Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: fungal_20sp._20ARF18_20[genbank_20GCA_5F002224055.1_202017-07-24] 412 sequences; 46,394,168 total letters Query= AAMG01002244.1 Length=504 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq189 838 0.0 >seq189 Length=79730 Score = 838 bits (928), Expect = 0.0 Identities = 491/505 (97%), Gaps = 3/505 (1%) Strand=Plus/Minus Query 1 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16624 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 16565 Query 61 CCCCGTGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 120 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16564 CCCCGAGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 16505 Query 121 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGATACCATGGTA 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 16504 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATAGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGAAACCATGGTA 16445 Query 181 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCT 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16444 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCG 16385 Query 241 CAAGGCCATGCGATTCGTTAAGTTATTATGAATCACCAAGGAGCCCCGAAGGGCGTTGGT 300 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||| Sbjct 16384 CAAGGCCATGCGATTCGTTTAGTTATCATGAATCACCAACAAG-CCCGAA-GGCATTGGT 16327 Query 301 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCC-GAAGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 359 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16326 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCCGGAGGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 16267 Query 360 GAATTACCACGGTTATCCATGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 419 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16266 GAATTACCACGGTTATCCAAGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 16207 Query 420 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16206 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 16147 Query 480 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 504 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16146 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 16122 Score = 838 bits (928), Expect = 0.0 Identities = 491/505 (97%), Gaps = 3/505 (1%) Strand=Plus/Minus Query 1 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 27491 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 27432 Query 61 CCCCGTGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 120 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 27431 CCCCGAGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 27372 Query 121 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGATACCATGGTA 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 27371 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATAGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGAAACCATGGTA 27312 Query 181 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCT 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 27311 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCG 27252 Query 241 CAAGGCCATGCGATTCGTTAAGTTATTATGAATCACCAAGGAGCCCCGAAGGGCGTTGGT 300 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||| Sbjct 27251 CAAGGCCATGCGATTCGTTTAGTTATCATGAATCACCAACAAG-CCCGAA-GGCATTGGT 27194 Query 301 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCC-GAAGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 359 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 27193 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCCGGAGGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 27134 Query 360 GAATTACCACGGTTATCCATGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 419 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 27133 GAATTACCACGGTTATCCAAGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 27074 Query 420 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 27073 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 27014 Query 480 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 504 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 27013 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 26989 Score = 838 bits (928), Expect = 0.0 Identities = 491/505 (97%), Gaps = 3/505 (1%) Strand=Plus/Minus Query 1 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 38358 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 38299 Query 61 CCCCGTGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 120 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 38298 CCCCGAGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 38239 Query 121 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGATACCATGGTA 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 38238 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATAGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGAAACCATGGTA 38179 Query 181 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCT 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 38178 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCG 38119 Query 241 CAAGGCCATGCGATTCGTTAAGTTATTATGAATCACCAAGGAGCCCCGAAGGGCGTTGGT 300 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||| Sbjct 38118 CAAGGCCATGCGATTCGTTTAGTTATCATGAATCACCAACAAG-CCCGAA-GGCATTGGT 38061 Query 301 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCC-GAAGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 359 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 38060 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCCGGAGGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 38001 Query 360 GAATTACCACGGTTATCCATGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 419 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 38000 GAATTACCACGGTTATCCAAGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 37941 Query 420 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 37940 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 37881 Query 480 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 504 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 37880 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 37856 Score = 838 bits (928), Expect = 0.0 Identities = 491/505 (97%), Gaps = 3/505 (1%) Strand=Plus/Minus Query 1 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 49225 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 49166 Query 61 CCCCGTGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 120 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 49165 CCCCGAGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 49106 Query 121 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGATACCATGGTA 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 49105 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATAGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGAAACCATGGTA 49046 Query 181 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCT 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 49045 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCG 48986 Query 241 CAAGGCCATGCGATTCGTTAAGTTATTATGAATCACCAAGGAGCCCCGAAGGGCGTTGGT 300 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||| Sbjct 48985 CAAGGCCATGCGATTCGTTTAGTTATCATGAATCACCAACAAG-CCCGAA-GGCATTGGT 48928 Query 301 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCC-GAAGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 359 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 48927 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCCGGAGGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 48868 Query 360 GAATTACCACGGTTATCCATGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 419 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 48867 GAATTACCACGGTTATCCAAGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 48808 Query 420 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 48807 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 48748 Query 480 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 504 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 48747 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 48723 Score = 838 bits (928), Expect = 0.0 Identities = 491/505 (97%), Gaps = 3/505 (1%) Strand=Plus/Minus Query 1 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 60084 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 60025 Query 61 CCCCGTGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 120 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 60024 CCCCGAGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 59965 Query 121 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGATACCATGGTA 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 59964 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATAGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGAAACCATGGTA 59905 Query 181 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCT 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 59904 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCG 59845 Query 241 CAAGGCCATGCGATTCGTTAAGTTATTATGAATCACCAAGGAGCCCCGAAGGGCGTTGGT 300 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||| Sbjct 59844 CAAGGCCATGCGATTCGTTTAGTTATCATGAATCACCAACAAG-CCCGAA-GGCATTGGT 59787 Query 301 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCC-GAAGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 359 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 59786 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCCGGAGGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTA 59727 Query 360 GAATTACCACGGTTATCCATGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 419 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 59726 GAATTACCACGGTTATCCAAGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATG 59667 Query 420 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 59666 AGCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTT 59607 Query 480 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 504 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 59606 GAGACAAGCATATGACTACTGGCAG 59582 Score = 830 bits (920), Expect = 0.0 Identities = 488/504 (97%), Gaps = 2/504 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5833 GTACTCATTCCAATTACAAGACCCAAAAGAGCCCTGTATCAGTATTTATTGTCACTACCT 5774 Query 61 CCCCGTGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 120 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5773 CCCCGAGTCGGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTT 5714 Query 121 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGATACCATGGTA 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 5713 TCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATAGAACCCTAATTCCCCGTTACCCGTTGAAACCATGGTA 5654 Query 181 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCT 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5653 GGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGAACCATCGCCGGCG 5594 Query 241 CAAGGCCATGCGATTCGTTAAGTTATTATGAATCACCAAGGAGCCCCGAAGGGCGTTGGT 300 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||| Sbjct 5593 CAAGGCCATGCGATTCGTTTAGTTATCATGAATCACCAACAAG-CCCGAA-GGCATTGGT 5536 Query 301 TTTTTATCTAATAAATACACCCCTTCCGAAGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTAG 360 |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5535 TTTTTATCTAATAAATACACCCTTCCGGAGGTCGGGGTTTTTAGCATGTATTAGCTCTAG 5476 Query 361 AATTACCACGGTTATCCATGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATGA 420 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5475 AATTACCACGGTTATCCAAGTAGTAAGGTACTATCAAATAAACGATAACTGATTTAATGA 5416 Query 421 GCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTTG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5415 GCCATTCGCAGTTTCACTGTATAGATTGCTTATACTTAGACATGCATGGCTTAATCTTTG 5356 Query 481 AGACAAGCATATGACTACTGGCAG 504 |||||||||||||||||||||||| Sbjct 5355 AGACAAGCATATGACTACTGGCAG 5332 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 1510393777152