Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Candida_20parapsilosis_20[genbank_20GCA_5F000982675.1_202014-10-24] 39 sequences; 13,025,060 total letters Query= NC_001422.1 Length=5386 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq37 3741 0.0 >seq37 Length=5821 Score = 3741 bits (4148), Expect = 0.0 Identities = 2076/2077 (99%), Gaps = 0/2077 (0%) Strand=Plus/Plus Query 629 CGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACATTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGG 688 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3745 CGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACATTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGG 3804 Query 689 CGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCGTCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATT 748 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3805 CGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCGTCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATT 3864 Query 749 GTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGA 808 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3865 GTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGA 3924 Query 809 AAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCGGAAGGAGTGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGT 868 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3925 AAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAGTGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGT 3984 Query 869 TCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGC 928 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3985 TCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGC 4044 Query 929 GCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACT 988 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4045 GCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACT 4104 Query 989 TGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCC 1048 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4105 TGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCC 4164 Query 1049 CATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCGTCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTT 1108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4165 CATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCGTCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTT 4224 Query 1109 ATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGT 1168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4225 ATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGT 4284 Query 1169 CGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCAC 1228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4285 CGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCAC 4344 Query 1229 GTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCG 1288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4345 GTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCG 4404 Query 1289 ACTGTTAACACTACTGGTTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGAT 1348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4405 ACTGTTAACACTACTGGTTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGAT 4464 Query 1349 ACCAATAAAATCCCTAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTT 1408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4465 ACCAATAAAATCCCTAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTT 4524 Query 1409 AAAGCGCCGTGGATGCCTGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGAT 1468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4525 AAAGCGCCGTGGATGCCTGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGAT 4584 Query 1469 GCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCT 1528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4585 GCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCT 4644 Query 1529 GAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTG 1588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4645 GAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTG 4704 Query 1589 CAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTAC 1648 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4705 CAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTAC 4764 Query 1649 CATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTA 1708 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4765 CATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTA 4824 Query 1709 CTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACG 1768 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4825 CTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACG 4884 Query 1769 TCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTC 1828 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4885 TCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTC 4944 Query 1829 TTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCG 1888 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4945 TTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCG 5004 Query 1889 ACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGC 1948 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5005 ACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGC 5064 Query 1949 GACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGT 2008 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5065 GACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGT 5124 Query 2009 TCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCT 2068 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5125 TCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCT 5184 Query 2069 TCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCT 2128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5185 TCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCT 5244 Query 2129 TCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAG 2188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5245 TCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAG 5304 Query 2189 TCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAAT 2248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5305 TCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAAT 5364 Query 2249 CTGCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATA 2308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5365 CTGCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATA 5424 Query 2309 ACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGG 2368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5425 ACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGG 5484 Query 2369 TAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAA 2428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5485 TAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAA 5544 Query 2429 ACtttttttCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTT 2488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5545 ACTTTTTTTCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTT 5604 Query 2489 TACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTG 2548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5605 TACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTG 5664 Query 2549 GTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGG 2608 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5665 GTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGG 5724 Query 2609 TTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGG 2668 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5725 TTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGG 5784 Query 2669 TTCGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCC 2705 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5785 TTCGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCC 5821 Score = 3301 bits (3660), Expect = 0.0 Identities = 1830/1830 (100%), Gaps = 0/1830 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 763 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 822 Query 3530 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 3589 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 823 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 882 Query 3590 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 3649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 883 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 942 Query 3650 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 943 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 1002 Query 3710 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3769 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1003 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 1062 Query 3770 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3829 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1063 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 1122 Query 3830 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3889 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1123 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 1182 Query 3890 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1183 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 1242 Query 3950 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 4009 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1243 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 1302 Query 4010 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 4069 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1303 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 1362 Query 4070 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 4129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1363 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 1422 Query 4130 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 4189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1423 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 1482 Query 4190 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 4249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1483 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 1542 Query 4250 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 4309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1543 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 1602 Query 4310 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 4369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1603 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 1662 Query 4370 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 4429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1663 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 1722 Query 4430 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 4489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1723 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 1782 Query 4490 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 4549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1783 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 1842 Query 4550 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 4609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1843 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 1902 Query 4610 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 4669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1903 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 1962 Query 4670 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 4729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1963 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 2022 Query 4730 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 4789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2023 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 2082 Query 4790 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 4849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2083 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 2142 Query 4850 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 4909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2143 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 2202 Query 4910 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 4969 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2203 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 2262 Query 4970 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 5029 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2263 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 2322 Query 5030 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 5089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2323 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 2382 Query 5090 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 5149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2383 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 2442 Query 5150 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 5209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2443 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 2502 Query 5210 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 5269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2503 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 2562 Query 5270 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGC 5299 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2563 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGC 2592 Score = 1247 bits (1382), Expect = 0.0 Identities = 696/699 (99%), Gaps = 0/699 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2708 CTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGG 2767 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGG 60 Query 2768 ACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCA 2827 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 61 ACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAATGTTTATGTTGGTTTCA 120 Query 2828 TGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTA 2887 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTA 180 Query 2888 TTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGC 2947 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGC 240 Query 2948 TGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCA 3007 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCA 300 Query 3008 AAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGG 3067 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGG 360 Query 3068 CATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGA 3127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGA 420 Query 3128 GGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGG 3187 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGG 480 Query 3188 TACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGG 3247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGG 540 Query 3248 TGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCC 3307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCC 600 Query 3308 TGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGC 3367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGC 660 Query 3368 CGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 3406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 699 Score = 1180 bits (1308), Expect = 0.0 Identities = 656/657 (99%), Gaps = 0/657 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2886 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 2945 Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2946 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 3005 Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3006 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 3065 Query 181 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3066 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 3125 Query 241 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3126 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 3185 Query 301 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3186 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 3245 Query 361 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3246 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 3305 Query 421 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3306 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 3365 Query 481 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3366 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 3425 Query 541 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3426 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCT 3485 Query 601 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCA 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3486 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCA 3542 Score = 172 bits (190), Expect = 2e-39 Identities = 95/95 (100%), Gaps = 0/95 (0%) Strand=Plus/Plus Query 5292 ACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGC 5351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2791 ACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGC 2850 Query 5352 GCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 5386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2851 GCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 2885 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 17123192695885