Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Stramenopiles_20sp._20TOSAG41- 1_20[genbank_20GCA_5F900128575.1_202016-12-02] 9,021 sequences; 30,044,774 total letters Query= NC_001422.1 Length=5386 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq8774 1736 0.0 seq2011 1355 0.0 seq7100 1234 0.0 seq4720 942 0.0 seq7334 704 0.0 >seq8774 Length=2034 Score = 1736 bits (1924), Expect = 0.0 Identities = 967/970 (99%), Gaps = 0/970 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3525 CTTGCTTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAAT 3584 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 54 CTTGATTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAAT 113 Query 3585 CTTTCCAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACG 3644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 114 CTTTCCAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACG 173 Query 3645 GCTGGTCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAG 3704 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 174 GCTGGTCAGTATTTTACCAATGACCAAATTAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAG 233 Query 3705 GTTGACTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCT 3764 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 234 GTTGACTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCT 293 Query 3765 ACTGCAAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTT 3824 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 294 ACTGCAAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTGCTGGTGTGGTTGATATTTTT 353 Query 3825 CATGGTATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCT 3884 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 354 CATGGTATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCT 413 Query 3885 GATGGTATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTG 3944 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 414 GATGGTATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTG 473 Query 3945 TATGTTTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCT 4004 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 474 TATGTTTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCT 533 Query 4005 GAATGTCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAG 4064 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 534 GAATGTCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAG 593 Query 4065 GCTTGTGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGAT 4124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 594 GCTTGTGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGAT 653 Query 4125 AACCGCATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGAT 4184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 654 AACCGCATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGAT 713 Query 4185 AATGGTGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTA 4244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 714 AATGGTGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTA 773 Query 4245 TCTGTTACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTT 4304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 774 TCTGTTACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTT 833 Query 4305 GATATTAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAAC 4364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 834 GATATTAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAAC 893 Query 4365 GAGAAGACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATT 4424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 894 GAGAAGACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATT 953 Query 4425 CGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTG 4484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 954 CGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTG 1013 Query 4485 GAGGCCTCCA 4494 |||||||||| Sbjct 1014 GAGGCCTCCA 1023 Score = 1736 bits (1924), Expect = 0.0 Identities = 967/970 (99%), Gaps = 0/970 (0%) Strand=Plus/Minus Query 3525 CTTGCTTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAAT 3584 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 CTTGATTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAAT 1922 Query 3585 CTTTCCAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACG 3644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 CTTTCCAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACG 1862 Query 3645 GCTGGTCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAG 3704 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1861 GCTGGTCAGTATTTTACCAATGACCAAATTAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAG 1802 Query 3705 GTTGACTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCT 3764 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 GTTGACTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCT 1742 Query 3765 ACTGCAAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTT 3824 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1741 ACTGCAAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTGCTGGTGTGGTTGATATTTTT 1682 Query 3825 CATGGTATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCT 3884 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 CATGGTATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCT 1622 Query 3885 GATGGTATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTG 3944 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 GATGGTATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTG 1562 Query 3945 TATGTTTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCT 4004 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 TATGTTTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCT 1502 Query 4005 GAATGTCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAG 4064 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 GAATGTCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAG 1442 Query 4065 GCTTGTGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGAT 4124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 GCTTGTGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGAT 1382 Query 4125 AACCGCATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGAT 4184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 AACCGCATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGAT 1322 Query 4185 AATGGTGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTA 4244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 AATGGTGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTA 1262 Query 4245 TCTGTTACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTT 4304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 TCTGTTACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTT 1202 Query 4305 GATATTAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAAC 4364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 GATATTAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAAC 1142 Query 4365 GAGAAGACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATT 4424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GAGAAGACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATT 1082 Query 4425 CGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTG 4484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 CGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTG 1022 Query 4485 GAGGCCTCCA 4494 |||||||||| Sbjct 1021 GAGGCCTCCA 1012 >seq2011 Length=1498 Score = 1355 bits (1502), Expect = 0.0 Identities = 759/764 (99%), Gaps = 0/764 (0%) Strand=Plus/Minus Query 4623 GATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGTTCTTGCTGCC 4682 |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1498 GATAATCCCATTGCTTTCCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGTTCTTGCTGCC 1439 Query 4683 GAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTTTTGTGTGCCTGAG 4742 | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1438 GGGGGCCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTTTTGTGTGCCTGAG 1379 Query 4743 TATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGACACTTCCT 4802 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1378 TATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGCCACTTCCT 1319 Query 4803 ACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCAGTTAAATAGC 4862 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1318 ACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCAGTTAAATAGC 1259 Query 4863 TTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGAC 4922 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1258 TTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGAC 1199 Query 4923 GCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGAGCCGCTTAAAGCT 4982 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 GCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGAGCCGCTTAAAGCT 1139 Query 4983 ACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAAAAAGTCAGATATG 5042 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1138 ACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAAAAAGTCAGATATG 1079 Query 5043 GACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTG 5102 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 GACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTG 1019 Query 5103 TCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTTCGGGATGAAAATG 5162 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 TCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTTCGGGATGAAAATG 959 Query 5163 CTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAAGCTGGGTTACGAC 5222 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 CTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAAGCTGGGTTACGAC 899 Query 5223 GCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTG 5282 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 GCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTG 839 Query 5283 GGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAA 5342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 GGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAA 779 Query 5343 TTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 5386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 TTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 735 Score = 1297 bits (1438), Expect = 0.0 Identities = 722/724 (99%), Gaps = 0/724 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 734 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 675 Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 674 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 615 Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 614 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 555 Query 181 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 554 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 495 Query 241 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 494 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 435 Query 301 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 434 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 375 Query 361 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 374 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTCCGTT 315 Query 421 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 314 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 255 Query 481 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 254 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 195 Query 541 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 194 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCT 135 Query 601 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 134 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 75 Query 661 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 74 TTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCG 15 Query 721 TCGA 724 |||| Sbjct 14 TCGA 11 >seq7100 Length=919 Score = 1234 bits (1368), Expect = 0.0 Identities = 701/712 (98%), Gaps = 0/712 (0%) Strand=Plus/Minus Query 2695 ACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATGGTGGTTAT 2754 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 877 ACTACCATCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTCGCCATGATGGTGGTTAT 818 Query 2755 TATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAACGTT 2814 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 817 TATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAATGTT 758 Query 2815 TATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCG 2874 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 757 TATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCG 698 Query 2875 CTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGT 2934 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 697 CTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGT 638 Query 2935 TTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGT 2994 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 637 TTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGT 578 Query 2995 TTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATA 3054 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 577 TTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATA 518 Query 3055 ACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTC 3114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 517 ACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTC 458 Query 3115 CTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAG 3174 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 457 CTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAG 398 Query 3175 GACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATT 3234 | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 397 GTCTTCTTGATGGTTCGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATT 338 Query 3235 TGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTG 3294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 337 TGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTG 278 Query 3295 CTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTG 3354 |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 277 CTGCTGCAGTTCCTGAGCCTACTGCTTGGGCGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTG 218 Query 3355 GTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 3406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217 GTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACT 166 Score = 100 bits (110), Expect = 1e-17 Identities = 60/63 (95%), Gaps = 0/63 (0%) Strand=Plus/Minus Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || Sbjct 102 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGAATATGCACAAAATGAGTTGCTCGC 43 Query 3530 TTA 3532 ||| Sbjct 42 TTA 40 >seq4720 Length=582 Score = 942 bits (1044), Expect = 0.0 Identities = 525/527 (99%), Gaps = 0/527 (0%) Strand=Plus/Plus Query 733 TTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACTGACGTTC 792 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 17 TTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACTGACGTTC 76 Query 793 TTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCGGAAGGAGTGATGTAATGTC 852 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 77 TTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAGTGATGTAATGTC 136 Query 853 TAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTACTAA 912 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 137 TAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTACTAA 196 Query 913 AGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAATTGCAGGG 972 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 197 AGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAATTGCAGGG 256 Query 973 GCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCGAGCGTAT 1032 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 257 GCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCGAGCGTAT 316 Query 1033 GCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCGTCTTATTACCAT 1092 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 317 GCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCGTCTTATTACCAT 376 Query 1093 TTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGGCGCTCTCCG 1152 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 377 TTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGGCGATCTCCG 436 Query 1153 TCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACATTTTTACTTTTTA 1212 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 437 TCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACATTTTTACTTTTTA 496 Query 1213 TGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGA 1259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 497 TGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGA 543 >seq7334 Length=501 Score = 704 bits (780), Expect = 0.0 Identities = 396/400 (99%), Gaps = 0/400 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1806 ATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCTTGCGC 1865 |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 447 ATAAGCCTTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTTTACTCTTGCGC 388 Query 1866 TTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTT 1925 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 387 TTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTT 328 Query 1926 TGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAA 1985 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 327 TGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCCGTTTTGTATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAA 268 Query 1986 TTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGG 2045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 267 TTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGG 208 Query 2046 GTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCT 2105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 207 GTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCT 148 Query 2106 TCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACC 2165 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 147 TCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACC 88 Query 2166 ATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCA 2205 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 87 ATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTTTTGCA 48 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 17121510502015