Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Ligia_20exotica_20[genbank_20GCA_5F002091915.1_202017-03-31] 1,663,556 sequences; 953,555,114 total letters Query= NC_001422.1 Length=5386 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq1663217 6120 0.0 seq681580 715 0.0 >seq1663217 Length=5386 Score = 6120 bits (6786), Expect = 0.0 Identities = 3401/3406 (99%), Gaps = 0/3406 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4041 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 3982 Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3981 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 3922 Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3921 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 3862 Query 181 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3861 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 3802 Query 241 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3801 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 3742 Query 301 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3741 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 3682 Query 361 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3681 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 3622 Query 421 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3621 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 3562 Query 481 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3561 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 3502 Query 541 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3501 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCT 3442 Query 601 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3441 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 3382 Query 661 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3381 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 3322 Query 721 TCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3321 TCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAA 3262 Query 781 ACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCGGAAGGAG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3261 ACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAG 3202 Query 841 TGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3201 TGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTT 3142 Query 901 GCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3141 GCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATT 3082 Query 961 TTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGG 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3081 TTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGG 3022 Query 1021 CGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3021 CGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCG 2962 Query 1081 TCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2961 TCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGT 2902 Query 1141 TGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACAT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2901 TGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACAT 2842 Query 1201 TTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2841 TTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAA 2782 Query 1261 GGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGGTTATATTGACCATGC 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2781 GGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGGTTATATTGACCATGC 2722 Query 1321 CGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAAGCATTTGTTTCAGGG 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2721 CGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAAGCATTTGTTTCAGGG 2662 Query 1381 TTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCCTGACCGTACCGAGGC 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2661 TTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCCTGACCGTACCGAGGC 2602 Query 1441 TAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTGCCATCTCAA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2601 TAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTGCCATCTCAA 2542 Query 1501 AAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTC 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2541 AAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTC 2482 Query 1561 TACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2481 TACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCA 2422 Query 1621 AGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAAC 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2421 AGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAAC 2362 Query 1681 CTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGG 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2361 CTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGG 2302 Query 1741 CTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2301 CTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACA 2242 Query 1801 GACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCT 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2241 GACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCT 2182 Query 1861 TGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2181 TGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGG 2122 Query 1921 TGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2121 TGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCG 2062 Query 1981 TGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGC 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2061 TGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGC 2002 Query 2041 TGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGA 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2001 TGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGA 1942 Query 2101 AGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCG 2160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1941 AGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCG 1882 Query 2161 CCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGT 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1881 CCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGT 1822 Query 2221 TAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTC 2280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1821 TAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTC 1762 Query 2281 GTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCC 2340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1761 GTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCC 1702 Query 2341 GCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTT 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1701 GCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTT 1642 Query 2401 CAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACtttttttCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCT 2460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1641 CAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTTTTTTCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCT 1582 Query 2461 GTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTA 2520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1581 GTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTA 1522 Query 2521 TATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATG 2580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1521 TATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATG 1462 Query 2581 GATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGAT 2640 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1461 GATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGAT 1402 Query 2641 GCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACC 2700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1401 GCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACC 1342 Query 2701 CTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACC 2760 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1341 CTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACC 1282 Query 2761 GTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAACGTTTATGTT 2820 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1281 GTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAATGTTTATGTT 1222 Query 2821 GGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAAT 2880 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1221 GGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAAT 1162 Query 2881 CAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTG 2940 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1161 CAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTG 1102 Query 2941 CTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAG 3000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1101 CTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAG 1042 Query 3001 GCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATA 3060 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1041 GCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATA 982 Query 3061 CTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACC 3120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 981 CTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACC 922 Query 3121 CTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTC 3180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 921 CTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTC 862 Query 3181 TTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTG 3240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 861 TTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTG 802 Query 3241 GACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTG 3300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 801 GACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTG 742 Query 3301 CATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGG 3360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 741 CATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGG 682 Query 3361 TTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 3406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 681 TTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 636 Score = 2426 bits (2690), Expect = 0.0 Identities = 1345/1345 (100%), Gaps = 0/1345 (0%) Strand=Plus/Minus Query 4042 AGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTGTGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGC 4101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5386 AGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTGTGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGC 5327 Query 4102 TTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCGCATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTC 4161 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5326 TTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCGCATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTC 5267 Query 4162 GTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGGTGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTT 4221 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5266 GTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGGTGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTT 5207 Query 4222 CTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGTTACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAAT 4281 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5206 CTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGTTACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAAT 5147 Query 4282 GCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATATTAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGG 4341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5146 GCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATATTAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGG 5087 Query 4342 ACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAAGACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTG 4401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5086 ACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAAGACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTG 5027 Query 4402 CTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTA 4461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5026 CTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTA 4967 Query 4462 AGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGCCTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTA 4521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4966 AGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGCCTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTA 4907 Query 4522 TTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACAGGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTG 4581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4906 TTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACAGGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTG 4847 Query 4582 ACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATTAGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGC 4641 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4846 ACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATTAGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGC 4787 Query 4642 GTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATG 4701 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4786 GTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATG 4727 Query 4702 ATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTTTTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCC 4761 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4726 ATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTTTTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCC 4667 Query 4762 GTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTA 4821 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4666 GTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTA 4607 Query 4822 ATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTT 4881 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4606 ATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTT 4547 Query 4882 ATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTT 4941 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4546 ATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTT 4487 Query 4942 GGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGAGCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTG 5001 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4486 GGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGAGCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTG 4427 Query 5002 GTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAAAAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTC 5061 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4426 GTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAAAAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTC 4367 Query 5062 TAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGC 5121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4366 TAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGC 4307 Query 5122 TGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTTCGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGT 5181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4306 TGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTTCGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGT 4247 Query 5182 CCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAAGCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGA 5241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4246 CCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAAGCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGA 4187 Query 5242 TATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCG 5301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4186 TATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCG 4127 Query 5302 ACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAA 5361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4126 ACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAA 4067 Query 5362 AAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 5386 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4066 AAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 4042 Score = 1032 bits (1144), Expect = 0.0 Identities = 572/572 (100%), Gaps = 0/572 (0%) Strand=Plus/Minus Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 572 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 513 Query 3530 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 3589 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 512 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 453 Query 3590 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 3649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 452 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 393 Query 3650 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 392 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 333 Query 3710 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3769 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 332 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 273 Query 3770 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3829 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 272 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 213 Query 3830 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3889 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 212 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 153 Query 3890 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 152 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 93 Query 3950 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 4009 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 92 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 33 Query 4010 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCG 4041 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 32 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCG 1 >seq681580 Length=406 Score = 715 bits (792), Expect = 0.0 Identities = 402/406 (99%), Gaps = 0/406 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2896 ATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTA 2955 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGCGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTA 60 Query 2956 TTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCG 3015 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCG 120 Query 3016 CCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTG 3075 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 121 CCTCCGGTGGCATTCAAGGGGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGGG 180 Query 3076 ATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCC 3135 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 181 ATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCC 240 Query 3136 CTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGC 3195 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGC 300 Query 3196 AGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGT 3255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGT 360 Query 3256 CTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGC 3301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGC 406 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 16811640914540