Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Gregarina_20niphandrodes_20[genbank_20GCA_5F000223845.4_202014-04- 11] 469 sequences; 14,009,070 total letters Query= NC_031450.1 Length=5166 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq119 6700 0.0 >seq119 Length=5926 Score = 6700 bits (7430), Expect = 0.0 Identities = 3806/3864 (98%), Gaps = 2/3864 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4 GGCTTATGGGCAAGCACCAAGTAAGGGAGATAAAGTGAAGTGTATAAATAGTGTTCAACA 63 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 118 GGCTTATGGGCAAGCACCAAGTAAGGGAGATAAAGTGAAGTGTATAAATAGTGTTCAACA 177 Query 64 TGTAAGTAGCTCATTTTGTTGTTGTATTTCGTGCAGTGCAGTAATACTTTGGTTTGGTAA 123 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 178 TGTAAGTAGCTCATTCTGTTGTTGTATTTCGTGCAGTGCAGTAATACTTTGGTTTGGTAA 237 Query 124 GTAGGTTTAAACATAAGAAGATATATCACCCTCAGAGCTTGTATGACATTACTAAGAAGA 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 238 GTAGGTTTAAACATAAGAAGATATATCACCCTCAGAGCTTGTATGACATTACTAAGAAGA 297 Query 184 AGGTAAGAGAGGTGTACAAGAATAATTGGAACGAGACGAAGGTACTACCGAAGACTATCC 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 298 AGGTAAGAGAGGTGTACAAGAATAATTGGAACGAGACGAAGGTACTACCGAAGACTATCC 357 Query 244 AGAGGGAACTACTACTAGATTGGTTAAGATGTGACGAGACAATTCCTGAGAGTGATGACG 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 358 AGAGGGAACTACTACTAGATTGGTTAAGATGTGACGAGAAAATTCCTGAGAGTGATGACG 417 Query 304 ATGTGGAACGAATAGTGGCACGTATGGAAAGGGGATGGGAGGCATTGAAGCCCTTTGGTC 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 418 ATGTGGAACGAATAGTGGCACGTATGGAAAGGGGATGGGAGGCATTGAAGCCCTTTGGTC 477 Query 364 CAACTACATTTGTGTACTTGATGAGATTACCAGATGAAGTACCGCCATTTGCACATGAAA 423 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 478 CGACCACATTTGTGTACTTGATGAGATTACCAGATGAAGTACCGCCATTTGCACATGAAA 537 Query 424 GGAATCATATCATTTGGGACTTCTATTTGTGGTATGAACAAGGGCGAGAAAAGAAAATTT 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 GGAATCATATCATTTGGGACTTCTATTTGTGGTATGAACAAGGGCGAGAAAAGAAAATTT 597 Query 484 GTGAACCGTGTTATTCCGGGAAGAGTCGTTTCTACCGTCCAGGATCTGCTAATGAATGGT 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 GTGAACCGTGTTATTCCGGGAAGAGTCGTTTCTACCGTCCAGGATCTGCTAATGAATGGT 657 Query 544 TAGAAAAAGGATGGGTATTTAAACGCGTAGAGAATCACTCCATGATTGATGGGGACAGAT 603 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 TGGAAAAAGGATGGGTATTTAAACGCGTAGAGAATCACTCCATGATTGATGGGGACAGAT 717 Query 604 TGTTAGAGGATTTGATATGGGATGAAGACAACTGGTGCAGTTTATGTATTGTTGAGCCAT 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 TGTTAGAGGATTTGATATGGGATGAAGACAACTGGTGCAGTTTATGTATTGTTGAGCCAT 777 Query 664 TATGGATCCATATATTTGATGATGATGATTGTTTGTTTGATTATGACTATCATTTGAAGA 723 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 TATGGATCCATATACTTGATGATGATGATTGTTTGTTTGATTATGACTATCATTTGAAGA 837 Query 724 GAAGGCGTACATGGAGTGACTCAAGCTCTGAGGACAGTGATATTGATTATTGTAAACATA 783 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 GAAGACGTACATGGAGTGACTCAAGCTCTGAGGACAGTGATATTGATTATTGTAAACATA 897 Query 784 CTGTTATGCAAGGGATTCGTATGAACCCCACTTTGTATAAATTTATTAATGAATAAAGCA 843 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 CTGTTATGCAAGGGATTCGTATAAACCCCACTTTGTATAAATTTATTAATGAATAAAGCA 957 Query 844 AGTGTTATAGAATTGTTGTTTTATTGCAGATGAATAATGACGACCACTTTTGGGAATATT 903 ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 AGTGTTATAGAATTGTTGTTTCATTACAGATGAATAATGACGACCACTTTTGGGAATATT 1017 Query 904 TTGACAGTACTCTGGGAGATGCTTCCGGACGAGTGGGCGAATCATCCGGGAGTATGGTGG 963 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 TTGACAGTACTCTGGGAGATGCTTCCGGACGAGTGGGCGAATCATCCGGGAGTATGGTGG 1077 Query 964 AAGATTATGGATACGATACCACTGGACCAACAATGCAAGAATGCGATGTTACAGCTAATA 1023 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 AAGATTATGGATACGATACCACTGGACCAACAATGCAAGAATGCGATGTTACAGCTAATA 1137 Query 1024 GGGCGTTGGAGCAAGAATTACAAACAATGGTCGACCGGTTCGTTACCCGCCTTGAAAAAG 1083 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1138 GGGCGTTGGAGCAAGAATTACAAACAATGGTCGACCGGTTCGTTACCCGCCTTGAAAAAG 1197 Query 1084 AAGATTGGCAAGACAGCGGATACTATGTGTCAGATGTCTTTGCCTGCGAATCAATTGGAC 1143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 AAGATTGGCAAGACAGCGGATACTATGTGTCAGATGTCTTTGCCTGCGAATCAATTGGAC 1257 Query 1144 GAGCTCAAGGATTGGCTAAGCGAATGGCTGAACGAGCGGGAAATTTCCGAAGAGGACTTA 1203 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1258 GAGCTCAGGGATTGGCTAAGCGAATGGCTGAACGAGCGGGAAATTTCCGAAGAGGACTTA 1317 Query 1204 TCCTCATATCTATTCACAGCGATCAAGATGGCGGTGCCCATATCCACACCATCCACAGCT 1263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1318 TCCTCATATCTATTCACAGCGATCAAGATGGCGGTGCCCATATCCACACCATCCACAGCT 1377 Query 1264 GCGCCTACGCAAACAGGTCGTGCAGGTGCTACTTCAAAGCGTTCCCCGAAGCGCAAGAGG 1323 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1378 GCGCCTACGCAAACAGGGCGTGCAGGTGCTACTTCAAAGCGTTCCCCGAAGCGCAAGAGG 1437 Query 1324 ACGCTAGACGACTTCTTCGAAAGCCTCCACCCATCGAAACGTTCAAGCGAAGCGATTGGG 1383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1438 ACGCTAGACGACTTCTTCGAAAGCCTCCACCCATCGAAACGTTCAAGCGAAGCGATTGGG 1497 Query 1384 AAAATATCACAAAGTATTTTTGTACGAAAGGGAGACGAGCAACGTTCGCTAAAATCAACG 1443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1498 AAAATATCACAAAGTATTTTTGTACGAAAGGGAGACGAGCAACGTTCGCTAAAATCAACG 1557 Query 1444 GTGCCATACAAAGACTTCCTCTTGAAATTACAAATCTATCCGACATTATCCTATCAGGCC 1503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1558 GTGCCATACAAAGACTTCCTCTTGAAATTACAAATCTATCCGACATTATCCTATCAGGCC 1617 Query 1504 AAGTTGAAGGAGGATCACACTCAGGCCTGGAGAACTGCCACGACCCGCTTGACAATAACA 1563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1618 AAGTTGAAGGAGGATCACACTCAGGCCTGGAGAACTGCCACGACCCGCTTGACAATAACG 1677 Query 1564 ATGAACGAAAACGAGGAATTGAACCGAAAGGTGATGGAGGTACTCGAAGTCGCAAAAGAA 1623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1678 ATGAACGAAAACGAGGAATTGAACCGAAAGGTGATGGAGGTACTCGAAGTCGCAAAAGAA 1737 Query 1624 GAGGTGTTGGCAACGCAGGAGGAGATGGAGGAATCAGAGGGGACACAGGAGTAATTCTTG 1683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1738 GAGGTGTTGGCAACGCAGGAGGAGATGGAGGAATCAGAGGGGACACAGGAGTAATTCTTG 1797 Query 1684 ATATAATTAAGAGGTATGCTGTTTGTCCATTATCTGAGATAGTATATACTCGCGAGTACT 1743 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1798 ATTTAATTAAGAGGTATGCTGTTTGTCCATTATCTGAGATAGTATATACTCGCGAGTACT 1857 Query 1744 TGGAAAATCCCCTTGCAGTTAAAAGGTTAGATGATAGGGATGTAAAGAACGCTATAGATT 1803 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1858 TGGAAAATCCCCTTGCAGTTAAAAGGTTAGATGATAGGGATGTAAAGAACGCTATAGATT 1917 Query 1804 GCCATGCTGCTATTATTAATACTTGGAATAGAGAGGATTATGTTAAGTTTTATGAGGACC 1863 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1918 GCCATGCTGCTATTATTAATACTTGGAATAGAGAGGATTATGTTAAGTTTTATGAGGACC 1977 Query 1864 CAAACACTGTTAAAATTTGGAGTGCACGTAATATTGACTCGGTGGAGTTATATTATTTAA 1923 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1978 CAAACACTGTTAAAATTTGGAGTGCACGTAATATTGACTCGGTGGAGTTATATTATTTAA 2037 Query 1924 CTGATAATGAATCTAGAGATATTATTAATAAACTGCTTGATTATCAATGTGGGTTAGCTA 1983 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2038 CTGATAATGAATCTAGAGATATTATTAATAAACTGCTTGATTATCAATGTGGGTTAGCTA 2097 Query 1984 AGAAACAGTTTGTAACGGATTTGATTAATGTAACAGACATGAATATTCCAAAGTGTAATT 2043 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2098 AGAAACAGTTTGTAACGGATTTGATTAATGTAACAGACATGAATATTCCCAAGTGTAATT 2157 Query 2044 GCTTTCTAATTGTTAGCCCTCCAAGTGCTGGCAAGAACTTTCTATGCGATGCTATTAAAG 2103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2158 GCTTTCTAATTGTTAGCCCTCCAAGTGCTGGCAAGAACTTTCTATGCGATGCTATTAAAG 2217 Query 2104 ATTACTATATTAATGTTGGACAAATGCAGAACCCTAATAAATATAATACCTTCGCGTATC 2163 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2218 ATTACTATATTAATGTTGGACAAATGCAGAACCCTAATAAATATAATACCTTCGCGTATC 2277 Query 2164 AGGATTGTCACAATAGACGACTTCTTATTTGGAATGAACCAAACTACGAACCTAGGGAAA 2223 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2278 AGGATTGTCACAATAGACGACTTCTTATTTGGAATGAACCAAACTACGAACCTAGGGAAA 2337 Query 2224 CGGAGAATTTGAAGATGTTATTTGGAGGGGATAACTTGTCTGCTAATGTTAAGTGTAAAC 2283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2338 CGGAGAATTTGAAGATGTTATTTGGAGGGGATAACTTGTCTGCTAATGTTAAGTGTAAAC 2397 Query 2284 CTCAAGCTAATGTAAAGCGTACTCCAGTAATATGTATGAGTAATGTTGTACCCAGATTTG 2343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2398 CTCAAGCTAATGTAAAGCGTACTCCAGTAATATGTATGAGTAATGTTGTACCCAGATTTG 2457 Query 2344 CTAATCATGAAGCATTTGCTGACAGAGTTATTACATATTATTGGAATGCTGCTCCTTTCT 2403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2458 CTAATCATGAAGCATTTGCTGACAGAGTTATTACATATTATTGGAATGCTGCTCCTTTCT 2517 Query 2404 TAAAAGAGGTAATAAAAAAGCCACGACCTGATTCTGTAATGAATTTATTATATGAAATAT 2463 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2518 TAAAAGAGGTAATAAAAAAACCACGACCTGATTCTGTAATGAATTTATTATATGAAATAT 2577 Query 2464 ACAATTCATAATTATGGTTTTACAGTTTTAATCATTTGCATCCTGCCATATACATTAGGA 2523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2578 ACAATTCATAATTATGGTTTTACAGTTTTAATCATTTGCATCCTGCCATATACATTAGGA 2637 Query 2524 TTATCATATACTTTAGCAATAGGACGACCATCACTTGCAAAATATTGAAGTTGAGATTTG 2583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2638 TTATCATATACTTTAGCAATAGGACGACCATCACTTGCAAAATATTGAAGTTGAGATTTG 2697 Query 2584 GTATTGGCCGAGTAACATCCGCCCTTAATGTATGTGTAAGGGTCGACACTCTCTGTTGTT 2643 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2698 GTATTGGCCGAGTAACATCCGCCCTTAATGTATGTGTAAGGGTCGACACTCTCTGTTGTT 2757 Query 2644 AGTACACAATCAACTTCGAAGTAGCCTTGTGCGTCTAACCAGGAATTAGCTTGAGTAGTT 2703 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2758 AGTACACAATCAACTTCGAAGTAGCCTTGTGCGTCTAGCCAGGAATTAGCTTGAGTAGTT 2817 Query 2704 TCATCAATGGTAGTTAACTTGGGAACAGCTCTTATGCCAACATTTATAGATGGCATTTGA 2763 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2818 TCATCAATGGTAGTTAACTTGGGAACAGCTCTTATGCCAACATTTATAGATGGCATTTGA 2877 Query 2764 GTGTCATGTACTGTCTCAACATTTACCTCCTCGAATATACCACCTTGTTCAATAGGGACT 2823 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2878 GTGTCATGTACTGTCTCAACATTTACCTCCTCGAATATACCACCTTGTTCAATAGGGACT 2937 Query 2824 CGAAGATAGTTCTGTTCCTCATCGAAGAATGTTGTATCTGCGTGGGGACCCTGTATATAT 2883 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2938 CGAAGATAGTTCTGTTCCTCATC-AAGAATGTTGTATCTGCATGGGGACCCTGTATATAT 2996 Query 2884 TTGCGAGGTGCATTACGTACTTGTGTTGGTGCTGTAGCTTGTGAGGAATCGGTTGTTTTC 2943 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2997 TTGCGAGGTGCATTACGTACTTGTGTTGGTGCTGTAGCTTGTGAGGAATCGGTTGTTTTC 3056 Query 2944 GCTGCCGTCACTTCATTCTTTGTTCCCGCAGGATAACTACCATTATAATTTTGAGTAATC 3003 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3057 GCTGCCGTCACTTCATTCTTTGTTCCCGCAGGATAACTACCATTATAATTTTGAGTAATC 3116 Query 3004 AAGTTGTTTGGTACTGGTGCAAACTGTGGTACCAGAGGTGCGTAGCTAAAATCGTAATCC 3063 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3117 AAGTTGTTTGGTACTGGTGCAAACTGTGGTACCAGAGGTGCGTAGCTAAAATCGTAATCC 3176 Query 3064 ATAGCAACTACATCTGTGTTGATACATGCACTTGCATCGAATTCTTCTATAAAGTTTTTG 3123 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3177 ATAGCAACTACATCTGTGTT-ATACATGCACTTGCATCGAATTCTTCTATAAAGTTTTTG 3235 Query 3124 TATGGTGGAAACCCCGCCAATATCTTAGTACCAGTAGTAGCCCTTGCATCATTAGTGTAA 3183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3236 TATGGTGGAAACCCCGCCAATATCTTAGTACCAGTAGTAGCCCTTGCATCATTAGTGTAA 3295 Query 3184 ATGGTTAAATAGTCCTGTAGATATATCTCTGCGCCAGTTGCATCTGCTGGTGGTTTCTTA 3243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3296 ATGGTTAAATAGTCCTGTAGATATATCTCTGCGCCAGTTGCATCTGCTGGTGGTTTCTTA 3355 Query 3244 GCAAAGTCTGCACTGTCATTATCGTAACCATACATAGCAATCTTGAGACCATCTCGATAT 3303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3356 GCAAAGTCTGCACTGTCATTATCGTAACCATACATAGCAATCTTGAGACCATCTCGATAT 3415 Query 3304 TGGTAGGATGTCAAGGTTGCGAATCCAGTAGGTTGCATGGGTTCAGTATCAGAATATGTA 3363 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3416 TGGTAGGATGTCAATGTTGCGAATCCCGTAGGTTGCATGGGTTCAGTATCAGAATATGTA 3475 Query 3364 TACTTTCTGTTTGTAGAGCATATAAAAGGAATACTCCTAATCCCCTTAGCCACTTGTAAG 3423 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | Sbjct 3476 TACTTTCTGTTTGTAGAACATATAAAAGGAATACTTCTAATACCCTTAGCAACTTGCAGA 3535 Query 3424 AATTTATTCTGATTTAGTGTAGCATTAGCTGTTTGAGTATCTCCAGTTTGGAATGCAACT 3483 ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3536 AATTTGTTTTGATTCAGTGTAGCATTAGCCGTTTGAGTATCTCCAGTTTGGAATGCAACT 3595 Query 3484 CTTGTGTTCCACGTCCTAATACGTACTGACGCGGACTTAGCAAACGTACCAGGATAGTTC 3543 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3596 CTTGTGTTCCACGTCCTAATACGTACTGAAGCGGACTTAGCAAACGTACCAGGATAGTTC 3655 Query 3544 TTCATTCTGTTATATTCTGCTGGACTCATATAGAAGAATAAGTATTCCCATGGAATTGAT 3603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3656 TTCATTCTGTTATATTCTGCTGGACTCATATAGAAGAATAAGTATTCCCATGGAATTGAT 3715 Query 3604 GCCATTCCTGTCGTTAGCGCCCATCTTGCTGGTCTTTCTCCGCTGGCCGCTTCAGCCAAT 3663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| Sbjct 3716 GCCATTCCTGTCGTTAGCGCCCATCTTGCTGGTCTTTCGCCGCTGGCTGCCTCGGCCAAG 3775 Query 3664 ATAACGTTTGCATTTGCTGAAGTCAGAAACCTCCATTTCTTTCTATAAGTTTGTTGAAAC 3723 || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 3776 ATGACGTTGGCATTTGCTGAAGTTAGGAATCTCCATTTCTTTCGGTATGTTTGTTGAAAC 3835 Query 3724 TTCTCAACATGAAGTCCAATTGGACGTAATATAGCTGTAGCTCCGCCTTCCCCACTACCT 3783 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3836 TTCTCAACATGAAGTCCAATTGGACGTAATATAGCTGTAGCTCCGCCTTCCCCACTACCT 3895 Query 3784 CCTCTAACCATGCCATCTAAGTTGCCTCCAGTTCCAGGGAGACTCGTCCCTGATTTGGAT 3843 ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||| Sbjct 3896 CCTCTAACCATACCATCCAAATTGCCTCCTGTTCCTGGTAAACTTGTCCCAGACTTGGAT 3955 Query 3844 ACCTTACTCGGCGGTCCGCCACCA 3867 ||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3956 ACCTTACTCGGCGGTCCGCTACCA 3979 Score = 3032 bits (3362), Expect = 0.0 Identities = 1729/1761 (98%), Gaps = 0/1761 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3406 CCCTTAGCCACTTGTAAGAATTTATTCTGATTTAGTGTAGCATTAGCTGTTTGAGTATCT 3465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4002 CCCTTAGCCACTTGTAAGAATTTATTCTGATTTAGTGTAGCATTAGCTGTTTGAGTATCT 4061 Query 3466 CCAGTTTGGAATGCAACTCTTGTGTTCCACGTCCTAATACGTACTGACGCGGACTTAGCA 3525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4062 CCAGTTTGGAATGCAACTCTTGTGTTCCACGTCCTAATACGTACTGAAGCGGACTTAGCA 4121 Query 3526 AACGTACCAGGATAGTTCTTCATTCTGTTATATTCTGCTGGACTCATATAGAAGAATAAG 3585 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4122 AACGTACCAGGATAGTTCTTCATTCTGTTATATTCTGCTGGACTCATATAGAAGAATAAG 4181 Query 3586 TATTCCCATGGAATTGATGCCATTCCTGTCGTTAGCGCCCATCTTGCTGGTCTTTCTCCG 3645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4182 TATTCCCATGGAATTGATGCCATTCCTGTCGTTAGCGCCCATCTTGCTGGTCTTTCTCCG 4241 Query 3646 CTGGCCGCTTCAGCCAATATAACGTTTGCATTTGCTGAAGTCAGAAACCTCCATTTCTTT 3705 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4242 CTGGCCGCTTCAGCCAATATGACGTTTGCATTTGCTGAAGTCAGAAACCTCCATTTCTTT 4301 Query 3706 CTATAAGTTTGTTGAAACTTCTCAACATGAAGTCCAATTGGACGTAATATAGCTGTAGCT 3765 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4302 CTATAAGTTTGTTGAAACTTCTCAACATGAAGTCCAATTGGACGTAATATAGCTGTAGCT 4361 Query 3766 CCGCCTTCCCCACTACCTCCTCTAACCATGCCATCTAAGTTGCCTCCAGTTCCAGGGAGA 3825 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || | | Sbjct 4362 CCGCCTTCCCCACTACCTCCTCTAACCATACCATCCAAATTGCCTCCTGTTCCTGGTAAA 4421 Query 3826 CTCGTCCCTGATTTGGATACCTTACTCGGCGGTCCGCCACCACCACTACCTCGCTTCGAT 3885 || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| Sbjct 4422 CTTGTCCCAGACTTGGATACCTTACTCGGCGGTCCGCTACCATCACTACCTCGCTTGGAT 4481 Query 3886 CCACCGCTAGAACTTGATACTTGAGACATTTCTATGTCCGCCATGTTTGGTTGTGGTGCG 3945 |||| ||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4482 CCACTACTAGAGCTAGATACTCGAGCCATTTCTACGTCCGCCATGTTTGGTTGTGGTGCG 4541 Query 3946 TTACTTGGTCCGGCGTCTCTTAAATCTTGTCTATCTCTTACTTGTTGTAAAAAATCGTCT 4005 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4542 TTACTTGGTCCGGCGTCTCTTAAATCTTGTCTATCTCTTACTTGTTGTAAAAAATCGTCT 4601 Query 4006 ACTCCGTCTTCTGATTGCTGACTGGGTTGTTCCGCCTCCTGGGGTGACCCTAAAAGATCC 4065 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4602 ACTCCGTCTTCTGATTGCTGACTGGGTTGTTCCGCCTCCTGGGGTGACCCTAAAAGATCC 4661 Query 4066 AAATCAAAGTTATCAATCGCATCAGCCTGAGTTAAAGGTAGGTCGTCATCCCCAGGAGGA 4125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4662 AAATCAAAGTTATCAATCGCATCAGCCTGAGTTAAAGGTAGGTCGTCATCCCCAGGAGGA 4721 Query 4126 TCAAAGTATTCCCCACGTCTTACTCTAGCTAGGTTCCATTGTTCCATAGCATAACGTCTT 4185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4722 TCAAAGTATTCCCCACGTCTTACTCTAGCTAGGTTCCATTGTTCCATAGCATAACGTCTT 4781 Query 4186 TGTCCCTCATTCATACTATCCCAATTAGGACGATCCTGAGGACTCGGACCCAACGGTCTA 4245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4782 TGTCCCTCATTCATACTATCCCAATTAGGACGATCCTGAGGATTCGGACCCAACGGTCTA 4841 Query 4246 ACTCTAGGCATTGCTTACCGTAGTATACTTTTCCGCTTAAATGTTCGACTGCGTGCTTAA 4305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4842 ACTCTAGGCATTGCTTACCGTAGTATACTTTTCCGCTTAAATGTTCGACTGCGTGCTTAA 4901 Query 4306 CTCCCAGCCCGATTCCTCCCACTGCCGCGTGTACCCTAGATATAGGATCCTGACCCTGGA 4365 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4902 CTCCCAGCCCGATTCCTCCCACTGCCGCGTGTATCCTAGATATAGGATCCTGACCCTGGA 4961 Query 4366 TTGCCTCGTGTGCGAATTGTGAGATTGCTTCTCTATCCGCTGACAGCACGTCGCTATTGC 4425 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4962 TTGCCTCGTGTGCGAATTGTGAGATTGCTTCTCTATCCGCTGACAGCACGTCGCTATCGC 5021 Query 4426 TCTTAGCTTGTTGATAATGTAAGTCGTGACCCTGCGCAATAAGGTCAGCTCTGTTGGTCG 4485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5022 TCTTAGCTTGTTGATAATGTAAGTCGTGACCCTGCGCAATAAGGTCAGCTCTGTTGGTCG 5081 Query 4486 CGGGACGTATTGAATTTCCAGGTCCGATATTGTTCGAAAACGGTAAAACTAGTCCGTTCC 4545 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5082 CGGGACGTATTGGATTTCCAGGTCCGATATTGTTCGAAAACGGTAAAACTAGTCCGTTCC 5141 Query 4546 GTGGTGGTTCTCCCCTTGCTCGATTGGCAGAATCTCTTCTCGCCTGTGCTTCCCTTTGTT 4605 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5142 GTGGTGGTTCTCCCCTTGCTAGATTGGCAGAATCTCTTCTCGCCTGTGCTTCCCTTTGTT 5201 Query 4606 CTTGCTTCTTCGCCTTGTTTAGTCCCCTGCGAGGATTTACAAGTCTCCAGTGTTCTGGGT 4665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 5202 CTTGCTTCTTCGCCTTGTTTAGTCCCCTGCGAGGATTTACTAGTCTCCAGTGTTCTGGAT 5261 Query 4666 ATTTAGCCTTAGTGTCCTTATTCCAAGGATCTCCGTACGGTTTGATCTTCTCCTGTCGCT 4725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5262 ATTTAGCCTTAGTGTCCTTATTCCAAGGATCTCCGTACGGTTTGATCTTCTCCTGTCGCT 5321 Query 4726 CTTTCAACCCCAAACGTCTCAATTCCCAAGGAACGGCTGCGTAGTAATCGTCTCGATTAC 4785 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5322 CTTTCAACCCCAAACGTCTCAATTCCCAAGGAACGGCTGCGTAGTAATCGTCTCGATTAC 5381 Query 4786 CAAATATTGCTCTCGATAAAGGGTTGTTAGGGTCAGCTGCTGCTCTTCCCAATTGCCCTT 4845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5382 CAAATATTGCTCTCGATAAAGGGTTGTTAGGGTCAGCTGCTGCTCTTCCCAATTGCCCTT 5441 Query 4846 CGAATATTGGTTGATATTGGCTACCTGCTCCAATAACCGCACCCCCAACACGTGGTGTAT 4905 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5442 CGAATATTGGTTGATATTGGCTACCTGCTCCAATAACCGCACCCCCAACACGTGGTGTAT 5501 Query 4906 TAGGTACTCTCAATTTACTGTCACTTCCGGCACTGGAGATACTACTATTAGACGAGTTAA 4965 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5502 TAGGTACTCTCAATTTACTGTCACTGCCGGCACTGGAGATACTACTATTAGACGAGTTAA 5561 Query 4966 TAGGAATAGATACGTATCCACCCCTACGTCGCACCCCTGTACTTGTACTGGGTTGATTAA 5025 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5562 TAGGAATAGATACGTATCCACCCCTACGTCGCACCCCTGTACTTGTACTGGGTTGATTAA 5621 Query 5026 ACACACTCTCTTCACTACTGCTGGGGGTAATAGTGCTCAGCTCGATGTACTCGGACATAC 5085 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5622 ACACACTCTCTTCACTACTGCTGGGGGTAATAGTGCTCAGCTCGATGTACTCGGACATAC 5681 Query 5086 TGACTGGAAATAACCTGCGCATACATATTTATATCCATGCTGATCCCCCTTACTTGGTGC 5145 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 5682 TGACTGGAAATAACCTGCGCATACATATTTATATCCATGTTGATCCCCCTTACTTGGTGC 5741 Query 5146 TTGCCCATAAGCCCTTGGCTT 5166 |||||||||||||| |||||| Sbjct 5742 TTGCCCATAAGCCCCTGGCTT 5762 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 16419115774635