Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Echinostoma_20caproni_20[genbank_20GCA_5F000950555.1_202014-10-12] 86,083 sequences; 834,556,378 total letters Query= NC_001422.1 Length=5386 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq33826 5341 0.0 >seq33826 Length=5446 Score = 5341 bits (5922), Expect = 0.0 Identities = 2967/2971 (99%), Gaps = 0/2971 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2476 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 2535 Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2536 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 2595 Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2596 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 2655 Query 181 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2656 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 2715 Query 241 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2716 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 2775 Query 301 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2776 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 2835 Query 361 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2836 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 2895 Query 421 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2896 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 2955 Query 481 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2956 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 3015 Query 541 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3016 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCT 3075 Query 601 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3076 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 3135 Query 661 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3136 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 3195 Query 721 TCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3196 TCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAA 3255 Query 781 ACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCGGAAGGAG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3256 ACACTGACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAG 3315 Query 841 TGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3316 TGATGTAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTT 3375 Query 901 GCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3376 GCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATT 3435 Query 961 TTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGG 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3436 TTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGG 3495 Query 1021 CGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3496 CGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCG 3555 Query 1081 TCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3556 TCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGT 3615 Query 1141 TGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACAT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3616 TGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACAT 3675 Query 1201 TTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3676 TTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAA 3735 Query 1261 GGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGGTTATATTGACCATGC 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3736 GGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGGTTATATTGACCATGC 3795 Query 1321 CGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAAGCATTTGTTTCAGGG 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3796 CGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAAGCATTTGTTTCAGGG 3855 Query 1381 TTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCCTGACCGTACCGAGGC 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3856 TTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCCTGACCGTACCGAGGC 3915 Query 1441 TAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTGCCATCTCAA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3916 TAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTGCCATCTCAA 3975 Query 1501 AAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTC 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3976 AAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTC 4035 Query 1561 TACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4036 TACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCA 4095 Query 1621 AGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAAC 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4096 AGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAAC 4155 Query 1681 CTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGG 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4156 CTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGG 4215 Query 1741 CTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4216 CTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACA 4275 Query 1801 GACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCT 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4276 GACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCT 4335 Query 1861 TGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4336 TGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGG 4395 Query 1921 TGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4396 TGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCG 4455 Query 1981 TGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGC 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4456 TGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGC 4515 Query 2041 TGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGA 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4516 TGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGA 4575 Query 2101 AGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCG 2160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4576 AGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCG 4635 Query 2161 CCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGT 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4636 CCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGT 4695 Query 2221 TAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTC 2280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4696 TAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTC 4755 Query 2281 GTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCC 2340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4756 GTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCC 4815 Query 2341 GCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTT 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4816 GCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTT 4875 Query 2401 CAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACtttttttCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCT 2460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4876 CAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTTTTTTCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCT 4935 Query 2461 GTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTA 2520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4936 GTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTA 4995 Query 2521 TATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATG 2580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4996 TATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATG 5055 Query 2581 GATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGAT 2640 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5056 GATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGAT 5115 Query 2641 GCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACC 2700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5116 GCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACC 5175 Query 2701 CTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACC 2760 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5176 CTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACC 5235 Query 2761 GTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAACGTTTATGTT 2820 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 5236 GTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAATGTTTATGTT 5295 Query 2821 GGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAAT 2880 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5296 GGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAAT 5355 Query 2881 CAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTG 2940 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5356 CAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTG 5415 Query 2941 CTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGC 2971 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5416 CTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGC 5446 Score = 3458 bits (3834), Expect = 0.0 Identities = 1917/1917 (100%), Gaps = 0/1917 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 559 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 618 Query 3530 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 3589 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 619 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 678 Query 3590 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 3649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 679 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 738 Query 3650 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 739 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 798 Query 3710 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3769 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 799 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 858 Query 3770 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3829 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 859 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 918 Query 3830 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3889 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 919 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 978 Query 3890 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 979 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 1038 Query 3950 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 4009 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1039 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 1098 Query 4010 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 4069 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1099 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 1158 Query 4070 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 4129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1159 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 1218 Query 4130 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 4189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1219 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 1278 Query 4190 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 4249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1279 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 1338 Query 4250 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 4309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1339 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 1398 Query 4310 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 4369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1399 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 1458 Query 4370 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 4429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1459 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 1518 Query 4430 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 4489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1519 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 1578 Query 4490 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 4549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1579 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 1638 Query 4550 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 4609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1639 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 1698 Query 4610 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 4669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1699 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 1758 Query 4670 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 4729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1759 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 1818 Query 4730 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 4789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1819 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 1878 Query 4790 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 4849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1879 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 1938 Query 4850 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 4909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1939 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 1998 Query 4910 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 4969 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1999 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 2058 Query 4970 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 5029 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2059 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 2118 Query 5030 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 5089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2119 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 2178 Query 5090 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 5149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2179 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 2238 Query 5150 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 5209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2239 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 2298 Query 5210 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 5269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2299 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 2358 Query 5270 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGAC 5329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2359 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGAC 2418 Query 5330 AAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 5386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2419 AAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 2475 Score = 888 bits (984), Expect = 0.0 Identities = 494/495 (99%), Gaps = 0/495 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2912 CACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGC 2971 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGC 60 Query 2972 TGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCA 3031 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCA 120 Query 3032 AGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATC 3091 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATC 180 Query 3092 TGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGG 3151 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 181 TGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGG 240 Query 3152 TGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGC 3211 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGC 300 Query 3212 CGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGG 3271 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGG 360 Query 3272 AAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGC 3331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 AAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGC 420 Query 3332 TGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCT 3391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCT 480 Query 3392 TACTAAAATGCAACT 3406 ||||||||||||||| Sbjct 481 TACTAAAATGCAACT 495 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 17107077945345