Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Babesia_20microti_20[genbank_20GCA_5F001650065.1_202016-05-23] 82 sequences; 6,346,114 total letters Query= NC_001422.1 Length=5386 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq24 1957 0.0 >seq24 Length=1130 Score = 1957 bits (2170), Expect = 0.0 Identities = 1090/1093 (99%), Gaps = 0/1093 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2314 GAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGT 2373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGT 60 Query 2374 TTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACttt 2433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTT 120 Query 2434 ttttCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAG 2493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TTTTCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAG 180 Query 2494 ACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAAT 2553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAAT 240 Query 2554 GGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTT 2613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTT 300 Query 2614 TCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGC 2673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGC 360 Query 2674 TTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAAT 2733 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 361 TTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGAT 420 Query 2734 GGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCC 2793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCC 480 Query 2794 CGTACGCCGGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACT 2853 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CGTACGCCGGGCAATAATGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACT 540 Query 2854 AAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCA 2913 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCA 600 Query 2914 CTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTG 2973 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTG 660 Query 2974 GTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAG 3033 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAG 720 Query 3034 GTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTG 3093 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTG 780 Query 3094 CCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTG 3153 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 781 CCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTG 840 Query 3154 CTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCG 3213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCG 900 Query 3214 TTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAA 3273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 TTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAA 960 Query 3274 AGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTG 3333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 AGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTG 1020 Query 3334 GTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTA 3393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 GTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTA 1080 Query 3394 CTAAAATGCAACT 3406 ||||||||||||| Sbjct 1081 CTAAAATGCAACT 1093 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 17123184642630