Alignment viewer
BLASTN 2.6.0+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Database: Rhinopithecus_20roxellana_20[refseq_20GCF_5F000769185.1_202014-10-
28] 135,512 sequences; 2,899,552,139 total letters
Query= NC_023676.1
Length=9501
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
seq42544 2792 0.0
seq43009 1342 0.0
seq105983 717 0.0
seq93594 545 1e-151
seq57899 363 9e-97
>seq42544
Length=1694
Score = 2792 bits (3096), Expect = 0.0
Identities = 1636/1694 (97%), Gaps = 3/1694 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7399 GGTAAAATTAATTGGGTTGCCTGCTGCAAAGAACATTGTGAATTATTTTTGTAGTGAACG 7458
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1 GGTAAAGTTAATTGGCTTGCCTGCTGCAAAGAACATCGTGAATTATTTCTGTAGTGAACG 60
Query 7459 AGAGGCTGGCTCGCTTAAGTCATTAGCTTGTTGGATAAAACCAGTAGGGGAGAGGGTTAC 7518
||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 61 AGAGGCTAGCTCACTCAAATCATTAGCTTGTTGGATAAAACCAGTAGGGGAGAGAGTTAC 120
Query 7519 CTGGGGAGATTCCACTATCCAACCTTACTATTGCACCAACGTATCCTACTCAAACCCAGG 7578
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 121 CTGGGGAGATTCCACTATCCAGCCTTACTATTGTACCAACGTATCCTACTCAAATCCAGG 180
Query 7579 TATGGAGAAGATGAAGACAGAACTATTGGGATTTAAGATGAAGAACTATAATAATCCACA 7638
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 181 TATGGAGAAGATGAAGACAGAACTATTGGGATTTAAGATGAAGAACCATAATAATCCACA 240
Query 7639 TAAATGCGGTACTTTAATCATGTCGAATGATGTTATTTGTGGTATGATCATTGCCGCGAC 7698
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 241 TAAATGTGGTACTTTAATCATGTCGAACGATGTTATTTGTGGTATGATCATTGCTGCGAC 300
Query 7699 TACACTTGCGGGTGAATCTTTCGCTGTAAGTGTTAGTCGCGAAATGGTTGTTGAGGGCCT 7758
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 301 TACACTTGCGGGTGAATCTTTTGCTGTAAGTGTTAGTCGCGAGATGGTTGTTGAGGGCCT 360
Query 7759 TAGGGTCCTTGGGGCAACACCTTTTGACATGAAGATGAAGATTACCCCAATAGATACTGT 7818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TAGGGTCCTTGGGGCAACACCTTTTGACATGAAGATGAAGATTACCCCAATAGATACTGT 420
Query 7819 TGAGGGCACACCTAAGATGTTACCACCCGAGGATGGCGACTTCATCCTTGTGGGGAAGGC 7878
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TGAGGGCACACCTAAGATGTTACCACCCGAGGAGGGCGACTTCATCCTTGTGGGGAAGGC 480
Query 7879 TGGTAAAGGATTGACATACGCGGGGAAAACCAGATTGACGCCGTCGATCATTCAGGGAGA 7938
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 481 TGGTAAAGGATTGACGTACGCGGGTAAAACCAGATTGACGCCATCGATTATTCAGGGAGA 540
Query 7939 GATTTCAGAACCTTTTCGATTCCCAGCCGCGCAGAAGTTGGAGGCGACTGGGGAACGTAC 7998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 541 GATTTCAGAACCTTTTCGATTCCCAGCCGCGCAGAAGTTGGAGGCAACTGGGGAACGCAC 600
Query 7999 GGGATTTGATGTGGTGATGAATGGATGTCGGCGCCAGTTTAATAGACCGAAGACAATAGC 8058
||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GGGCTTTGATGTGGTGATGAATGGGTGCCGGCGCCAGTTTAATAGACCGAAGACAATAGC 660
Query 8059 ACGTGATGAAGTAGAGAAGATCACTGAGTATCTGATTGAAAGAATAGTGCCTAGTAGTCC 8118
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 661 ACGTGATGAAGTAGAGAAGATCACTGAGTATTTGATTGAGAGAATAGTACCTAGTAGTCC 720
Query 8119 ACCAACGCGGATGATTGGTGCCAAGCCGGTTGATTTAGACACCGCTATACTAGGAATACC 8178
| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 721 ATCAGCGCGGATGATTGGCTCCAAGCCAGTTGATTTAGACACCGCTATACTAGGGATACC 780
Query 8179 CAAGACACGATACTCTGCTATGAAGTTGAACACTGCAATTGGTTGGCCACTAATGTGCAA 8238
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CAAGACACGATACTCTGCTATGAAGTTAAACACTGCCATTGGTTGGCCACTAATGTGCAA 840
Query 8239 GTTTCCGAAGGGCCAAAAGAAGAGTGACATCATTAAGATAAGCGAAGAGCGTACCGAAGT 8298
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 841 GTTCCCGAAGGGCCAAAAGAAGAGTGACATCATTAAGATAAACGAAGAGCGTACCGAGGT 900
Query 8299 TAAGATTCATAAGTATGCCTTGGAGGAGTATGCGAGTGCAAATGAAGGACGCAAACGTGC 8358
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TAAGATTCATAAGTATGCCTTGGAGGAGTATGTGAGTGCAAATGAAGGACGCAAACGTGC 960
Query 8359 AGTTTGCGCCCCGACTGTGTTCATGGACTTCCCCAAGGATGAACTTTTGAAAGTTGGTAA 8418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AGTTTGCGCCCCGACTGTGTTCATGGACTTCCCCAAGGATGAACTTTTGAAAGTTGGTAA 1020
Query 8419 GGCTACTCGTTTGATAAA---TGCCCCTCTTCACCACACTTTAGATATGCGTAGATATCT 8475
||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GGCTACTCGTTTGATTAATGGTGCCCCTCTCCACCATACTTTAGATATGCGTAGATATCT 1080
Query 8476 GGGAGAATTCCTCGAGTCCATCGTTCACCTTGGCAACAAGATTGCGGTGGGCATAGATGT 8535
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1081 GGGAGAATTCCTTGAGTCCATCGTTCATCTTGGCAACAAGATTGCGGTCGGCATAGATGT 1140
Query 8536 ACATTCCACGGACTGGGTTGAAGTAAACGCTGGACAGAATGACGTAGTGAATGAGGATTA 8595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 ACATTCCACGGACTGGGTTGAAGTAAACGCTGGACAGAATGACGTAGTGAATGAGGATTA 1200
Query 8596 TAAAAATTTCGGACCTGGCTTTCATAGTCAGTGGATCGATGTAATATCTGAGATTGCTGT 8655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TAAAAATTTCGGACCTGGCTTTCATAGTCAGTGGATCGATGTAATATCTGAGATTGCTGT 1260
Query 8656 CGCCTGGACAAAGCGTTATAAGACCAATGACCCCGAATATGAGAACGTAATCCGCTGTTT 8715
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CGCCTGGACTAAGCGTTATAAGACCAATGACCCCGAATATGAGAACGTAATCCGCTGTTT 1320
Query 8716 GTTTAGGGAATTGCAGAATGCTACACATATCGCAGGGGACCTAATATTCCAAGTCCTCTG 8775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GTTTAGGGAATTGCAGAATGCTACACATATCGCAGGGGACCTAATATTCCAAGTCCTCTG 1380
Query 8776 TGGCTCCCCTAGTGGAGCCTTTGCTACCGATAGAATCAATAGTCTGGCTAATATTTGTTA 8835
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 TGGCTCTCCTAGTGGGGCCTTTGCTACCGATAGAATCAATAGTCTGGCTAATATTTGTTA 1440
Query 8836 TCATTGTTTATGTTATTTACGCAAATATAGTACTTTAGTTGGTTTTTGGGAATATTATCT 8895
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CCATTGCTTATGTTATTTACGCAAATATAGTACTTTAGTTGGTTTTTGGGAATATTATCT 1500
Query 8896 AACGGTCTATGGTGATGACACTAGACGCTCCGGAAAGGCATATAGTTACGAAGAATTTCG 8955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 AACGGTCTATGGTGATGACACTAGACGCTCCGGAAAGGCATATAGTTACGAAGAATTTCG 1560
Query 8956 TGACTGTATGGCGTCCATTGGCATCACCGTAGAGCTAGATAAGGGTGGAAATACTTTCCT 9015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 TGACTGTATGGCGTCCATTGGCATCACCGTAGAGCTAGATAAGGGTGGAAATACTTTCCT 1620
Query 9016 TAAGAGAGAATTTCGCCCCTATAGTTACAAAGGTATTAATATATTATTAGCACCCTTACC 9075
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 TAAGAGAGAATTTCGCCCCTATAGTTATAAAGGTATTAATATATTATTAGCACCCTTACC 1680
Query 9076 CCTCCCGATCGTGG 9089
||||||||||||||
Sbjct 1681 CCTCCCGATCGTGG 1694
>seq43009
Length=814
Score = 1342 bits (1488), Expect = 0.0
Identities = 786/814 (97%), Gaps = 0/814 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5832 TATCGCGAACTGCTCCAGTAACGTATGTGTCATATCAAGAGGCTATTAGTCGTGTACGCG 5891
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TATCACGAACTGCTCCAGTAACGTATGTGTCATATCAGGAGGCTATTAGTCGTGTACGCG 755
Query 5892 ATGAGGCTTTACTACACCGGCAGAAGGAACTTAAATCATTAGAGCGAAAGGGACCACTTT 5951
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 754 ATGAGGCTTTATTACACCGGCAGAAGGAACTTAAATCATTAGAACGAAAGGGACCACTTT 695
Query 5952 ATGCCCGTTTGAAACCTGAACATGAGATTACCGGAAACGAATTTAGGGAGCGCATCTTCA 6011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 ATGCCCGTTTGAAACCTGAACATGAGATTACCGGAAACGAATTTAGGGAGCGCATCTTCA 635
Query 6012 CTGCCACAGCTGATGAGGTTCCGCGACCTATTGATATCGACCTTTTGGAGATGGAGGATG 6071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 CTGCCACAGCTGATGAGGTTCCGCGACCTATTGATATCGACCTTTTGGAGATGGAGGATG 575
Query 6072 TGCAGGTGAATGATGCTACCTCTGGGCGCATGCAAATTAGACTACATCCAACGGGGTCTA 6131
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 574 TGCCGGTGAATGATGCTACCTCTGGGCGCATGCAAATTAGACTGCATCCAACGGGGTCTA 515
Query 6132 CCACCTGTGATTGTCACAGTGAAATTGATGGGAGAATTAAGACCAGGTTCTATTGTAAAA 6191
| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 CTACCTGTGATTGCCACAGCGAGGTTGATGGGAGAATTAAGACCAGGTTCTATTGTAAAG 455
Query 6192 GTCATTACCCTGGAGCCCAACACCAGGTAATAACCAAGGAAGTGTTGAGAGAGGCCATAG 6251
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 454 ACCATTATCCTGGAGCCCAACACCAGGTAATAACCAAGGAAGTGTTGAGAGAGGCCATAG 395
Query 6252 AATCAGAAGATCCTATATCAGCTCCACCGTTGCTCGCATTTGTAGATGAAAAGACCATCC 6311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 394 AATCAGAAGATCCTATATCAGCTCCACCGTTGCTCGCATTTGTAGATGAAAAGACCATCC 335
Query 6312 CCAATAATCCGCGTGATCCTACGGGACTCCTAATGAATTGGTTTAACACACGGTATGCTC 6371
||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334 CCAATAATCCGCGTGATCCCACCGGGCTCCTAATGAATTGGTTTAACACACGGTATGCTC 275
Query 6372 GAAGGCTCCCAGAAGGGTATCAGTATTGGCATAATATCTCTTTATCCTGTTGTCATCAAC 6431
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 GAAGGCTCCCAGAAGGGTATCAGTATTGGCATAACATCTCTTTATCCTGTTGTCATCAAC 215
Query 6432 CTAACATCTTACAACGCGCTTACTTCGAGAATGTGGGGGGAAAAGTGGAGGTAGTGCTAG 6491
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 CTAATATCTTACAACGTGCTTACTTCGAGAATGTGGGGGGAAAAGTGGAGGTAGTGCTAG 155
Query 6492 ATTATTATCTTAGTGAGCGGGATCTTCCAAATTGCTCCATTTGGAGTAGTAGCACGAAGG 6551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 154 ATTATTATCTTAGTGAGCGGGATCTTCCAAATTGCTCCATTTGGAGTAGTAGCACAAAGG 95
Query 6552 AACACTGCAAGATAGTTTTGACACCGGCCTGCCCTGTTTCAGTCTATAATAGTTTGGTCA 6611
| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 94 AGCATTGCAAGGTAGTTTTGACGCCGGCCTGCCCTGTTTCAGTCTATAATAGTTTGCTCA 35
Query 6612 AGCTAAAGAACCATCCATTTGCAGGAGATCTAGA 6645
||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 34 AGCTAAAGAACCACCCATTTGCAGGAGATCTAGA 1
>seq105983
Length=415
Score = 717 bits (794), Expect = 0.0
Identities = 408/415 (98%), Gaps = 0/415 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 9050 ATTAATATATTATTAGCACCCTTACCCCTCCCGATCGTGGGAGATATTGTCAATTGGGTA 9109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 ATTAATATATTATTAGCACCCTTACCCCTCCCGATCGTGGGAGATATTGTCAATTGGGTA 356
Query 9110 AAGAAACCGATCTTCGATCCGGTTTCGGCGTTAGAACAATCGGTTGACTCGTATCTCTCC 9169
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 AAGAAACCGATTTTTGATCCGGTTTCGGCGTTAGAACAATCGGTTGACTCGTATCTCTCC 296
Query 9170 GAGATGTTCCATCACGGGCAGGAGCGTTTTGATACGGCTCGCTCCCAGATCCAGGAAATA 9229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 GAGATGTTCCATCACGGGCAGGAGCGTTTTGATACGGCTCGCTCCCAGATCCAGGAAATA 236
Query 9230 TTCGCGAGGTTTGGTAGGAATCCAGAATTGAAAGACTTCAACACCATTTGGGTGGAGAAG 9289
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 235 TTCGCGAGGTTTGGTAGGAATCCAGAATTGAAAGACTTTAACACCATTTGGGTGGAAAAG 176
Query 9290 TATGGTAAAGTTGGAATACTTCCTACCGGCAGCTATGTGGATGAACGAGGTGAAATCTTG 9349
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 TATGGTAAAGTCGGAATACTTCCTACCGGCAGCTATGTGGATGAACGAGGTGAAATCTTG 116
Query 9350 AAGCATGGCATAGCTGGGACATTCCTGGGTGACCCTAACTCCTTTGAGGATGACGAAGGT 9409
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 115 AAGCATGGCATAGCTGCGACATTCCTGGGTGACCCTAACTCCTTTGAGGATGATGAAGGT 56
Query 9410 TACTCAGTTGAATGATAGAAAGTCCGGATGGTAATCCTTATGAACCCAAGTCGGC 9464
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 TACTCAGTTGAATGATAGAAAGTCCGGATGGTAATCCTTATGAACCCAAGTCGGC 1
>seq93594
Length=320
Score = 545 bits (604), Expect = 1e-151
Identities = 313/320 (98%), Gaps = 0/320 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4183 AGGACCTTCGAGTGATCCCCCTGGCAGCCACCAGCCCGACCCAGAGTCGGAGTACTTCAC 4242
||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 320 AGGACCTTCGAGTAATCCCCCTGGCGGTCACCAGCCCGACCCAGAGTCGGAGTACTTCAC 261
Query 4243 TACGGAGGAACAAGAGGAAATGGGTCGGGCTGGCATGACGAGGAGATTATATAATAAAGT 4302
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260 TACGGAGGAACAAGAGGAAATGGGTCGGGCTGGTATGACGAGGAGATTATATAATAAAGT 201
Query 4303 GTCATCCTACTTAAGAACGGTGCGTAGGATGCCCAGGGATACCGTTGACGAGTTTTGGCG 4362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 GTCATCCTACTTAAGAACGGTGCGTAGGATGCCCAGGGATACCGTTGACGAGTTTTGGCG 141
Query 4363 AAGGTATGAGGAAAAGAAGAGAATAGTGGTTGATCTTACTGATTCAGTTAGAACCGTGTC 4422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 140 AAGGTATGAGGAAAAGAAGAGAATAGTGGTTGATCTTACTGATTCAGTTAGGACCGTGTC 81
Query 4423 TGAATTTGTAAAGCACGTGGAGGACTCGAACATGGATAAACAAAAGTTTGAGCGTGCTTT 4482
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80 TGAATTTGTAAAGAACGTGGAGGACTCGAACATGGATAAACAAAAGTTTGAGCGTGCTTT 21
Query 4483 TGAGGCTTTTGAGAGTATTG 4502
||||||||||||||| ||||
Sbjct 20 TGAGGCTTTTGAGAGCATTG 1
>seq57899
Length=219
Score = 363 bits (402), Expect = 9e-97
Identities = 212/219 (97%), Gaps = 0/219 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3211 GGAAGGGGAGCCAGTTGAACAACAAGTGGACCAGGGGGATGAGCGAACTAAGGTCATGGA 3270
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1 GGAAGGGGAGCCAGTTGAACAACAAGTGGACCAAGGGGACGAGCGAACTAAGGTTATGGA 60
Query 3271 TGCTTCCACTCCTCTACGGGTAACCTATCCAGCATGGGCACTGAATCTTAATGAAACATA 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TGCTTCCACTCCTCTACGGGTAACCTATCCAGCATGGGCACTGAATCTTAATGAAACATA 120
Query 3331 CGACATCCGTGACGTAGTTAAGCGCTACACCACTTGGTTCTCAAGGGACACCCACCCTAG 3390
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||
Sbjct 121 CGACATCCGTGATGTAGTTAAGCGCTACACCACTTGGTTTTCAAGGGACACCCTCTCTAG 180
Query 3391 TAACACCCGTGCTGAAACTTTACAATTTTTCCAGGTTTC 3429
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TAACACCCGTGCTGAAACTTTACAATTTTTCCAGGTTTC 219
Lambda K H
0.634 0.408 0.912
Gapped
Lambda K H
0.625 0.410 0.780
Effective search space used: 30241825641120
Made in 2017 by Kirill Kryukov This page is placed in public domain using CC0 |