Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Microbotryum_20violaceum_20[genbank_20GCA_5F900015425.1_202016-12- 23] 166 sequences; 31,780,530 total letters Query= AAMG01000911.1 Length=280 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq163 370 2e-100 seq115 370 2e-100 seq89 370 2e-100 seq64 370 2e-100 seq31 370 2e-100 seq28 365 7e-99 >seq163 Length=28061 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 20012 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 19953 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 19952 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 19893 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 19892 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 19833 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 19832 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 19773 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 19772 AAGAGCTATCAATCTGTC 19755 Score = 365 bits (404), Expect = 7e-99 Identities = 237/259 (92%), Gaps = 1/259 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 423 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 364 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAA-CTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAG 119 |||||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| Sbjct 363 ACCTGTTATTGCCTCAAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAG 304 Query 120 CCACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179 || ||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 CCGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 244 Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| Sbjct 243 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAG 184 Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258 ||||||||||||||||||| Sbjct 183 AAAGAGCTATCAATCTGTC 165 Score = 360 bits (398), Expect = 3e-97 Identities = 236/258 (91%), Gaps = 2/258 (1%) Strand=Plus/Minus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10230 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 10171 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 10170 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 10111 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10110 CGCCAGCCA-AGCCGGCGGA-CTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 10053 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 10052 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 9993 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 9992 AAGAGCTATCAATCTGTC 9975 >seq115 Length=31698 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5210 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 5269 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 5270 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 5329 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5330 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 5389 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 5390 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 5449 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 5450 AAGAGCTATCAATCTGTC 5467 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 15039 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 15098 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 15099 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 15158 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 15159 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 15218 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 15219 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 15278 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 15279 AAGAGCTATCAATCTGTC 15296 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 24869 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 24928 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 24929 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 24988 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 24989 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 25048 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 25049 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 25108 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 25109 AAGAGCTATCAATCTGTC 25126 >seq89 Length=1766943 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6918 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 6977 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 6978 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 7037 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7038 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 7097 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 7098 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 7157 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 7158 AAGAGCTATCAATCTGTC 7175 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16705 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 16764 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 16765 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 16824 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16825 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 16884 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 16885 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 16944 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 16945 AAGAGCTATCAATCTGTC 16962 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 26530 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 26589 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 26590 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 26649 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 26650 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 26709 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 26710 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 26769 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 26770 AAGAGCTATCAATCTGTC 26787 >seq64 Length=29568 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9619 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 9560 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 9559 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 9500 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9499 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 9440 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 9439 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 9380 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 9379 AAGAGCTATCAATCTGTC 9362 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 19444 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 19385 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 19384 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 19325 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 19324 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 19265 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 19264 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 19205 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 19204 AAGAGCTATCAATCTGTC 19187 Score = 324 bits (358), Expect = 2e-86 Identities = 232/259 (90%), Gaps = 6/259 (2%) Strand=Plus/Minus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| Sbjct 29089 TACTCGC-GGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCG-CCCAGAACATCTAAGG-CATCACAG 29033 Query 61 ACCTGTTATT-GCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAG 119 |||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| Sbjct 29032 ACCTGTTATTTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAG 28973 Query 120 CCACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 179 || ||| ||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 28972 CCGCCAGCCAAAGCCGGCGGA-CTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATT 28914 Query 180 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAG 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| Sbjct 28913 AACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAG 28854 Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258 ||||| ||||||||||||| Sbjct 28853 AAAGA-CTATCAATCTGTC 28836 >seq31 Length=24951 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 12533 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 12592 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 12593 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 12652 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 12653 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 12712 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 12713 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 12772 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 12773 AAGAGCTATCAATCTGTC 12790 Score = 370 bits (410), Expect = 2e-100 Identities = 237/258 (92%), Gaps = 0/258 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 22357 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 22416 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 22417 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 22476 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 22477 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 22536 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 22537 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 22596 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 22597 AAGAGCTATCAATCTGTC 22614 Score = 203 bits (224), Expect = 5e-50 Identities = 213/258 (83%), Gaps = 24/258 (9%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| || ||| |||| ||||||| || |||| || |||||| ||||| |||||||| Sbjct 2767 TACTCGCTG-CTCTGTCA-TGTAGCG-GC-TGCGCCC--GAACAT-TAAGG-CATCACAG 2818 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 |||||||||||| |||| |||| | || | || ||||||| ||| | |||| Sbjct 2819 ACCTGTTATTGC-TCAA-CTTCA--TCACTAAACGCTGATAGTCCT----AGA-GTCAGC 2869 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | || || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2870 CGCCG--CA-AGCCGGCGGA-CTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCG-AATTA 2924 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| Sbjct 2925 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAAC-GCCATGCACCACCAACCACAG-ATCAAGA 2982 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 2983 AAGAGCTATCAATCTGTC 3000 >seq28 Length=23327 Score = 365 bits (404), Expect = 7e-99 Identities = 237/259 (92%), Gaps = 1/259 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16618 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 16677 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 16678 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 16737 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16738 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 16797 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCA-CCACCACCCATAGAATCAAG 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||| Sbjct 16798 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCCACCAACCACAAGATCAAG 16857 Query 240 AAAGAGCTATCAATCTGTC 258 ||||||||||||||||||| Sbjct 16858 AAAGAGCTATCAATCTGTC 16876 Score = 347 bits (384), Expect = 2e-93 Identities = 234/258 (91%), Gaps = 3/258 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 6849 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGG-CATCACAG 6907 Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120 ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 6908 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 6967 Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180 | ||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6968 CGCCAGCCAAAGCCGGCGGA-CTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 7026 Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 7027 ACCAGACAAATCACT-CACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 7085 Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258 |||||||||||||||||| Sbjct 7086 AAGAGCTATCAATCTGTC 7103 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 796798718646