Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Fragaria_20orientalis_20[genbank_20GCA_5F000517285.1_202013-12-06]
323,163 sequences; 214,184,023 total letters
Query= NC_001422.1
Length=5386
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq322525 3458 0.0
seq317663 2013 0.0
seq298749 1157 0.0
seq206210 603 3e-169
>seq322525
Length=3476
Score = 3458 bits (3834), Expect = 0.0
Identities = 1917/1917 (100%), Gaps = 0/1917 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3470 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 3529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAAATGAGATGCTTGC 1392
Query 3530 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 TTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCTTTC 1452
Query 3590 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 3649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 CAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGG 1512
Query 3650 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 3709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1513 TCAGTATTTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGA 1572
Query 3710 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 3769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1573 CTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGC 1632
Query 3770 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 3829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 AAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGATGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGG 1692
Query 3830 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 3889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693 TATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGG 1752
Query 3890 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 3949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1753 TATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCTCCCAATTGTATGT 1812
Query 3950 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 4009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813 TTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGAATG 1872
Query 4010 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 4069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 TCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTG 1932
Query 4070 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 4129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 TGGCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCG 1992
Query 4130 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 4189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 CATCAAGCTCTTGGAAGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGG 2052
Query 4190 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 4249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 TGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGT 2112
Query 4250 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 4309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 TACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATAT 2172
Query 4310 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 4369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2173 TAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTTTAGAGAACGAGAA 2232
Query 4370 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 4429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2233 GACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCGCGA 2292
Query 4430 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 4489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2293 TGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGC 2352
Query 4490 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 4549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2353 CTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACA 2412
Query 4550 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 4609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2413 GGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATT 2472
Query 4610 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 4669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2473 AGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTAT 2532
Query 4670 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 4729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2533 GGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCACACGCCGACTGCTATCAGTATTT 2592
Query 4730 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 4789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2593 TTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATGCGGTGCACTTTAT 2652
Query 4790 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 4849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2653 GCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCG 2712
Query 4850 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 4909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 CCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCG 2772
Query 4910 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 4969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2773 CTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGA 2832
Query 4970 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 5029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2833 GCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAA 2892
Query 5030 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 5089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2893 AAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACT 2952
Query 5090 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 5149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2953 AAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACTT 3012
Query 5150 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 5209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3013 CGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAATCCAACTTACCAA 3072
Query 5210 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 5269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3073 GCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGAT 3132
Query 5270 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGAC 5329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3133 GAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGAC 3192
Query 5330 AAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 5386
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3193 AAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGCA 3249
Score = 2275 bits (2522), Expect = 0.0
Identities = 1266/1269 (99%), Gaps = 0/1269 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2138 TTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAG 2197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAG 60
Query 2198 TTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACC 2257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACC 120
Query 2258 ACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAG 2317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAG 180
Query 2318 CGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTC 2377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTC 240
Query 2378 TGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACttttttt 2437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTTTTTT 300
Query 2438 CTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACAC 2497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACTCCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACAC 360
Query 2498 CTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTG 2557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTG 420
Query 2558 GTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTG 2617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTG 480
Query 2618 TTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTG 2677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTG 540
Query 2678 AGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTC 2737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 541 AGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTC 600
Query 2738 GCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTA 2797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTA 660
Query 2798 CGCCGGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAAT 2857
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CGCCGGGCAATAATGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAAT 720
Query 2858 GCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTA 2917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTA 780
Query 2918 AGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGG 2977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGG 840
Query 2978 CGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGA 3037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGA 900
Query 3038 TGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCAT 3097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCAT 960
Query 3098 TCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTAT 3157
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTAT 1020
Query 3158 GGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTC 3217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTC 1080
Query 3218 TGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGA 3277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGA 1140
Query 3278 TACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGC 3337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 TACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGC 1200
Query 3338 TGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAA 3397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAA 1260
Query 3398 AATGCAACT 3406
|||||||||
Sbjct 1261 AATGCAACT 1269
Score = 410 bits (454), Expect = 4e-111
Identities = 227/227 (100%), Gaps = 0/227 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3250 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 3309
Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3310 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 3369
Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3370 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 3429
Query 181 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTT 227
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3430 GCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTT 3476
>seq317663
Length=1116
Score = 2013 bits (2232), Expect = 0.0
Identities = 1116/1116 (100%), Gaps = 0/1116 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1072 GATTGGTCGTCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGAT 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GATTGGTCGTCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGAT 60
Query 1132 GGACGCCGTTGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTAC 1191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGACGCCGTTGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTAC 120
Query 1192 TGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAA 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TGTAGACATTTTTACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAA 180
Query 1252 GTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGGTTATAT 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGGTTATAT 240
Query 1312 TGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAAGCATTT 1371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTGATACCAATAAAATCCCTAAGCATTT 300
Query 1372 GTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCCTGACCG 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCCGTGGATGCCTGACCG 360
Query 1432 TACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTG 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCGTTGCTG 420
Query 1492 CCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAAT 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAAT 480
Query 1552 GACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCA 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCA 540
Query 1612 TACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTTGG 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TACTGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTTGG 600
Query 1672 AGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTG 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AGGTAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTG 660
Query 1732 GGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCG 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCG 720
Query 1792 TGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTAT 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTAT 780
Query 1852 GTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAA 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAA 840
Query 1912 CGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTT 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTT 900
Query 1972 GCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTT 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTT 960
Query 2032 TAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCA 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TAAGATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCA 1020
Query 2092 CCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGT 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 CCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGT 1080
Query 2152 ACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCA 2187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 ACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCA 1116
>seq298749
Length=646
Score = 1157 bits (1282), Expect = 0.0
Identities = 644/646 (99%), Gaps = 0/646 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 429 GCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCGAAGATGAT 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 646 GCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCGAAGATGAT 587
Query 489 TTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTGCTCGTCGC 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 TTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTGCTCGTCGC 527
Query 549 TGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCTTTCCTGCT 608
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 526 TGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCTTTCCTGCT 467
Query 609 CCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACATTCAAACG 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 466 CCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACATTCAAACG 407
Query 669 GCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCGTCGAGCGT 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 GCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCGTCGAGCGT 347
Query 729 CCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACTGAC 788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 CCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACTGAC 287
Query 789 GTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCGGAAGGAGTGATGTAA 848
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 286 GTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAGTGATGTAA 227
Query 849 TGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTA 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 TGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTA 167
Query 909 CTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAATTGC 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 CTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAATTGC 107
Query 969 AGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCGAGC 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 AGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCGAGC 47
Query 1029 GTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGAT 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 GTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGAT 1
>seq206210
Length=334
Score = 603 bits (668), Expect = 3e-169
Identities = 334/334 (100%), Gaps = 0/334 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 162 CTCGAGAAGCTCTTACTTTGCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGA 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334 CTCGAGAAGCTCTTACTTTGCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGA 275
Query 222 CGCGTTGGATGAGGAGAAGTGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAG 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 CGCGTTGGATGAGGAGAAGTGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAG 215
Query 282 ATATGAGTCACATTTTGTTCATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGG 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 ATATGAGTCACATTTTGTTCATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGG 155
Query 342 ATTACTATCTGAGTCCGATGCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTT 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 154 ATTACTATCTGAGTCCGATGCTGTTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTT 95
Query 402 ACTGAACAATCCGTACGTTTCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCT 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 ACTGAACAATCCGTACGTTTCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCT 35
Query 462 GCCGTTTTGGATTTAACCGAAGATGATTTCGATT 495
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 GCCGTTTTGGATTTAACCGAAGATGATTTCGATT 1
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 17062676417545
Made in 2017 by Kirill Kryukov This page is placed in public domain using CC0 |