Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Protopolystoma_20xenopodis_20[genbank_20GCA_5F000950455.1_202014-09- 26] 316,398 sequences; 617,344,661 total letters Query= NC_026431.1 Length=982 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq192717 1755 0.0 >seq192717 Length=982 Score = 1755 bits (1946), Expect = 0.0 Identities = 976/978 (99%), Gaps = 0/978 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 ATGAGTCTTCTAACCGAGGTCGAAACGTACGTTCTTTCTATCATCCCGTCAGGCCCCCTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 978 ATGAGTCTTCTAACCGAGGTCGAAACGTACGTTCTTTCTATCATCCCGTCAGGCCCCCTC 919 Query 61 AAAGCCGAGATCGCGCAGAGACTGGAAAGTGTCTTTGCAGGAAAGAACACAGATCTTGAG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 918 AAAGCCGAGATCGCGCAGAGACTGGAAAGTGTCTTTGCAGGAAAGAACACAGATCTTGAG 859 Query 121 GCTCTCATGGAATGGCTAAAGACAAGACCAATCTTGTCACCTCTGACTAAGGGAATTTTA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 858 GCTCTCATGGAATGGCTAAAGACAAGACCAATCTTGTCACCTCTGACTAAGGGAATTTTA 799 Query 181 GGATTTGTGTTCACGCTCACCGTGCCCAGTGAGCGAGGACTGCAGCGTAGACGCTTTGTC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 798 GGATTTGTGTTCACGCTCACCGTGCCCAGTGAGCGAGGACTGCAGCGTAGACGCTTTGTC 739 Query 241 CAAAATGCCCTAAATGGGAATGGGGACCCGAACAACATGGATAGAGCAGTTAAACTATAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 738 CAAAATGCCCTAAATGGGAATGGGGACCCGAACAACATGGATAGAGCAGTTAAACTATAC 679 Query 301 AAGAAGCTCAAAAGAGAAATAACGTTCCATGGGGCCAAGGAGGTGTCACTAAGCTATTCA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 678 AAGAAGCTCAAAAGAGAAATAACGTTCCATGGGGCCAAGGAGGTGTCACTAAGCTATTCA 619 Query 361 ACTGGTGCACTTGCCAGTTGCATGGGCCTCATATACAACAGGATGGGAACAGTGACCACA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 618 ACTGGTGCACTTGCCAGTTGCATGGGCCTCATATACAACAGGATGGGAACAGTGACCACA 559 Query 421 GAAGCTGCTTTTGGTCTAGTGTGTGCCACTTGTGAACAGATTGCTGATTCACAGCATCGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 558 GAAGCTGCTTTTGGTCTAGTGTGTGCCACTTGTGAACAGATTGCTGATTCACAGCATCGG 499 Query 481 TCTCACAGACAGATGGCTACTACCACCAATCCACTAATCAGGCATGAAAACAGAATGGTG 540 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 498 TCTCACAGACAAATGGCTACTACCACCAATCCACTAATCAGGCATGAAAACAGAATGGTG 439 Query 541 CTGGCTAGCACTACGGCAAAGGCTATGGAACAGATGGCTGGATCGAGTGAACAGGCAGCG 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 438 CTGGCTAGCACTACGGCAAAGGCTATGGAACAGATGGCTGGATCGAGTGAACAGGCAGCA 379 Query 601 GAGGCCATGGAGGTTGCTAATCAGACTAGGCAGATGGTACATGCAATGAGAACTATTGGG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 378 GAGGCCATGGAGGTTGCTAATCAGACTAGGCAGATGGTACATGCAATGAGAACTATTGGG 319 Query 661 ACTCATCCTAGCTCCAGTGCTGGTCTGAAAGATGACCTTCTTGAAAATTTGCAGGCCTAC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 318 ACTCATCCTAGCTCCAGTGCTGGTCTGAAAGATGACCTTCTTGAAAATTTGCAGGCCTAC 259 Query 721 CAGAAGCGAATGGGAGTGCAGATGCAGCGATTCAAGTGATCCTCTCGTCATTGCAGCAAA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 258 CAGAAGCGAATGGGAGTGCAGATGCAGCGATTCAAGTGATCCTCTCGTCATTGCAGCAAA 199 Query 781 TATCATTGGGATCTTGCACCTGATATTGTGGATTACTGATCGTCtttttttCAAATGTAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 198 TATCATTGGGATCTTGCACCTGATATTGTGGATTACTGATCGTCTTTTTTTCAAATGTAT 139 Query 841 TTATCGTCGCTTTAAATACGGTTTGAAAAGAGGGCCTTCTACGGAAGGAGTGCCTGAGTC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 138 TTATCGTCGCTTTAAATACGGTTTGAAAAGAGGGCCTTCTACGGAAGGAGTGCCTGAGTC 79 Query 901 CATGAGGGAAGAATATCAACAGGAACAGCAGAGTGCTGTGGATGTTGACGATGGTCATTT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 78 CATGAGGGAAGAATATCAACAGGAACAGCAGAGTGCTGTGGATGTTGACGATGGTCATTT 19 Query 961 TGTCAACATAGAGCTAGA 978 |||||||||||||||||| Sbjct 18 TGTCAACATAGAGCTAGA 1 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 3026891363834