Alignment viewer

BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: Salmo_20salar_20[refseq_20GCF_5F000233375.1_202015-06-10] 232,155 sequences; 2,966,890,203 total letters Query= NC_007368.1 Length=1467 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value seq63787 2470 0.0 >seq63787 Length=1469 Score = 2470 bits (2738), Expect = 0.0 Identities = 1428/1467 (97%), Gaps = 0/1467 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGCAAAAGCAGGAGTAAAGATGAATCCAAATCAAAAGATAATAACGATTGGCTCTGTTTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2 AGCAAAAGCAGGAGTAAAGATGAATCCAAATCAAAAGATAATAACGATTGGCTCTGTTTC 61 Query 61 TCTCACCATTTCCACAATATGCTTCTTCATGCAAATTGCCATCCTGATAACCACTGTAAC 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct 62 TCTCACCATTTCCACAATATGCTTCTTCATGCAAATTGCCATCTTGATAACTACTGTAAC 121 Query 121 ATTGCATTTCAAGCAATATGAATTCAACTcccccccAAACAACCAAGTGATGCTGTGTGA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 122 ATTGCATTTCAAGCAATATGAATTCAACTCCCCCCCAAACAACCAAGTGATGCTGTGTGA 181 Query 181 ACCAACAATAATAGAAAGAAACATAACAGAGATAGTGTATCTGACCAACACCACCATAGA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 182 ACCAACAATAATAGAAAGAAACATAACAGAGATAGTGTATCTGACCAACACCACCATAGA 241 Query 241 GAAGGAAATGTGCCCCAAACTAGCAGAATACAGAAATTGGTCAAAGCCGCAATGTGACAT 300 ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| Sbjct 242 GAAGGAAATATGCCCCAAACCAGCAGAATACAGAAATTGGTCAAAACCGCAATGTGGCAT 301 Query 301 TACAGGATTTGCACCTTTTTCTAAGGACAATTCGATTAGGCTTTCCGCTGGTGGGGACAT 360 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 302 TACAGGATTTGCACCTTTCTCTAAGGACAATTCGATTAGGCTTTCCGCTGGTGGGGACAT 361 Query 361 CTGGGTGACAAGAGAACCTTATGTGTCATGCGACCCTGACAAGTGTTACCAATTTGCCCT 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 362 CTGGGTGACAAGAGAACCTTATGTGTCATGCGATCCTGACAAGTGTTATCAATTTGCCCT 421 Query 421 TGGACAGGGAACAACACTAAACAACGTGCATTCAAATGACACAGTACATGATAGGACCCC 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct 422 TGGACAGGGAACAACACTAAACAACGTGCATTCAAATAACACAGTACGTGATAGGACCCC 481 Query 481 TTATCGGACCCTATTGATGAATGAATTAGGTGTTCCATTTCATCTGGGGACCAAGCAAGT 540 ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 482 TTATCGGACTCTATTGATGAATGAGTTGGGTGTTCCTTTTCATCTGGGGACCAAGCAAGT 541 Query 541 GTGCATAGCATGGTCCAGCTCAAGTTGTCACGATGGAAAAGCATGGCTGCATGTTTGTGT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 542 GTGCATAGCATGGTCCAGCTCAAGTTGTCACGATGGAAAAGCATGGCTGCATGTTTGTAT 601 Query 601 AACGGGGGATGATAAAAATGCAACTGCTAGCTTCATTTACAATGGGAGGCTTGTAGATAG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 602 AACGGGGGATGATAAAAATGCAACTGCTAGCTTCATTTACAATGGGAGGCTTGTAGATAG 661 Query 661 TATTGTTTCATGGTCCaaaaaaaTCCTCAGGACCCAGGAGTCAGAATGCGTTTGTATCAA 720 | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 662 TGTTGTTTCATGGTCCAAAGAAATTCTCAGGACCCAGGAGTCAGAATGCGTTTGTATCAA 721 Query 721 TGGAACTTGTACAGTAGTAATGACTGATGGGAGTGCTTCAGGAAAAGCTGATACTAAAAT 780 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 722 TGGAACTTGTACAGTAGTAATGACTGATGGAAGTGCTTCAGGAAAAGCTGATACTAAAAT 781 Query 781 ACTATTCATTGAGGAGGGGAAAATCATTCATACTAGCACATTGTCAGGAAGTGCTCAGCA 840 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 782 ACTATTCATTGAGGAGGGGAAAATCGTTCATACTAGCACATTGTCAGGAAGTGCTCAGCA 841 Query 841 TGTCGAGGAGTGCTCCTGCTATCCTCGATATCCTGGTGTCAGATGTGTCTGCAGAGACAA 900 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 842 TGTCGAAGAGTGCTCTTGCTATCCTCGATATCCTGGTGTCAGATGTGTCTGCAGAGACAA 901 Query 901 CTGGAAAGGCTCCAATAGGCCCATCGTAGATATAAACATAAAGGATTATAGCATTGTTTC 960 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 902 CTGGAAAGGCTCCAATCGGCCCATCGTAGATATAAACATAAAGGATCATAGCATTGTTTC 961 Query 961 CAGTTATGTGTGCTCAGGGCTTGTTGGAGACACACCCAGAAAAAACGACAGCTCCAGCAG 1020 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 962 CAGTTATGTGTGTTCAGGACTTGTTGGAGACACACCCAGAAAAAACGACAGCTCCAGCAG 1021 Query 1021 TAGCCATTGCTTGGATCCTAACAATGAAGAAGGTGGTCATGGAGTGAAAGGCTGGGCCTT 1080 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1022 TAGCCATTGTTTGGATCCTAACAATGAAGAAGGTGGTCATGGAGTGAAAGGCTGGGCCTT 1081 Query 1081 TGATGATGGAAATGACGTGTGGATGGGAAGAACGATCAGCGAGAAGTTACGCTCAGGATA 1140 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| || Sbjct 1082 TGATGATGGAAATGACGTGTGGATGGGAAGAACAATCAACGAGACGTCACGCTTAGGGTA 1141 Query 1141 TGAAACCTTCAAAGTCATTGAAGGCTGGTCCAAACCTAATTCCAAATTGCAGATAAATAG 1200 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1142 TGAAACCTTCAAAGTCATTGAAGGCTGGTCCAACCCTAAGTCCAAATTGCAGATAAATAG 1201 Query 1201 GCAAGTCATAGTTGACAGAGGTAATAGGTCCGGTTATTCTGGTATTTTCTCTGTTGAAGG 1260 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1202 GCAAGTCATAGTTGACAGAGGTGATAGGTCCGGTTATTCTGGTATTTTCTCTGTTGAAGG 1261 Query 1261 CAAAAGCTGCATCAATCGGTGCTTTTATGTGGAGTTGATAAGGGGAAGAAAAGAGGAAAC 1320 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1262 CAAAAGCTGCATCAATCGGTGCTTTTATGTGGAGTTGATTAGGGGAAGAAAAGAGGAAAC 1321 Query 1321 TGAAGTCTTGTGGACCTCAAACAGTATTGTTGTGTTTTGTGGCACCTCAGGTACATATGG 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1322 TGAAGTCTTGTGGACCTCAAACAGTATTGTTGTGTTTTGTGGCACCTCAGGTACATATGG 1381 Query 1381 AACAGGCTCATGGCCTGATGGGGCGGACATCAATCTCATGCCTATATAAGCTTTCGCAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1382 AACAGGCTCATGGCCTGATGGGGCGGACCTCAATCTCATGCCTATATAAGCTTTCGCAAT 1441 Query 1441 TTTAGaaaaaaaCTCCTTGTTTCTACT 1467 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1442 TTTAGAAAAAAACTCCTTGTTTCTACT 1468 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 4574288944090