Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Primula_20vulgaris_20[genbank_20GCA_5F001077355.1_202015-01-29] 229 sequences; 1,504,784 total letters Query= NC_001422.1 Length=5386 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq173 2091 0.0 seq174 1707 0.0 seq159 1615 0.0 seq15 1269 0.0 seq49 500 3e-138 >seq173 Length=1356 Score = 2091 bits (2318), Expect = 0.0 Identities = 1159/1159 (100%), Gaps = 0/1159 (0%) Strand=Plus/Minus Query 4228 TTCGTGATGAGTTTGTATCTGTTACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACA 4287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1356 TTCGTGATGAGTTTGTATCTGTTACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTACA 1297 Query 4288 ATGTGCTCCCCCAACTTGATATTAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAA 4347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1296 ATGTGCTCCCCCAACTTGATATTAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAA 1237 Query 4348 AATGGTTTTTAGAGAACGAGAAGACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAAC 4407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1236 AATGGTTTTTAGAGAACGAGAAGACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAAC 1177 Query 4408 GCCCTCTTAAGGATATTCGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATG 4467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1176 GCCCTCTTAAGGATATTCGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATG 1117 Query 4468 AGTGTTCAAGATTGCTGGAGGCCTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGC 4527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1116 AGTGTTCAAGATTGCTGGAGGCCTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGC 1057 Query 4528 GTTTGATGAATGCAATGCGACAGGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTC 4587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1056 GTTTGATGAATGCAATGCGACAGGCTCATGCTGATGGTTGGTTTATCGTTTTTGACACTC 997 Query 4588 TCACGTTGGCTGACGACCGATTAGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACT 4647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 996 TCACGTTGGCTGACGACCGATTAGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGCTTTGCGTGACT 937 Query 4648 ATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCAC 4707 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 936 ATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCAC 877 Query 4708 ACGCCGACTGCTATCAGTATTTTTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTC 4767 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 876 ACGCCGACTGCTATCAGTATTTTTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTC 817 Query 4768 ATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTG 4827 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 816 ATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTG 757 Query 4828 GTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTT 4887 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 756 GTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTT 697 Query 4888 ACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGT 4947 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 696 ACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGT 637 Query 4948 GGCCTGTTGATGCTAAAGGTGAGCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCT 5007 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 636 GGCCTGTTGATGCTAAAGGTGAGCCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTGGTTTCT 577 Query 5008 ATGTGGCTAAATACGTTAACAAAAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAG 5067 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 576 ATGTGGCTAAATACGTTAACAAAAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAAAGGTCTAGGAG 517 Query 5068 CTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCA 5127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516 CTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCA 457 Query 5128 GAATCAGAATGAGCCGCAACTTCGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGG 5187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 456 GAATCAGAATGAGCCGCAACTTCGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGG 397 Query 5188 AGTGCTTAATCCAACTTACCAAGCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGA 5247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 396 AGTGCTTAATCCAACTTACCAAGCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGA 337 Query 5248 AGCAGAACGCAAAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTT 5307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 336 AGCAGAACGCAAAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTT 277 Query 5308 TGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGA 5367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 276 TGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTGCTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGA 217 Query 5368 TTGGCGTATCCAACCTGCA 5386 ||||||||||||||||||| Sbjct 216 TTGGCGTATCCAACCTGCA 198 Score = 356 bits (394), Expect = 8e-95 Identities = 197/197 (100%), Gaps = 0/197 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 197 GAGTTTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAA 138 Query 61 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 137 AAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGAC 78 Query 121 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 77 TGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTT 18 Query 181 GCGACCTTTCGCCATCA 197 ||||||||||||||||| Sbjct 17 GCGACCTTTCGCCATCA 1 >seq174 Length=946 Score = 1707 bits (1892), Expect = 0.0 Identities = 946/946 (100%), Gaps = 0/946 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1495 TCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGAC 1554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 946 TCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGAC 887 Query 1555 GACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATAC 1614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 886 GACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATAC 827 Query 1615 TGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGG 1674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 826 TGACCAAGAACGTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTTCTTCATTTGGAGG 767 Query 1675 TAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGC 1734 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 766 TAAAACCTCTTATGACGCTGACAACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGC 707 Query 1735 ATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGT 1794 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 706 ATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAACGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGT 647 Query 1795 TCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTT 1854 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 646 TCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCCTGAGCATGGCACTATGTT 587 Query 1855 TACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGC 1914 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 586 TACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTACCTTAACGC 527 Query 1915 TAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCC 1974 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 526 TAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCC 467 Query 1975 GCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAA 2034 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 466 GCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAA 407 Query 2035 GATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCT 2094 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 406 GATTGCTGAGGGTCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCT 347 Query 2095 TCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACT 2154 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 346 TCTTGAAGGCTTCCCATTCATTCAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACT 287 Query 2155 TATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAG 2214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 286 TATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAG 227 Query 2215 TCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGATTCAATCAT 2274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 226 TCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGATTCAATCAT 167 Query 2275 GACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATT 2334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 166 GACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATT 107 Query 2335 TTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATC 2394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 106 TTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATC 47 Query 2395 ATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACtttttttCTG 2440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 46 ATGTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTTTTTTCTG 1 >seq159 Length=903 Score = 1615 bits (1790), Expect = 0.0 Identities = 900/903 (99%), Gaps = 0/903 (0%) Strand=Plus/Minus Query 2501 AAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTT 2560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 903 AAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTT 844 Query 2561 TTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTG 2620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 843 TTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTCTGTTG 784 Query 2621 GTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGT 2680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 783 GTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTTGAGT 724 Query 2681 CTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCC 2740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 723 CTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGGATGGTCGCC 664 Query 2741 ATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGC 2800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 663 ATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGC 604 Query 2801 CGGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCC 2860 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 603 CGGGCAATAATGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCC 544 Query 2861 GCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGT 2920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 543 GCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGT 484 Query 2921 GAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGC 2980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 483 GAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGC 424 Query 2981 CATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGT 3040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 423 CATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGCATTCAAGGTGATGT 364 Query 3041 GCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCA 3100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 363 GCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCATTCA 304 Query 3101 AGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGC 3160 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 AGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGC 244 Query 3161 TAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGA 3220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 243 TAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGA 184 Query 3221 TAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATAC 3280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 183 TAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATAC 124 Query 3281 TCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGA 3340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 123 TCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTCCTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGA 64 Query 3341 TGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAAT 3400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 63 TGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAAT 4 Query 3401 GCA 3403 ||| Sbjct 3 GCA 1 >seq15 Length=708 Score = 1269 bits (1406), Expect = 0.0 Identities = 706/708 (99%), Gaps = 0/708 (0%) Strand=Plus/Minus Query 306 TAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGATGCTGT 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 708 TAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGATGCTGT 649 Query 366 TCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTTTCCAG 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 648 TCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTTTCCAG 589 Query 426 ACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCGAAGAT 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 588 ACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCGAAGAT 529 Query 486 GATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTGCTCGT 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 528 GATTTCGATTTTCTGACGAGTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTGCTCGT 469 Query 546 CGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCTTTCCT 605 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 468 CGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTAGGATACCCTCGCTTTCCT 409 Query 606 GCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACATTCAA 665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 408 GCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGTTCATCCCGTCAACATTCAA 349 Query 666 ACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCGTCGAG 725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 348 ACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAATGGCGTCGAG 289 Query 726 CGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACT 785 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 288 CGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACT 229 Query 786 GACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCGGAAGGAGTGATG 845 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 228 GACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAGTGATG 169 Query 846 TAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAG 905 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 168 TAATGTCTAAAGGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAG 109 Query 906 GTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAAT 965 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 108 GTACTAAAGGCAAGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAAT 49 Query 966 TGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTC 1013 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 48 TGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTC 1 >seq49 Length=277 Score = 500 bits (554), Expect = 3e-138 Identities = 277/277 (100%), Gaps = 0/277 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1024 CGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCGTCT 1083 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 277 CGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCTGGTCAGATTGGTCGTCT 218 Query 1084 TATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGG 1143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217 TATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGG 158 Query 1144 CGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACATTTT 1203 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 157 CGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACATTTT 98 Query 1204 TACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGA 1263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 97 TACTTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGA 38 Query 1264 TGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACT 1300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 37 TGGTGTTAATGCCACTCCTCTCCCGACTGTTAACACT 1 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 17123157111735