Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Phaeomoniella_20chlamydospora_20[genbank_20GCA_5F001006345.1_202015-
05-13] 702 sequences; 27,513,354 total letters
Query= NC_001422.1
Length=5386
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq114 3992 0.0
>seq114
Length=3343
Score = 3992 bits (4426), Expect = 0.0
Identities = 2218/2221 (99%), Gaps = 0/2221 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1186 CTCTACTGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTG 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCTACTGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTG 60
Query 1246 GATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGG 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGG 120
Query 1306 TTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAA 1365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAA 180
Query 1366 GCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCC 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCC 240
Query 1426 TGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCG 1485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCG 300
Query 1486 TTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCG 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCG 360
Query 1546 CCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAA 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAA 420
Query 1606 TTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTC 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTC 480
Query 1666 ATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAA 1725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAA 540
Query 1726 TCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTC 1785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTC 600
Query 1786 TGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGG 1845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGG 660
Query 1846 CACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTA 1905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTA 720
Query 1906 CCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGG 1965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGG 780
Query 1966 CAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAA 2025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAA 840
Query 2026 GAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGC 2085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGC 900
Query 2086 TTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGA 2145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGA 960
Query 2146 ACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCA 2205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCA 1020
Query 2206 GTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGA 2265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGA 1080
Query 2266 TTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAA 2325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAA 1140
Query 2326 ATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGG 2385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 ATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGG 1200
Query 2386 AGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACtttttttCTGATAAG 2445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 AGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTTTTTTCTGATAAG 1260
Query 2446 CTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCT 2505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCT 1320
Query 2506 ACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTT 2565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 ACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTT 1380
Query 2566 CATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGGTGCT 2625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 CATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGGTGCT 1440
Query 2626 GATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTCTTCT 2685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTCTTCT 1500
Query 2686 TCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGAT 2745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1501 TCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTCGCCATGAT 1560
Query 2746 GGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGC 2805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGC 1620
Query 2806 AATAACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGA 2865
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 AATAATGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGA 1680
Query 2866 TTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGT 2925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGT 1740
Query 2926 GATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGT 2985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGT 1800
Query 2986 CTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTG 3045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 CTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTG 1860
Query 3046 CTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCT 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 CTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCT 1920
Query 3106 CTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAG 3165
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAG 1980
Query 3166 CTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGT 3225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 CTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGT 2040
Query 3226 TGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTG 3285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 TGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTG 2100
Query 3286 ATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTT 3345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 ATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTT 2160
Query 3346 CCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAAC 3405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 CCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAAC 2220
Query 3406 T 3406
|
Sbjct 2221 T 2221
Score = 1911 bits (2118), Expect = 0.0
Identities = 1059/1059 (100%), Gaps = 0/1059 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 2344
Query 3530 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2345 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 2404
Query 3590 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 3649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2405 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 2464
Query 3650 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2465 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 2524
Query 3710 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2525 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 2584
Query 3770 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2585 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 2644
Query 3830 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2645 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 2704
Query 3890 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2705 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 2764
Query 3950 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 4009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2765 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 2824
Query 4010 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 4069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2825 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 2884
Query 4070 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 4129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2885 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 2944
Query 4130 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 4189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2945 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 3004
Query 4190 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 4249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3005 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 3064
Query 4250 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 4309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3065 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 3124
Query 4310 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 4369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3125 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 3184
Query 4370 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 4429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3185 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 3244
Query 4430 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 4489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3245 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 3304
Query 4490 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCG 4528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3305 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCG 3343
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 17123068525930
Made in 2017 by Kirill Kryukov This page is placed in public domain using CC0 |