 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 7424
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 7423 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 7365
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 7364 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 7305
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 7304 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 7286
Score = 347 bits (384), Expect = 2e-93
Identities = 236/260 (91%), Gaps = 5/260 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAG-CGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACA 59
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Sbjct 16049 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACA 15990
Query 60 GACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAG 119
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Sbjct 15989 GACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCGGCTG--AGCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGG 15932
Query 120 CCACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAAT 178
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Sbjct 15931 CGTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAAT 15873
Query 179 TAACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAA 238
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Sbjct 15872 TAAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAA 15813
Query 239 GAAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 15812 GAAAGAGCTCTCAATCTGTC 15793
Score = 345 bits (382), Expect = 7e-93
Identities = 235/259 (91%), Gaps = 4/259 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 24510 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAACGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 24451
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 24450 ACCTGTTATTGC-TCAAACTTCCATCGGCTTGA-GCCGATAGTCCCTCTAAGAAGCCGGC 24393
Query 121 CACCAACCATAGTCGATG-GGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179
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Sbjct 24392 GTACTGCCAAAG-CAATACGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGCAATT 24334
Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239
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Sbjct 24333 AAGCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCACAAAATCAAG 24274
Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 24273 AAAGAGCTCTCAATCTGTC 24255
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 796799722116
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