Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Acanthamoeba_20rhysodes_20[genbank_20GCA_5F000826385.1_202015-01-07] 62,836 sequences; 75,821,316 total letters Query= NC_001422.1 Length=5386 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq28339 4417 0.0 seq20259 114 4e-22 seq5206 114 4e-22 >seq28339 Length=5449 Score = 4417 bits (4898), Expect = 0.0 Identities = 2454/2457 (99%), Gaps = 0/2457 (0%) Strand=Plus/Minus Query 950 GGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAAT 1009 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5449 GGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAAT 5390 Query 1010 ATTCAAACTGGCGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGT 1069 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5389 ATTCAAACTGGCGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGT 5330 Query 1070 CAGATTGGTCGTCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAG 1129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5329 CAGATTGGTCGTCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAG 5270 Query 1130 ATGGACGCCGTTGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCT 1189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5269 ATGGACGCCGTTGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCT 5210 Query 1190 ACTGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATT 1249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5209 ACTGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATT 5150 Query 1250 AAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGGTTAT 1309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5149 AAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGGTTAT 5090 Query 1310 ATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAAGCAT 1369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5089 ATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAAGCAT 5030 Query 1370 TTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCCTGAC 1429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5029 TTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCCTGAC 4970 Query 1430 CGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCGTTGC 1489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4969 CGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCGTTGC 4910 Query 1490 TGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAA 1549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4909 TGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAA 4850 Query 1550 ATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTG 1609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4849 ATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTG 4790 Query 1610 CATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTT 1669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4789 CATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTT 4730 Query 1670 GGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTC 1729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4729 GGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTC 4670 Query 1730 TGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGT 1789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4669 TGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGT 4610 Query 1790 CGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACT 1849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4609 CGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACT 4550 Query 1850 ATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTT 1909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4549 ATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTT 4490 Query 1910 AACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAAC 1969 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4489 AACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAAC 4430 Query 1970 TTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAG 2029 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4429 TTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAG 4370 Query 2030 TTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTAT 2089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4369 TTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTAT 4310 Query 2090 CACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGC 2149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4309 CACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGC 4250 Query 2150 GTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGG 2209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4249 GTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGG 4190 Query 2210 AATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGATTCA 2269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4189 AATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGATTCA 4130 Query 2270 ATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTT 2329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4129 ATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTT 4070 Query 2330 TAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTT 2389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4069 TAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTT 4010 Query 2390 TAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACtttttttCTGATAAGCTGG 2449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4009 TAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTTTTTTCTGATAAGCTGG 3950 Query 2450 TTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCTACAT 2509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3949 TTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCTACAT 3890 Query 2510 CGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTTCATT 2569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3889 CGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTTCATT 3830 Query 2570 GCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGGTGCTGATA 2629 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3829 GCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGGTGCTGATA 3770 Query 2630 TTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTCTTCTTCGG 2689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3769 TTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTCTTCTTCGG 3710 Query 2690 TTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATGGTG 2749 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3709 TTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTCGCCATGATGGTG 3650 Query 2750 GTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATA 2809 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3649 GTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATA 3590 Query 2810 ACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGG 2869 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3589 ATGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGG 3530 Query 2870 TTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATT 2929 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3529 TTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATT 3470 Query 2930 TATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAA 2989 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3469 TATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAA 3410 Query 2990 ATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTAC 3049 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3409 ATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTAC 3350 Query 3050 CGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAA 3109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3349 CGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAA 3290 Query 3110 TGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGG 3169 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3289 TGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGG 3230 Query 3170 TAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCT 3229 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3229 TAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCT 3170 Query 3230 TGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTA 3289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3169 TGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTA 3110 Query 3290 TCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTC 3349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3109 TCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTC 3050 Query 3350 TGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 3406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3049 TGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 2993 Score = 3458 bits (3834), Expect = 0.0 Identities = 1917/1917 (100%), Gaps = 0/1917 (0%) Strand=Plus/Minus Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2929 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 2870 Query 3530 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 3589 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2869 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 2810 Query 3590 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 3649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2809 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 2750 Query 3650 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2749 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 2690 Query 3710 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3769 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2689 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 2630 Query 3770 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3829 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2629 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 2570 Query 3830 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3889 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2569 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 2510 Query 3890 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2509 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 2450 Query 3950 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 4009 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2449 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 2390 Query 4010 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 4069 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2389 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 2330 Query 4070 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 4129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2329 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 2270 Query 4130 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 4189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2269 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 2210 Query 4190 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 4249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2209 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 2150 Query 4250 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 4309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2149 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 2090 Query 4310 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 4369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2089 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 2030 Query 4370 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 4429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2029 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 1970 Query 4430 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 4489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1969 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 1910 Query 4490 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 4549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1909 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 1850 Query 4550 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 4609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1849 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 1790 Query 4610 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 4669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1789 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 1730 Query 4670 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 4729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1729 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 1670 Query 4730 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 4789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1669 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 1610 Query 4790 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 4849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1609 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 1550 Query 4850 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 4909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1549 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 1490 Query 4910 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 4969 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1489 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 1430 Query 4970 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 5029 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1429 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 1370 Query 5030 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 5089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1369 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 1310 Query 5090 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 5149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1309 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 1250 Query 5150 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 5209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1249 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 1190 Query 5210 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 5269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1189 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 1130 Query 5270 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGAC 5329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1129 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGAC 1070 Query 5330 AAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 5386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1069 AAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 1013 Score = 1817 bits (2014), Expect = 0.0 Identities = 1010/1012 (99%), Gaps = 0/1012 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1012 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 953 Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 952 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 893 Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 892 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 833 Query 181 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 832 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 773 Query 241 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 772 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 713 Query 301 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 712 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 653 Query 361 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 652 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 593 Query 421 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 592 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 533 Query 481 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 532 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 473 Query 541 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 472 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCT 413 Query 601 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 412 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 353 Query 661 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 352 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 293 Query 721 TCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 292 TCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAA 233 Query 781 ACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCGGAAGGAG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 232 ACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAG 173 Query 841 TGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 172 TGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTT 113 Query 901 GCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 112 GCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATT 53 Query 961 TTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATT 1012 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 52 TTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATT 1 >seq20259 Length=66 Score = 114 bits (126), Expect = 4e-22 Identities = 65/66 (98%), Gaps = 0/66 (0%) Strand=Plus/Plus Query 947 GGTGGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCT 1006 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGGGGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCT 60 Query 1007 AATATT 1012 |||||| Sbjct 61 AATATT 66 >seq5206 Length=64 Score = 114 bits (126), Expect = 4e-22 Identities = 63/63 (100%), Gaps = 0/63 (0%) Strand=Plus/Minus Query 950 GGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAAT 1009 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 64 GGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAAT 5 Query 1010 ATT 1012 ||| Sbjct 4 ATT 2 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 17111431759740