Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Tilletia_20indica_20[genbank_20GCA_5F001689945.1_202016-07-20]
470 sequences; 37,216,861 total letters
Query= AAMG01000911.1
Length=280
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq349 414 2e-113
seq324 414 2e-113
seq302 414 2e-113
seq269 414 2e-113
seq407 407 2e-111
seq220 82.4 1e-13
>seq349
Length=16128
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
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Sbjct 5943 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 5884
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
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Sbjct 5883 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 5824
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
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Sbjct 5823 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 5764
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
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Sbjct 5763 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 5704
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 5703 AGAGCTATCAATCTGTC 5687
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
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Sbjct 14627 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 14568
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14567 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 14508
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14507 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 14448
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14447 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 14388
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 14387 AGAGCTATCAATCTGTC 14371
>seq324
Length=18829
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2643 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 2702
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2703 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 2762
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
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Sbjct 2763 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 2822
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2823 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 2882
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 2883 AGAGCTATCAATCTGTC 2899
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16248 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 16307
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16308 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 16367
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
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Sbjct 16368 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 16427
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16428 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 16487
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 16488 AGAGCTATCAATCTGTC 16504
>seq302
Length=20267
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
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Sbjct 10601 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 10542
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
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Sbjct 10541 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 10482
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
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Sbjct 10481 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 10422
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10421 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 10362
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 10361 AGAGCTATCAATCTGTC 10345
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19085 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 19026
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19025 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 18966
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18965 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 18906
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18905 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 18846
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 18845 AGAGCTATCAATCTGTC 18829
>seq269
Length=42124
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8459 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 8400
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8399 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 8340
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8339 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 8280
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8279 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 8220
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 8219 AGAGCTATCAATCTGTC 8203
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19406 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 19347
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19346 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 19287
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
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Sbjct 19286 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 19227
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19226 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 19167
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 19166 AGAGCTATCAATCTGTC 19150
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27838 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 27779
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27778 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 27719
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27718 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 27659
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27658 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 27599
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 27598 AGAGCTATCAATCTGTC 27582
Score = 414 bits (458), Expect = 2e-113
Identities = 246/257 (96%), Gaps = 0/257 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36336 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 36277
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36276 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCG 36217
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36216 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 36157
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36156 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 36097
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 36096 AGAGCTATCAATCTGTC 36080
>seq407
Length=6235
Score = 407 bits (450), Expect = 2e-111
Identities = 245/257 (95%), Gaps = 1/257 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2050 ACTCGTTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 1991
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCTGGAAGCCAATAGTCCCTCTAAGAAGCCAGCC 121
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Sbjct 1990 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTAGCTAGACGCCAATAGTCC-TCTAAGAAGCCAGCG 1932
Query 122 ACCAACCATAGTCGATGGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 181
| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931 GCTAACCAAAGTCGGCCGGGCTATTTAGCAGGTTAAGGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAA 1872
Query 182 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1871 CCAGACAAATCACTCCACCAACTAAGAACGGCCATGCACCACCACCCATAGAATCAAGAA 1812
Query 242 AGAGCTATCAATCTGTC 258
|||||||||||||||||
Sbjct 1811 AGAGCTATCAATCTGTC 1795
>seq220
Length=549732
Score = 82.4 bits (90), Expect = 1e-13
Identities = 73/89 (82%), Gaps = 2/89 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACTCGGTGGCTCCGTCAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCACAGA 61
|||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||||||| |||||
Sbjct 346849 ACTCATTGGCTCCGTCAGTGTA-CGCACCTGCGGCCGCTCTCATCCAAGGGCATTACAGA 346791
Query 62 CCTGTTATTGCCTCAAACTTCCATTGGCT 90
|||||| ||||||||||| ||| || |||
Sbjct 346790 CCTGTT-TTGCCTCAAACCTCCGTTAGCT 346763
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 796796372070
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