Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Arabidopsis_20halleri_20subsp._20gemmifera_20[genbank_20GCA_5F900078
215.1_202016-09-29] 2,239 sequences; 196,243,198 total letters
Query= NC_001422.1
Length=5386
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq1927 3782 0.0
seq762 1422 0.0
>seq1927
Length=3296
Score = 3782 bits (4194), Expect = 0.0
Identities = 2102/2105 (99%), Gaps = 0/2105 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1302 CTGGTTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCC 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3296 CTGGTTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCC 3237
Query 1362 CTAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGA 1421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3236 CTAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGA 3177
Query 1422 TGCCTGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTT 1481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176 TGCCTGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTT 3117
Query 1482 TCCGTTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTT 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 TCCGTTGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTT 3057
Query 1542 CTCGCCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATG 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 CTCGCCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATG 2997
Query 1602 CTAATTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTT 1661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2996 CTAATTTGCATACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTT 2937
Query 1662 CTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCT 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2936 CTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCT 2877
Query 1722 CTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGT 1781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2876 CTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGT 2817
Query 1782 TTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGC 1841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2816 TTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGC 2757
Query 1842 ATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTC 1901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2756 ATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTC 2697
Query 1902 AGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGT 1961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2696 AGTACCTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGT 2637
Query 1962 ATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGT 2021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 ATGGCAACTTGCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGT 2577
Query 2022 CTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTC 2081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 CTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTC 2517
Query 2082 CTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGC 2141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 CTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGC 2457
Query 2142 AAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGT 2201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 AAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGT 2397
Query 2202 TGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTC 2261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 TGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTC 2337
Query 2262 GCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGT 2321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 GCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGT 2277
Query 2322 AAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCT 2381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 AAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCT 2217
Query 2382 TAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACtttttttCTGA 2441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 TAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTTTTTTCTGA 2157
Query 2442 TAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAA 2501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 TAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAA 2097
Query 2502 AGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTT 2561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 AGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTT 2037
Query 2562 TCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGG 2621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 TCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTGG 1977
Query 2622 TGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTC 2681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 TGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGTC 1917
Query 2682 TTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCA 2741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1916 TTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTCGCCA 1857
Query 2742 TGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCC 2801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 TGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCC 1797
Query 2802 GGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCG 2861
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 GGGCAATAATGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCG 1737
Query 2862 CGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTG 2921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 CGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTG 1677
Query 2922 AGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCC 2981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 AGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCC 1617
Query 2982 ATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTG 3041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 ATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGTG 1557
Query 3042 CTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAA 3101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 CTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCAA 1497
Query 3102 GGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCT 3161
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 GGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCT 1437
Query 3162 AAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGAT 3221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 AAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGAT 1377
Query 3222 AAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACT 3281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 AAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACT 1317
Query 3282 CGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGAT 3341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 CGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGAT 1257
Query 3342 GCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATG 3401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 GCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATG 1197
Query 3402 CAACT 3406
|||||
Sbjct 1196 CAACT 1192
Score = 2035 bits (2256), Expect = 0.0
Identities = 1128/1128 (100%), Gaps = 0/1128 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 1069
Query 3530 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 1009
Query 3590 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 3649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 949
Query 3650 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 889
Query 3710 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 829
Query 3770 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 769
Query 3830 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 709
Query 3890 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 649
Query 3950 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 4009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 589
Query 4010 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 4069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 529
Query 4070 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 4129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 528 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 469
Query 4130 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 4189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 468 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 409
Query 4190 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 4249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 349
Query 4250 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 4309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 289
Query 4310 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 4369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 229
Query 4370 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 4429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 228 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 169
Query 4430 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 4489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 168 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 109
Query 4490 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 4549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 49
Query 4550 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGC 4597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGC 1
>seq762
Length=1457
Score = 1422 bits (1576), Expect = 0.0
Identities = 788/788 (100%), Gaps = 0/788 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4599 GACGACCGATTAGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGAT 4658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GACGACCGATTAGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGAT 60
Query 4659 ATTGGTCGTATGGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGC 4718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATTGGTCGTATGGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGC 120
Query 4719 TATCAGTATTTTTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCG 4778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TATCAGTATTTTTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCG 180
Query 4779 GTGCACTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTA 4838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTGCACTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTA 240
Query 4839 CGCAATCGCCGCCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCC 4898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CGCAATCGCCGCCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCC 300
Query 4899 ATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGAT 4958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGAT 360
Query 4959 GCTAAAGGTGAGCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAA 5018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCTAAAGGTGAGCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAA 420
Query 5019 TACGTTAACAAAAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGG 5078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TACGTTAACAAAAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGG 480
Query 5079 AACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATG 5138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATG 540
Query 5139 AGCCGCAACTTCGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATC 5198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGCCGCAACTTCGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATC 600
Query 5199 CAACTTACCAAGCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCA 5258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CAACTTACCAAGCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCA 660
Query 5259 AAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAA 5318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAA 720
Query 5319 CCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCC 5378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCC 780
Query 5379 AACCTGCA 5386
||||||||
Sbjct 781 AACCTGCA 788
Score = 1202 bits (1332), Expect = 0.0
Identities = 668/669 (99%), Gaps = 0/669 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 848
Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 908
Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 968
Query 181 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAG 1028
Query 241 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTT 1088
Query 301 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 CATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGAT 1148
Query 361 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 GCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTT 1208
Query 421 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1209 TCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCG 1268
Query 481 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1269 AAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG 1328
Query 541 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCT 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1329 CTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCT 1388
Query 601 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 TTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACA 1448
Query 661 TTCAAACGG 669
|||||||||
Sbjct 1449 TTCAAACGG 1457
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 17122780668885
Made in 2017 by Kirill Kryukov This page is placed in public domain using CC0 |