Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Leptinotarsa_20decemlineata_20[genbank_20GCA_5F000500325.1_202013- 12-02] 24,393 sequences; 1,170,241,964 total letters Query= NC_001422.1 Length=5386 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq23633 1833 0.0 >seq23633 Length=1016 Score = 1833 bits (2032), Expect = 0.0 Identities = 1016/1016 (100%), Gaps = 0/1016 (0%) Strand=Plus/Minus Query 4199 TGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGTTACTGAGAA 4258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1016 TGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGTTACTGAGAA 957 Query 4259 GTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATATTAATAACAC 4318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 956 GTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATATTAATAACAC 897 Query 4319 TATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAAGACGGTTAC 4378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 896 TATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAAGACGGTTAC 837 Query 4379 GCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGATGAGTATAA 4438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 836 GCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGATGAGTATAA 777 Query 4439 TTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGCCTCCACTAT 4498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 776 TTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGCCTCCACTAT 717 Query 4499 GAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACAGGCTCATGC 4558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 716 GAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACAGGCTCATGC 657 Query 4559 TGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATTAGAGGCGTT 4618 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 656 TGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATTAGAGGCGTT 597 Query 4619 TTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGTTCTTGC 4678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 596 TTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGTTCTTGC 537 Query 4679 TGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTTTTGTGTGCC 4738 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 536 TGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTTTTGTGTGCC 477 Query 4739 TGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGACACT 4798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 476 TGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGACACT 417 Query 4799 TCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCAGTTAAA 4858 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 416 TCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCAGTTAAA 357 Query 4859 TAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCA 4918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 356 TAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCA 297 Query 4919 GGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGAGCCGCTTAA 4978 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 296 GGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGAGCCGCTTAA 237 Query 4979 AGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAAAAAGTCAGA 5038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 236 AGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAAAAAGTCAGA 177 Query 5039 TATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAA 5098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 176 TATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAA 117 Query 5099 GCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTTCGGGATGAA 5158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 116 GCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTTCGGGATGAA 57 Query 5159 AATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAAGCTGG 5214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 56 AATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAAGCTGG 1 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 17118631556995