Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Candida_20parapsilosis_20[genbank_20GCA_5F000982675.1_202014-10-24]
39 sequences; 13,025,060 total letters
Query= NC_001422.1
Length=5386
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq37 3741 0.0
>seq37
Length=5821
Score = 3741 bits (4148), Expect = 0.0
Identities = 2076/2077 (99%), Gaps = 0/2077 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 629 CGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACATTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGG 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3745 CGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACATTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGG 3804
Query 689 CGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCGTCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATT 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3805 CGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCGTCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATT 3864
Query 749 GTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGA 808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3865 GTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGA 3924
Query 809 AAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCGGAAGGAGTGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGT 868
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3925 AAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAGTGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGT 3984
Query 869 TCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGC 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3985 TCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGC 4044
Query 929 GCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACT 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4045 GCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACT 4104
Query 989 TGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCC 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4105 TGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCC 4164
Query 1049 CATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCGTCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTT 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4165 CATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCGTCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTT 4224
Query 1109 ATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGT 1168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4225 ATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGT 4284
Query 1169 CGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCAC 1228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4285 CGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCAC 4344
Query 1229 GTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCG 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4345 GTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCG 4404
Query 1289 ACTGTTAACACTACTGGTTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGAT 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4405 ACTGTTAACACTACTGGTTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGAT 4464
Query 1349 ACCAATAAAATCCCTAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTT 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4465 ACCAATAAAATCCCTAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTT 4524
Query 1409 AAAGCGCCGTGGATGCCTGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGAT 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4525 AAAGCGCCGTGGATGCCTGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGAT 4584
Query 1469 GCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCT 1528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4585 GCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCT 4644
Query 1529 GAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTG 1588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4645 GAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTG 4704
Query 1589 CAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTAC 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4705 CAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTAC 4764
Query 1649 CATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTA 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4765 CATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTA 4824
Query 1709 CTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACG 1768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4825 CTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACG 4884
Query 1769 TCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTC 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4885 TCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTC 4944
Query 1829 TTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCG 1888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4945 TTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCG 5004
Query 1889 ACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGC 1948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5005 ACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGC 5064
Query 1949 GACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGT 2008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5065 GACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGT 5124
Query 2009 TCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCT 2068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5125 TCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCT 5184
Query 2069 TCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCT 2128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5185 TCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCT 5244
Query 2129 TCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAG 2188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5245 TCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAG 5304
Query 2189 TCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAAT 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5305 TCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAAT 5364
Query 2249 CTGCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATA 2308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5365 CTGCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATA 5424
Query 2309 ACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5425 ACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGG 5484
Query 2369 TAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAA 2428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5485 TAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAA 5544
Query 2429 ACtttttttCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTT 2488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5545 ACTTTTTTTCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTT 5604
Query 2489 TACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTG 2548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5605 TACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTG 5664
Query 2549 GTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGG 2608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5665 GTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGG 5724
Query 2609 TTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGG 2668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5725 TTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGG 5784
Query 2669 TTCGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCC 2705
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5785 TTCGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCC 5821
Score = 3301 bits (3660), Expect = 0.0
Identities = 1830/1830 (100%), Gaps = 0/1830 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 822
Query 3530 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 882
Query 3590 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 3649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 942
Query 3650 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 1002
Query 3710 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 1062
Query 3770 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 1122
Query 3830 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 1182
Query 3890 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 1242
Query 3950 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 4009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 1302
Query 4010 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 4069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 1362
Query 4070 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 4129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 1422
Query 4130 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 4189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 1482
Query 4190 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 4249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 1542
Query 4250 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 4309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 1602
Query 4310 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 4369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 1662
Query 4370 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 4429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1663 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 1722
Query 4430 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 4489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1723 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 1782
Query 4490 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 4549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 1842
Query 4550 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 4609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 1902
Query 4610 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 4669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 1962
Query 4670 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 4729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 2022
Query 4730 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 4789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2023 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 2082
Query 4790 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 4849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2083 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 2142
Query 4850 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 4909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 2202
Query 4910 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 4969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2203 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 2262
Query 4970 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 5029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2263 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 2322
Query 5030 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 5089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2323 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 2382
Query 5090 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 5149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2383 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 2442
Query 5150 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 5209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 2502
Query 5210 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 5269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 2562
Query 5270 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGC 5299
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGC 2592
Score = 1247 bits (1382), Expect = 0.0
Identities = 696/699 (99%), Gaps = 0/699 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2708 CTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGG 2767
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGG 60
Query 2768 ACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCA 2827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 ACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAATGTTTATGTTGGTTTCA 120
Query 2828 TGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTA 2887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTA 180
Query 2888 TTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGC 2947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGC 240
Query 2948 TGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCA 3007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCA 300
Query 3008 AAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGG 3067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGG 360
Query 3068 CATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGA 3127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGA 420
Query 3128 GGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGG 3187
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGG 480
Query 3188 TACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGG 3247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGG 540
Query 3248 TGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCC 3307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCC 600
Query 3308 TGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGC 3367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGC 660
Query 3368 CGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 3406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 699
Score = 1180 bits (1308), Expect = 0.0
Identities = 656/657 (99%), Gaps = 0/657 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 2945
Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2946 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 3005
Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3006 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 3065
Query 181 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3066 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 3125
Query 241 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3126 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 3185
Query 301 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3186 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 3245
Query 361 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3246 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 3305
Query 421 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3306 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 3365
Query 481 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3366 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 3425
Query 541 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCT 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3426 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCT 3485
Query 601 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCA 657
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3486 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCA 3542
Score = 172 bits (190), Expect = 2e-39
Identities = 95/95 (100%), Gaps = 0/95 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5292 ACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGC 5351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2791 ACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGC 2850
Query 5352 GCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 5386
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2851 GCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 2885
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 17123192695885
Made in 2017 by Kirill Kryukov This page is placed in public domain using CC0 |