Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Onchocerca_20flexuosa_20[genbank_20GCA_5F000951355.1_202014-09-26]
45,472 sequences; 86,175,476 total letters
Query= NC_001422.1
Length=5386
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq2815 3458 0.0
>seq2815
Length=5464
Score = 3458 bits (3834), Expect = 0.0
Identities = 1917/1917 (100%), Gaps = 0/1917 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4185 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 4126
Query 3530 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4125 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 4066
Query 3590 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 3649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4065 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 4006
Query 3650 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4005 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3946
Query 3710 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3945 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3886
Query 3770 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3885 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3826
Query 3830 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3825 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3766
Query 3890 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3765 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3706
Query 3950 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 4009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3705 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 3646
Query 4010 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 4069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3645 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 3586
Query 4070 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 4129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3585 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 3526
Query 4130 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 4189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3525 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 3466
Query 4190 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 4249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3465 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 3406
Query 4250 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 4309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 3346
Query 4310 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 4369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3345 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 3286
Query 4370 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 4429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3285 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 3226
Query 4430 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 4489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3225 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 3166
Query 4490 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 4549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3165 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 3106
Query 4550 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 4609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3105 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 3046
Query 4610 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 4669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3045 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 2986
Query 4670 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 4729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2985 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 2926
Query 4730 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 4789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2925 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 2866
Query 4790 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 4849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2865 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 2806
Query 4850 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 4909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2805 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 2746
Query 4910 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 4969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2745 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 2686
Query 4970 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 5029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2685 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 2626
Query 5030 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 5089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2625 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 2566
Query 5090 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 5149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 2506
Query 5150 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 5209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 2446
Query 5210 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 5269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2445 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 2386
Query 5270 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGAC 5329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2385 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGAC 2326
Query 5330 AAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 5386
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2325 AAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 2269
Score = 2210 bits (2450), Expect = 0.0
Identities = 1228/1230 (99%), Gaps = 0/1230 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 2209
Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 2149
Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 2089
Query 181 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2088 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 2029
Query 241 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 1969
Query 301 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 1909
Query 361 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 1849
Query 421 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 1789
Query 481 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 1729
Query 541 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCT 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1728 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCT 1669
Query 601 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 1609
Query 661 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 1549
Query 721 TCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 TCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAA 1489
Query 781 ACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCGGAAGGAG 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1488 ACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAG 1429
Query 841 TGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 TGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTT 1369
Query 901 GCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 GCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATT 1309
Query 961 TTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGG 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308 TTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGG 1249
Query 1021 CGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCG 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 CGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCG 1189
Query 1081 TCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 TCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGT 1129
Query 1141 TGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACAT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 TGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACAT 1069
Query 1201 TTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGT 1230
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 TTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGT 1039
Score = 2179 bits (2416), Expect = 0.0
Identities = 1213/1216 (99%), Gaps = 0/1216 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2191 CGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCT 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5464 CGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCT 5405
Query 2251 GCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAAC 2310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5404 GCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAAC 5345
Query 2311 GCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTA 2370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5344 GCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTA 5285
Query 2371 GGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAAC 2430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5284 GGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAAC 5225
Query 2431 tttttttCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTA 2490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5224 TTTTTTTCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTA 5165
Query 2491 CAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGT 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5164 CAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGT 5105
Query 2551 AATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTT 2610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5104 AATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTT 5045
Query 2611 GTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTT 2670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5044 GTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTT 4985
Query 2671 CGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTG 2730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4984 CGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTG 4925
Query 2731 AATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTT 2790
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4924 GATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTT 4865
Query 2791 CCCCGTACGCCGGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCT 2850
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4864 CCCCGTACGCCGGGCAATAATGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCT 4805
Query 2851 ACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAG 2910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4804 ACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAG 4745
Query 2911 CCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTG 2970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4744 CCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTG 4685
Query 2971 CTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTC 3030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4684 CTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTC 4625
Query 3031 AAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAAT 3090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4624 AAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAAT 4565
Query 3091 CTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTG 3150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4564 CTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTG 4505
Query 3151 GTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTG 3210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4504 GTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTG 4445
Query 3211 CCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAG 3270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4444 CCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAG 4385
Query 3271 GAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4384 GAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTG 4325
Query 3331 CTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGC 3390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4324 CTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGC 4265
Query 3391 TTACTAAAATGCAACT 3406
||||||||||||||||
Sbjct 4264 TTACTAAAATGCAACT 4249
Score = 1359 bits (1506), Expect = 0.0
Identities = 760/763 (99%), Gaps = 1/763 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1302 CTGGTTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCC 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CTGGTTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCC 730
Query 1362 CTAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGA 1421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 CTAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGA 670
Query 1422 TGCCTGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTT 1481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 TGCCTGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTT 610
Query 1482 TCCGTTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTT 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 TCCGTTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTT 550
Query 1542 CTCGCCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATG 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549 CTCGCCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATG 490
Query 1602 CTAATTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTT 1661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 CTAATTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTT 430
Query 1662 CTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCT 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 CTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCT 370
Query 1722 CTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGT 1781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 CTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGT 310
Query 1782 TTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGC 1841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 309 TTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGC 250
Query 1842 ATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTC 1901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 ATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTC 190
Query 1902 AGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGT 1961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 AGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGT 130
Query 1962 ATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGT 2021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 ATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGT 70
Query 2022 CTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGC 2064
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||
Sbjct 69 CTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGATCTCG-TATGC 28
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 17114683776480
Made in 2017 by Kirill Kryukov This page is placed in public domain using CC0 |