Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Microbotryum_20violaceum_20[genbank_20GCA_5F900015965.1_202016-12-
23] 147 sequences; 31,827,297 total letters
Query= AAMG01000911.1
Length=280
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq128 367 2e-99
seq79 367 2e-99
seq71 367 2e-99
seq40 367 2e-99
seq39 367 2e-99
>seq128
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Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 294629 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 294570
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 294569 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 294510
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 294509 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 294450
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 294449 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 294390
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 294389 AAGAGCTATCAATCTGTC 294372
Score = 334 bits (370), Expect = 1e-89
Identities = 232/258 (90%), Gaps = 4/258 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 304578 TACTCGC-GGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGG-CATCACAG 304521
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 304520 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 304461
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 304460 CGCCAGCCCAAC-CGGCGGGACTATT-AGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 304403
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 304402 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 304343
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 304342 AAGAGCTATCAATCTGTC 304325
>seq79
Length=30831
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 4978 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 4919
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 4918 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 4859
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 4858 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 4799
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 4798 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 4739
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 4738 AAGAGCTATCAATCTGTC 4721
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 14951 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 14892
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 14891 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 14832
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 14831 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 14772
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 14771 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 14712
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 14711 AAGAGCTATCAATCTGTC 14694
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 24924 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 24865
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 24864 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 24805
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 24804 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 24745
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 24744 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 24685
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 24684 AAGAGCTATCAATCTGTC 24667
>seq71
Length=22528
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 10287 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 10228
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 10227 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 10168
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 10167 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 10108
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 10107 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 10048
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 10047 AAGAGCTATCAATCTGTC 10030
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 20255 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 20196
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 20195 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 20136
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 20135 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 20076
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 20075 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 20016
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
||||||||||||||||||
Sbjct 20015 AAGAGCTATCAATCTGTC 19998
Score = 264 bits (292), Expect = 2e-68
Identities = 222/258 (86%), Gaps = 16/258 (6%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 330 TACTCGCTG-CTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 272
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 271 A-CTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 213
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 212 CGCCAGCCA-AGCCGGCGGGACTATTTAG--AGTTAAG--TTCGTTCGTTATC-GAATTA 159
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 158 A-CAGAC-AATCACTCCA-CAACTAAGAACGGCCATGCACCACAA---ACAG-ATCAAGA 106
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
|| |||||||||||||||
Sbjct 105 AA-AGCTATCAATCTGTC 89
>seq40
Length=35106
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4317 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 4258
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 4257 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 4198
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 4197 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 4138
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 4137 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 4078
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
||||||||||||||||||
Sbjct 4077 AAGAGCTATCAATCTGTC 4060
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 14287 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 14228
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 14227 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 14168
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 14167 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 14108
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 14107 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 14048
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
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Sbjct 14047 AAGAGCTATCAATCTGTC 14030
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 24258 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 24199
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 24198 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 24139
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
| ||| || || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24138 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 24079
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 24078 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 24019
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
||||||||||||||||||
Sbjct 24018 AAGAGCTATCAATCTGTC 24001
Score = 342 bits (378), Expect = 8e-92
Identities = 233/258 (90%), Gaps = 3/258 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 34220 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGG-CATCACAG 34162
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 34161 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 34102
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
| ||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34101 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGA-CTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 34043
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||
Sbjct 34042 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCA-CAACCACAAGATCAAGA 33984
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
||||||||||||||||||
Sbjct 33983 AAGAGCTATCAATCTGTC 33966
>seq39
Length=26446
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
Identities = 236/258 (91%), Gaps = 0/258 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9613 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 9554
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
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Sbjct 9553 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 9494
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
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Sbjct 9493 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 9434
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 9433 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 9374
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
||||||||||||||||||
Sbjct 9373 AAGAGCTATCAATCTGTC 9356
Score = 367 bits (406), Expect = 2e-99
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 60
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Sbjct 19578 TACTCGCTGGCTCTGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAG 19519
Query 61 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGC 120
||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 19518 ACCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATCAGCTAAACGCTGATAGTCCCTCTAAGAAGTCAGC 19459
Query 121 CACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 180
| ||| || || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19458 CGCCAGCCCAAGCCGGCGGGACTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTA 19399
Query 181 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGA 240
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Sbjct 19398 ACCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCAACCACAAGATCAAGA 19339
Query 241 AAGAGCTATCAATCTGTC 258
||||||||||||||||||
Sbjct 19338 AAGAGCTATCAATCTGTC 19321
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 796798865307
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